Récepteurs et molécules membranaires accessoires Flashcards
Qu’est ce qui est essentiel pour éliminer les pathogènes extra et intra cellulaire?
Lymphocyte T
Vrai ou faux? Un individu qui n’a pas de lymphocytes T va tomber malade à tout?
Vrai
Vrai ou faux? Le lymphocyte T reconnaît l’antigène présenté par la CPA
Faux, il reconnaît le peptide dérivé de l’Ag présenté par CPA
Vrai ou faux? Chaque lymphocyte T porte un récepteur T différent
Vrai
Vrai ou faux? Les cellules T ne lient pas les virus ou les Ag sous leur forme native
Vrai, plutôt sous la forme peptidique
Est ce que les peptides dérivés des protéines du soi sont aussi chargés sur les molécules de classe I et II du CMH?
Oui
Quels sont les deux modèles qui existaient avant qu’on sache qu’un fragment peptidique de l’Ag associé au CMH était reconnu par le RCT?
1) deux récepteurs séparés: un reconnaissant le CMH et l’autre reconnaissant l’Ag (modèle double récepteur)
2) un seul récepteur: capable de reconnaitre l’Ag complexé avec une molécule du CMH du soi (modèle du «soi modifié»)
Quel modèle entre le modèle double récepteur et le modèle soi modifié s’est avéré vrai?
Le modèle soi modifié : un seul récepteur qui reconnait l’Ag et le CMH
Que signifie CPA? Ou APC?
Cellule présentatrice d’Ag
Que signifie la double spécificité du RcT?
Il est spécifique pour l’antigène et pour le CMH
Qu’est ce que l’immunoprécipitation?
Consiste à utiliser des billes absorbées avec l’Ac et de les incuber avec un lysat protéique des cellules T, suite à une incubation on peut récupérer le matériel lié à l’Ac et le migrer sur gel
Chaque chaîne du RcT possède combien de domaines de combien d’acides aminés contenant chacun quoi?
2 domaines de 60 à 75 acides aminés contenant chacun un pont di-sulfure intrachaîne
Combien de régions hypervariables y-a-t-il dans V dans le RcT?
3 régions hypervariables
La région transmembranaires des RcT ont combien d’acide aminé et contiennent des résidus chargés + ou -?
La région transmembranaire de 21 à 22 aa contiennent des résidus chargés +
Est ce qu’il est habituel pour une région transmembranaires de contenir des régions chargées +?
Non c’est inhabituel
Le RcT a une courte ou longue queue cytoplasmique en C terminal?
Courte
Vrai ou faux? Il existe aussi un RcT composé d’une chaîne delta et gamma?
Vrai
Quelles sont les deux chaînes du RcT?
Chaîne alpha et bêta
Dans le RcT, la section proximale de la membrane est variable ou constante?
Constante
Dans le RcT, la section la + discale de la membrane est variable ou constante?
Variable, ce n’est pas la même d’un récepteur T à l’autre
La diversité du RcT est possible grâce à quoi?
Grâce au réarrangement (recombinaison) de segments de gènes
Combien de gènes avant nous dans notre ADN?
Environ 30 000
Qu’est ce que la juxtaposition aléatoire des segments VDJ permet?
Permet d’obtenir un grand nombre de RcT différents
Quels segments (V, D, J) sont présents dans les chaînes alpha, bêta, gamma et delta?
Chaîne alpha: V-J
Chaîne beta: V-D-J
Chaîne gamma: V-J
Chaîne delta: V-D-J (dans locus alpha)
Vrai ou faux? Certains segments de gène Valpha et Vdelta peuvent être utilisé par les chaînes alpha et delta
Vrai et cela augmente encore la diversité du répertoire RCT
Que signifie SSR ou RSS?
Séquence signal de recombinaison
Quel est le rôle de SSR (séquence signal de recombinaison)? (4)
-Dictent quels segments peuvent être réarrangés
-s’assurent que les réarrangements se feront seulement avec les segments de gène du RCT et non avec d’autres gènes
-assurent que les bons segments sont réarrangés ensemble (V-J pour la chaîne alpha et VDJ pour la chaîne bêta)
-assurent qu’il n’y a pas de réarrangement V-V ou J-J
Qui dictent quels segments peuvent être réarrangés?
