Instabilité génomique Flashcards
V/F: seulement 1% genome code pour des genes
Vrai
-> cancerc= manque de chance.
Pourquoi les cancer sont dur à traiter ?
accumulation de mutation heterogène
Quelle complexe peut être gatekeeper et caretaker en même temps?
MRE11 , RAD50 et NBS1
quand on a decouvert 1er mécanisme réparation ADN ? comment ?
1940
-> en faisant l’erreur d’expérimentation de Kelner
c’est quoi l’erreur d’expérimentation de Kelner ?
essayait de faire des mutant aux UV chez streptomyces griseus
Les laissait dans les pétri étager,
eux en haut (proche lumiere) = survis et en dessous survivait moins.
c’est quoi la photolyase ?
enzyme photoactivation qui détectte les domage avec la lumière. La distorsion est reconnu par les photolyase et répare.
l’ADN n’est pas sensuble à des agression chimique ou physique
faux
La gravité des lésions que l’ADN subit est liée à quoi ?
le fait que l’ADN est unique et est transmissible.
Les MMS (toxines) causent quoi?
4 alkylation sur l’ADN et 1000 sur cystéine
alkylation sur les azotes de PURINES (A et G)
Pourquoi le benzoapyrene est cancerigene ?
La molécule en soit est ok,
une fois oxydé dans les cellule, elle s’insere sur un G et déforme l’ADN. (ne peut lier C)
Comment fonctionnent les dommages oxydatif ?
pendant on respire,
nos enzyme (SOD2 et GPX1) catalyse les anions toxiques.
-> Superoxyde anion radicale et hydroxyde font des cassure
C’Est le OH- qui provoque la cassure.
C’est quoi le test de Ames ?
test pour établir le pouvoir mutagene dun composer.
-> deux pétrie
1. pas d’addition
2. suspect mutagene
=> beaucoup de division?
Comment fonctionne la réversion de mutation ponctuelle dans un gène synthese de histidine ?
codon stop muté = gène histidine continue sa transcription et fait une proteine pas rapport.
Le chimio et radio sont des thérapie basée sur quoi?
la réparation de l’ADN
Comment fonctionnent les agent alkylant dans la chimio?
endommage ADN dans TOUT les phases du cycle.
-> soud les brins ensemble
= ne se réplique pas = mort
** MUTATION SECONDAIRE POSSIBLE
c’est quoi les medoc agent alkylant?
Carboplatin
Cisplatin
Oxaliplatin
Comment fonctionnent les antimétabolites en chimio?
Des analogue des nucloside (T,A,G,C) qui s’insère et interfere avec la synthese.
Comment fonctionne la radiothérapie ?
utilise les radicaux ocydatif pour faire un dommage et une voie direct
= dommage double brin.
Si cassure deux brin pas lamême place, quoi la distance pour ce soit considérer cassurer ouble brin?
20pb
probleme avec radiotherapie ?
probleme avec le dosage
-> beaucoup de probleme associé et de symptome
-> CANCER SECONDAIRE POSSIBLE
Le principe majeur derriere la chimio et radio?
s’assurer que les cellules saine n’ont pas de lésion (pour ca dose important)
-> cell normal doivent être capable de supporter le traitement.
comment les cellules normal sont proteger ?
réparation de l’ADN
C’est quoi le mécanisme de la base excision repair (BER) ?
BER reconnait dommage et
-> utilise une ‘BASE’ - ADN- Glycosylase qui enleve la base
-> Endonucléase (ajout OH temporaire)
-> polymérase reconnait OH et ajoute un nucléotide
-> ligase (lie le tout et enleve OH)
qui a découvert les glycosylase en 1970?
T. Lindahl
BER reconnait quel trype de dommage ?
- déamination (NH2-> O)
- dépurination (donc juste squelette, perte de base)
- alkylation (ajout CH3 sur O)
- Carcninogène ‘‘nouvelle base’’
PARP fait quoi?
coordonne les réparation (acteur clé du BER)
comment on nomme ADN qui manque une base ?
site abasique
Comment on peut détecter les activités BER en labo ?
- incube avec un extrait normal et un muté de BER = BER ne sera pas clivé.
- essai ‘‘comet’’ = met cell sur tampon alcalin qui dénature = voit ADN migre hors noyau .
ADN est chargé - ou +?
il va aller vers ou dans l’electroporese ?
négatif
va vers positif
BER peut tourner mal. c’est quoi les 4 possibilité ?
- mutation synonyme: même prot, mais séquence différente. ok
- Non synonyme = muté
- Non sense = devient codon stop
- Readthrought= stop devient de quoi…
Pourquoi il y a pas beaucoup de cancer ?
Il y a beaucoup de back up de BER.
C’est quoi le mécanisme MMR
Mismatch repair
C’Est quoi le fonctionnement de MMR ?
mauvais appariement reconnu et répare.
-> brin parent es méthylé = sait quel est à changer.
Comment fonctionne MMR avec les proteine Mut ?
Mut S (MSH2 chez humain) reconnait les mauvais appariements de + 4 nucléotide
Mut L (MSH humain) stabilise le complexe (sur le MutS)
Mut H lie ADN méthylé et forme une cassure simple brin dans l’ADN (fait une boucle plus loin et lie complexe MutS-MutL
Exo1 dégrade bout ADN
Polymérase resynthese
ADN ligase fait le dernier pont.
UvrD fait quoi dans MMR ?
c’est une helicase qui aide à dérouler l’ADN.
MMR est souvent associé dans quel cancer ?
cancer du colon
NER est souvent associé dans quel cancer ?
