Trafic: FIN Flashcards
Quelles sont les protéines empruntant le trafic rétrograde pour rentrer au RE?
Prots résidentes s’étant échappées par trafic antérograde:
→ Prots memb portant le signal dilysine dans leur endodomaine
→ Prots luminales portant la séquence KDEL
Quelles vésicules se chargent du transport rétrograde?
Couvertes de COP I
Où se déroule le trafic rétrograde?
Prots collectées dès l’ERGIC et tout au long du Golgi, rapportées au RE
Comment le pH influence-t-il la séquence KDEL?
+ milieu acide, + KDEL a une affinité pour le récepteur. pH RE neutre, puis diminue de + en + jusqu’au Golgi acide. Donc association KDEL/récepteur dans le Golgi, et dissociation dans le RE
A quoi sert le système de reconnaissance KIN?
Limite la fuite des prots du RE par trafic antérograde sans gêner leur rôle, en les faisant s’agréger
Quelles sont les 2 voies de tri des glycoprots dans le Golgi/réseau transgolgien?
- Vers la MP via vésicules de sécrétion
- Vers endosomes tardifs, ce qui permet:
→ retour vers Golgi
→ Aller vers lysosomes
Quelles sont les deux voies de sécrétion ?
→ Sécrétion constitutive
→ Sécrétion contrôlée
Propriétés de la sécrétion constitutive?
- dans toutes les ç
- Voie par défaut
Que fournit la voie de sécrétion constitutive?
- Nvx composants MP
- Protéoglycannes + glycoprots de la MEC
Caractéristiques des vésicules de la voie de sécrétion constitutive?
- Bourgeonnent réseau Transgolgien
- COP I
- Leurs prots TM deviendront prots MP
- Leurs prots luminales vont aller dans la MEC
- leurs lipides vont dans la MP
Comment est la fusion des vésicules lors de la sécrétion constitutive?
- non contrôlée
- de façon continue, par défaut
Quelles sont les propriétés de la sécrétion contrôlée?
- Que dans les ç spécialisées (ex: prod enzymes digestives ou hormones)
- Sécrétion rapide de produits mis en réserve dans les vésicules de sécrétion contrôlée
Caractéristiques des vésicules de la voie de sécrétion contrôlée?
- Bourgeonnent de l’appareil de Golgi
- Manteau de clathrine
- Stockent les prots à sécréter
- Mises en attente sous la membrane
Comment se déroule la fusion de la vésicule de sécrétion contrôlée?
Provoquée par une voie de signalisation intraç: en réponse à un signal extraç de type hormone ou NT
A quoi sert le système de rétention dans l’appareil de golgi?
A empêcher les prots du réseau transgolgien de partir grâce au système KIN
Qu’est-ce que les radeaux lipidiques/rafts?
Micro-domaines riches en lipides: PL à chaîne hydrocaburée, sphingomyélines +++ et cholestérol +++. Dans ces rafts, il y a les prots avec un trop petit domaine TM
Comment la vésicule immature de la sécrétion contrôlée se forme-t-elle?
- Bourgeonnement du réseau transgolgien
- Couverte d’un manteau de clathrine discontinu
Que donne la maturation de la vésicule?
► une vésicule de recyclage: couverte de clathrine qu’elle va perdre pour fusionner avec le transgolgien, sans chargement
► Une vésicule mature: sans clathrine, + concentrée en chargement, + elle est chargée + le lumen s’acidifie
Comment visualise-t-on la clathrine?
Par un marquage grâce à des Ac avec de l’or colloïdal
Comment se passe la sécrétion de l’insuline?
- Glucose entre dans la ç via des GLUT2 → prod ATP
- Cascade d’évènements chiants → plein de Ca dans le cytosol
- Calcium → fusion des vésicules de sécrétion avec la MP
- vésicules de sécrétion contrôlée fusionnent en réponse à un signal extraç
A quoi servent les lysosomes?
Digestion intraç, dont dégradation prots à 1/2 vie longue (protéasome se charge de celles à 1/2 vie courte)
Qu’est-ce qu’un lysosome?
organite intraç avec 1 membrane simple
Quelle est la taille des lysosomes?
0.2-0.5 µm
Quel est le pH du lysosome?
Acide: 5 grâce à des pompes à protons (ATP)
Qu’est-ce que les hydrolases acides?
Enzymes lysosomales hydrolytiques:
- Fonctionnent à pH = 5
- dégradent molécules complexes
pourquoi le lumen des lysosomes est-il acide?
Ca protège la cellule: comme ça si les hydrolases se déversent dans le cytosol elles feront pas trop de dégâts
Pourquoi les prots de la membrane du lysosome sont-elles glycosylées?
pour protéger la membrane de l’acidité
Où les enzymes lysosomales sont-elles synthétisées?
