P1 - complexidade do genoma e nomenclatura da variantes Flashcards

1
Q

INTROES

A
  • seq dadoras e recetora de splicing ( GT e AG)
  • genes de RNA funcionais tmb podem ter introes~
  • gene intronico : gene dentro de intrao de outro gene
  • podem dar origem a micro rna (etc etc)
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2
Q

Sequencia sense e antisense

A
  • SENSE: seq do dna correspondente a do mrna q vai ser traduzido e a seq dos codoes corresponde a seq dos aminoacidos
  • ANTISENSE: seq dna complementar a sense; molde p transcricao; pode ser a seq sense de outro gene
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3
Q

EFEITO CIS E TRANS

A
  • CIS: Mecanismo de regulação de um gene efetuado por sequência de DNA localizada na mesma molécula de DNA ou cromossoma; ex. sequências da região reguladora
  • TRANS: Mecanismo de regulação de um gene efetuado por sequência de DNA localizada noutro cromossoma; ex. gene de fator de transcrição que regula a expressão de genes localizados noutros cromossomas; interação direta entre domínios de diferentes cromossomas
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4
Q

TRANSPOSOES

A
  • dna repetitivo relacionado com sequencias moveis
  • Retrotransposoes: Através de copy and paste, sequência de DNA transcrita para RNA, convertida em cDNA que se insere numa qualquer parte do genoma
  • LINE: seq dna codifica ptn c atividade transcripase reversa e de endonuclease (resp por atividade reversa do genoma)
  • SINE: inclui familia ALU (seq movel mais abundante)
  • Transposoes: cut and paste
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5
Q

REGIAO REGULADORA

A
  • seq de dna onde se ligam ptn q interferem com a transcricao
  • inclui o promotor principal (onde se ligam enhancers e silencers) e sequencias reguladoras (q podem estar distantes do promotor)
  • variante provoca alt quantitativas
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6
Q

REGIAO PROMOTORA

A
  • mais prox do gene
  • ligam se fatores de transcricao
  • pode incluir seq do 1 exao
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7
Q

fatores de transcricao

A

ptn determinam onde inicia e qual a taxa da transcricao. essenciais p atividade da RNA polimerase

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8
Q

!! primeiro e ultimos codoes a serem transcritos sao os da zona utr

A
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9
Q

PSEUDOGENES

A
  • Cópias defeituosas de genes funcionais contendo vários exões desse gene
  • nao processados: duplicacao do genoma; processados: Inserção de cDNA resultante de transcrição reversa do transcrito do gene inicial
  • mais mutacoes quando comparado ao gene funcional ( devido a evolucao ao longo do tempo)
  • estudo imp pois na pcr os primeirs podem amplificar os pseudo
  • algumas mutacoes monogenicas ocorrem por emparelhamento indevido entre genes e respetivos pseudogenes (recombinacao e conversao genica)
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10
Q

VARIANTE TRANS / HETEROZIGOTICO COMPOSTO

A
  • variante diferentres em alelos diferentes (materno e paterno)
  • associado a doenca autossomica recessiva
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11
Q

VARIANTE CIS/ MONOALELICA / ALELO COMPLEXO

A
  • duas variantes no mm alelo (ambos do mm progenitor)
  • caso cause patologia, sera associado a doenca autossomica dominante
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