T12- Consanguinidade e genética de populações

Question 1

CONSAGUINIDADE

Answer 1

casal consanguíneo
- com pelo menos um ascendente em comum

consequências
- possibilidade herdar alelos identicos
- + prob descendentes manif doencas (recessivas e multifatoriais) e risco doenca mais greve por homozigotia (dominantes)

Question 2

conceitos

Answer 2

tronco
- pessoa do qual procedem todos os consanguíneos

linha
- série de pessoas unidas por consanguinidade

Question 3

coeficientes

Answer 3

de consanguinidade (r)
- proporção de alelos idênticos entre dois indiv por terem sido herdados de ascendentes comuns
- prob de partilharem um determinado alelo
- em gémeos monozigóticos = 1 (partilham mm genoma)

coeficiente de endocruzamento (f)
- Proporção de loci em homozigotia nos descendentes de um casal
consanguíneo resultante da consanguinidade dos progenitores

Question 4

formulas
(pag 95 sebenta, ver exemplos com contas resolvidas)

Answer 4

R
- 1/2 : probabilidade transmitir um ou outro alelo do mm locus
- n: n transferencias do progenitor comum ate cada um dos desecentes
- somar contribuicao de cada progenitor comum (se forem meios irmaos, pai unico em comum, nao se soma mais nenhuma contribuicao)

F
- metade de r

exemplos:
pag 95 e 96 e slides 7-10

Question 5

graus

Answer 5

1
- pais/filhos e irmaos : (r) 1/2

2
- tios/sobrinhos, meios irmaos e avos netos : (r) 1/4

3
- primos em 1 grau:(r) 1/8

importancia
- síndromas tumorais hereditarias de transmissao dominante , um dos criterios p identificação do portador consiste no grau de parentesco com o fmailiar afetado

Question 6

Risco de anomalias na descendência

Answer 6

p primos em 1 grau (r=1/8)
- 6% (dobro do verificado em casais nao consaguineos)

p r=1/4
- 5 a 10

p r=1/2 (incesto)
- 50%
- defice intelectual frequente

Question 7

%

Answer 7

• > 85% europeus portadores de 1.3 variantes p uma doenca recessiva grave e 2.2 variantes de doencas recessivas no geral
• 0.8 a 1% casais com risco de descendente com doenca AR grave
• n esperado criancas afetadas por cada 100k nascimentos aumenta imenso de um casal normal p descendentes de primos em 1 grau ( doencas com maior aumento: défice intelectual e doencas do esqueleto)

Question 8

aconselhamento genetico
(casal consaguineo)

Answer 8

doencas conhecidas na familia
- se mongenicas calculo especifico
- se multifatoriais, tabelas de risco empirico

sem antecedentes
- r=1/32 como referencia (se maior, risco especifico, se menor, risco igual ao da populacao)
- quando r>1/32. avaliação pré concecional do risco de doencas recessivas (painel ou exoma p indetificacao de heterozigotia do casal p variantes patogenicas ou provavelmente patogenicas nos mm genes)
- p malformacoes congenitas de etiologia multifatorial realizamos vigilância normal da gravidez

Question 9

diversidade genetica entre populacoes

Answer 9

indicacao p rastreios e pesuisa de variantes especificas varia com incidência da doenca nas populacoes

Question 10

frequência de casamentos consanguíneos

Answer 10

• 1/7 da populacao vive em paises com %20 a mais de 50% unioes consaguineas

Question 11

painel de NGS p identificar heterozigotos p genes de doencas autossómicas recessivas graves

Answer 11

• casais normais e consaguineos
• dpn
  -dadores de gametas
  (…)

Question 12

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GENETICA DE POPULACOES

Answer 12

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- estudo das freq alelicas e genotipicas nas populacoes

Question 13

pe, populacao com locus com alelos A e a com frequencia p e q onde p+q=1
(slide 28)

Answer 13

genotipos…
AA p ao quadrado (homo normais)
aa q ao quadrado (homo mutados)
Aa pq vezes dois (hetero)

Question 14

população em equilíbrio de HARDY-WEINBERG

Answer 14

-p (quadrado) + q (quadrado) +2pq = 1
(se freq alelicas nao se alt, proporcoes entre freq dos genotipos mantem ao logo de geracoes)
- a partir do fenotipo e respetivo genotipo podemos infererir freq alelica

fatores q perturbam o quilibrio
- PANMIXIA: cruzamento seletivo
- neomutacoes
- selecao ambiental (pode levar melhor ou pior sobrevivencia de um genotipo, vantagem p os hetero)
- pequena dimensao da populacao
- fenomenos migatorios (fluxo genetico)
- CONSAGUINIDADE
a) aumenta freq de homos AA (p ao qiuadrado+Fpq) e aa (q quadrado +Fpq)
b) dim freq de hetero (2pq-2Fpq)
(*F = coeficiente de endocruzamento)

Question 15

porque nao desaparecem das populacoes as variantes patogenicas associadas a doencas recessivas

Answer 15

• selecao do meio
• vantagem sobrevivencia dos hetero
• ex da malaria onde hetero vantagem comparado homo normal logo regioes com malaria com maior freq alelo mutado

Question 16

deriva genética

Answer 16

• grandes flutuações das frequências dos alelos
• típicas das pequenas populações
• pode levar extinção ou fixação na população

Question 17

fluxo genetico

Answer 17

Migração de genes entre populações

Question 18

isolados genéticos

Answer 18

• barreiras geograficas, religiosas, culturais…
• taxa elevada de endogamia
• grande freq homo recessivos(q quadrado + Fpq) e de doencas recessivas raras

Question 19

efeito fundador

Answer 19

• pequeno grupo abandona populacao e estabelece se num local, isolado
• colonia com freq alelica distinta
  -ex: franceses do quebec

Question 20

Estudos de associação

Answer 20

• Comparam-se as frequências alélicas entre populações de doentes e saudáveis
• variantes genéticas que não estão em equilíbrio de Hardy-Weinerg nas populações
  estudadas são excluídas.

Question 21

Antropologia

Answer 21

Estudo da origem das populações

Question 22

Medicina legal

Answer 22

• métodos usados em Medicina Legal permitem a
  identificação de indivíduos com uma probabilidade na ordem de 0,999

Question 23

GENETICA DAS POPULACOES- - APLICACAO

Answer 23

1) recessivas
2) recessivas ligadas ao X

Question 24

1) doencas autossómicas recessivas

Answer 24

• freq doentes (aa) = (q quadrado), sendo freq “a”=q, ou seja (raiz freq dos doentes)
• freq do alelo dominante A (P)= 1-q
• freq de hetero = 2pq (prob individuo saudavel sem antecedentes familiares da doenca ser heterozigoto)
• frequencia de homo saudaveis = p quadrado

(atraves da incidencia sabemos (q quadrado) com isso sabemos o q e o p, calculamos valor de 2pq que é prob da gaja que vem da populacao ser hetero e depois a prob do gajo ve se pela familia, 2/3 pq sabemos que nao e doente logo nao pode ser aa, e 1/4 pq e a probabilidade dos dois passarem o alelo mutado; slide 40)

• nas recessivas, prob indiv saudavel sem antecedentes ser hetero corresponde praticamente a freq de heteros na populacao

Question 25

2) recessivas ligadas ao X

Answer 25

• freq alelo mutado (q)= frequencia da doenca no masculino e é identica na populacao masculina e femina
• numero de alelos mutados na mulher é o dobro mas tem o dobro dos cromossomas X (freq = n alelos mutados / n total alelos)
• muito raro mulher portadora nao ter homem com doenca na familia, logo mulher saudavel sem antecedentes considerad homo normal