CMH Flashcards
1
Q
Réponse T en fonction de virus
A
- virus infectieux = classe 1 et 2
- virus inactivé = pas de classe 1 car pas de synthèse de protéines virales mais oui classe 2
- virus infectieux + emetine (boue synthèse protéine) = CMH1 et pas CMH II (CMHII n’est pas affecté car ne dépend pas de la synthèse de protéines)
- virus infectieux + chloroquine (empêche acidification des vésicules) = CMH1 et pas II car pas d’activation de protases pour couper les peptides donc pas de digestion)
2
Q
Voie endogène
A
- virus entre dans la cellule
- libère son ARN
- utilise la machinerie de la cellule pour synthétiser ses protéines
- dégradation par le protéasome
- présenté aux molécules de classe 1
3
Q
Voie exogène
A
- virus s’attache au récepteur
- récepteur est endocytosé
4
Q
Comment les protéines virales seront-elles présentés sur le CMH de classe 2?
A
- les protéines peuvent entrer par la voie endocytaire par autophagie
5
Q
Autophagie
A
- Ag forme un photophore avec une double membrane
- forme un autophagosome
- fusionne avec les compartiments endocytaires
- l’autophagie permet de présenter sur le CMHII des Ag viraux provenant de virus infectieux qui se retrouvent dans le cytoplasme sans passer par les endo-lysosomes acides riches en CMHII et HLA-DM
- les cellules dendritiques peuvent aussi micropinocytoser des virus infectieux circulants et les présenter comme les Ag exogènes par la voie endocytaire et présenter à CMH2 comme virus inactivé
6
Q
Cross-présentation des Ag exogènes : voie vacuolaire
A
- phagosome du RE
- membrane du RE peut aider à la phagocytose
- amène beaucoup d’enzymes du RE
- TAP dans membrane du RE
- RE mobile donc peut présenter par la voie endogène CMH1
- Ag exogènes dans le RE ou vacuole sont présentés par CMH1 par la voie endocytaire
7
Q
Cross-présentation des Ag exogènes : voie vacuole vers cytosol
A
- Ag pris par phagosome par voie endocytaire
- Ag sort de la vésicule et vas dans le cytosol et devient une protéine endogène
- est dégradé dans le protéasome
- surtout par DC
8
Q
Comment les peptides sont-ils générés dans la voie classique?
A
- ubiquitine active E1
- transfère de E1 à E2
- E2 va aider E3 à transférer ubiquitine au substrat
- E3 you un rôle dans la spécificité pour reconnaitre le substrat
- plusieurs cycles pour avoir plusieurs ubiquitines
- cela marque la protéines pour ls digestion
- protéasome a une fonction ubiquitaire et digère les peptides
- peptides sortent du protéasome
- différents types d’ubutiination mais poly-Ub veut dire dégradation par le protéasome
- le prtéasome peut être ouvert ou fermé
9
Q
Protéasome
A
- dégradation sélective des protéines dans le noyau et le cytoplasme des cellules eucaryotes
- complexe d’un coefficient de sédimentation de 20S contenant 2 copies de 14 polypeptides différents
- 7 alpha-type formant les extrémités
- 7 beta-type formant les anneaux centraux, activité protéolytique associée à 3 des sous0unit.s beta ayant chacune leur spécificité
- sites activés (3 protéines)
- passage de la chaine polypeptidique à l’intérieur du protéasome et couper des liaison peptidiques par les sous-unités b1,b2 et b5
10
Q
Immuno-protéasome
A
- augmente l’abondance et la diversité des peptides liés au CMH I
- nettoyer la cellule suite ç l’inflammation
- 3 sous-unités catalytiques sont remplacées par des sous-unités qui répondent à l’INF-g
11
Q
Quelle est la source des peptides?
A
- les peptides provient des protéines dégradées rapidement alors que les protéines les plus abondantes ont généralement une longue demi-vie
- une large proportion des peptides sont générés à partir des DRiPs et ces sous-produits sont générés de façon variable pour différentes protéines
- DRiPs sont des bout de protéines et sont la source de protéines qui sont chargés sur CMH
12
Q
Comment les peptides sont acheminés aux classe 1?
