Dysfonction, épuisement et sénescence cellulaires Flashcards

1
Q

Réponse T effectrice normale

A
  • une réponse T effectrice efficace nécessite:
    1. une reconnaissance de l’antigène + signaux 2 et 3
    2. une prolifération/différentiation de la cellule activée
    3. une fonction effectrice vers une cellule cible
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2
Q

3 types de dysfonctions

A
  • cellule anergique : cellule présentant un défaut de prolifération et de réponse effectrice en raison d’une stimulation sous-optimale (signal 1 sans signal 2 (CD40 et CD40L)) lors de son activation (« priming »)
  • cellule sénescente : cellule dans un stade de différentiation terminal en raison d’une prolifération excessive, cet état est associé à un arrêt irréversible du cycle cellulaire et à des télomères courts (beaucoup de prolifération donc les chromosomes sont courts)
  • cellule épuisée (« exhausted ») : cellule soumise à une stimulation excessive et continue par un antigène persistant, cette cellule présente des capacités prolifératives et des fonctions effectrices altérées et exprime des marqueurs d’épuisement (récepteurs inhibiteurs ou « exhaustion markers »)
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3
Q

Tableau comparaison des types de dysfonction

A
  • diapo 5
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4
Q

Cellule anergique

A
  • cellule présentant un défaut de prolifération et de réponse effectrice en raison d’une stimulation sous-optimale (signal 1 sans signal 2) lors de son
    activation (« priming »)
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5
Q

Anergie

A
  • défaut de prolifération et de réponse effectrice en raison d’une stimulation sous- optimale (signal 1 sans signal 2) lors de l’activation d’une cellule T (il y a engagement du TCR)
  • l’activation d’une cellule nécessite une co-stimulation par CD28 qui induit l’activation de la voie des MAPK de AP1 et la production d’IL-2
  • en absence de co-stimulation, pas de production d’IL-2 et pas de prolifération
  • soit interruption du signal 2 CD28 arrête d’interagir), pas de signal 2 (CPA n’a pas de ligand CD28), ou signal 2 inhibiteur (signal inhibiteur au lieu d’activateur)
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6
Q

Anergie et tolérance périphérique

A
  • la tolérance centrale est assurée dans le thymus lors de la sélection négative (TCR de forte affinité pour un complexe CMH/peptide du soi)
  • toutefois, certains clones échappent à la sélection négative (car tous les peptides du soi ne sont pas présentés)
  • des cellules auto-réactives peuvent donc sortir du thymus => nécessité de mécanismes de tolérance périphérique
  • ces cellules anergiques et les Tregs sont connues depuis longtemps pour leur rôle dans la tolérance périphérique
  • ceci est particulièrement vrai dans les muqueuses, un environnement immunotolérant aux antigènes du soi, mais également au microbiote ou aux antigènes dérivés des aliments
  • les Tregs et les cellules anergiques partagent un répertoire TCR commun, suggérant un lien entre ces deux populations
  • en effet, les Tregs muqueuse régulant les réponses T contre les antigènes microbiens semblent dériver de cellules T anergiques
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7
Q

Cellule sénescente

A
  • cellule dans un stade de différentiation terminal en raison d’une prolifération excessive
  • cet état est associé à un arrêt irréversible du cycle cellulaire et à des télomères courts
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8
Q

Sénescence

A
  • la sénescence est une dysfonction qui apparait graduellement au cours des divisions répétées et qui est associée à un raccourcissement des télomères
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9
Q

3 phases du développement de la sénescence

A
  • phase 1 : induction (raccourcissement des télomères, dommages ADN non télomériques (ROS, radiation ionisante, UV), manque de facteur de croissance)
  • réversible entre la phase 1 et 2
  • phase 2 : réponse aux dommages de l’ADN (réponse au stress oxydatif, formation du DNA foci, voies ATM et ATR)
  • irréversible lorsqu’on arrive à la phase 3
  • phase 3 : arrêt de croissance (sénéscence) (plus capables de réparer les télomères)
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10
Q

Phénotype et fonction des cellules sénescentes et épuisées

A
  • les cellules sénescentes sont présentes dans les infections virales chroniques avec quantité d’antigène limitée (mais récurrent) ➔ ≠ cellules épuisées
  • les cellules sénescentes expriment CD57 (pas habituellement sur les T) et KLRG-1 ainsi que des KIR (marqueurs NK) et peuvent produire des quantités importantes de molécules effectrices (perforine, IFN-gamma, TNF-alpha) ➔ ≠ cellules épuisées (perdu la capacité de proliférer mais pas la fonction effectrice)
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11
Q

