Le Noyau Pt. I Flashcards

1
Q

Quels sont les deux types de génome?

A
  • Mitochondrial : 1%

- Nucléaire : 99%

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Q

Quels ARN existe-t-il?

A

Ribosomal, de transfert, messager (seuls mentionnés ici)

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3
Q

Combien de gènes existe-t-il dans les deux génomes?

A
  • Mitochondrial: 37 gènes

- Nucléaire : 25 000 - 30 000

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4
Q

Pourcentages du génome nucléaire des différents types de gènes?

A
A) ADN non transcrit = 42%
- Séquences répétitives = 34%
- Séquences peu répétitives = 8%
B) Séquences transcrites = 58%
- ADN codant (exons) = 1,5 %
- ADN non codant = 56,5 %
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5
Q

Caractéristiques de l’ADN non codant?

A
  • transcrit mais non traduit en prots
  • 56, 5 % du génome
  • 30% introns
  • 3% ARNr et ARNt
  • Pseudo gènes, fragments de gènes
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6
Q

Combien de chromosomes avont-nous?

A

23 paires = 46

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7
Q

Taille du génome nucléaire?

A

6.4 Md de nt

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8
Q

Taille des chromosomes?

A
  • 50/250 M de nt
  • ADN d’1 chr étalé = 1.7 à 8.5 cm
  • ADN total de tous les chr humains = 2m
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9
Q

Volume du noyau et volume occupé par l’ADN?

A

Dans un lymphocyte: noyau = 5 µm^3

ADN = 1,9 µm^3 (moins de la moitié)

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10
Q

Qu’est-ce que la chromatine?

A

ADN associé à des prots (systématiquement dans le noyau)

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11
Q

Quand peut-on observer le noyau?

A

seulement en interphase

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12
Q

Quelle est la propriété du noyau interphasique?

A

Seulement chez les eucaryotes

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13
Q

Caractéristiques de la membrane nucléaire?

A
  • délimite le noyau (duh)
  • 2 membranes : interne + externe (couverte de ribosomes, continuité avec le RE)
  • Interrompue par des pores nucléaires pour le trafic
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14
Q

Qu’est-ce que l’espace périnucléaire?

A

L’espace entre les 2 membranes du noyau

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15
Q

Qu’est-ce que le nucléoplasme?

A

Solution/Gel dans lequel la chromatine baigne à l’intérieur du noyau

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16
Q

Quelles sont les deux formes de la chromatine dans le noyau?

A
  • Hétérochromatine : condensée ++, dense aux électrons et à la périphérie du noyau
  • Euchromatine : Peu condensée, peu dense aux électrons et au centre du noyau
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17
Q

Qu’est-ce que le nucléole?

A

Zone du noyau dense aux électrons MAIS pas constitué d’hétérochromatine, fixe davantage les colorants

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18
Q

De quoi la lamina est-elle formée et comment?

A
  • Formée par la polymérisation des lamines, des filaments intermédiaires du noyau
  • formés en réseau de dimères sous la membrane interne
  • Permet la formation du noyau en interphase
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19
Q

Que permettent les chromosomes?

A
  • transcription des gènes
  • Réplication de l’info génétique
  • Séparation de l’ADN
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20
Q

Quelles sont les formes des chromosomes au cours du cycle cellulaire?

A
  • Interphase : chr accessibles pour la transcription et réplication de l’ADN
  • Phase M : chr se condensent +++ pour former les chr mitotiques
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21
Q

Quelles sont les 3 séquences qu’un chromosome doit contenir pour être fonctionnel?

A
  • Des origines de réplication
  • Un centromère
  • 2 télomères
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22
Q

Qu’est-ce que les origines de réplication?

A

Séquences d’ADN permettant d’initier la réplication, toutes les 100 000 paires de bases

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23
Q

Qu’est-ce que le centromère?

A

Séquence sur laquelle s’accroche le fuseau mitotique, à peu près au centre du chr

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24
Q

Que sont les télomères?

A

Il y en a un à chaque extrémité du chromosome: protègent les extrémités des chr et permettent de vérifier que la réplication s’est faite complètement

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25
Q

Qu’est-ce que la fibre nucléosomique?

A

1er niveau de compaction de la chromatine dans la ç eucaryote

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26
Q

A quoi ressemble la fibre nucléosomique au MET?

A

Collier de perles, avec le fil = double hélice d’ADN et les perles = nucléosomes

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27
Q

Quelle taille fait le noyau du nucléosome?

A

11 nm de diamètre, 1 nucléosome = entouré par 147 paires de bases

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28
Q

Combien d’histones y a-t-il dans un nucléosome ?

