Rho GTPase Flashcards
à quoi servent les Rho GTPase ?
organisation cytosquellette
c’est quoi des Rho GTPase ?
prot de signalisation
-> commutateur moléculaire
elle sont active quand et inactive quand
Active quand GEF lui donne ATP
inactive quand GAP met ADP
V\F: les GTPase ont une activité GTPase intrinséque
Vrai
-> fixe le GTP, mais besoin de son régulateur
Combien de sous famille des GTPase ?
5
Ras
Rho
ARF
Rab
Ran
V\F: les RAS sont des oncogène rare dans les cancer
Faux
-> souvent et aide progression tumorale
RAC est comme rAs dans les cancer
Faux. RAC est diffférent.
Il existe combien de Rho GTPase? classé en combien de sous-famille selon quoi?
20
8 (4 classiques et 4 atypiques)
-> homologie structure et régulation
différence entre Rho GTPase classiques et atypique ?
classique: alterne entre GDP et GTP
Atypique: réguler par d’autre (certaine toujours active)
C’est quoi les 3 familles de régulateurs des Rho GTPase classique
- GEF: régule positivement -> libère GDP et met GTP
- GAP: régule négativement
- GDI: isole dans le cytosole (régulateurs négatifs)
quel signaux en amont peuvent activer une Rho GTPase via l’activation d’une RhoGEF ?
- ligand GPCR
- Facteur de croissance et récepeur tyrosine kinase
- prot de la matrice
- Jonctione cell-cell
C’est quoi la voie de signalisation de RhoGTPase ?
- signaux active RHOgtpase
- GEF active Rho
- Rho se lie au effecteur + action bio
- inactivation par GAP
- Séquestration par GDI
l’activation de RHO (classique ou non) peut être mdoifier apres la traduction, comment ?
- phosphorylation
- ubiquitination
- sumoylation
Pourquoi on dit que Rho est compelxe
- pour 20 GTPase humain, 140 GEF et GAP
- plusieurs GEF / GAP peuvent agir sur une même Rho
- une même GEF peut agir sur plusieurs Rho
Une fois activé, les Rho font quoi comme action biologique ?
RAC -> lamellipode
CDC42 -> forme filopode
RHOA -> Fibre de stresse
plusieurs effecteurs moléculaire =
plusieurs fonctions biologiques
Comment rho sait quoi activer si il participe a plusieurs processus ?
GEF agit comme prot echaffaudage = amène spécificité
-> selon le GEF, l’Effecteur et l’Effet sera différent.
les prot echafaudage GEF permettent quoi
éviter les réactions croisé
activation efficace et séléctive
quoi les effet de Rho sur les hellmarks ?
effet sur TOUTE
C’est quoi les 6 mécanismes moléculaire qui peuvent être déréglé dans les cancers ?
- mutation de Rho
- alteration expression de Rho
- surexpression de GEF
- perte ou inactivation régulation négatif
- changement niveau modif post-traductionnel
- alternance des isoforme exprimés
c’est quoi le mécanisme de mutation Rho? mutation fréquente ou?
Mutation fréquente dans
1. BRAF
2. NRAS
3. RAC1 (mélanome)
-> réfractaire à RASGAP = toujours lié au GTP
ou diminue activité GTPase
= hyperactivation
c’est quoi exactement la mutation de RAC ?
proline 29 devient une sérine ou thréonine
que fait la mutation RAC p26ST ?
augmente le rythme d’échange entre GDP et GTP
= maintient GTPase
= maintient régulation
= augmente RAC globalement
Comment fonctionne le mécanisme d’altération de l’Expression des RHO GTPase ?
augmentation de l’expression de RHO = contribue au cancer. CONTRIBUE POSITIVE
= agissent comme oncogène
= augmentation augment k’agressivité du cancer
Quelle altréaration de RHO GTPase n’est PAS un oncogene, mais un supresseur de tumeur ?
RhoB
Comment fonctionne le mécanisme de surexpression ou activation d’un activateur.
Tumeur activent la signalisation indirectement
-> change le niveau d’expression et leur activité
= les tumeur augmente Rho GEF = augmente activité GTPase
que fait Rho-DOCK1 ?
régule la formation de métastase
-> plus de ARNm = faible pronostic cancer du seins HER+
Comment fonctionne le mécanisme de la perte ou inactivation de régulateur négatif ?