Métabolisme des cellules sénescentes et épuisées

A
  • les cellules sénescentes utilisent davantage la glycolyse que la respiration mitochondriale (mitochondries géantes et dysfonctionnelles dans ces cellules très différenciées) ➔ ≠ cellules épuisées
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12
Q

Marqueurs de sénescence

A
  • les marqueurs de sénescence et d’épuisement ne sont pas toujours spécifiques
  • CD57 et KLRG1 sont de relativement bons marqueur de sénescence (mais pas exclusifs)
  • la perte de CD28 (pas d’IL-2 donc pas de prolifération) et le gain de CD57 sont caractéristiques des cellules sénescentes
  • l’expression de marqueurs d’épuisement n’est pas spécifique de la sénescence
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13
Q

Vieillissement et sénescence

A
  • la production thymique diminuée est « compensée » par une prolifération périphérique
  • si cette prolifération est très importante, elle conduit à un état favorable au développement de la sénescence
  • si il y a moins de nouveaux T, on compense avec une prolifération périphérique
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14
Q

Sénescence accélérée

A
  • les expressions de CD28 et CD57 sont souvent mutuellement exclusives
  • la proportion de cellules T CD57+ augmente avec l’âge (CD4 et CD8)
  • l’infection par le VIH accélère ce vieillissement immunologique
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15
Q

Cellule épuisée

A
  • cellule soumise à une stimulation excessive et continue par un antigène persistant
  • cette cellule présente des capacités prolifératives et des fonctions
    effectrices altérées et exprime des marqueurs d’épuisement (récepteurs inhibiteurs ou « exhaustion markers »)
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16
Q

Histoire naturelle de la réponse normale

A
  • après infection ou vaccination, activation des LT naïf et différentiation en LT effecteurs en quelques jours
  • différentiation + forte prolifération + reprogrammation transcriptionnelle, épigénétique et métabolique qui permet à la cellule T d’acquérir des capacités de migration et des fonctions effectrices
  • après le pic d’expansion, l’inflammation diminue, l’antigène est éliminé et la plupart des LT effecteurs meurent, mais un faible nombre persistent sous forme de LT mémoires
  • la différentiation en LT mémoire est caractérisée par une diminution du programme effecteur, mais par le gain de la capacité à générer une réponse effectrice très rapide suite à une nouvelle exposition
  • les LT mémoires sont maintenus par divisions lentes en réponse à IL-7 et IL-15
  • la génération d’une mémoire fonctionnelle se fait donc alors que l’antigène a presque totalement disparu et que l’inflammation est contrôlée
  • mais que se passe-t-il dans les lymphocytes T au cours des infections persistantes ou des cancers, lorsque l’antigène et l’inflammation persistent ?
    • fonction effectrice altérée avec perte progressive des fonctions
    • expression de plusieurs récepteurs « inhibiteurs »
    • expression altérée de facteurs de transcription
    • désordres métaboliques
    • génération de la mémoire altérée
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17
Q

Réponse dysfonctionelle au cours des infections virales chroniques

A
  • la persistance de l’antigène à un niveau élevé induit des modifications épigénétiques, transcriptionnelles, phénotypiques et fonctionnelles des cellules T
  • l’épuisement des cellules T se caractérise par
    • une prolifération altérée
    • une production réduite de molécules effectrices (pas de fonction effectrice)
    • l’expression de récepteurs inhibiteurs (ou régulateurs négatifs, ou « immune checkpoints »)
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18
Q

Télomères

A
  • complexes de 4 molécules CMH qui sont associées avec un peptide spécifique et liées à un fluorochrome
  • ils permettent de quantifier et de caractériser les cellules T spécifiques d’un complexe CMH/peptide donné par cytométrie de flux
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19
Q

L’épuisement des lymphocytes T (souris)

A
  • tout d’abord décrit chez la souris (LCMV) puis chez l’homme (VHC et VIH)
  • perte de la production de cytokines
  • perte de la capacité de prolifération
20
Q

L’épuisement des lymphocytes T (VIH)

A
  • défaut de production de perforine par les CTL spécifiques du VIH
  • plus de fonction effectrice
21
Q

Mesure de la polyfonctionnalité des lymphocytes T

A
  • la cytométrie en flux permet l’étude de la
    polyfonctionnalité des cellules spécifiques d’un antigène
22
Q

Polyfonctionnalité des CD8 chez les contrôleurs du VIH

A
  • les T CD8 spécifiques du VIH des contrôleurs sont davantage
    polyfonctionnelles que celles des progresseurs
23
Q

Épuisement : perte hiérarchique des fonctions

A
  • la persistance de l’antigène conduit à la perte de production d’IL-2, puis de TNF-alpha puis d’IFN-gamma à une diminution des capacités prolifératives, à une augmentation de la sensibilité à l’apoptose
  • ces dysfonctions s’accompagnent de l’expression de récepteurs
    inhibiteurs à la surface de la cellule épuisée (PD-1, LAG-3, 2B4, CD160 etc…)
24
Q

