Récepteurs et molécules membranaires accessoires Flashcards

1
Q

Qu’est ce qui est essentiel pour éliminer les pathogènes extra et intra cellulaire?

A

Lymphocyte T

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Q

Vrai ou faux? Un individu qui n’a pas de lymphocytes T va tomber malade à tout?

A

Vrai

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3
Q

Vrai ou faux? Le lymphocyte T reconnaît l’antigène présenté par la CPA

A

Faux, il reconnaît le peptide dérivé de l’Ag présenté par CPA

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4
Q

Vrai ou faux? Chaque lymphocyte T porte un récepteur T différent

A

Vrai

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Q

Vrai ou faux? Les cellules T ne lient pas les virus ou les Ag sous leur forme native

A

Vrai, plutôt sous la forme peptidique

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6
Q

Est ce que les peptides dérivés des protéines du soi sont aussi chargés sur les molécules de classe I et II du CMH?

A

Oui

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7
Q

Quels sont les deux modèles qui existaient avant qu’on sache qu’un fragment peptidique de l’Ag associé au CMH était reconnu par le RCT?

A

1) deux récepteurs séparés: un reconnaissant le CMH et l’autre reconnaissant l’Ag (modèle double récepteur)

2) un seul récepteur: capable de reconnaitre l’Ag complexé avec une molécule du CMH du soi (modèle du «soi modifié»)

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8
Q

Quel modèle entre le modèle double récepteur et le modèle soi modifié s’est avéré vrai?

A

Le modèle soi modifié : un seul récepteur qui reconnait l’Ag et le CMH

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9
Q

Que signifie CPA? Ou APC?

A

Cellule présentatrice d’Ag

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10
Q

Que signifie la double spécificité du RcT?

A

Il est spécifique pour l’antigène et pour le CMH

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11
Q

Qu’est ce que l’immunoprécipitation?

A

Consiste à utiliser des billes absorbées avec l’Ac et de les incuber avec un lysat protéique des cellules T, suite à une incubation on peut récupérer le matériel lié à l’Ac et le migrer sur gel

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12
Q

Chaque chaîne du RcT possède combien de domaines de combien d’acides aminés contenant chacun quoi?

A

2 domaines de 60 à 75 acides aminés contenant chacun un pont di-sulfure intrachaîne

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13
Q

Combien de régions hypervariables y-a-t-il dans V dans le RcT?

A

3 régions hypervariables

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14
Q

La région transmembranaires des RcT ont combien d’acide aminé et contiennent des résidus chargés + ou -?

A

La région transmembranaire de 21 à 22 aa contiennent des résidus chargés +

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15
Q

Est ce qu’il est habituel pour une région transmembranaires de contenir des régions chargées +?

A

Non c’est inhabituel

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16
Q

Le RcT a une courte ou longue queue cytoplasmique en C terminal?

A

Courte

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17
Q

Vrai ou faux? Il existe aussi un RcT composé d’une chaîne delta et gamma?

A

Vrai

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18
Q

Quelles sont les deux chaînes du RcT?

A

Chaîne alpha et bêta

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19
Q

Dans le RcT, la section proximale de la membrane est variable ou constante?

A

Constante

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20
Q

Dans le RcT, la section la + discale de la membrane est variable ou constante?

A

Variable, ce n’est pas la même d’un récepteur T à l’autre

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21
Q

La diversité du RcT est possible grâce à quoi?

A

Grâce au réarrangement (recombinaison) de segments de gènes

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22
Q

Combien de gènes avant nous dans notre ADN?

A

Environ 30 000

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23
Q

Qu’est ce que la juxtaposition aléatoire des segments VDJ permet?

A

Permet d’obtenir un grand nombre de RcT différents

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24
Q

Quels segments (V, D, J) sont présents dans les chaînes alpha, bêta, gamma et delta?

A

Chaîne alpha: V-J
Chaîne beta: V-D-J
Chaîne gamma: V-J
Chaîne delta: V-D-J (dans locus alpha)

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25
Q

Vrai ou faux? Certains segments de gène Valpha et Vdelta peuvent être utilisé par les chaînes alpha et delta

A

Vrai et cela augmente encore la diversité du répertoire RCT

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26
Q

Que signifie SSR ou RSS?

A

Séquence signal de recombinaison

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27
Q

Quel est le rôle de SSR (séquence signal de recombinaison)? (4)

A

-Dictent quels segments peuvent être réarrangés

-s’assurent que les réarrangements se feront seulement avec les segments de gène du RCT et non avec d’autres gènes

-assurent que les bons segments sont réarrangés ensemble (V-J pour la chaîne alpha et VDJ pour la chaîne bêta)

-assurent qu’il n’y a pas de réarrangement V-V ou J-J

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28
Q

Qui dictent quels segments peuvent être réarrangés?

