T1 - Regulação da expressão génica (1) Flashcards
diversidade celular provem
diferente expressao genica
genoma
-toda a inf q esta codificada no dna (conj genes do organismo)
-extenso e complexo
-mm genoma pode dar dif transcritomas e dif proteomas
Restricao padrao transc no desenv embrionario
TOTI
-zigoto e cels emb iniciais
-dao origem qualquer cel embriao e tecidos extra emb
PLURI
-qualquer cel do embriao menos placenta
MULTI
-dif limitada ao tipo celular que cada folheto da origem
UNI
-celulas tronco
tipo de REGULACAO GENICA
QUANTI ( + ou -)
QUALI ( dif na const)
TEMPO (det altura do desenv)
LUGAR ( certo tecido)
imp da REGULACAO GENICA
-dif celular
-diversidade interind
-mecanismos moleculares das doencas
-medicina regenerativa
-terapeutica doencas generativas
maior numero de ptn que de genes de ptn
-gene pode codificar mais que 1 ptn
-loci com info sobreposta
REGULACAO TRANSCRICAO—————————————————————————
regulacao intercromossomica;mecanismos epigeneticos; ;disp e inativacao fatores transc; promotores altern
gene
REGIAO REG
-localizada a 5´ do inicio da transc
-fatores transc ligam a seq especificas de bases desta regiao, determinando lugar de ligacao do RNA poli e a taxa de transc (promotores, regiao mais prox do gene)
-seq reguladoras (lig ptn enhancers e silencers)
REGIAO TRANSC
-intrao
-exao
fatores de transc ligam se
-regiao promotora princ (core)
-elementos controlo proximais
core (regiao promotora principal) de genes transc por rna polimerase 2
TATA BOX
-genes expressao especifica de tecido
-mutacao alt local de inicio de transc
GC BOX
-genes housekeeping
CAAT BOX
-imp p eficiencia do promotor
1) regulacao intercromossomica
DISPOSICAO DA CROMATINA
-permite contatco entre dif regioes do cromossoma
-interacao com ptn localizadas em seq intensificadores e silenciadoras
-partilha fatores reguladores
INTERACAO CROMOSSOMAS DIF
-variante genetica num pode influenciar a expressao de um gene noutro cromossoma
2) mecanismos epigeneticos
-reg quantitativa
-regulam estrutura da cromatina
codigo epigenetico
(complexo padrao transmitido nas mitoses de celula a celula)
-DNMTS induz metilacao do DNA
-ligam se MECPS (ptn com afinidade para mCpG)
-MECPS recrutam, pe, HDAC (histonas desacetilases) e HMT (histonas metiltransferases)
-ligacao ptn remodeladoras
-condensacao da cromatina e inibicxao da transc por inacessibilidade fat de transc
METILACAO
- quanti
- hipermetilacao associado a ausencia de transcricao
- (de citosinas) da se por DNA metiltransferase
- nem toda metilacao de CpG associada a cond cromatina e ausencia de transc
- ocorre maioritariamente (em CpG na zona promotora) e (1 exao)
- mais de 90% mC localizadas em regioes de dna repetitivos (funcao estabilizacao)
- maioria dos genes hipometilados na regiao reg (ind de serem expressos ou nao)
- freq hipermet em seq genica
- hipermet na regiao reg inibe transc
- muitos CpG metalizados nos retrotransposoes
- padrao de metilacao mantem na replicacao e mitoses
tipos de Dnametiltransferase
1) – manutencao padrao de metil
3) —met de novo na dif ceular e por estimulos amb
no dsenv embrionario
- formacao de zigoto
- desmetilacao global
- metilacao de novo p criacao de padrao de restricao genica especifica de tecido (pergil epigenetico especifico de tecido)
-cels geminais com loci com dif padrao metilacao das somaticas
-pode haver variabilidade interind do padrao epigenetico
MEC EPIGENETICOS REVERSIVEIS, podendo ser a desmetilacao:
-passiva
-ativa (acao TET, BER, TDG)
ACETLACAO (e codigo das histonas)
acetilacao- transc ativa
desacetilacao - silenciamento
CODIGO DAS HISTONAS
- padrao de modificao (terminacoes amina) das histonas do nucleossoma q interferem com expressao genica, criando dominios + ou - condensados, ativos ou inativos p transc (padroes de modif criam locais de ligacao de ptn imp p determinar estado da cromatina)
- muitas ocmbincaoes e modificacoes quimicas possiveis
-enzimas resp por reversibilidade do codigo das histonas
*acetiltransferases e desacetiltransferases
*metiltransferases e desmetilases
