Sujet 5 - Antibiotiques et relations hote-microorganismes Flashcards
Composé de faible poids moléculaire produit par un
microorganisme qui, à faible concentration, inhibe la
croissance des bactéries (bactériostatique) et dans
certains cas, tue les bactéries (bactéricide)
Antibiotique
Quelle est la problématique dans la destruction des microorganismes dans un hote vivant
détruire le microorganisme sans endommager l’hote
Décrivez la strategie des antibiotiques
Tirer profit des proprietes structurales et metaboliques specifiques des micro-organismes, qui les distinguent des humains
Chimiothérapie
Traitement des maladies en utilisant des agents chimiques (s’emploie souvent dans le sens anti-cancéreux)
Agent chimiothérapeutique capable de tuer ou d’inhiber la croissance de microorganismes
Antibiotique
Père de la chimiothérapie moderne (toxicité spécifique)
Paul Ehrlich
Decouvre le rouge Trypan affecte le typanosome responsable de la maladie du sommeil
Paul Ehrlich
Arsphénamine (dérivé de l’arsenic) contre le spirochète causant la syphilis
Paul Ehrlich
Découvre que le rouge Prontosil, utilisé pour colorer le cuir, qui tue les streptocoques et les staphylocoques pathogènes sans affecter les animaux
Prix Nobel en 1939
Gerhard Domagk
Decouvre la pénicilline
Alexander Fleming
Découvre la streptomycine isolée de l’actinomycète Streptomyces griseus
Selman Waksman
Ils ont découvert comment augmenter la production de pénicilline et le moyen de la purifier
Howard Florey et Erns Chain
Toxicité sélective
Toxique pour les microorganismes mais non toxique pour l’hôte (tuer ou inhiber l’agent pathogene)
Dose therapeutique
Quantité d’antibiotique requise pour le traitement efficace d’une infection
Dose toxique
Quantité d’antibiotique qui cause de la toxicité chez l’hôte
C’est un indice de la toxicité sélective
Indice thérapeutique
Equation de l’indice thérapeutique
Dose létale/Dose efficace
Plus l’indice thérapeutique est élevé, plus l’antibiotique est ___ à l’endroit du microorganisme
sélectif
Spectre d’activité des antibiotiques
Nombre d’espèces microbiennes sensibles à un
antibiotique
Antibiotique actif contre un nombre restreint d’espèces microbiennes
Spectre étroit
Exemple de spectre étroite
Pénicilline vs Gram +
Gentamicine vs Gram -
Antibiotique actif contre plusieurs espèces microbiennes
Large spectre
Exemple large spectre (2)
- Sulfamides actifs contre les bacteries et certains protozoaires
- Tetracycline et chloramphenicol agissent contre les Gram+ et Gram-
Caractere de l’activité antimicrobienne (3)
- Statique (inhibition)
- Cide (tue les bactéries)
- Peut dépendre de la concentration et de l’espece microbienne
Types d’antimicrobiens (4)
- Antibactériens
- Antifongiques
- Antiprotozoaires
- Antiviraux
Provenance des antibiotiques (3)
- Naturels (produits par bactéries gram+ et mycetes)
- Synthétiques (chimiques)
- Semi-synthétiques (naturels avec des modifications)
Concentration la plus faible d’un antibiotique capable d’empêcher la croissance d’un microorganisme
Concentration minimale inhibitrice (CMI)
La concentration minimale létale (CML)
Concentration la plus faible d’un antibiotique capable de tuer un microorganisme
Pour être efficace, un antimicrobien doit atteindre ___ de l’infection une concentration ___ à la CMI du germe pathogène
au site, supérieure
Vrai ou faux. Dans les cas d’infections graves, il est souvent nécessaire d contrôler la concentration des antimicrobiens dans le sang et autres liquides biologiques
Vrai
Détermination de CMI (5)
- Série de tubes contenant du bouillon de culture qui assure une bonne croissance
- Addition d’un antibiotique à des concentrations variant de 0,1 jusqu’à 128 µg/ml
- Inoculation des tubes avec le microorganisme à tester
- Incubation de 16 à 20 heures dans un environnement adéquat
- La concentration la plus faible qui inhibe la croissance bactérienne = CMI
Détermination de la CML (2)
Apres les 5 etapes pour determiner CMI:
1. Un échantillon de chacun des tubes qui ne présentent pas de croissance est inoculé dans des tubes de bouillon frais sans antibiotique ou sur un agar sans antibiotique
2. La concentration d’antibiotique la plus faible à laquelle les bactéries furent soumise dans la détermination de la CMI et qui ne présente pas de croissance dans ce nouveau milieu sans antibiotique = CML Donc les bactéries ont été tuées
Comment déterminer l’activité antimicrobienne ? (4)
- Ensemencer uniformément la surface d’une gélose avec un écouvillon stérile trempé dans une suspension bactérienne
- Déposer sur la gélose des disques, chacun imprégné d’un antibiotique différent
- L’antibiotique diffuse à partir du disque en formant un gradient de concentration
(plus forte concentration près du disque) - Après incubation (16 à 18 h) il y a un halo autour des disques, là où il n’y a pas
de croissance bactérienne. Plus le diamètre du halo est grand, plus l’espèce est
sensible à l’antibiotique (pour un antibiotique donné)
En général, plus la zone est grande, plus l’antibiotique est ___ contre la souche microbienne présente sur la gélose
actif
Facteurs influençant l’activité des antibiotiques (3)
- Capacité d’atteindre le site de l’inflection
- Sensibilité de la bactérie a l’antibiotique
- Concentration plus elevee que la CMI au site d’infection
Dans la capacité d’atteindre le site de l’inflection, décrivez l’importance de la voie d’administration (3)
- Orale : résistance à l’acidité de l’estomac, facilité d’absorbtion par l’intestin
- Cutané : directement sur la peau pour les infections cutanées
- Parentérale : injection intraveineuse, intramusculaire
Ces deux facteurs peuvent empecher l’antibiotiques d’atteindre les bactéries
- Caillots sanguins
- Tissus nécrotiques
Dans la sensibilité de la bacterie a l’antibiotique (3)
- Bactérie en phase de latence sera insensible aux antibiotiques (absence de replication ou synthese de la paroi)
- Mycoplasmes sans paroi insensibles a la penicilline
- Résistance
La concentration plus élevée que la CMI au site d’infection (pharmacocinétique) est influencée par (4):
- dose administrée
- voie d’administration
- vitesse d’absorption
- vitesse de métabolisme et d’excretion
Mécanismes d’action des antibiotiques (5)
- Inhibition de la synthese de la paroi cellulaire
- Inhibition de la synthese proteique
- Inhibition de la synthese nucleiques ou réplication
- Attaque de la membrane cytoplasmique
- Antagonisme de la biosynthese de l’acide folique
Substances qui inhibent la synthèse de la paroi
- B-lactamines (penicilline, cephalosporine)
- Glycopeptides (vancomycine, activité Gram+)
Les substances qui inhibent la synthèse de la paroi ont un indice thérapeutique ___
eleve
Décrivez les penicillines (5)
- La pénicilline G (Fleming, 1929) est produite par Penicillium chrysogenum
- Maintenant également en dérivés semi-synthétiques
- Les moins toxiques des antibiotiques, mais 1-5% des adultes allergiques
- Il y a de plus en plus de résistance envers les pénicillines
- Bactéricides
Décrivez les céphalosporines (5)
- La premiere a ete produite par le mycete Cephalosporium
- Maintenant en versions semi-synthetiques
- Spectre d’activité plus large que les penicillines
- Souvent prescrites aux patients souffrant d’allergie aux penicillines
- Bactéricides
Les penicillines et les cephalosporines sont des
B-lactamines
Vrai ou faux. Toutes les penicillines ont la meme structure
Faux. Bien qu’elles partagent toutes le même noyau, les différentes pénicillines diffèrent les unes des autres par la structure de leurs groupes R
Substances qui inhibent la synthese des proteines (3)
- Aminoglycosides
- Tetracyclines
- Chloramphenicol
- Macrolides
Aminoglycosides - cible
sous-unité 30S des ribosomes
Aminoglycosides - caractere
Bactéricides, plus efficaces contre les Gram -
Aminoglycosides - La streptomycine, la kanamycine, la néomycine sont synthétisés par le genre ___. La gentamicine est synthétisée par le genre ___
Streptomyces, Micromonospora
Aminoglycosides - Utilisation a diminué significantly. Pq ?