A

SSR

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29
Q

Qui s’assure que les réarrangement se feront seulement avec les segments de gène du RCT et non avec d’autres gènes?

A

SSR

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30
Q

Qui s’assure que les bons segments sont réarrangé ensemble c’est-à-dire V-J pour la chaîne alpha et V-D-J pour la chaîne bêta?

A

SSR

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31
Q

Qui s’assurent qu’il n’y a pas de réarrangement V-V ou J-J

A

SSR

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32
Q

De quoi sont constitués les SSR (2)?

A

-d’un heptamère et d’un nonamère, dont la séquence est conservé dans tous les SSR

-d’un espaceur de 12 ou 23 pb, dont la séquence est moins conservé

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33
Q

Vrai ou faux? Lors d’un réarrangement on associe toujours un espaceur de 12pb avec un espaceur de 13pb

A

Vrai

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34
Q

Qu’est ce que représente la taille des espaceurs?

A

12pb: représente un tour de double hélice
23 pb: représente deux tours de double hélice

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35
Q

Le fait que les deux espaceurs ne soit pas de la même longueur permet quoi?

A

Permet de positionner les SSR du même côté de la double hélice d’ADN afin de les rendre accessibles à une même enzyme

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36
Q

Qu’est ce qui permet de positionner les RSS du même côté de la double hélice d’ADN afin de les rendre accessibles à une même enzyme?

A

Les espaceurs qui font toujours 12 ou 23 pb

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37
Q

Comment sont positionnés les SSR au locus du RCT sur la chaîne alpha?

A

Région V: 23pb
Région J: 12 pb

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38
Q

Comment sont positionnés les SSR au locus du RCT sur la chaîne bêta?

A

Région v: 23pb
Région D: 12 et 23pb
Région J: 12 pb

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39
Q

Quelle est la seule région qui possède à la fois un espaceur de 12 et de 23 pb?

A

Région D de la chaîne bêta

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40
Q

Quelle région possède un espaceur 23pb?

A

Région V des chaînes alpha et bêta

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41
Q

Quelle région possède un espaceur 12pb?

A

Région J des chaînes alpha et bêta

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42
Q

Que signifie RAG?

A

Recombination activating gene

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43
Q

Quelles protéines sont spécifiques aux lymphocytes T (3)?

A

RAG 1
RAG 2
TDT

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44
Q

Quelles protéines sont exprimés par tous les types cellulaires?

A

Les protéines qui agissent dans la voie de réparation de l’ADN par jonctions d’extrémités non-homologues (NHEJ)
-artemis
-ADN ligase IV

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45
Q

Est ce que RAG 1 et RAG 2 fonctionnent ensemble?

A

Oui, si une des deux est absentes cela empêche la recombinaison

46
Q

Les gènes codants pour RAG 1 et RAG 2 sont distants de combien de paire de base sur l’ADN génomique?

A

Seulement distants de 8kb

47
Q

Quand est-ce que RAG 1 et 2 sont exprimés?

A

Seulement pendant le développement des lymphocytes

48
Q

Pourquoi est ce que RAG1 et RAG2 sont exprimés seulement pendant le deéveloppement des lymphocytes T et B?

A

Afin que le réarrangement ait lieur seulement dans les cellules lymphoides

49
Q

Vrai ou faux? RAG 1 et 2 sont indispensables à la recombinaison VDJ

A

Vrai

50
Q

Qu’est ce que les jonctions codantes?

A

Nouvelles jonctions entre les segments de gène de la région variable

51
Q

Qu’est ce que les jonctions signals?

A

Celles créées entre les heptamères SSR

52
Q

Quel est le rôle de RAG 1 et RAG 2 lors de la recombinaison?

A

-leur liaison au SSR permet de créer une synapse qui rapproche les deux segments de gènes
-ils clivent ensuite les segments

53
Q

Est ce que les jonctions signales seront transmise?

A

Non

54
Q

Quel est le rôle de la protéine HMG?

A

Permet d’aider le repliement de l’ADN afin de rapprocher les segments de gène

55
Q

Quel type de cassure RAG1 et 2 introduisent?

A

Une cassure simple brin dans un des brins de l’ADN exactement en 5’ de l’heptamère

56
Q

Où est ce que RAG 1 et 2 introduisent une cassure simple brin?

A

Dans un des brins de l’ADN exactement en 5’ de l’heptamère

57
Q

Qu’est ce que le groupement 3’ OH généré par le clivage de RAG1/2 va attaquer? Et comment s’appelle cette réaction?

A

Le groupement phosphate de l’autre brin (trans-estérification)

58
Q

Qu’est ce que la trans-estérification provoque?