- Traduites dans le cytosol et adressées au RE
- Portent un peptide d’adressage au RE clivé
- Leurs précurseurs sont glycosylées et transportées au Golgi
Comment le signal mannose-6-phosphate est-il attaché aux précurseurs d’enzymes lysosomales?
- Précurseurs portent un patch de signal
- Ce sont des AA reconnus par une GlucNac phosphotransférase
- Celle-ci ajoute un groupement P sur le C 6 du mannose terminal de l’oligosaccharide des précurseurs dans le cis-golgi
→ c’est le signal mannose-6-phosphate: (duh)
Que permet le signal mannose-6-phosphate?
Les glycoprots luminales portant le signal mannose-6-phosphate échappent au remodelage des glycoprots dans le golgi
Caractéristiques du récepteur au mannose-6-phosphate?
- Prot TM:
→ dans le réseau trans-golgien
→ exodomaine reconnaît le signal mannose-6-phosphate
→ endodomaine interagit avec les adaptines pour recruter un manteau de clathrine
Comment est la vésicule apportant les enzymes lysosomales?
- recouverte d’un manteau de clathrine à son bourgeonnement
- qu’elle perd à sa fusion avec l’endosome tardif
Quel est le pH de l’endosome tardif?
6 (+ acide que dans le golgi)
Comment le pH plus acide de l’endosome tardif va-t-il amener l’enzyme lysosomale à maturation?
- récepteur mannose-6-phosphate se dissocie de son ligand
2. enzyme perd le phosphate, devenant ainsi mature
(Sorry it’s a long one) Expliquer la voie de sécrétion/recapture des enzymes lysosomales?
- E.L. échappent au tri dans le réseau trans-golgien:
1. Sécrétion constitutive les apporte à la MP: - Dans la MEC: E.L. pas actives car pH = 7
- Il y a des récepteurs mannose-6-phosphate dans la MP
2. Recapture: - Reconnaissance par les récepteurs mannose-6-phosphate
- Vésicule avec clathrine bourgeonne
- Fusion de cette vés. avec un endosome précoce
- Qui fusionne avec un endosome tardif: pH acide → sépration E.L. et récepteur et rejoignent les autres E.L.
Caractéristiques des maladies de surcharge lysosomale?
- causées par l’accumulation de substrats non digérés par les lysosomes
- Génétiques, souvent héréditaires
- Affections pathologiques sévères ++ (mort cellulaire, organes-clefs touchés: foie, SNC…)
A quoi sont causées les maladies de la surcharge lysosomale?
Mutation touchant soit:
- Gène codant une E.L. : accumulation d’un seul substrat
- Gène codant la GLCNAC phosphotransférase : aucune enzyme ne sera adressée au lysosome
Quelles stratégies thérapeutiques peut-on adopter pour traiter les maladies de surcharge lysosomale?
- Traitement symptomatique
- Thérapie génique + transplantation de moelle osseuse
- Enzymologie substitutive
- Uilisation mol. chaperonnes
Qu’est-ce que l’hétérophagie?
= Nutrition de la cellule à partir de matériaux extérieurs. 2 types:
- Fonction de phagocytose
- Fonction d’endocytose
Qu’est-ce que la fonction de phagocytose?
- Chez des ç spé pour se débarasser de ç sénescentes/micro-org
- Englober le truc à dégrader dans le phagosome
- Qui fusionne avec l’endosome tardif, qui fusionne avec le lysosome
Qu’est-ce que la fonction d’endocytose?
Permet l’ingestion de macromolécules solubles extraç via des vésicules → endosome précoce → acidification → endosome tardif → lysosome
Quand la fonction d’autophagie est-elle utilisée?
Pour éliminer des organes sénescents
Comment se produit la fonction d’autophagie?
- Organite entouré d’une lame venant du RE ou du Golgi, ce qui donne un autophagosome à 2 membranes
- Autophagosome fusionne avec le lysosome:
- Memb externe fusionne avec la membrane du lysosome
- E.L. dégradent la membrane internepuis l’organite
Caractéristiques de l’adressage direct?
Dédié à la dégradation des prots cytosoliques portant un signal d’adressage direct et via un canal membranaire lysosomal, donc sans passer par le trafic vési
Qu’est-ce que l’endocytose? (déf)
Phénomène par lequel la MP s’invagine et forme une vésicule qui englobe du milieu EC
Caractéristiques des vésicules d’endocytose?
- Côté cytosolique recouvert de clathrine
- Aspect en nid d’abeille
Pourquoi l’endocytose est-elle aussi efficace?