SSR
Qui s’assure que les réarrangement se feront seulement avec les segments de gène du RCT et non avec d’autres gènes?
SSR
Qui s’assure que les bons segments sont réarrangé ensemble c’est-à-dire V-J pour la chaîne alpha et V-D-J pour la chaîne bêta?
SSR
Qui s’assurent qu’il n’y a pas de réarrangement V-V ou J-J
SSR
De quoi sont constitués les SSR (2)?
-d’un heptamère et d’un nonamère, dont la séquence est conservé dans tous les SSR
-d’un espaceur de 12 ou 23 pb, dont la séquence est moins conservé
Vrai ou faux? Lors d’un réarrangement on associe toujours un espaceur de 12pb avec un espaceur de 13pb
Vrai
Qu’est ce que représente la taille des espaceurs?
12pb: représente un tour de double hélice
23 pb: représente deux tours de double hélice
Le fait que les deux espaceurs ne soit pas de la même longueur permet quoi?
Permet de positionner les SSR du même côté de la double hélice d’ADN afin de les rendre accessibles à une même enzyme
Qu’est ce qui permet de positionner les RSS du même côté de la double hélice d’ADN afin de les rendre accessibles à une même enzyme?
Les espaceurs qui font toujours 12 ou 23 pb
Comment sont positionnés les SSR au locus du RCT sur la chaîne alpha?
Région V: 23pb
Région J: 12 pb
Comment sont positionnés les SSR au locus du RCT sur la chaîne bêta?
Région v: 23pb
Région D: 12 et 23pb
Région J: 12 pb
Quelle est la seule région qui possède à la fois un espaceur de 12 et de 23 pb?
Région D de la chaîne bêta
Quelle région possède un espaceur 23pb?
Région V des chaînes alpha et bêta
Quelle région possède un espaceur 12pb?
Région J des chaînes alpha et bêta
Que signifie RAG?
Recombination activating gene
Quelles protéines sont spécifiques aux lymphocytes T (3)?
RAG 1
RAG 2
TDT
Quelles protéines sont exprimés par tous les types cellulaires?
Les protéines qui agissent dans la voie de réparation de l’ADN par jonctions d’extrémités non-homologues (NHEJ)
-artemis
-ADN ligase IV
Est ce que RAG 1 et RAG 2 fonctionnent ensemble?
Oui, si une des deux est absentes cela empêche la recombinaison
Les gènes codants pour RAG 1 et RAG 2 sont distants de combien de paire de base sur l’ADN génomique?
Seulement distants de 8kb
Quand est-ce que RAG 1 et 2 sont exprimés?
Seulement pendant le développement des lymphocytes
Pourquoi est ce que RAG1 et RAG2 sont exprimés seulement pendant le deéveloppement des lymphocytes T et B?
Afin que le réarrangement ait lieur seulement dans les cellules lymphoides
Vrai ou faux? RAG 1 et 2 sont indispensables à la recombinaison VDJ
Vrai
Qu’est ce que les jonctions codantes?
Nouvelles jonctions entre les segments de gène de la région variable
Qu’est ce que les jonctions signals?
Celles créées entre les heptamères SSR
Quel est le rôle de RAG 1 et RAG 2 lors de la recombinaison?
-leur liaison au SSR permet de créer une synapse qui rapproche les deux segments de gènes
-ils clivent ensuite les segments
Est ce que les jonctions signales seront transmise?
Non
Quel est le rôle de la protéine HMG?
Permet d’aider le repliement de l’ADN afin de rapprocher les segments de gène
Quel type de cassure RAG1 et 2 introduisent?
Une cassure simple brin dans un des brins de l’ADN exactement en 5’ de l’heptamère
Où est ce que RAG 1 et 2 introduisent une cassure simple brin?
Dans un des brins de l’ADN exactement en 5’ de l’heptamère
Qu’est ce que le groupement 3’ OH généré par le clivage de RAG1/2 va attaquer? Et comment s’appelle cette réaction?
Le groupement phosphate de l’autre brin (trans-estérification)
Qu’est ce que la trans-estérification provoque?
