Le Noyau Pt. I Flashcards
Quels sont les deux types de génome?
- Mitochondrial : 1%
- Nucléaire : 99%
Quels ARN existe-t-il?
Ribosomal, de transfert, messager (seuls mentionnés ici)
Combien de gènes existe-t-il dans les deux génomes?
- Mitochondrial: 37 gènes
- Nucléaire : 25 000 - 30 000
Pourcentages du génome nucléaire des différents types de gènes?
A) ADN non transcrit = 42% - Séquences répétitives = 34% - Séquences peu répétitives = 8% B) Séquences transcrites = 58% - ADN codant (exons) = 1,5 % - ADN non codant = 56,5 %
Caractéristiques de l’ADN non codant?
- transcrit mais non traduit en prots
- 56, 5 % du génome
- 30% introns
- 3% ARNr et ARNt
- Pseudo gènes, fragments de gènes
Combien de chromosomes avont-nous?
23 paires = 46
Taille du génome nucléaire?
6.4 Md de nt
Taille des chromosomes?
- 50/250 M de nt
- ADN d’1 chr étalé = 1.7 à 8.5 cm
- ADN total de tous les chr humains = 2m
Volume du noyau et volume occupé par l’ADN?
Dans un lymphocyte: noyau = 5 µm^3
ADN = 1,9 µm^3 (moins de la moitié)
Qu’est-ce que la chromatine?
ADN associé à des prots (systématiquement dans le noyau)
Quand peut-on observer le noyau?
seulement en interphase
Quelle est la propriété du noyau interphasique?
Seulement chez les eucaryotes
Caractéristiques de la membrane nucléaire?
- délimite le noyau (duh)
- 2 membranes : interne + externe (couverte de ribosomes, continuité avec le RE)
- Interrompue par des pores nucléaires pour le trafic
Qu’est-ce que l’espace périnucléaire?
L’espace entre les 2 membranes du noyau
Qu’est-ce que le nucléoplasme?
Solution/Gel dans lequel la chromatine baigne à l’intérieur du noyau
Quelles sont les deux formes de la chromatine dans le noyau?
- Hétérochromatine : condensée ++, dense aux électrons et à la périphérie du noyau
- Euchromatine : Peu condensée, peu dense aux électrons et au centre du noyau
Qu’est-ce que le nucléole?
Zone du noyau dense aux électrons MAIS pas constitué d’hétérochromatine, fixe davantage les colorants
De quoi la lamina est-elle formée et comment?
- Formée par la polymérisation des lamines, des filaments intermédiaires du noyau
- formés en réseau de dimères sous la membrane interne
- Permet la formation du noyau en interphase
Que permettent les chromosomes?
- transcription des gènes
- Réplication de l’info génétique
- Séparation de l’ADN
Quelles sont les formes des chromosomes au cours du cycle cellulaire?
- Interphase : chr accessibles pour la transcription et réplication de l’ADN
- Phase M : chr se condensent +++ pour former les chr mitotiques
Quelles sont les 3 séquences qu’un chromosome doit contenir pour être fonctionnel?
- Des origines de réplication
- Un centromère
- 2 télomères
Qu’est-ce que les origines de réplication?
Séquences d’ADN permettant d’initier la réplication, toutes les 100 000 paires de bases
Qu’est-ce que le centromère?
Séquence sur laquelle s’accroche le fuseau mitotique, à peu près au centre du chr
Que sont les télomères?
Il y en a un à chaque extrémité du chromosome: protègent les extrémités des chr et permettent de vérifier que la réplication s’est faite complètement
Qu’est-ce que la fibre nucléosomique?
1er niveau de compaction de la chromatine dans la ç eucaryote
A quoi ressemble la fibre nucléosomique au MET?
Collier de perles, avec le fil = double hélice d’ADN et les perles = nucléosomes
Quelle taille fait le noyau du nucléosome?
11 nm de diamètre, 1 nucléosome = entouré par 147 paires de bases
Combien d’histones y a-t-il dans un nucléosome ?
