Le Noyau Pt. II (suite et fin) Flashcards

1
Q

Dans quel sens se fait le trafic par les pores nucléaires?

A

Bidirectionnel

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Q

De quoi est fait le pore nucléaire?

A

Complexe de prots, les nucléoporines

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Q

Quels sont les deux types de trafic à travers le pore nucléaire?

A
  • Diffusion libre/passive

- Transport contrôlé

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4
Q

Quelles sont les propriétés du pore nucléaire?

A
  • Canal aqueux
  • Toujours ouvert
  • 10 nm de diamètre
  • Forme octogonale
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Q

Quelles molécules sont concernées par la diffusion passive ou simple?

A

Molécules de taille <10 nm ou de masse moléculaire <5000 Da (petites molécules ie ions, nucléotide…)

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6
Q

Quelles molécules sont concernées par le transport contrôlé?

A

Molécules de taille >10 nm ou de masse moléculaire >5000 Da

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7
Q

Quelles sont les caractéristiques du transport contrôlé?

A
  • Nécessite une DILATATION du pore nucléaire
  • Nécessite de l’énergie (ATPases)
  • Transport sélectif
  • Protéines traversent REPLIÉES
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8
Q

Comment peut-on observer les pores nucléaires?

A

Au ME à balayage, après cryofracture

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9
Q

Comment le nombre de pores varie-t-il?

A

En fonction du moment du cycle cellulaire: pendant l’interphase: nbr +++ en phase S, diminue après la phase S (-)

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10
Q

Comment met-on en évidence le trafic des protéines par les pores nucléaires?

A

Marquage avec un AA et de l’or colloïdal, puis observation au MET

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11
Q

Comment met-on en évidence le trafic des ARN par les pores nucléaires, ainsi que l’activité de transcription?

A

Marquage en incubant les ARN avec de l’URIDINE TRITIÉE, puis on ajoute sur l’échantillon du bromure d’argent et on observe au MET

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12
Q

Comment les nucléoporines reconnaissent-elles les prots?

A

Elles projettent des filaments de part et d’autre du pore qui vont reconnaître les molécules

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13
Q

Quelles molécules vont passer le pore nucléaire par transport contrôlé du cytoplasme vers le noyau?

A
  • Enzymes du métabolisme des acides nucléiques:
  • ADN et ARN poly + leurs cofacteurs
  • Enzymes de maturation des ARN
  • Enzymes de la réparation
  • Prots de structure de la chromatine
  • Prots de régulation (ie facteurs de transcription)
  • Prots ribosomales
  • Nucléolines
  • Lamines
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14
Q

Quelles molécules vont passer le pore nucléaire par transport contrôlé du noyau vers le cytoplasme?

A
  • ARNm (consomment ATP +++)
  • Ribosomes
  • ARNt
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15
Q

Quelle est la règle générale du trafic par le pore nucléaire?

A

Ne prend en charge QUE LES PROTS, donc si d’autres molécules doivent passer elles doivent le faire en s’associant à des prots

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16
Q

Quelles sont les caractéristiques des séquences d’adressage pour le trafic nucléaire?

A
  • PAS localisées à endroit spé de la prot

- Différentes selon le trafic: NLS/NES

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17
Q

Qu’est-ce que la séquence NLS?

A
  • Pour les prots importées dans le noyau

- Lysine +++

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18
Q

Qu’est-ce que la séquence NES?

A
  • Pour les ports Exportées du noyau

- Leucine +++

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19
Q

Comment font les prots qui font des trajets d’aller et retour?

A

Elles ont à la fois des séquences NLS et NES

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20
Q

Qu’est-ce qui permet à certaines prot sd’être retenues dans le noyau?

A

Des signaux de rétention (séquences)

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21
Q

A quoi servent les protéines adaptatrices?

A

Aident à la reconnaissance de la prot par les nucléoporines

22
Q

Quels sont les deux types de prots adaptatrices?

A

Importines : prot avec NLS
Exportines : prot avec NES
(makes sense)

23
Q

Qu’est-ce que la protéine Ran et quelles sont ses propriétés?

A
  • petite prot G monomérique
  • Active avec GTP, inactive avec GDP
  • Activité GTPase
24
Q

Que fait, concrètement, la prot Ran?

A

Contrôle la direction du transport car il y a un gradient de ran-GTP dans la ç : [Ran-GTP] dans le noyau toujours > à [Ran-GTP] dans le cytoplasme

25
Q

Pourquoi [Ran-GTP] dans le noyau toujours > à [Ran-GTP] dans le cytoplasme?