Tumeur activent la signalisation indirectement
-> change le niveau d’expression et leur activité
= diminution de rho GAP
= augmente activité RHo GTPase
Rho GAP DLC1 agit comme supresseur de tumeur ou oncogene ?
supresseur de tumeur
-> son silence épigénétique contribue a progresser les tumeurs
Comment fonctionne le mécanisme de changement au niveau de modif post-traductionnel ?
ca peut être positif ou négatif
->peut être ciblé pour dégrader avec l’ubiquitination = moins de contractilité cellulaire et augmente la formation de migration
c’est quoi le mécanisme de l’alternance des isoformes exprimée
via épissage, des EXON peuvent être élever ou pas.
-> change la signalisation
ex. RAC1 (14 a.a. de plus) et RAC1B (affinité réduite pour GDI = mécanisme direc)
Avantage d’utiliser des souris pour l’étude des cancer ?
- microenvironnement qui est similaire au culture
- peut voir causalité des gènes (99% gène = parreil)
- limite expérience chez humain
- cycle de reproduction court
Désavantage d’utiliser un modele de souris ?
- dispendieux
- trasngénique difficile
- permet voir sur longuen duré
- peu hétérogène comparer au patient entre les tumeurs
- difficile de controler les variable individuelle.
4 classes de modele de souris ?
- tumeur spontannée
- tumeur induite
- tumeur transgénique
- modele de greffe de cellule cancereuse
c’Est quoi le modele de tumeur spontanné ?
avantage ?
désavantage ?
= sans intervention artificielle
prends des facteurs et attend que tumeur arriver
bien: comme humain
Mauvais:
- plusieurs animaux
- pas synchro
- très long
- très hétérogène
c’Est quoi le modele de tumeur induite ?
avantage ?
désavantage ?
utilise des carcinogène pour entrainer des mutations et formation de tumeur
(composé chimique, physique ou bio)
Bien:
- carniogene plus efficace pour favoriser tumeur
- plus cours que d’autre modele de souris
- reproductible
mauvais:
- mortalité chez souris
- lésion pas uniforme chez animaux
c’Est quoi le modele de tumeur transgénique ?
avantage ?
désavantage ?
change le genome des souris
Bien:
-permet étudier gène
- bien pour étude des mécanisme
- permet tester thérapie
- possible combiner des mutations
- possible de créer une perte de fonction ou un gain
Mauvais:
- long et dispendieux
- prise de risque pour l’Experimenteur
Comment on produit une souris transgénique de facon NON CIBLÉE ?
avantage ? désavantage %
- injection ADN dans l’oocyste
- transgène se met dans le génome
- implantation chez mère porteuse
- regarde nouveau né et regarde phénotype
Bien:
- rapide
- cellule sont tous des clone qui exprime le transgène
Mauvais
- plusieurs copies peuvent être intégré = surexpression
- transgene peut s’integrer mauvaise place = effet indépendant au transgène
- peut s’intégrer place silencieuse
- lourd et couteux
- phénotype est pas nécessairement relié ex jambe
Comment on produit une souris transgénique de facon CIBLÉE ?
avantage ? désavantage %
- fait ADN qui cible eet permet recombinaison avec portion identifié du génome
- met dasn les cellules souches embryonnaire
- recombinaison et intégration au. site précis
- cellule souche injecté dans le blastocyte
- met dans mère porteuse
- Analyse des nouveau né
- croisement des nouveau né pour avoir souris knock out
Bien:
- modif génome précis
- minimise intégration région essentiel
Mauvias:
- long, incertain, couteux, plusieur croisement nécessaire
C’est quoi le modèle de greffe, avantage et désavantage
souris immunosupprimé et greffe.
Bien:
- permet l’étude
- dispo rapidement
- facile
- pas de développement transgénique
- reproductible
Mauvais:
- souris immunodéficiente = hébergement adapté
- peut pas voir la progression immunitaire
Différence entre allogreffe et xenogreffe ?
allogreffe: transplantation même espèce
Xénogreffe: transplantation autre espece
différence entre CDX et PDX
CDX: lignée cellule transplanté de humaine
= facile, pas hétérogène, pas le même microenvironneemnt
PDX: cellule provenant des tumeurs des patient
= conserve interaction cellulaire, criblage possible et taux de succes variable et longd
différence entre hétéropique et orthopique ?
Hétéropique: implante dans un organe différent d’ou la tumeur arrive. (sous cutané)
Orthopique: même organe ou tissus que chez le cancer
avantage de hétéropique vs orthopique ?
hétéro:
- facile
- facilement observable
- pas sacrifice
Ortho:
- tumeur se développe ‘‘neturellement’’ = évalue condition réell
- réplique mieux les métastase
avantage et désavantage d’injecter queue des souris ?
bien:
- facile
- plusieur lignée dispo
- étudie les métastases
Mauvais:
- progression tumoral pa complete
- site premier poumon pcq circulations sanguine.
