Présentation antigénique Flashcards
Comment démontrer quel isotope de classe II restreint la présentation d’une protéine donnée?
- immunise avec différents Ag our produire des Ac
- H-2d x H-2k
- chez la progéniture = i-Ak, I-Ad, I-Ek, I-Ed
- on génère une réponse T contre OVA et on se demande quel classe 2 est responsable de la réponse
- réponse T : cellules G de la rate de la souris F1 immunisés avec OVA + CPA exprimant uniquement I-Ak ou I-Ad ou I-Ek ou I-Ed
- cette expérience démontre que dans la souris F1, la présentation de l’épitoge OVA est restreinte par le classe II I-Ad
- IL-2 est seulement produit avec I-Ad (seule a présenter les peptides de OVA)
Le CMH lie des peptides mais lesquels?
- besoin de temps pour faire la présentation (ex : fixation au glutaraldehyde)
- on peut produire des peptides synthétiques
- séquence de a.a de OVA
- lorsque peptides se chevauchent démontre quel épitoge st présenté à la cellule T et active le système immunitaire (ont réagit)
- on test différents peptides
- mesure de la liaison aux cellules lorsque les protéines sont radioactives
- lequel fixe un peptide radioactif donc IAd fixe le peptide OVA
Fabrication de vaccins : l’immunogène comporte des séquences capables de lier le CMH II et si oui, quels isotopes? : ex Covid-19
- plusieurs protéines candidates pour faire le vaccin
- on veut la plus grade couverture de la population
- Ac contre spike (récepteur du virus)
- on connait séquence de protéine spike
Identifier directement les peptides liés par le CMH de classe II
- savoir quels sont les peptides de classe 2 sans faire de tests fonctionnels
- capable de cartographier les peptides de spike
- Ag spike est présenté au CPA
- présentation sur CMH à la surface des CPA
- immunoprécipitation avec Ac spécifiques (permet d’isoler les peptides présentés sur les CMH)
- édition acide des peptides (permet de libérer les peptides des molécules de CMH
Peptidome
- en fonction de leur masse, la composition en a.a des peptides est déduite
- ensuite, des recherches in silico dans les bases de données des protéines de l’espèce à l’étude permettent de trouver quelle protéine contient cet agencement d’a.a et donc de recréer la séquence primaire du peptide
- le peptide est constitué principalement de peptides du soi (qui ont été dégradés)
- mais si on est infecté avec virus, on va aussi voir des peptides virus
- on peut déterminer le peptidome de différents
isotypes (par exemple HLA-A vs HLA-B) et de
différents allèles (allotypes) (HLA-B7 vs
HLA-B27). - même concept pour les classe II : le polymorphisme du CMH oblige parfois les peptides à posséder des acides aminés précis pour se lier dans les poches de la niche.
Évasion ou subversion
- les pathogènes attaquent différents système inhérents au fonctionnement de la cellule afin d’assurer leur survie et/ou leur propagation
3 types de façon que les pathogènes affecte le système immunitaire
- camouflage
- sabotage
- exploitation
Sabotage : classe I : transcription
- adénovirus 12 : code pour la protéine E1A-12 qui inhibe le gène pour la transcription, moins de classe I, TAP et LMP
Sabotage : classe I : transport peptidique
- HSV ICP47 : baisse activité de TAP par compétition avec peptides (s’insère dans transporteur TAP et empêche les peptide de passer)
- HCMV US6 : moins de TAP (certains allèles) (force la dégradation de TAP donc moins de peptides
- Ad E3 19K : baisse activité tapasine en liant TAP
Sabotage : classe I : internalisation
- HIV NEF : spécifique pour HLA-A et HLA_B (+ impliqué dans l’activation T et B) mais pas HLA-C (si à la surface les NK ne vont pas être activées car présence CMH I)
- Kapos’is sarcoma associated herpesvirus (KHSV) K3 et K5
- Murtine gamma-2 herpesvirus 68 (MHV68) K3
- quand K3 diminue on diminue aussi l’expression de molécules de classe I
Sabotage : classe I : destruction
- HCMV US2 et US11 : dislocation cytologique et dégradation par le protéasome, requiert la queue du classe I
Sabotage : classe II : transcription
- HIV Tat : diminue expression de surface des classe II causée par une titration (fixation) des facteurs de transcription (transcription de gènes de classe II)
- mycobactérium : baisse transmission du signal par l’INF-g
Sabotage : classe II : protéolyse
- salmonella : baisse de fonctions lysosomales par injection de médiateurs à partir de la bactérie extracellulaire
- hélicobacter pylori toxine Vac A : baisse dégradation de li en modulant Rab7 (empêche dégradation chaine invariante donc pas de chargement de peptides)
- mycobacterium : baisse fonctions lysosomales par sécrétion d’ammonium
- BPV E5 : baisse des fonctions lysosomales par expression d’un homologue inactif des pompes à proton (empêche la digestion de protéines)
Sabotage : classe II : rétention et dégradation
- EPV : homologue de l’IL-10 (cytokine anti-inflammatoire donc pour arrêter l’inflammation donc ça diminue la réponse immunitaire
- MCMV : augmente la sécrétion d’IL-10 (force la sécrétion, down-régule l’expression CMH2 en surface)
IL-10 : schéma
- quand juste INF-g : classe II en surface sur HLA-DR
- quand ING-g + IL-10 : classe II dans les vésicules donc IL-10 force internalisation de classe II donc pas de présentation