Crée une extrémité en épingle à cheveu au niveau de l’extrémité codante et une extrémité franche au niveau du bout signal
Qu’est ce que l’extrémité franche formé suite à la trans-estérification formera?
Un cercle de recombinaison qui sera éventuellement perdu
Quel est le rôle de Artemis?
Ouverture de l’épingle à cheveu
Où a lieu l’ouverture de l’épingle à cheveu par Artemis?
Peut avoir lieu à différents endroits, et selon l’endroit différentes extrémités seront crées
Quelles sont les différentes extrémités que Artemis peut créer selon où elle ouvre l’épingle à cheveu?
-cohésives en 5’
-cohésives en 3’
-franches
Les extrémités cohésives sont remplis par quoi?
Par une polymérase en utilisant l’information du brin complémentaire
Que signifie des nucléotides palindromiques?
Ayant la même séquence sur les deux brins
Qu’est ce qui peut se passer à l’occasion avant que les extrémités soient remplies par la polymérase?
Ils arrivent que des exonucélases enlèvent des nucléotides
Qu’est ce que l’ajout de N-nucléotides?
Avant la liaison des extrémités codantes, il y aura ajout de nucléotides de manière aléatoire et indépendante de la matrice d’ADN par l’enzyme Tdt
Quel est le rôle de l’enzyme Tdt?
Ajout de nucléotide de façon aléatoire et indépendante de la matrice d’ADN
Quel est le rôle de l’ADN lipase IV?
Ligation des extrémités pour former la jonction codante
Quelle est la dernière étape de la recombinaison?
Ligation des extrémités pour former la jonction codante. Utilises les enzymes classiques de la réparation des cassures d’ADN double brin
Quelles sont en bref les étapes de la recombinaison? (8)
- Formation de la synapse pas RAG1/2 avec l’aide des protéines HMG
- Clivage par RAG1/2
- Trans-estérification (groupement OH attaque groupement phosphate) qui crée épingle à cheveu et bout signal
- Ouverture de l’épingle à cheveu par Artémis
- Ajout des P-nucléotides par la polymérase en utilisant l’info du brin complémentaire
- Parfois, ezonucléases enlève quelques nucléotides
- Ajout de N-nucléotides par l’enzyme Tdt (aléatoire et indépendante de la matrice)
- Ligation des extrémités par l’ADN ligase
Quelle étape de la recombinaison VDJ augmente de façon très importante la diversité de séquence du RCT?
Ajout de N-nucléotides par l’enzyme Tdt (aléatoire et indépendante de la matrice)
Qu’est ce qui génère de la diversité? (6)
-diversité génique (polymorphisme)
-diversité combinatoire (V,D,J)
-P nucléotides (artemis)
-N nucléotide (Tdt)
-activité exonucléase
-réassortiment des alpha et bêta
Est ce que les lymphocytes T font de l’hypermutation somatique?
Non
Avec l’ajout de P-nucléotide et N-nucléotide combien y-a-t-il de séquence d’acide aminé possibles?
10 à la 13
La diversité jonctionelle provient de quoi?
-p nucléotide
-n nucléotide
-activité exonucléase
Combien y a-t-il de RCT possibles?
Plus de 10 à la 15
Est ce que tous les réarrangements VDJ vont permettre de produire une protéine fonctionnelle?
Non, peut arriver qu’on introduit un codon stop
Qu’est ce que l’exclusion allélique?
Le réarrangement productif (qui code pour une protéine fonctionnelle) de la chaîne alpha et bêta mène à l’arrêt du réarrangement au locus spécifique
Pourquoi l’exclusion alléique est-elle importante?
Afin que chaque cellule T n’exprime qu’un RCT d’une spécificité donné
Où se trouvent CDR1/2 et CDR3?
CDR1/2: dans V
CRR3: jonction V-J (chaîne alpha) ou jonction V-D ou D-J (chaîne bêta)
Quelle région CDR1/2 ou CDR3 possède le plus de diversité de séquences?
CDR3 à cause de l’ajout des N et des P nucléotides
Quelle région va être impliquée dans la reconnaissance du peptide antigénique?
CDR3
Comment est ce que le RCT se lie sur le complexe peptide-CMH?
En diagonale
Où se trouve Valpha?
