prokaryotic genetic Flashcards
ökaryotlarda post transcriptional işlemler nerede gerçekleşiyor
çekirdek
repressor protein ne işe yarar
DNA’ya bağlanarak RNA polymerazın bağlanmasını engeller ve transkripsiyon gerçekleşmez
genelde operator site’a bağlansa da promoter site’a da bağlanan vardır
activator
RNA polymerase’ın DNA’ya bağlanmasını kontrol eder ve pozitif etki yapar
genelde promoter site’a bağlasa da operator site’a da bağlanan vardır
cystrone
gen için kullanılan başka bir terimdir
proteinlerin alt birimlerini kodlar
ökaryotlarda her bir subunit için ayrı bir mRNA kodlanırken(monocstronic) prokaryotlarda bir mRNA birden fazla subunit kodlar yani birden fazla cystron bulundurur(polycistronic)
operon neler içerir ve bu kısımların görevleri nelerdir
regulatory gene: represson genin sentezine izin verir
terminator sequence nedir
genin son kısmını belirtir
Lac operon …. regulated by lac repressor
negatively
Trp operon … regulated by trp repressor
positively
repressordeki alloseric part nedir ne işe yara
repressorün inactive kısmıdır
laktoz bağlandığı zaman inaktif olur ve operon tercüme edilir
trp bağlandığında aktif olur ve operator’e bağlanarak genin tercüme edilmesini engeller
laktozu parçalayan enzimler nelerdir
B-galactosidase, galactoside permase, thiogalactoside transacetylase
laktoz ortamda yoksa ne gözlenir
ortamda allactose olmadığından repressor aktiftir ve operator’e bağlanır. Operondan mRNA sentezlenmez
laktoz ortamda varsa ne olur
B-galactosidase allactose sentezler ve allolactose lacl’a bağlanır ve inaktif eder. operondan genler sentezlenir
CAP ile düzenlemeye ne denir
catabolite repression
laktoz varken glikoz azsa ne olur
cAMP konsantasyonu artar ve CAP proteinine bağlanabilir. CAP kendi kısmına bağlanır RNA poly. ı hızlandırır
laktoz varken glukoz çoksa ne olur
cAMP konstantrasyonu azalır ve CAP proteinine bğlanamaz ve CAP aktif olamaz. bundan dolayı DNA’ya CAP bağlanmaz. RNA poly. yavaş ilerler
CAP’ RNA polymerase’ın neresine bağlanır
alpha sub unite
hem glukoz hem de laktoz olmadığı zaman CAP ne yapar
cAMP çok fazla üretilir CAP DNA’ya bağlanır anca repressor protein de bağlı olduğu için transkripsiyon gerçekleşmez
glukoz varken ama laktoz yokken CAP’e ne olur
glukoz çok olduğundan dolayı cAMP az salgılanır ve CAP aktif olmaz bundan dolayı bağlanmaz. Laktoz olmadığından dolayı DNA’ya repressor bağlıdır transkripsiyon gerçekleşmez
aporepressor’ün yapısı nasıldır
iki bağlanma kısmı vardır birine corepressor olan tryptophan bağlanır diğer yerle ise aporepressor DNA’a ya bağlanır
hücredeki Trp azsa ne olur
reprssor DNA’ya bağlanmaz ve mRNA sentezi gerçekleşir
hücredeki Trp fazlaysa ne olur
repressor DNA’ya bağlanır ve transkripsiyon gerçekleşemez
leader peptide sekansındaki kodonlar nelerdir
UGG UGG sonunda UGA(stop kodonu) var
2-3 sekans base pairing
antitermination
3-4 sekans base pairing
termination
Trp fazlaysa ne olur (2)
Trp-tRNA UUGUUG kısma hızlıca Trp bulduğu için bağlanabilir ve ribozom durmadan ilerler. Bu sayede 1 ve 2. kısım geçilir 3 ve 4. kısım birbirine bağlanır bu da diğer proteinlerin transkripsiyonunu engeller
Trp azsa ne olur (2)
rTrp az olduğu için tRNA UGGUGG kodonu için Trp arar ve zaman harcar. Zaman harcandığı için 2 ve 3. kısım bağlanır. Transkripsiyon devam eder
neden ökaryotlarda attenuation gerçekleşmez
çünkü transkripsiyon çekirdekte stranslasyon stoplazmada gerçekleşir