Résistance + toxicité
Tetracyclines - Cible
sous-unité 30S des ribosomes
Tetracyclines - Structure
Structure à 4 cycles, avec diverses chaîne slatérales
Tetracyclines - Production
Produites par Streptomyces sp, mais aussi en versions semi-synthétiques
Tetracyclines - Caractere
Effet bactériostatique (besoin du système immunitaire)
Tetracyclines - Elles ont un spectre large, mais
effets secondaires importants
Chloramphénicol - Caractere
Bactériostatique
Chloramphénicol - Cible
Fixation sur le ribosome (sous-unité 50S)
Chloramphénicol - Production
Produit au départ Streptomyces venezuelae, maintenant obtenu par synthèse chimique
Chloramphénicol - Spectre large mais
affecte la moelle osseuse de façon temporaire ou permanente.
Les aminoglycosides, les tetracyclines, les macrolides et le chloramphenicol sont des substance qui ___
inhibent la synthese proteique
Macrolides - Structure
Cycle lactone de 12 à 22 carbones associé à un ou plusieurs sucres
Macrolides - Production
Synthétisé par Streptomyces erythraeus
Macrolides - Prescrits aux patients allérgiques aux ___
Pénicilline
Macrolides - Caractere
Bactériostatique et spectre relativement large (bactérie Gram +; intracellulaire
Macrolides - Cible
Se fixe sur l’ARN 23 S de la sous-unité 50S et inhibe l’élongation de la chaîne peptidique.
Nommez des exemples des macrolides (3)
- Érythromycine
- Azithromycine
- Clarithromycine
Les substances qui inhibent la synthese proteique ont un indice therapeutique ___
relativement eleve
Substances qui inhibent la synthese des acides nucleiques (1)
- Les quinolones
Quinolones - Structure
Antibiotiques synthétiques comportant un noyau 4-quinolone
Quinolones - Cible
Inhibent la topoisomérase II (gyrase) en se fixant au complexe ADN-gyrase
Quinolones - Caractere
Réplication et réparation de l’ADN sont sévèrement perturbées au point de tuer la bactérie (Bactéricide)
Quinolones - Spectre
Large spectre et couramment utilisées
Les substances qui inhibent la synthese des acides nucleiques ont un indice therapeutique ___
peu eleve
Substances antagonistes du métabolisme (antimétabolites) (1)
Les sulfamides
Les substances antagonistes du métabolisme (antimétabolites)ont un indice thérapeutique __
eleve
Sulfamides - Cible
Entrent en compétition avec l’acide p-aminobenzoïque (précurseur de la biosynthèse de l’acide folique, essentielle chez les bactéries)
Sulfamides - Mode d’action
Synthèse des nucléotides est inhibée, il en va de même pour l’ADN et lesARN
Sulfamides - Caractere
Bactériostatiques (besoin du système immunitaire)
Sulfamides - Spectre
Efficacité limitée: résistance croissante + effets secondaires (allergies)
Vrai ou faux. Les humains sont capables de synthétiser l’acide folique
Faux.
Les substances antagonistes du métabolisme (antimétabolites) ont un indice thérapeutique ___
élevé
Substances qui détruisent la membrane plasmique
La polymyxine B
Polymixine B - Cible
Se fixe à la membrane plasmique et en perturbe sa structure et ses propriétés de perméabilité sélective
Polymixine B - Caractere
Bactéricide
Polymixine B - Utilisation
Restreinte (pommades topiques), car trop toxique par la voie systémique
Les substances qui detruisent la membrane plasmique ont un indice therapeutique ___
eleve
En ordre décroissant, nommez la production et utilisation d’antibiotiques (6)
- Cephalosporines
- Macrolides
- Quinolones
- Penicillines
- Aminoglycosides
- Tetracyclines
Décrivez le processus de résistance antibiotique des bactéries (4)
- Cible altérée
- Dégradation
- Modification chimique
- Exportation
Nommez 5 stratégies pour réduire le risque d’émergence de la résistance des antibiotiques
- Concentration de l’antib. assez elevee pour detruire les mutants spontanés
- Combinaison d’antibiotiques
- Reduire l’utilisation des antibiotiques a large spectre (favoriser le spectre etroit)
- Eviter l’abus d’antibiotiques (ne pas les prendre sauf si y a une infection bactérienne)
- Nouvelles approches (bactériophages, etc…)
Le corps humain contient une multitude d’écosystèmes formés de plusieurs ___ qui vivent dans des conditions
environnementales différentes (sec, humide, riche en nutriments,
anaérobique…)
communautés de cellules
En plus des cellules eucaryotes qui nous constituent, il faut ajouter les ___ qui forment divers écosystèmes distincts dans le corps humain. En fait nous transportons tous les jours plus de ___ que nos propres cellules eucaryotes. En réalité, nous pourrions renommer les