A

8, formant un octamère

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29
Q

Quels sont les différents types d’histones?

A

4, chacun par paires: H2A, H2B, H3 et H4

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30
Q

Combien d’histones y a-t-il pour 1 ç diploïde?

A

60 M (en poids, à peu près autant d’ADN que d’histones)

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31
Q

Quelle est la taille des histones nucléosomiques?

A

102 à 135 AA

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32
Q

Quelle est la fréquence des nucléosomes le long de l’ADN?

A

Toutes les 200 paires de bases le long du double-brin

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33
Q

Quel est le niveau de compaction de la fibre nucléosomique?

A

Longueur : de 5 cm à 2 cm

Épaisseur: de 2nm à 11nm

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34
Q

Qu’est-ce que la fibre chromatinienne?

A

2ème niveau de compaction de la chromatine dans la ç eucaryote

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35
Q

Qu’est-ce qui permet la compaction en fibre chromatinienne?

A

Les histones H1

36
Q

Quelle est la taille des histones H1?

A

220 AA

37
Q

Quel est le facteur de compaction de la fibre chromatinienne?

A

Longueur : de 3 cm à 1,2 mm

Épaisseur : de 11 nm à 30 nm

38
Q

Sous quelle forme la chromatine peut-elle être transcrite/répliquée ?

A

En fibre nucléosomique, PAS chromatinienne

39
Q

Que sont les deux complexes de remodelage de la chromatine et que font-ils?

A

A : Relâchement de l’interaction ADN - Histones

B : Renforcement de l’interaction ADN - Histones (après la transcription

40
Q

Comment y a-t-il interaction entre les histones et l’ADN ?

A
  • N-ter des histones: (+) car riche en lysines basiques

- interagit avec la double-hélice d’ADN (-)

41
Q

Que permet l’acétylation des histones?

A

Relâche l’interaction entre la double hélice et les histones, ce qui permet la transcription/réplication

42
Q

Qui se charge de l’acétylation des histones?

A

Les enzymes HAT (Histone Acétyl Transférase) : greffent des résidus acétyles lysines sur la N-ter des histones, ce qui annule les charges (+) des histones

43
Q

Que va faire la désacétylation des histones?

A

Renforcent l’interaction ADN-histones

44
Q

Qui fait la désacétylation des histones?

A

Les enzymes HDAC, qui désacétylent les lysines de la N-ter des histones, ce qui leur rend leurs charges (+)

45
Q

Qui fait la phosphorylation/déphosphorylation?

A

Phosphorylation : Kinases

Déphosphorylation : phosphatases

46
Q

Que permet la phosphorylation de l’histone H1?

A

Permet de passer de la fibre nucléosomique à chromatinienne

47
Q

Que permet la déphosphorylation de l’histone H1?

A

passer de chromatinienne à nucléosomique

48
Q

Que sont les séquences MAR?

A

Séquences d’ADN à la base des boucles de fibre chromatinienne, il n’y a pas de gènes et la chromatine y est toujours très condensée en hétérochromatine

49
Q

Quel est le facteur de compaction pour la compaction en boucles?

A

Longueur: de 1,2 mm à 100µm

Épaisseur/Diamètre: de 30 nm à 300 nm

50
Q

L’hétérochromatine a-t-elle une activité transcriptionnelle?

A

Non

51
Q

Quelle est la proportion d’hétéro et d’euro chromatine en interphase?

A

90% d’eurochomatine, 10% d’hétérochromatine

52
Q

De quoi se compose l’hétérochromatine?

A
  • d’hétérochromatine constitutive: télomères et centromères

- d’hétérochromatine facultative: gènes non transcrits selon le type cellulaire

53
Q

Où trouve-t-on généralement les gènes?

A

Aux boucles de fibre chromatinienne, pas à la base

54
Q

Les deux membranes de l’enveloppe nucléaire sont-elles en continuité?

A

Oui

55
Q

Qu’est-ce qu’un pore nucléaire?

A

Complexe de 15 protéines

56
Q

De quoi se compose la bicouche lipidique de l’enveloppe nucléaire?

A

30% lipides (90% PL)

70% protéines

57
Q

Quelles protéines présente la membrane interne de l’enveloppe nucléaire?

A
  • Des récepteurs qui fixent des dimères de lamine

- Des sites de fixation de la chromatine

58
Q

Quelles protéines présente la membrane externe de l’enveloppe nucléaire?

A

Des protéines d’attachement des ribosomes

59
Q

De quoi se compose la lamina?