8, formant un octamère
Quels sont les différents types d’histones?
4, chacun par paires: H2A, H2B, H3 et H4
Combien d’histones y a-t-il pour 1 ç diploïde?
60 M (en poids, à peu près autant d’ADN que d’histones)
Quelle est la taille des histones nucléosomiques?
102 à 135 AA
Quelle est la fréquence des nucléosomes le long de l’ADN?
Toutes les 200 paires de bases le long du double-brin
Quel est le niveau de compaction de la fibre nucléosomique?
Longueur : de 5 cm à 2 cm
Épaisseur: de 2nm à 11nm
Qu’est-ce que la fibre chromatinienne?
2ème niveau de compaction de la chromatine dans la ç eucaryote
Qu’est-ce qui permet la compaction en fibre chromatinienne?
Les histones H1
Quelle est la taille des histones H1?
220 AA
Quel est le facteur de compaction de la fibre chromatinienne?
Longueur : de 3 cm à 1,2 mm
Épaisseur : de 11 nm à 30 nm
Sous quelle forme la chromatine peut-elle être transcrite/répliquée ?
En fibre nucléosomique, PAS chromatinienne
Que sont les deux complexes de remodelage de la chromatine et que font-ils?
A : Relâchement de l’interaction ADN - Histones
B : Renforcement de l’interaction ADN - Histones (après la transcription
Comment y a-t-il interaction entre les histones et l’ADN ?
- N-ter des histones: (+) car riche en lysines basiques
- interagit avec la double-hélice d’ADN (-)
Que permet l’acétylation des histones?
Relâche l’interaction entre la double hélice et les histones, ce qui permet la transcription/réplication
Qui se charge de l’acétylation des histones?
Les enzymes HAT (Histone Acétyl Transférase) : greffent des résidus acétyles lysines sur la N-ter des histones, ce qui annule les charges (+) des histones
Que va faire la désacétylation des histones?
Renforcent l’interaction ADN-histones
Qui fait la désacétylation des histones?
Les enzymes HDAC, qui désacétylent les lysines de la N-ter des histones, ce qui leur rend leurs charges (+)
Qui fait la phosphorylation/déphosphorylation?
Phosphorylation : Kinases
Déphosphorylation : phosphatases
Que permet la phosphorylation de l’histone H1?
Permet de passer de la fibre nucléosomique à chromatinienne
Que permet la déphosphorylation de l’histone H1?
passer de chromatinienne à nucléosomique
Que sont les séquences MAR?
Séquences d’ADN à la base des boucles de fibre chromatinienne, il n’y a pas de gènes et la chromatine y est toujours très condensée en hétérochromatine
Quel est le facteur de compaction pour la compaction en boucles?
Longueur: de 1,2 mm à 100µm
Épaisseur/Diamètre: de 30 nm à 300 nm
L’hétérochromatine a-t-elle une activité transcriptionnelle?
Non
Quelle est la proportion d’hétéro et d’euro chromatine en interphase?
90% d’eurochomatine, 10% d’hétérochromatine
De quoi se compose l’hétérochromatine?
- d’hétérochromatine constitutive: télomères et centromères
- d’hétérochromatine facultative: gènes non transcrits selon le type cellulaire
Où trouve-t-on généralement les gènes?
Aux boucles de fibre chromatinienne, pas à la base
Les deux membranes de l’enveloppe nucléaire sont-elles en continuité?
Oui
Qu’est-ce qu’un pore nucléaire?
Complexe de 15 protéines
De quoi se compose la bicouche lipidique de l’enveloppe nucléaire?
30% lipides (90% PL)
70% protéines
Quelles protéines présente la membrane interne de l’enveloppe nucléaire?
- Des récepteurs qui fixent des dimères de lamine
- Des sites de fixation de la chromatine
Quelles protéines présente la membrane externe de l’enveloppe nucléaire?
Des protéines d’attachement des ribosomes
De quoi se compose la lamina?
Dimères de lamine (filaments intermédiaires) organisés en réseau
A quoi sert la lamina?