Cancer de la peau
C’Est quoi NER ?
nucléotide excision repair
Comment fonctionne NER avec TOUT les protéine ?
- XPC-R23 localise pont entre pyrimidine et ouvre un peu ADN
- TFIIH ouvre et localise la mutation
- XPA maintient le tout ouvert.
- RPA stabilise l’ADN sb
- XPG et ERCC1/XPF coupe l’ADN (prend une grosse batch)
- pol delta et epsilon répare
Les UV font quoi dans l’ADN ?
font des pont entre pyrimidine du même brin
= distorsion ADN
Différence entre GNER et TCNER ?
différence dans la reconnaissance de la lésion
GNER: XPE/XPC/HR..
TCNER: RNAP II engage CSB et CSA (répare pré transcription)
Le reste est parreil
après l’excision dans NER, qui répare ?
PCNA, RPA, Pol et ligase
c’est quoi les deux maladies associé au GNER ou TCNER
Xeroderma pigmentosum -> photosensible xtrem + 2000x plus de chance cancer peau
(defaut GNER et TCNER)
Cockayne syndrome ->
photosensible
probleme de croissance
(défaut dans TCNER)
Vrai ou faux: cancer de la peau est le 7iem plus courant au canada
vrai
l’exposition au bronzage artificielle avant lage de 35 ans augmente combien les chance dun cancer ?
75%
76% des mélanome sont du a quoi chez les jeune ?
bronzage artificiel
3mm sous la peau, on peut voir quoi
zone densité pigmentaire
c’est quoi les mécanisme de réparation simple brin et double brin?
SB: NER, MMR, BER
DB: non-homologue end-joining (NHEJ) et HR (recombinaison homologue)
quoi qui peut causer des cassure double brin?
Exogene (radiation, chimique)
Endogene (radicaus, bris fourche)
C’Est quoi la chromotrypsis ?
plusieurs cassure db qui s’accumule et qui vont se mettre aléatoirement.
Comment on peut détecter les cassure db ?
comet et dénaturation
Comment fonctionne NHEJ? globalement
on remet ensemble sans chercher homologue
Comment fonctionne NHEJ? précisement ?
surtout G1
-> Ku7080 et DNA-pk reconnait et lie les extrémité coupé
-> XRCC4-ligase-XLF
à quoi sert la nucléase artemis dans NHEJ ?
dégrade un peu extrémité deja couper pour bien remettre l’ADN ensemble
V/F: NHEJ a peu de risque de provoquer la mort (létalité) en comparaison avec la recombinaison homologue
vrai
Comment fonctionne la recombinaison homologue ?
MRE11 / RAD50 endonucléase coupe un peu dans l’ADN DB
RAD51 envahis en cherchant un bout d’ADN homologue
Polymérase met les nuléotide ou les trou
Étape de la recombinaison homologue ?
Détection
Resection
Invasion
Dissociation
Annealing (recombinaison)
À quoi sert Rad50
pince moléculaire qui permet associement avec la cassure
Il arrive quoi si on enleve RAD51 ?
pas de cassure réparé
RAD51 est chez les humaisn quelle proteine chez bactérie ?
RecA
Pourquoi chez levure plus de recombinaison et humain NHEJ si NHEJ est mutagene ?
+ cell en G1 et pas de recombinaison en G1
+ pas grave pas perd une cellule, alors que levure une cellule = toute sa vie
+ genome très petit (95% est codant chez levure) et 1% chez nous.
différence entre RecA et RAD51 ?
ATPase plus efficace RecA
transfert de brin efficace RecA et limité à moins de 1000 bp chez RAD51
Direction faible 3’-> 5’ RAD51
5’ -> 3’ RecA
c’est quoi le Angelina Effect?
mutation dans BRCA1
c’est quoi un cofacteur de RAD51?
BRCA1
BRCA1/2 sont responsable combien % cancer du seins ?
5%
-> 8/10 des femmes avec les BRCa von développer cancer du seins
Il se passe quoi lorsque mutation BRCA2 ?
sensible rayon X et deficience de recombinaison
-> pas de BRCA1/2 et RAD51 = mort embryonnaire parce que instabilité chromosomique
lien entre BRCA2 et RAD51 ?
s’accumule ensemble.
Il se passe quoi dans les cellules CAPAN-1 ?
BRCA2 est tronqué = pas de RAD51 après irradiation
= pas de NLS (signal localisation nucléaire) = reste dans le cytoplasme.
Vrai ou faux. La localisation nucléaire de RAD51 est indépendante de BRCA2 ?
Faux.
dépendante. sans BRCA2, RAD51 va pas au noyau.
à quoi servent les inhibiteur de PARP ?
tuer les cellules BRCA2 (ou cell cancereuse defaut en HR) en utilisant leur instabilité
Comment fait PARP?
après radiation,
NAD fait un 3iem acide nucléique (polyac…)
C’est comme un aimant et ca attire vraiment vite PARP
PARP orchestre la réparation
C’est quoi le concepte de la létalité synthétique ?
Inhibe la voie PARP et BRCA2 = deux voie sont inhiber et provoque la mort.
les cancers du seins utilisent2 moyens pour réparer leur ADN. quoi?
PARP et BCRA12
Cas9 fait des cassures dans l’ADN. il se passe quoi après ? (2)
création de mutation par NHEJ
recombinaison homologue
Crispr Cas9 dépend de quoi?
NHEJ pour faire un knock out
pourquoi NHEJ est moins létale que HR ?
HR: plus fiable mais erreur plus grave