A

Dimères de lamine (filaments intermédiaires) organisés en réseau

60
Q

A quoi sert la lamina?

A

Stabiliser l’enveloppe nucléaire

61
Q

Qu’est-ce qui permet aux dimères de lamine de s’attacher à la membrane interne?

A

Les récepteurs à lamine B

62
Q

Que sont les protéines d’attachement aux lamines et que permettent-elles?

A
  • LAP1 et LAP2

- Stabilisent les dimères de lamine en lamina

63
Q

Comment peut-on observer la lamina?

A

Seulement au ME à balayage après cryofracture

64
Q

Quelle est l’épaisseur de la lamina?

A

30-100 nm

65
Q

Comment la lamina évolue-t-elle au cours du cycle cellulaire?

A
  • Début de mitose : dépolymérisation par phosphorylation grâce à une kinase → déstructuration de l’enveloppe nucléaire
  • Fin de mitose: déphosphorylation par une phosphatase: la lamina retrouve sa structure and so does l’enveloppe nucléaire
66
Q

Le nucléole est-il un organite?

A

NON (pas de membrane)

67
Q

Comment peut-on observer le nucléole?

A
  • MO car colorable facilement
  • ME car dense aux électrons
    Bref c’est un gentil
68
Q

De quoi se compose le nucléole?

A
  • ARN et prots le rendant dense aux électrons

- ADN maaaais de l’EUROCHROMATINE SEULEMENT (-)

69
Q

Quelles sont les différentes fonctions du nucléole?

A
  • Zone de transcription active: transcription des ARNr
  • Maturation des ARNr
  • Formation de la grande et de la petite SU ribosomales
70
Q

Quelle est la taille du nucléole?

A

1 à 7 µm

71
Q

De quoi dépend la taille du nucléole?

A
  • En fonction de l’activité traductionnelle de la ç

- +++ dans une ç en croissance puisqu’elle doit produire beaucoup de prots

72
Q

Quels sont les différents constituants du nucléole en observation microscopique?

A
  1. Composants fibrillaires dense: coloré +++, en croissant, zones de transcription des gènes des ARNr
  2. Centres fibrillaires: + clairs, au centre d’un composant fibrillaire dense, zone où y a que de l’ADN → pas de transcription
  3. Composants granulaires: Partout, faits de particules ribosomiques = précurseurs des ribosomes en cours de maturation
73
Q

Structure d’un organisateur nucléolaire?

A

10 boucles d’ADN appartenant aux chromosomes homologues 13, 14, 15, 21 et 22

74
Q

Combien d’organisateurs nucléolaires y a-t-il dans le nucléole?

A

10

75
Q

Que contiennent les organisateurs nucléolaires?

A

Chacun 20 copies du gène de l’ARNr précurseur 45S→ 200 copies en tout dans le nucléole

76
Q

Que permet la duplication du gène de l’ARNr 45S?

A

On a besoin de produire des tonnes d’ARNr, or avec seulement 2 copies de ce gène ça irait trop lentement, donc on duplique le gène pour accélérer la production d’ARNr

77
Q

Qui transcrit le gène en ARNr 45S?

A

L’ADN polymérase I

78
Q

Quels ARNr l’ARNr précurseur 45S donne-t-il?

A

Après moult modifications:

  • 18S pour la petite SU ribosomale
  • 5,8S et 28S pour la grande SU ribosomale
79
Q

Qu’est-ce qu’il a de spécial, l’ARNr 5S?

A

SEUL ARNr pas synthétisé dans le nucléole mais dans le noyau, par la poly III. Appartient à la grande SU ribosomale

80
Q

Comment les SU ribosomales sont-elles formées?

A

Maturées dans le nucléole, passent par les pores nucléaires et se réunissent dans le cytosol pour faire leur job

81
Q

Combien de temps faut-il pour produire et transporter la petite SU ribosomale? Et la grande?

A

Petite : 1/2 h

Grande: 1h

82
Q

En quelle proportion les petite et grand SU ribosomales sont-elles produites?

A

En mêmes qttés

83
Q

Comment appelle-t-on les prots impliquées dans la maturation des ARNr?

A

Les nucléolines

84
Q

Quand peut-on observer le nucléole?

A

Seulement pendant l’interphase (se désagrège pendant la mitose)

85
Q

Que fait le nucléole en prophase?

A

Il se désagrège: il y a une dispersion des composants fibrillaires denses et des composants granulaires

86
Q

Comment le nucléole se reforme-t-il en fin de mitose?

A

10 corps prénucléolaires apparaissent, futurs corps nucléolaires. Se réunissent pour former le nucléole