divers systèmes qui nous composent, en ___ respiratoire, digestif,
uro-génital, …
microorganismes, cellules procaryotes, écosystèmes
Objectif de tous les etres vivants
La survie
L’homeostasie a une grande relation avec la santé car
si y a pas d’equilibre, une infection will arise
Population de microorganismes que l’on trouve normalement dans un
site anatomique spécifique (flore commensale)
Microbiote humain
Le corps humain héberge ___ microorganismes
10 to the 14
Vrai ou faux. Le fœtus ne possède aucun microbiot
Vrai
Décrivez l’origine du microbiote humain (5)
- Colonisation au moment de la naissance par la flore vaginale et l’environnement
- L’alimentation semble un facteur déterminant dans la colonisation bactérienne
- 2 jours apres la naissance la peau et les muqueuses sont colonisées mais la composition definitve est formée vers l’age 2-3 ans
- Preuve de leur presence: odeur
Role du microbiote humain (4)
- Interférence à la colonisation (effet de barriere)
- Contribution nutritionnelle et métabolique (digestion, vitamine K)
- Stimulation du systeme immunitaire
- Source d’infections (pathogenes opportunistes
Les bonnes bactéries sont connues comme des
probiotiques
Quels types de relations symbiotiques les microorganismes ont-ils établi avec l’Homme ? (3)
- Mutualisme
- Commensalisme
- Parasitisme
Dans la relation du mutualisme ___
Les microorganismes apportent un certain bénéfice (vitamines produites par les bactéries du côlon), et l’hôte fournit les nutriments nécessaires à la croissance microbienne
Dans cette type de relation, certains microorganismes tirent un avantage unidirectionnel de l’hôte (nourriture, humidité, température) sans toutefois l’affecter
Commensalisme
Dans la relation de parasitisme, ___
seuls les microorganismes tirent profit de la relation, et l’hôte est souvent lésé
Microorganisme de l’environnement ou du microbiote qui devient pathogène lorsque les mécanismes de défense de l’hôte sont affaiblis
Pathogene opportuniste
On passe d’une relation commensalisme vers une relation parasitisme lorsque ___ ou ___
- les microorganismes sont introduits dans un site anatomique qu’ils n’occupent pas normalement
- les defenses immunitaires de l’hote sont affaiblies l’équilibre précaire peut etre rompu
Exemple d’une relation microorganisme-hote passant d’une relation mutualiste vers l’une parasitique
E. coli et infections urinaires (normalement se trouve dans les intestins)
Pour induire une maladie, une bactérie pathogène doit conserver un ___, a partir duquel elle est ___, pour ensuite ___
réservoir, transportée vers un hote susceptible, adhérer, envahir et endommager les tissus de l’hote
Origines de l’infection exogène (3)
- Transmission directe
- Transmission indirecte
- Transmission par vecteur
Directement d’un hôte infecté à un hôte susceptible (toux,
éternuements, contact corporel (MTS))
Transmission directe
Agents pathogènes dispersés dans l’environnement par un hôte infecté (air, sol, eau, aliments) via les fomites
Transmission indirecte
Organisme différent de l’humain qui transmet les agents pathogènes d’un hôte infecté à un hôte susceptible (ex. les anophèles et la malaria)
Transmission par un vecteur
Des objets non vivants qui facilitent la transmission indirecte d’agents pathogènes
les fomites, ex: serviettes, seringues, doorknobs, etc…
Le virus Zika est un exemple de transmission
par vecteur
Les deux types d’exposition aux agents pathogenes
- Exogene (outside organism)
- Endogene
Décrivez le type d’exposition endogene (2)
- Agents infectieux proviennent de la flore commensale
- L’infection survient à la suite d’un affaiblissement du système immunitaire, de la rupture d’une barrière anatomique,
Nombre de nouveaux cas dans une période donnée
Incidence
Nombre total de cas à une période donnée
Prévalence
Apparaît qu’occasionnellement et par cas isolés (ex. fièvre typhoïde)
Maladie sporadique
Constamment présente (ex. le rhume)
Maladie endemique
Grand nombre de cas dans un courte période de temps (ex. la grippe)
Maladie epidemique
Maladie épidémique à l’échelle mondiale
Pandemie
Types d’infections (4)
- Aigue
- Chronique
- Subaigue
- Latente
Évolue rapidement mais de courte durée (ex. la grippe)
infection aigue