Stabiliser l’enveloppe nucléaire
Qu’est-ce qui permet aux dimères de lamine de s’attacher à la membrane interne?
Les récepteurs à lamine B
Que sont les protéines d’attachement aux lamines et que permettent-elles?
- LAP1 et LAP2
- Stabilisent les dimères de lamine en lamina
Comment peut-on observer la lamina?
Seulement au ME à balayage après cryofracture
Quelle est l’épaisseur de la lamina?
30-100 nm
Comment la lamina évolue-t-elle au cours du cycle cellulaire?
- Début de mitose : dépolymérisation par phosphorylation grâce à une kinase → déstructuration de l’enveloppe nucléaire
- Fin de mitose: déphosphorylation par une phosphatase: la lamina retrouve sa structure and so does l’enveloppe nucléaire
Le nucléole est-il un organite?
NON (pas de membrane)
Comment peut-on observer le nucléole?
- MO car colorable facilement
- ME car dense aux électrons
Bref c’est un gentil
De quoi se compose le nucléole?
- ARN et prots le rendant dense aux électrons
- ADN maaaais de l’EUROCHROMATINE SEULEMENT (-)
Quelles sont les différentes fonctions du nucléole?
- Zone de transcription active: transcription des ARNr
- Maturation des ARNr
- Formation de la grande et de la petite SU ribosomales
Quelle est la taille du nucléole?
1 à 7 µm
De quoi dépend la taille du nucléole?
- En fonction de l’activité traductionnelle de la ç
- +++ dans une ç en croissance puisqu’elle doit produire beaucoup de prots
Quels sont les différents constituants du nucléole en observation microscopique?
- Composants fibrillaires dense: coloré +++, en croissant, zones de transcription des gènes des ARNr
- Centres fibrillaires: + clairs, au centre d’un composant fibrillaire dense, zone où y a que de l’ADN → pas de transcription
- Composants granulaires: Partout, faits de particules ribosomiques = précurseurs des ribosomes en cours de maturation
Structure d’un organisateur nucléolaire?
10 boucles d’ADN appartenant aux chromosomes homologues 13, 14, 15, 21 et 22
Combien d’organisateurs nucléolaires y a-t-il dans le nucléole?
10
Que contiennent les organisateurs nucléolaires?
Chacun 20 copies du gène de l’ARNr précurseur 45S→ 200 copies en tout dans le nucléole
Que permet la duplication du gène de l’ARNr 45S?
On a besoin de produire des tonnes d’ARNr, or avec seulement 2 copies de ce gène ça irait trop lentement, donc on duplique le gène pour accélérer la production d’ARNr
Qui transcrit le gène en ARNr 45S?
L’ADN polymérase I
Quels ARNr l’ARNr précurseur 45S donne-t-il?
Après moult modifications:
- 18S pour la petite SU ribosomale
- 5,8S et 28S pour la grande SU ribosomale
Qu’est-ce qu’il a de spécial, l’ARNr 5S?
SEUL ARNr pas synthétisé dans le nucléole mais dans le noyau, par la poly III. Appartient à la grande SU ribosomale
Comment les SU ribosomales sont-elles formées?
Maturées dans le nucléole, passent par les pores nucléaires et se réunissent dans le cytosol pour faire leur job
Combien de temps faut-il pour produire et transporter la petite SU ribosomale? Et la grande?
Petite : 1/2 h
Grande: 1h
En quelle proportion les petite et grand SU ribosomales sont-elles produites?
En mêmes qttés
Comment appelle-t-on les prots impliquées dans la maturation des ARNr?
Les nucléolines
Quand peut-on observer le nucléole?
Seulement pendant l’interphase (se désagrège pendant la mitose)
Que fait le nucléole en prophase?
Il se désagrège: il y a une dispersion des composants fibrillaires denses et des composants granulaires
Comment le nucléole se reforme-t-il en fin de mitose?
10 corps prénucléolaires apparaissent, futurs corps nucléolaires. Se réunissent pour former le nucléole
