Propriétés des acides nucléiques

Question 1

stabilité acides nucléiques

Answer 1

ø ln H

due à l’empilement des paires de bases

Question 2

effets acide fort

≠ agents dénaturants

Answer 2

hydrolyse complète (décomposition)

ex: acide perchlorique (HClO4)

Question 3

effets acide faible

≠ agents dénaturants

Answer 3

formation site apuriques:

• rupture de la ln N-glycosidique (entre sucre et base dans nucléoside)
• nucléosides à bases puriques: ln glycosidique + fragile que pour les bases pyrimidiques

Question 4

effets alcali ADN

Answer 4

changement d’état tautomérique des bases
perte H⁺ (bc base) = perte ln H entre bases
dénaturation ADN: séparation des 2 brins de la dhélice

Question 5

effets agents dénaturants chimiques

Answer 5

rupture ln H intermoléculaires

eau s’insinue entre les bases → dénaturation ADN

Question 6

agents dénaturants chimiques

Answer 6

formamide

urée

Question 7

viscosité

Answer 7

rapport axial important: glissement molécules difficiles → fore viscosité
extraction ADN sans coupure quasi impossible
obligation couper ADN pour étudier

Question 8

absorbance UV

Answer 8

présence bases aromatiques (possèdent double ln conjuguées)
P et sucres n’absorbent pas UV
mesure par spectrophotomètre
longueur d’onde max = 260nm
permet de détecter, quantifier et évaluer la pureté des acides nucléiques

Question 9

quantification

1UA260nm (unité d’absorbance)

Answer 9

= 50µg/mL d’ADNdb

= 40µg/mL d’ADNsb ou ARN

Question 10

vérification pureté → rapport des absorbances

Answer 10

R = A260nm/ A280nm 
def degré de contamination de l'ADN

Question 11

rapport des absorbances

R > 2

Answer 11

présence ARN

Question 12

rapport des absorbances

R < 1,8

Answer 12

présence prot

Question 13

rapport des absorbances

1,8 < R < 2

Answer 13

ADN pur

Question 14

à même concentration absorbance à 260nm

Answer 14

A260nm nucléotide > A260nm ADNsb (ou ARN) > A260nm ADNdb

accessibilité des bases aux UV

Question 15

dénaturation thermique (augmentation tº)

Answer 15

destruction ln H: db → sp

Question 16

absorbance relative

Answer 16

absorbance à une température donnée/ absorbance à 20ºC

si augmentation de la tº: augmentation de 40% de l’absorbance relative à 260nm

Question 17

Tm

Answer 17

température de fusion = T melting
tº pour laquelle solution comporte 50% de molécules sb et 50% de molécules db
dépend du % de CG d’un ADN
80-100ºC

Question 18

Tm Thermus Aquaticus

Answer 18

vivant près sources chaudes

très fort CG% → Tm = 100ºC

Question 19

organismes ADNdb circulaire

Answer 19

plasmides de bactérie
certains génomes viraux
mitochondries
chloroplastes

Question 20

formtion ADNdb circulaire

Answer 20

ln phosphodiester entre 3’OH et 5’P des 2 brins compl

ø d’extremité libre

Question 21

nombre d’enroulement ADNdb circulaire

Answer 21

Lk = nmbr de ln
Lk = 0 en position relachée
∆Lk = nmbr de supertours

Question 22

∆Lk

Answer 22

∆Lk > 0: surenroulement dans le même sens que la doublé hélice d’ADN
∆Lk < 0: dans le sens contraire (ADN, symbolise le déroulement de l’ADN)

Question 23

ADN cellulaire naturel

Answer 23

surenroulement négatif

nmbr supertours = ∆Lk/ Lk0 = -0,06

Question 24

topoisomères

Answer 24

molécules d’ADN de même séquence + ou - enroulées

Question 25

agents intercalants

Answer 25

bromure d’éthidium (BET)

doxorubicine

Question 26

BET

Answer 26

augmente torsion
agent mutagène: introduit encombrement stérique
augmente fluorescence de l’ADN

Question 27

Doxorubicine

Answer 27

Anthracycline
Antibiotique
Action anticancéreuse et immunosupp

Question 28

augmentation enroulement

Answer 28

augmentation force ionique

Question 29

diminution enroulement

Answer 29

hausse température
présence formamide (agent dénaturant chimique)
présence agents intercalants: BET, doxorubicine

Question 30

topoisomérases

Answer 30

enzymes qui déroulent db ADN au niveau du noyau
réglage du taux d’enroulement: ajout ou sup. d’un enroulement
inhibées par agents intercalants et les antibio
impliquées dans réplication, recombinaison et transcription

Question 31

implication topoisomérases

Answer 31

compaction des gènes

réplication, recombinaison, transcription des gènes

Question 32

topoisomérases I

Answer 32

enzymes essentielles à la réplication de l’ADN
1 brin coupé
surenroulements modifiés de +1 ou -1

Question 33

inhibiteur topoisomérases I

Answer 33

Topotécan:
agent antiK
antinéoplasique
antimitotique
utilisé dans traitement du K de l'ovaire

Question 34

topoisomérases II

Answer 34

permet séparation des molécules d’ADN filles lors réplic
2 brins coupés
surenroulements modifiés de +2 ou -2

Question 35

inhibiteurs toposiomérases II

Answer 35

Doxorubicine: traitement des tumeurs liquides

Acide nalidixique: inhibe la s-u gyrA de l’ADN gyrase bactérienne

Novobiocine, quinolone: inhibe la s-u gyrB

Question 36

effets alcali ARN

Answer 36

hydrolyse alcaline par coupures stats du brin

gr alcool IIR en C2 attaqué par base HO⁻ → disco molécule d’eau

Question 37

SDS

Answer 37

détergent

désorganise les mb lipidiques

Question 38

protéinase K

Answer 38

hydrolase

hydrolyse prot

Question 39

extraction lipides

Answer 39

phénol
chloroforme
alcool isoamylique