Cell Death Flashcards
apoptsis’in fazla gerçekleşmesi sonucunda hangi hastalıklar oluşur
huntington disease
ALS
shigeliosis
AIDS
stroko
myocardial inferction
Ced-4 ve Ced-3 ne yapar görevleri nelerdir
Ced-4, Ced-3’ü aktive eder ve beraber hücre ölümünü (apoptosis) uyarırlar
Ced-9 ne işe yarar
hücre ölümünü kontrol eder
Ced-4’e negatif etki yapar ve hücre ölümünün gerçekleşmesini engeller
Caspase’lar nedir ve özellikleri ve görevleri nelerdir
Cysteine dependent protease
Hepsi inaktif olarak sentezlenirler
Cleavage sonucu aktif olurlar ve genelde aspartic asit kısımlarından kesilirler
aktive olduktan sonra başka capase’ları aktive ederle
IAP proteinailesi ile kontrol edilirler (inhibitor of caspases)
executioner caspase ne yapar
CAD enzimini inaktif tutan iCAD enzimini keser
CAD enzimi 1 nükleozom 2nükleozom 3 nükleozom şeklinde DNA’yı kesmeye başlar ve ladder formasyonunu oluşturur
Caspse’larn kesmekle görevli olduğu yapılar nelerdir
DNA kesiminde rol oynar (executation caspase)
Nuclear lamina kesimi
Cytoskeletal proteinlerin kesimi
golgide protein kesimi
scramblase
initiator caspase’lar hangileridir
2, 8, 9, 10
executioner caspase’lar hangileridir ve görevleri nelerdir
3, 6, 7
aktive edildikten sonra initiator casoase’ları aktive ederler
IPA protein ailesi görevi nedir
caspase’ları kontrol ederler
caspase’lar ile direkt etkileşime girerler
Bcl-2 protein ailesi ne iş yapar
caspase’ları kontrol eden ana protein ailelerinden biridir
hepsi BH3 protein domain’i içerir
pro-apoptotic Bcl-2 proteinleri
BAK, BAX, BOK
Anti-apoptotic Bcl-2 proteinleri
Bcl-2, Bcl-X, Bcl-W
BH3-only olan prapoptotic proteinleren biri
Bim
normalde inaktifler
BAK ve BAX nerelerde bulunur
BAK ölüm sinyali olmasa bile mitokondri zarında bulunur
BAX ise sitoplazmadadır ve ölüm sinyali geldiğinde mitokondriye gider
Hücre sağlıklıyken nasıl apoptoza gitmez
anti Bcl-2 ailesi pro olanlara bağlanır ve onları inaktif tutar
bis sinyal geldiğinde BIM anti olanların hepsini alır ve pro’ların aktive olmasını sağlar
instrinsic pathway nasıl çalışır
sinyal gelir ve mitokondriyi uyarır
mitokondri cytochtome c salgılar
CC APAF1 ile bağlanır
7 tane APAF1 + CC bir araya gelir ve apoptosome oluşturur
apoptosome caspase-9 ve CARD komplseksine bağlanıp onları aktifleştirir ve sonra diğer caspase’ler aktifleşir ve apoptosis gerçekleşir
extrinsic pathway nasıl çalışır
killer lemfosit gelir ve ölmesi gereken hücrenin üçlü FAS reseptörlerine bağlanır ardından FADD ve Caspase8 içerden bu reseptöre bağlanır, DISC kompleksi oluşur Caspase-8 aktive olur ve kesilir sonrasında ölümü gerçekleştiren diğer caspase’ları aktive eder
cytotoxic lymphocytes ne yapar
içlerinde belli zehirli proteinler vardır
Reseptör ve ligand olmadan extrinsic pathway’i çalıştırır
Perforin içeri alınacak ve apoptosis i tetikleyecek olan Granzyme B iiçin pore oluşturur ölecek hücrenin zarında ve Granzyme B çeşitli pathway’leri uyarır
Atm - chk2 - p53 pathway nasıl çalışır
nomal hücrede p53 azdır
ancak hücre döngüsünde bir sıkıntı olursa chk2 p53 mktarını arttırır ve önce hücre döngüsünde eciikme ve eğer düzelme olmazsa hücre ölümü olur
necrosis nasıl gerçekleşir
dışarıdan ekstreme bir uyarı gelir
Ca++ seviyesi artar
Calpain’ler uyarılır
Cathepsin’ler uyarılır
hücre patlar
autophagy nedir çeşitleri nelerdir
self-eating
macro autophagy
micro autophagy
chapherone meidated autophagy
otofaji çeşitleri nasıl gerçekleşir
macro: veziküllerle besinler lizozoma taşınır
micro: moleküller kendileri lizozoma gider
şaperon: KFERQ sekansı içeren proteinler şaperonla tarafından lizozoma götürülür