A

Car:

  • Ran-GAP, qui induit l’activité GTPase de Ran n’existeque dans le cytoplasme
  • facteur d’échange GEF, qui switche la GDP et GTP, n’existe que dans le noyau
26
Q

Comment la protéine passe-t-elle le pore nucléaire?

A

Importine α reconnaît la séquence NLS. Elle est collée à l’importine β, qui est reconnue par les nucléoporines qui font passer le tout à l’intérieur du noyau

27
Q

Que permet la protéine Ran-GTP?

A

Elle sépare la prot NLS des importines

28
Q

Comment les importines et la Ran sont-elles recyclées?

A

Ran-GTP libère l’importine en hydrolysant son GTP dans le CYTOPLASME, puis la ran-GDP retourne dans le noyau pour switcher à nouveau au GTP

29
Q

Comment les ARN font-ils pour sortir du noyau?

A

Ils doivent être associés à une prot car ne peuvent pas directement être reconnus par les exportines (-)
Exportine + prot NES + Ran-GTP sortent du noyau, puis l’hydrolyse du GTP permet la séparation du tout dans le cytoplasme

30
Q

Comment la régulation des séquences NLS/NES procède-t-elle?

A

La protéine peut masquer ou dévoiler ces séquences, soit par repliement sur elle-même, soit par modifications type phosphorylation

31
Q

Combien d’ARN poly existe-t-il chez les eucaryotes?

A

3

32
Q

Que permet l’uracile?

A

Marquer la synthèse d’ARN dans la ç

33
Q

Quel pourcentage de l’activité du noyau les 3 poly occupent-elles?

A

I : 37% (nucléole)
II : 60%
III : 3%

34
Q

Quelles sont les fonctions des trois poly?

A
I : Synthèse de tous les ARNr SAUF le 5S
II : Synthèse des ARNm
III : Synthèse de :
    - ARNt
    - ARNr 5S
    - ARN 7S de la particule SRP
35
Q

Quels types d’ARN les trois poly synthétisent-elles?

A

I : Stables, majorité des ARN cytoplasmiques
II : Instables, traduits en prots, 3% des ARN cytoplasmiques
III : Stables, 16% des ARN cytoplasmiques

36
Q

Comment la demi-vie des ARNm varie-t-elle en fonction de la phase de l’interphase?

A

+ longtemps en phase S qu’en G1 et G2

37
Q

Combien de copies d’ARN peut-on produire en 1H?

A

Env. 1000

38
Q

Comment l’ARNm est-il coiffé?

A

Ajout d’une guanine méthylée en 5’, permet de marquer l’ARN comme ARNm et de protéger l’extrémité 5’

39
Q

Qu’est-ce que la poly-adénylation?

A

Ajout d’une queue poly-adénylée au 3’. Signal d’exportation de l’ARNm : on y ajoute des prots à NES

40
Q

Comment la chromatine est-elle modifiée pour pouvoir procéder à la transcription?

A

Fibre chromatinienne doit se déplier en nucléosomique -> phosphatases déphosphorylent les H1 et les HAT acétylent les lysine de la N-ter des histones pour que la fibre se déplie

41
Q

Que se passe-t-il lors du passage de la poly?

A

Les nucléosomes se dissocient partiellement: il y a dissociation partielle de H2A et H2B (tout se réassocie normalement en fin de transcription)

42
Q

Que permettent les séquences régulatrices?

A

le recrutement de facteurs de régulation de la transcription

43
Q

Quand la réplication des chromosomes s’opère-t-elle?

A

Phase S du cycle cellulaire

44
Q

Combien de temps la réplication des chromosomes prend-elle?

A

8 h

45
Q

Comment met-on en évidence les origines de réplication?

A

Avec de la THYMIDINE TRITIÉE , molécule qui s’incorpore spé dans l’ADN en cours de synthèse

46
Q

Quelle taille font les origines de réplication?

A

300 nt

47
Q

A quelle fréquence trouve-t-on les origines de réplication?

A

Toutes les 20 000 à 100 000 paires de bases

48
Q

De quelle manière les origines de réplication s’activent-elles?

A

pas toutes en même temps

49
Q

Qu’est-ce que l’unité de réplication?

A

20 à 80 origines de réplication s’activant en même temps. Il y a plusieurs unités de réplication sur un chr

50
Q

Que dire de la chronologie de réplication des chromosomes?

A

L’Euchromatine est répliquée avant l’hétérochromatine, en premier.
MNEMO : Ordre alphabétique : E before H