A

Crée une extrémité en épingle à cheveu au niveau de l’extrémité codante et une extrémité franche au niveau du bout signal

59
Q

Qu’est ce que l’extrémité franche formé suite à la trans-estérification formera?

A

Un cercle de recombinaison qui sera éventuellement perdu

60
Q

Quel est le rôle de Artemis?

A

Ouverture de l’épingle à cheveu

61
Q

Où a lieu l’ouverture de l’épingle à cheveu par Artemis?

A

Peut avoir lieu à différents endroits, et selon l’endroit différentes extrémités seront crées

62
Q

Quelles sont les différentes extrémités que Artemis peut créer selon où elle ouvre l’épingle à cheveu?

A

-cohésives en 5’
-cohésives en 3’
-franches

63
Q

Les extrémités cohésives sont remplis par quoi?

A

Par une polymérase en utilisant l’information du brin complémentaire

64
Q

Que signifie des nucléotides palindromiques?

A

Ayant la même séquence sur les deux brins

65
Q

Qu’est ce qui peut se passer à l’occasion avant que les extrémités soient remplies par la polymérase?

A

Ils arrivent que des exonucélases enlèvent des nucléotides

66
Q

Qu’est ce que l’ajout de N-nucléotides?

A

Avant la liaison des extrémités codantes, il y aura ajout de nucléotides de manière aléatoire et indépendante de la matrice d’ADN par l’enzyme Tdt

67
Q

Quel est le rôle de l’enzyme Tdt?

A

Ajout de nucléotide de façon aléatoire et indépendante de la matrice d’ADN

68
Q

Quel est le rôle de l’ADN lipase IV?

A

Ligation des extrémités pour former la jonction codante

69
Q

Quelle est la dernière étape de la recombinaison?

A

Ligation des extrémités pour former la jonction codante. Utilises les enzymes classiques de la réparation des cassures d’ADN double brin

70
Q

Quelles sont en bref les étapes de la recombinaison? (8)

A
  1. Formation de la synapse pas RAG1/2 avec l’aide des protéines HMG
  2. Clivage par RAG1/2
  3. Trans-estérification (groupement OH attaque groupement phosphate) qui crée épingle à cheveu et bout signal
  4. Ouverture de l’épingle à cheveu par Artémis
  5. Ajout des P-nucléotides par la polymérase en utilisant l’info du brin complémentaire
  6. Parfois, ezonucléases enlève quelques nucléotides
  7. Ajout de N-nucléotides par l’enzyme Tdt (aléatoire et indépendante de la matrice)
  8. Ligation des extrémités par l’ADN ligase
71
Q

Quelle étape de la recombinaison VDJ augmente de façon très importante la diversité de séquence du RCT?

A

Ajout de N-nucléotides par l’enzyme Tdt (aléatoire et indépendante de la matrice)

72
Q

Qu’est ce qui génère de la diversité? (6)

A

-diversité génique (polymorphisme)
-diversité combinatoire (V,D,J)
-P nucléotides (artemis)
-N nucléotide (Tdt)
-activité exonucléase
-réassortiment des alpha et bêta

73
Q

Est ce que les lymphocytes T font de l’hypermutation somatique?

A

Non

74
Q

Avec l’ajout de P-nucléotide et N-nucléotide combien y-a-t-il de séquence d’acide aminé possibles?

A

10 à la 13

75
Q

La diversité jonctionelle provient de quoi?

A

-p nucléotide
-n nucléotide
-activité exonucléase

76
Q

Combien y a-t-il de RCT possibles?

A

Plus de 10 à la 15

77
Q

Est ce que tous les réarrangements VDJ vont permettre de produire une protéine fonctionnelle?

A

Non, peut arriver qu’on introduit un codon stop

78
Q

Qu’est ce que l’exclusion allélique?

A

Le réarrangement productif (qui code pour une protéine fonctionnelle) de la chaîne alpha et bêta mène à l’arrêt du réarrangement au locus spécifique

79
Q

Pourquoi l’exclusion alléique est-elle importante?

A

Afin que chaque cellule T n’exprime qu’un RCT d’une spécificité donné

80
Q

Où se trouvent CDR1/2 et CDR3?

A

CDR1/2: dans V
CRR3: jonction V-J (chaîne alpha) ou jonction V-D ou D-J (chaîne bêta)

81
Q

Quelle région CDR1/2 ou CDR3 possède le plus de diversité de séquences?

A

CDR3 à cause de l’ajout des N et des P nucléotides

82
Q

Quelle région va être impliquée dans la reconnaissance du peptide antigénique?

A

CDR3

83
Q

Comment est ce que le RCT se lie sur le complexe peptide-CMH?