Épuisement dans les maladies virales chroniques chez l’homme

A
  • la nature (nombre de fonctions) et la sévérité (magnitude) de l’épuisement ne sont pas identiques dans toutes les maladies virales chroniques
25
Q

Le développement de l’épuisement est progressif

A
  • l’épuisement est causé par une stimulation excessive et continue par un antigène persistant
  • celle-ci conduit à l’expression de récepteurs inhibiteurs
  • la signalisation par ces récepteurs inhibe l’activation de AKT (phosphorylé par PI3K), ce qui induit l’arrêt du cycle cellulaire
26
Q

Épuisement et génération de la mémoire

A
  • les cellules T épuisées expriment faiblement CD122 (chaine beta des récepteurs à IL-2 et IL-15) et CD127 (chaine alpha du récepteur à IL-7), les récepteurs des cytokines maintenant la mémoire T (pas vraiment de mémoire mais vue que Ag persiste elles sont maintenues)
  • elles dépendent de la persistance de l’antigène pour leur maintien (« addiction à l’antigène»), contrairement aux cellules mémoires
27
Q

Médiateurs de la dysfonction

A
  • récepteurs inhibiteurs
  • cytokines immunorégulatrices (IL-10, TGF-beta)
  • cellules T régulatrices (Tregs)
  • fonctions altérées des APCs
28
Q

IL-10 et dysfonction

A
  • l’IL-10 peut altérer l’activation des cellules T ainsi que leur prolifération
  • l’IL-10 contribue également à l’épuisement
  • le blocage de l’IL-10 permet de restaurer la fonction effectrice et le développement
    des cellules mémoires
29
Q

Récepteurs inhibiteurs

A
  • de nombreux récepteurs inhibiteurs (ou immune checkpoints ou régulateurs négatifs) sont associés à l’épuisement des cellules T
  • jouent un rôle important dans la tolérance au soi et dans la prévention de l’auto immunité
  • peuvent être exprimés temporairement par des cellules T activées fonctionnelles
  • toutefois, l’expression prolongée et/ou forte de plusieurs récepteurs inhibiteurs est caractéristique des LT CD4 et CD8 épuisés (chez l’animal et l’homme)
30
Q

Mécanismes de régulation des récepteurs inhibiteurs

A
  • compétition (pour inhiber la costimulation)
  • inhibition de facteurs intracellulaires dans la voie du TCR
  • activation de gènes d’inhibition
31
Q

Compétition CTLA-4

A
  • CTLA-4 est en compétition avec CD28 pour se lier à CD80/CD86
  • son affinité pour CD80/CD86 est plus grande que celle de CD28
  • en plus de la compétition, CTLA-4 induit un signal négatif dans la cellule en inhibant la voie du TCR
32
Q

Compétition LAG-3

A
  • LAG-3 est en compétition avec CD4 pour se lier au HLA II
  • son affinité pour MHCII est plus grande que celle de CD4
  • en plus de la compétition qui inhibe la voie du TCR (pas d’activation de CD4 => pas d’activation de lck), LAG-3 induit un signal négatif dans la cellule (motif KIEELE) qui
    induit un arrêt de prolifération et de fonctions effectrices
33
Q

Inhibition de la voie du TCR par PD-1

A
  • la queue cytoplasmique de PD-1 contient un motif ITIM et un motif ITSM
  • après liaison à PD-L1 ou PD-L2, ITSM recrute SHP-1 et SHP-2 qui inhibe l’activation de PI3K (et donc AKT) dans la voie du TCR
  • mais PD-1 pourrait également jouer un rôle plus proximal dans l’inhibition de la voie du TCR…
  • PD-1 active la transcription du gène BATF (« basic leucine transcription factor, ATF-like »), un facteur de transcription de la famille AP-1
  • le « knock out » de BATF restaure la production d’IL-2
  • BATF inhibe la transcription de gènes effecteurs
34
Q

Les multiples mécanismes de PD-1

A
  • inhibition de la voie du TCR (zap70)
  • diminution de la prolifération et de la survie par PI3K
  • inhibition de la transcription de gènes codant pour des molécules effectrices par induction de BATF
35
Q

PD-1 : ex de molécule liée à la dysfonction

A
  • les cellules T CD8 spécifiques du VIH expriment de forts niveaux de PD-1, qui corrèlent avec la charge virale
36
Q