Évolue lentement mais de longue durée (ex.tuberculose)
infection chronique
Se situe entre aiguë et chronique
infection subaigue
Inactive pendant une période +/- longue, et risque de
réactivation (ex. zona)
infection latente
Types de dommage causé a l’hote (7)
- Infection locale
- Infection systémique
- Sepsie
- Septicemie
- Bactériémie
- Toxémie
- Virémie
- Infection primaire et infection secondaire
état inflammatoire toxique
sepsie
multiplication de pathogènes dans le sang
septicémie
présence de bactéries dans le sang
bacteriemie
présence de toxine dans le sang
toxemie
présence de virus dans le sang
viremie
5 phases du cycle infectieux
- Incubation
- Prodromique
- Periode d’etat
- Declin
- Convalescence
Phase comprise entre l’entrée du microorganisme dans l’hôte et l’apparition des premiers signes et symptômes de sa présence
Phase d’incubation
Caractéristiques de la phase d’incubation du cycle infectieux (2)
- Silencieuse, sans signes
- Patient peut neanmois transmettre la maladie
Durée du periode d’incubation du cycle infectieux
Tres variable selon l’agent infectieux. Ex: scarlatine, varicelle - jours. tetanos 1 a 3 - semaines. Tuberculose - mois. Sida - années
Intervalle généralement court, apparition des premiers signes et symptômes:
fièvre, courbatures, malaises non-spécifiques ne permettant pas de poser un
diagnostic précis.
Periode prodromique du cycle infectieux
Décrivez le periode d’etat du cycle infectieux (2)
- Phase la plus aigue (invasion), symptomes maximales
- Apparition des signes specifiques permettat diagnostique
Signes et symptômes s’estompent (cycle infectieux)
Déclin
Rétablissement des fonctions normales de l’organisme et réparation des dommages tissulaires le cas échéant : retour à l’homéostasie
Convalescence
La virulence est
variable
Augmentation progressive de la virulence (potentiel d’agression)
Exaltation
Exaltation naturelle de la virulence
Microorganismes plus virulents en période d’épidémie qu’en période normale
Transferts successifs d’un microorganisme pathogène chez des hôtes sensibles.
Mécanisme inconnu
Exaltation expérimentale de la virulence
Perte graduelle de la virulence
Atténuation
Atténuation naturelle (2)
- Conditions plus favorables aux microorganismes moins virulents
- Perte de l’information genetique conduisant a la virulence
Atténuation expérimentale (2)
- Vieillissement des cultures, actions de divers agents physiques
- Repiquages successifs sur certains milieux de culture
Important pour la mise au point de vaccins vivants atténués (BCG, bacille de Calmette et Guérin, Sabin contre la polio)
Atténuation virulente
Pouvoir pathogène atténué n’affecte pas le pouvoir immunogène. Un organisme vivant mais atténué est généralement plus immunogène qu’un organisme mort.
Vrai
Facteurs de risque d’infection chez l’hôte (6)
- Âge
- Le stress (fatigue, exercice, changement climatique, …)
- État nutritionnel
- Prédispositions génétiques
- Facteurs environnementaux
- Circonstances favorables
Facteur de risque de l’age chez les jeunes
systeme immunitaire immature et microbiote intestinal moins developee
Facteur de risque de l’age chez les personnes agees
baisse de defenses antimicrobiennes et moins de mictions
Le facteur de risque de stress
La cortisone produite en grande quantité en période de stress réduit la réponse anti-inflammatoire et donc l’induction de la réponse immunitaire
Facteur de risque de l’état nutritionnel
- La résistance aux maladies infectieuses est plus élevée chez une personne bien alimentée (protéines, vitamines, etc) que chez celle souffrant de malnutrition
Facteur de risque de predispositions genetiques (3)
- Selon les genes herités un individu possede un systeme immunitaire +/-
- Mutation dans le gene CFTR (fibrose kystique)
- Mutation delta 32 dans la gene CCR5: résistance VIH-1
Facteur de risque de l’environnement
Salubrité, surpopulation, installations sanitaires, qualité de l’eau, situation géographique, conditions climatiques, latitude
Facteur de risque des circonstances favorables
Tout événement (rupture d’une barrière naturelle, affaiblissement du système
immunitaire) qui permet à un organisme pathogène de pénétrer et de se multiplier à l’intérieur d’un hôte. Ex: accident, chirurgie, affaiblissement du systeme immunitaire
Les infections nosocomiales sont
des infections qui ont leur origine dans les etablissement de santé