A

En diagonale

84
Q

Où se trouve Valpha?

A

En N-terminal du peptide

85
Q

CDR3 interagit avec quoi?

A

Avec le peptide

86
Q

Est ce que la boucle CDR4 interagit avec le complexe CMH-peptide?

A

Non

87
Q

Quel est le rôle de CD3?

A

Permet la transmission des signaux d’activation lors de la reconnaissance antigénique (ne participe pas à la reconnaissance Ag)

88
Q

Vrai ou faux? CD3 est requis pour l’expression du complexe à la surface cellulaire et la transmission des signaux

A

Vrai

89
Q

CD3 est un complexe de combien de polypeptides invaribles formée de combien de dimères?

A

6 polypeptides invariables formés de 3 dimères (gamma-epsilon, delta-epsilon, zeta-zeta)

90
Q

Quels sont les 3 dimères de CD3?

A

Gamma-epsilon
Delta-epsilon
Zeta-zeta

91
Q

CD3gammadeltaepsilon sont des membres de ?

A

La superfamille des Ig

92
Q

La région cytoplasmique est de combien d’aa pour CD3gammadeltaepsilon?

A

Environ 40 aa

93
Q

Quelle sont les caractéristiques de CD3z?

A

Très courte région extracellulaire (9 aa)
Longue queue cytoplasmique (113 aa)

94
Q

Les régions cytoplasmiques des CD3 contiennent quel motif?

A

Motif ITAMS

95
Q

À quoi servent les motifs ITAMs?

A

Servir de sites de recrutement à des protéines adaptatrices suite à leur phosphorylation induite par l’activation

96
Q

Qu’est ce qui se passe avec les aa chargés - de la région transmembranaires des molécules CD3?

A

Elles interagissent avec les aa + des chaînes alpha et beta

97
Q

Quelles sont les caractéristiques de CD3? (6)

A
  • 5 chaînes invariantes exprimées avec le RcT à la surface cellulaire

-dimères ge, ed, zz et zh

-résidu aspartate (-) dans le transmembranaire

-longues régions intracytoplasmiques

-motifs d’Activation ITAM

-impliqués dans la transduction du signal

98
Q

Est ce que l’affinité du RCT pour le complexe antigène-CMH est forte?

A

Non, plutôt faible, on a besoin de molécules accessoires pour augmenter l’avidité de l’intéraction intercellulaire

99
Q

Quel est le rôle de l’adhésine?

A

Augmente l’interaction entre la cellule T et la cellule présentatrice d’Ag

100
Q

Quel est le rôle du co-récepteur?

A

Facilite l’interaction entre le RCT et son ligand

101
Q

Vrai ou faux? Le co-récepteur à cause de leur interaction avec le CMH et de leur rôle dans la transmission du signal d’activation via le RCT intéragissent avec des régions conservées du CMH

A

Vrai

102
Q

Quels sont les principaux co-récepteurs des cellules T?

A

CD4 et CD8

103
Q

Quels co-récepteurs fait des interactions avec le CMH I et le CMH II?

A

CD8: CMH I
CD4: CMH 2

104
Q

Qu’est ce que les co-récepteurs permettent aussi de définir?

A

Deux grandes familles de cellules T
(TH et TC)

105
Q

Décrire CD4:

A

-monomère
-4 domaines immunoglobulines extracellulaires
-longue queue cytoplasmique

106
Q

Décrire CD8:

A

-dimère lié par pont di-s
-chaîne alpha et beta
-1 seul domaine Ig
-1 région tige

107
Q

Qu’est ce que le co-engagement fait?

A

Augmente avidité de liaison du lymph T à sa cible et permet aussi de rassembler les domaines intracytoplasmiques du RCT/CD3 à proximité immédiate ce qui favorise l’initiation de la cascade d’événements intracellulaires d’activation des LT

108
Q

Quel est le rôle de la tyrosine kinase Lck associé à CD4 et CD8?

A

Rôle essentiel lors de la signalisation via le RCT

109
Q

Vrai ou faux? Les molécules accessoires (d’adhésion) renformissent l’interaction entre la cellule T et le CPA

A

Vrai

110
Q

Lorsque le contact intercellulaire (T-CPA) est fait, qu’Est ce que le RCT fait?

A

Balaye la membrane de la CPA ou de la cellule cible afin de détecter le complexe peptide-CMH, s’il y a reconnaissance le contact se renforcit

111
Q

Qu’est ce que la synapse immunitaire?

A

Structure très importante pour l’activation du complexe de la cellule T lorsqu’elle reconnait son Ag

112
Q

Quelles sont les 3 étapes de la synapse immunitaire?

A
  1. Formation de la jonction
  2. Transport des complexes CMH-Peptides
  3. Stabilisation