Car des récepteurs membranaires reconnaissent la macromolécule à endocyter
Comment se passe la reconnaissance des macromolécules à endocyter?
- Exodomaine reconnaît la molécule extraç
- Endodomaine porte une séquence de reconnaissance avec des adaptines NPXY
- Adaptines recrutent le manteau de clathrine
→ don pas interaction récepteur-manteau
Quelle est la structure de la clathrine?
3 chaînes lourdes + 3 chaînes légères
Assemblage en triskélion observable au MET
Comment les triskélions de clathrine s’assemblent-ils?
De façon spontanée: réseau convexe en forme de panier, recouvrent la face cytosolique de la vésicule
Quelle partie de la clathrine interagit avec les adaptines?
L’extrémité N-terminale des chaînes lourdes des triskélions de clathrine
Que nécessite le désassemblage du manteau de clathrine?
- ATP
- Prots chaperonnes dont hsp 70
- Prot auxiliaire: l’auxiline
Comment la vésicule d’endocytose des LDL se forme-t-elle?
Le récepteur LDL reconnaît la LDL, puis recrute les adaptines, ce qui peremt la formation de la vésicule qui va ensuite perdre son manteau
Comment le récepteur LDL se sépare-t-il de la LDL?
Au contact du pH légèrement acide de l’endosome précoce. Celui-ci va ensuite se transformer en corps multivésiculaires. Réecepteur sera recyclé
Ciomment les LDL seront-ils dégradés?
Dans l’endosome tardif, par les hydrolases acides (-)
Quelle est la cause de l’hypercholestérolémie familiale?
Mutation du gène du récepteur-LDL dans la séquence NPXY de reconnaissance des adaptines
Quelles sont les séquences de la mutation à l’origine de l’hypercholestérolémie familiale?
Récepteur muté peut plus recruter d’adaptines:
- ç peuvent plus endocyter les LDL
- Accumulation des LDL en extraç et dans la paroi artérielle
Quels sont les devenirs possibles des ligands et récepteurs lors de l’endocytose?
- Récepteur recyclé à la membrane (ex: LDL, transferrine)
- Récepteuremporté avec le ligand et dégradé dans le lysosome (ex: EGF)
- transcytose : Récepteur et ligand endocytés à partir d’une membrane et transférés à la membrane opposée
Que sont les cavéoles?
Un autre système d’endocytose
Quelles sont les caractériqtiques de la MP des cavéoles?
Proche des radeaux lipidiques:
- AG à chaîne saturée longue
- Sphingomyéline et cholestérol
- Prots à ancrage GPI
Quelle est la forme des cavéoles?
Moins sphériques que pour la clathrine
Caractéristiques du manteau des cavéoles?
- Pas observable au MET car pas dense aux électrons
- Observable au ME à balayage après cryofracture, forme en pelote de laine
- Formé grâce aux cavéolines
Quelles sont les caractéristiques de la cavéoline?
- Boucle en épingle à cheveux s’intégrant dans le feuillet P de la membrane de la cavéole :
- N et C terminales restent cytosoliques
- Pas de boucle extraç
- En dimères
2 caractéristiques des cavéoles?
- Constituent la voie d’entrée de nombreux virus
- Contiennent récepteurs de signalisation +++
Où trouve-t-on les peroxysomes?
Dans toutes les cellules
Le peroxysome a-t-il une membrane?
Oui
Avec quoi peut-on observer les peroxysomes?
MET
A quoi servent les peroxysomes?
- Utilisation de l’oxygène pour détoxifier la cellule de composants potentiellement dangereux
- 1ère étape de synthèse des plasmogènes (PL)
Quelles protéines peuvent être adressées au péroxysome?
Enzymes péroxysomales:
- Synthétisées cytosol
- Séquence signal d’adressage en C-ter:
- PTS-1
- les AA sér-lyc-leuc
Qu’est-ce que la catalase?
- Enzyme péroxysomale
- Apocatalases + Fer d’un noyau hème = catalase (complexe oligomérique)
- adressée au péroxysome sous cette forme oligomérique
Comment les enzymes vont-elles entrer dans le péroxysome?
Translocation post-traductionnelle à travers la membrane du P
Comment la translocation dans le peroxysome va-t-elle commencer?
- PTS-1 reconnue par une péroxine cytosolique
- Elle-même reconnue par ue péroxine membranaire
- Laquelle joue le rôle de récepteur membranaire et fait partir du translocon
Pour passer le translocateur dans le péroxysome, les protéines doivent-elles être dépliées?
Non
Que nécessite le passage dans le péroxysome?
ATP
Comment le renouvellement de la membrane des péroxysomes est-il assuré?
Vésicules en provenance du RE apportent de la membrane au péroxysome