Sujet 7 - Mycologie Flashcards
Le règne des champignons est très __
diversifié
~ 150,000 espèces
2-4 millions estimées (> 5 % caractérisées)
Micromycètes
Levures et moisissures (Microscopiques)
Macromycètes
Champignons macroscopiques Sporophores / Condiophores visibles
Mycetes AKA
champignons, fungi
Les mycetes sont des organismes ___
eucaryotes
Vrai ou faux. Les mycetes ont de chlorophylle
Faux
Nutrition par absorption et utilisent le carbone organique (Hétérotrophes)
Mycetes
Porteurs de spores
Mycetes
Mycetes - Reproduction souvent ___, rarement sexuée
asexuée
Mycetes - Leur paroi cellulaire contient typiquement de la ___ et des ___
chitine, glucanes
Morphologies des champignons
Basée sur la forme de la croissance végétative
On distingue trois types de morphologies chez les mycetes
- Levures (levuriformes)
- Moisissures (filamenteux)
- Dimorphiques (différencient à la fois des filaments et des levures)
La forme la plus simple des champignons
Levures
Le levure se multiplie par ___ (Saccharomyces cerevisiae et C. albicans A) ou par ___ (Schizosaccharomyces pombe- B)
bourgeonnement, fission
Les levures pathogènes de l’Homme sont nommées
Blastoconidies/blastospores (C. albicans)
Cellules filamenteuses et cylindriques souvent branchées nommées hyphes
Moisissures
Mycélium
Une masse d’hyphes
Hyphes avec (Aspergillus) ou sans ___
(Mucor
septum
Morphologie associée aux levures et distincte de la forme levure et la forme hyphale
Pseudohyphes
Cellules levuriformes allongées et attachées (en forme de collier)
Pseudohyphes
Le dimorphisme est une caractéristique de plusieurs champignons pathogènes endémiques comme ___ et ___
Blastomyces, Histoplasma
Champignons dimorphiques (2)
- Filamenteux à ~ 25°C
- Levures à 37°C température corporelle
Ce changement morphologique (___) est une caractéristique d’___ de ces champignons au laboratoire.
morphogenèse, identification
Agent de la blastomycose
Blastomyces derematitidis
Reproduction par production de spores (3)
- Endospores (produites à l’intérieur du sporocyste)
- Exospores (générées à l’extrémité des filaments/hyphes)
- Blastospores (propagules issues de bourgeonnement)
Spores formées à la suite de fragmentation d’hyphes/filaments
Fragmentation de mycélium
Propagation par extension des filaments
Production de stolons
Reproduction sexuée I
Fusion de deux gamètes (Isogamie) oude contenu cellulaire (Cystogamie/Plasmogamie) pour donner naissance à un zygote
Reproduction sexuée II
Formation de spores après méiose dans des structures spécialisées : Asques contenant des ascospores (ascomycètes), Basides contenant des basidiospores (basidiomycètes).
Classification actuelle dépend de la présence/absence de ___ et des caractères ___ (présence de septum, cycle de vie et physiologie)
reproduction sexuée (méiose), morphologiques
Basidiomycètes (2)
- Reproduction sexuée par formation des basidiospores (basidium) ou des conidies.