Degrés de l’épuisement

A
  • les cellules épuisées ne sont pas toutes semblables, il existe des degrés d’épuisement
  • la fonction des cellules PD-1mid Tbethi peut être restaurée en bloquant PD-1, alors que celle des cellules PD-1hi EOMEShi ne peut pas l’être
37
Q

Expression de plusieurs récepteurs inhibiteurs

A
  • l’infection chronique par LCMV est caractérisée par l’expression de plusieurs récepteurs inhibiteurs à la surface des CTL
  • la majorité des cellules spécifiques de l’antigène expriment (au moins) 3 ou 4 de ces récepteurs (PD-1, LAG-3, CD160, 2B4)
38
Q

Ac utilisés pour moduler la réponse immunitaire

A
  • il existe de nombreux anticorps utilisés en
    immunothérapies
  • ceux bloquant les récepteurs négatifs constituent une nouvelles classe nommée « immune checkpoint inhibitors » (ou blockers)
  • ce sont des anticorps monoclonaux, souvent humanisés, dirigés contre des récepteurs inhibiteurs (ou leurs ligands) afin de restaurer la fonction effectrice des lymphocytes T
39
Q

Blocage des récepteurs négatifs

A
  • le blocage de l’interaction entre PD-1 et ses ligands pourrait augmenter les fonctions effectrices d’une cellule T épuisée
40
Q

Immune checkpoint blockers

A
  • ils sont maintenant largement prescrits dans le traitement du cancer
    (mélanome, essais contre d’autres formes de cancer en cours)
  • leur efficacité dans le traitement des infections virales chroniques est à l’étude
  • ils causent souvent des effets secondaires
41
Q

Blocage de PD-1

A
  • le blocage de l’interaction PD-1/PD-L1 restaure la fonction des cellules T spécifiques du VIH
42
Q

Immune checkpoint blockers et mélanome

A
  • efficacité de ipilimumab (CTLA-4) + nivolumab (PD-1) pour la réduction des tumeurs dérivées de mélanomes
  • augmentation de la survie de patients avec mélanome avancé après administration de ipilimumab et nivolumab
43
Q

Blocages multiples

A
  • la restauration des fonctions effectrices des cellules très épuisées requiert le
    blocage de plusieurs récepteurs inhibiteurs (et de l’IL-10)
44
Q

Épuisement : un nouveau stade de différenciation des LT?

A
  • la persistance de l’antigène conduit au phénotype « épuisé » et s’accompagne de changement transcriptionnels (et
    épigénétiques)
  • le facteur de transcription Tbet est exprimé à un fort niveau dans les cellules effectrices, il inhibe l’expression du gène codant pour PD-1 (Pdcd1)
  • en revanche, Foxo1 (et Eomes) sont très exprimés dans les cellules épuisées
  • Foxo1 induit la transcription de PD-1, de Eomes et de Bcl2 (survie)
  • l’épuisement peut donc parfois être lié à un programme anti-apoptotique
  • les profils transcriptionnels des cellules épuisées, effectrices et mémoires sont distincts
  • bien que Eomes, BATF et FOXO1 soient plus exprimés dans ces cellules, ils peuvent aussi être exprimés de manière transitoire dans des cellules activées et/ou mémoires
  • le blocage des récepteurs inhibiteurs induit une augmentation transitoire des fonctions effectrices, ce qui suggère que les cellules épuisées constituent une sous-population de cellules distinctes des effectrices et des mémoires
  • le profil épigénétique (méthylation de l’ADN, acétylation des histones) des cellules épuisées est distinct de celui des cellules effectrices ou mémoires et n’est pas modifié par le blocage de PD-1 par exemple
  • les cellules épuisées ont donc un profil transcriptionnel et épigénétique stable, ce qui indique qu’elles constituent un nouveau stade de différenciation de cellules T
45
Q

Le degré d’épuisement influence la réponse au blocage de PD-1

A
  • au stade d’épuisement final (TCF-1lo), le blocage de PD-1 a peu d’effet sur la fonction des cellules T
46
Q

L’épuisement est lié à une reprogrammation épigénétique

A
  • l’augmentation de PD-1 à la surface des cellules épuisées est graduel, il est lié à des modifications épigénétiques
  • il s’accompagne de la perte de TCF-1 (associé aux capacités d’autorenouvellement)
  • au stade terminal de l’épuisement, les cellules ne répondent plus au blocage de PD-1 (« ICB non responsive »)
47
Q

TOX: un nouveau régulateur de la
différenciation des cellules T épuisées

A
  • TOX (facteur de transcription) n’est pas requis pour la formation des lymphocytes T effecteurs et mémoires, mais il est essentiel pour l’épuisement: en l’absence de TOX, les cellules Tex (=épuisées) ne se forment pas
  • cellule épuisée probablement important (rôle dans la fonction des cellules)