En N-terminal du peptide
CDR3 interagit avec quoi?
Avec le peptide
Est ce que la boucle CDR4 interagit avec le complexe CMH-peptide?
Non
Quel est le rôle de CD3?
Permet la transmission des signaux d’activation lors de la reconnaissance antigénique (ne participe pas à la reconnaissance Ag)
Vrai ou faux? CD3 est requis pour l’expression du complexe à la surface cellulaire et la transmission des signaux
Vrai
CD3 est un complexe de combien de polypeptides invaribles formée de combien de dimères?
6 polypeptides invariables formés de 3 dimères (gamma-epsilon, delta-epsilon, zeta-zeta)
Quels sont les 3 dimères de CD3?
Gamma-epsilon
Delta-epsilon
Zeta-zeta
CD3gammadeltaepsilon sont des membres de ?
La superfamille des Ig
La région cytoplasmique est de combien d’aa pour CD3gammadeltaepsilon?
Environ 40 aa
Quelle sont les caractéristiques de CD3z?
Très courte région extracellulaire (9 aa)
Longue queue cytoplasmique (113 aa)
Les régions cytoplasmiques des CD3 contiennent quel motif?
Motif ITAMS
À quoi servent les motifs ITAMs?
Servir de sites de recrutement à des protéines adaptatrices suite à leur phosphorylation induite par l’activation
Qu’est ce qui se passe avec les aa chargés - de la région transmembranaires des molécules CD3?
Elles interagissent avec les aa + des chaînes alpha et beta
Quelles sont les caractéristiques de CD3? (6)
- 5 chaînes invariantes exprimées avec le RcT à la surface cellulaire
-dimères ge, ed, zz et zh
-résidu aspartate (-) dans le transmembranaire
-longues régions intracytoplasmiques
-motifs d’Activation ITAM
-impliqués dans la transduction du signal
Est ce que l’affinité du RCT pour le complexe antigène-CMH est forte?
Non, plutôt faible, on a besoin de molécules accessoires pour augmenter l’avidité de l’intéraction intercellulaire
Quel est le rôle de l’adhésine?
Augmente l’interaction entre la cellule T et la cellule présentatrice d’Ag
Quel est le rôle du co-récepteur?
Facilite l’interaction entre le RCT et son ligand
Vrai ou faux? Le co-récepteur à cause de leur interaction avec le CMH et de leur rôle dans la transmission du signal d’activation via le RCT intéragissent avec des régions conservées du CMH
Vrai
Quels sont les principaux co-récepteurs des cellules T?
CD4 et CD8
Quels co-récepteurs fait des interactions avec le CMH I et le CMH II?
CD8: CMH I
CD4: CMH 2
Qu’est ce que les co-récepteurs permettent aussi de définir?
Deux grandes familles de cellules T
(TH et TC)
Décrire CD4:
-monomère
-4 domaines immunoglobulines extracellulaires
-longue queue cytoplasmique
Décrire CD8:
-dimère lié par pont di-s
-chaîne alpha et beta
-1 seul domaine Ig
-1 région tige
Qu’est ce que le co-engagement fait?
Augmente avidité de liaison du lymph T à sa cible et permet aussi de rassembler les domaines intracytoplasmiques du RCT/CD3 à proximité immédiate ce qui favorise l’initiation de la cascade d’événements intracellulaires d’activation des LT
Quel est le rôle de la tyrosine kinase Lck associé à CD4 et CD8?
Rôle essentiel lors de la signalisation via le RCT
Vrai ou faux? Les molécules accessoires (d’adhésion) renformissent l’interaction entre la cellule T et le CPA
Vrai
Lorsque le contact intercellulaire (T-CPA) est fait, qu’Est ce que le RCT fait?
Balaye la membrane de la CPA ou de la cellule cible afin de détecter le complexe peptide-CMH, s’il y a reconnaissance le contact se renforcit
Qu’est ce que la synapse immunitaire?
Structure très importante pour l’activation du complexe de la cellule T lorsqu’elle reconnait son Ag
Quelles sont les 3 étapes de la synapse immunitaire?
- Formation de la jonction
- Transport des complexes CMH-Peptides
- Stabilisation