- Apparences: Sporophore/carpophore, levures, filaments, capsules,
Reproduction sexuée III
Champignons parfaits à l’opposé de champignons imparfaits (reproduction sexuée absente ou non connue)
basée sur la ressemblance des séquences d’ADN
Phylogénie moléculaire/génétique
Classification en ___ basées sur l’analyse des génomes/ADN
15 embranchements/phyla
Ascomycètes (3)
- Représentent 75% des champignons connus
- Levures ou filamenteux
- Reproduction sexuée (ascospores) ou asexuée par bourgeonnement (blastospores/levures) ou par production de spores (conidies)
Forme primitive des champignons
Glomeromycètes, Mucoromycètes et Mortierellomycota (Zygomycètes)
Cellules coenocytiques (en majorité, mais exception existe)
Glomeromycètes, Mucoromycètes et Mortierellomycota (Zygomycètes)
Formation de zygospores (reproduction sexuée), sporocystes (reproduction asexuée)
Glomeromycètes, Mucoromycètes et Mortierellomycota (Zygomycètes)
Ectomycorhizes et endomycorhizes
Glomeromycètes, Mucoromycètes et Mortierellomycota (Zygomycètes)
Pathogènes intracellulaires de plusieurs animaux
Microsporidies
Exemple Microsporidies
Agent de la pébrine (maladie du ver à soie), Nosema bombycis et de la Microsporidiose (Encephalitozoon)
Caractéristiques de la cellule fongique - levure (7)
- Noyau avec membrane nucléaire
- Cytoplasme
- Mitochondrie
- Vacuole
- Réseau de transport vésiculaire RE et Golgi
- Membrane plasmique
- Paroi cellulaire
Caractéristiques de la cellule fongique - hyphe (7)
- Septum avec le pore septal
- Corps de Voronine (Woronin body)
- Noyau avec nucléole
- Paroi cellulaire avec 3 couches:
Interne (chitine), intermédiaire (glucane)
et externe (mannane) - Spitzenkorper
- Vacuole, golgi, RE, mitochondrie, membrane plasmique
Membrane plasmique fongiue - Ergosterol
- “Cholestérol” fongique”
- Stérol spécifique des champignons et de certains protozoaires et absent chez les cellules animales
- Constituant de la membrane (fluidite)
- Cible des antifongiques de la famille des azoles et des polyenes
Paroi cellulaire fongique - Couche externe
Mannanes et protéines pariétales
Paroi cellulaire fongique - Couche intermediaire
Glucane
Paroi cellulaire fongique - Couche interne
Chitine
Dans la paroi cellulaire fongique, on trouve présence de ___ chez certains champignons filamenteux (Aspergillus, Alternaria)
mélanine
2% et 6% de la masse de la paroi des levures et des champignons filamenteux
Chitine
Microfibres insolubles du poly ß-(1→ 4)-N -acetylglucosamine polymère associés aux glucanes.
Chitine
Glucanes (3)
- 58–60% de la masse de la paroi
- ß-(1→ 3)-D –Glucane et ß-(1→ 6)-D Glucane
- Cible des antifongiques de la famille des échinocandines
Mannanes (3)
- Hémi-cellulose
- Composants majeurs des protéines pariétales (38–40% de la masse de la paroi)
- Antigène majeure de C. albicans
Protéines pariétales
Protéines GPI ( glycosyl phosphatidylinositol-Protéines) associées à la chitine et au ß-1→ 6-glucane
Fonctions des protéines pariétales
Adhésines (attachement à l’hôte), Biogenèse de la paroi
se nourrissent de la matière organique en décomposition (recyclage)
Saprophytes
vivent en symbiose avec les racines de plantes (mycorhizes) ou algues (Lichens); ceci confère un avantage nutritif aux deux partenaires
Symbiotiques
Pathogène de plantes, des insectes, des animaux, de l’Homme et des champignons
Pathogènes/opportunistes:
ils peuvent être nécrotrophes (tuent l’hôte pour se nourrir) ou biotrophes (se nourrissent de l’hôte vivante)
Chez les plantes
ils peuvent être opportunistes (en condition d’immuno-supression) ou pathogènes stricts venant de l’environnement (sol, air, ..)
Chez les animaux/l’Homme
champignons faisant partie de la flore de plantes des animaux, de l’Homme et des plantes. Profitent de l’hôte sans causer de dommage. Ils peuvent être opportunistes dans certain contexte (Candida albicans)
Commensaux
Qu’implique le fait que les champignons sont des organismes eucaryotes ?
Avoir des cibles thérapeutiques similaires avec l’Homme
Des infections fongiques touchant les animaux incluant l’Homme
Mycoses
une discipline distincte de la microbiologie médicale qui consiste à isoler et à caractériser des champignons pathogènes dans le but de caractériser l’origine mycologique ou non d’une pathologie
Mycologie médicale
Éclosion de Sporothrix schenckii (infections sous-cutanée) chez 3000 travailleurs miniers en Afrique du Sud (1941-1944)
20ème siècle
apparition de zones endémiques aux USA (Histoplasma capsulatum, agent de l’Histoplasmose)
2ème guère mondiale
Ère de la suppression immunitaire et des mycoses opportunistes nosocomiales (Candidoses et aspergilloses)
20ème siècle:
20ème siècle (4)
- Chimiothérapie (traitement du cancer)
- Maintenance des greffons (immunosuppression)
- VIH/SIDA (1981-)
- Maladies auto-immunitaires (Arthrite, Psoriasis, sclérose en plaques, M. inflammatoires chroniques de l’intestin: Maladie de Crohn et rectocolite hémorragique)
Classification basée sur les sites d’infections primaires (5)
- Mycoses superficielles
- Mycoses cutanées
- Infections opportunistes systémiques
- Mycoses sous-cutanées
- Mycoses endémiques
Infection de la couche supérieure morte kératinisée de l’épiderme
Tinea versicolo, Mycoses superficielles
Infections causées par Malassezia
Mycoses superficielles
Problèmes majoritairement cosmétiques.
Mycoses superficielles
Dermatophytes
Mycoses cutanées
Infections touchant la peau, les cheveux et les ongles
Mycoses cutanées
Trichophyton tonsurans > T. rubrum > T. interdigitale > Microsporum canis
Mycoses cutanées
Mycoses opportunistes systématiques
Infections de tous les organes par des champignons environnementaux (Aspergillus fumigatus), ou des endosymbiontes commensaux/Mycobiota (Candida albicans)
Infections touchant des patients dont le système immunitaire est compromis (3)
- Porteurs de VIH
- Patients immunosupprimés: transplantation d’organes, Chimiothérapies …
- Nouveaux nés, femmes enceintes, …
Mais aussi des personnes seines: Cas de champignons dimorphiques
Mycoses opportunistes systématiques
Mycoses d’implantations (suite à des piqûres ou des traumatismes transcutanés)
Mycoses sous-cutanées
Causées par des champignons mélanisés
Mycoses sous-cutanées
Exemples: Sporothrix schenckii et Madurella mycetomatis
Mycoses sous-cutanées
Champignons ayant une répartition géographique restreinte.
Mycoses endémiques
Causant majoritairement des infections pulmonaires qui peuvent évoluer en infections systémiques
Mycoses endémiques
Mycoses endémiques : Exemples (7)
- Histoplasmose
- Blastomycoses
- Coccidiomycose
- Paracocciodomycoses
- Peniciliose
- Sporotrichose
- Cryptococcus gati
Principaux pathogènes fongiques (4)
- Aspergillus sp
- Cryptococcus
- Blastomyces
- Candida sp
Aspergillus sp (4)
- Aspergillomes pulmonaires et cérébrales
- Aspergilloses pulmonaires chroniques
- Infections superficielles : Sinus, otomycose (oreille), onychomycosis (ongles)
- Allergies
Aspergillus ___ et aspergillose invasive
fumigatus
Cryptococcus gattii
Cryptococcus
Cryptococcus gattii
Lésions cérébrales et pulmonaires, et Méningites
Cryptococcus gattii chez
sujets seins et immunosupprimés
Blastomyces dermatitidis
Blastomyces
Blastomyces dermatitidis (3)
- Infection fatale
- Infections pulmonaires, lésions dermiques et ostéomyélites
La 4ème maladie nosocomiale la plus commune
Candidose causé par C. albicans
Cause fréquente de morbidité et de mortalité chez les patients immunosupprimés
Candidose causé par C. albicans
Hospitalisation très couteuse (≈ 40,000 $)
Candidose causé par C. albicans
La virulence de C. albicans est associée à son ___
dimorphisme
Dans la forme hyphe de C. albicans,
Elle est dédiée à l’invasion et la colonisation des organes
Dans la forme levure de C. albicans,
Elle est associée à la dissémination de C. albicans.
Un biofilm de la levure Candida albicans est constitué de (4)
hyphes, pseudohyphes, levures et une matrice polysaccharidique
La maladie de Crohn et la colite ulcéreuse sont accompagnées d’une surcroissance anormale des levures ___
C. albicans, C. glabrata et C. tropicalis
Batrachochytrium dendrobatidis (Bd)
Chytridiomycose des amphibiens à l’échelle mondiale
Pseudogymnoascus destructans
Bat white-nose syndrome, USA et Canada (Ouest)