A
- aminopeptidase continue à faire la digestion des peptides jusqu’à ce qu’on trouve la taille parfaite pour le CMH1
- peptides sont générés dans le cytosol dans le protéasome et sont acheminés dans le RE grâce à TAP 1 et 2
- ils utilisent de l’énergie de l’ATP pour transloquer ces peptides à travers la membrane du réticulum endoplasmique
- TAP 1 et TAP 2 sont des transporteurs qui sont responsable du transport des peptides produits par la dégradation des protéines
- une fois dans le réticulum, les peptides sont chargés sur les molécules de MHC I, qui, une fois le complexe formé, migrent vers la surface cellulaire pour être présentées
- spécifique aux Ags de classe 1
- les molécules TAP sont peu polymorphiques mais certains polymorphismes sont associés par exemple à certaines maladies auto-immunitaires
- quand arrive dans RE, il y a ERAP1 (protées) qui va digérer encore les peptides pour qu’ils puissent se lier parfaitement aux molécules de classe 1
13
Q
Différents Ags en fonction de inhibiteurs de protéasome si il va y avoir une épitope qui est présenté
A
- protéine (Ag complet) = pas d’épitopes
- épitoge avec queue c-terminale = peptide trop gros car c’est le protéasome qui enlève c-terminal
- juste épitope = oui
- épitoge avec queue n-terminale = ERAP se charge de la dégradation de n-terminal dans le RE donc pas besoin du protéasome
- donc ce n’est pas juste le protéasome qui génère des peptides et ils ont besoin de d’autres types de protases pour le faire
14
Q
Comment les peptides sont chargés sur les molécules de classe 1?
A
- glucosidases I et II digèrent les sucres pour ne laisser qu’une glucose
- la lectine calnexine lie le glucose
- la calnexine est remplacée par la calréticuline suite à la liaison de b2-m
- va recruter ERp57 (rôle dans la formation de ponts disulfures) et tapasine pour se rapprocher de TAO
- CMH 1 vide n’est pas sable et a besoin de molécules chaperones ou des peptides pour le stabiliser
- chargement des peptides donc quand il y a des peptides, les chaperones s’enlèvent
- GlsII enlève le glucose
- CMH I instables sont reglucosylés par UGT1 (donne une deuxième chance d’avoir un peptide)
- ce sont les mêmes molécules qui sont impliqués dans le repliement des protéines cellulaires (sauf TAP qui est spécifique au CMH)
15
Q
Peptide-loading complex
A
- tapasine (encodée dans le CMH) lie le domaine N de TAP
- tapasine recrute CMH1, b2-m et calreticuline
- tapasine liée par un pont S-S à ERp57 (structure cristalline)
- ERp57 lie CRT, permettant l’isomérisation des ponts S-S des protéines glycolysées
16
Q
Molécules voie endogène
A
- Calnexine: Chaperon ubiquitaire transmembranaire de type lectine et fixant les sucres
- Calréticuline: Similiaire à calnexine mais soluble
- ERp57: « Protéine disulfide-isomerase »Co-chaperon spécifique de glycoprotéines;
activité thiol-disulfide oxidoreductase. - Tapasine:Fait le pont entre TAP et class I; augmente le transport des peptides;
Retient les class I immatures dans le RE - TAP:Transporte les peptides; fait partie de la famille des transporteurs ABC (ATP-
binding cassette) - Protéasome:Dégrade les protéines « marquées » à l’ubiquitine
- LMP2 et LMP7: Inductibles à l’IFN-g (comme MECL-1). Façonne les peptides
- ERAP: (ER amino-peptidase); Façonne les peptides pour les classe I
- TPPII: Activité endo et exo peptidase; Laisse lys en C-ter. Pas induit par l’IFN-g
17
Q
Comment empêcher que le classe II s’associe à des peptides du RE qui sont destinés aux classe 1?
A
- chaine invariante bouche la niche
- sinon le CMHII prendrait n’importe quoi comme des peptides du CMH 1
- CMH 2 + la chaine invariante forme un nonamère
- trimérisation de la chaine invariante
- la chaine invariante a plusieurs autres fonctions comme la régulation des gènes
18
Q
Comment le classe II est-il apporté dans les endosomes et préparé pour la liaison des peptides?
A
- dans le RE et Golgi, on place la chaine invariante
- dans les endosomes et lysosomes (compartiments pour amener les peptides exogènes) il y a digestion de la chaine invariante et remplacement par le CLIP
- CLIP est relâché et peptides vont dans la niche peptidique
- p31 dans l’endosmose va digérer en p22
- va générer p10 puis enlève CLIP de la niche pour avoir 1-82 a.a
- protées coupe en li-Cy
19
Q
Molécules de classe II non-classiques servant de chaperons dans le chargement des peptides
A
- HLA DM et HLA DR sit tr;s similaires
- DM ne lie pas de peptide (pas de place) alors que DR oui
- évolution a donné HLA DM peu polymorphique
- DM a une niche peptidique très étroite et n’est pas exprimé en surface (dans les endosomes)
- DM s’associe à DR
- DM est le décapsuleur
- HLA DM agit sur les classe II classique en modifiant la structure de la niche du côté n-terminal du peptide et ainsi fragiliser les liens entre le classe II et les peptides instables
- si le lien est faible, DM peut défaire les liens et libérer le peptide et ensuite relâchement du CLIP
20
Q
HLA-DO
A
- toujours en association avec DM
- DM sert de chaperon pour DO car mauvais repliment
- DO va empêcher DR de s’associer à DM
- si DO est là, il n’y a plus de CLIP
- DO élargit le répertoire des peptides car il pourrait être capable que les peptides avec une plus faible affinité peuvent rester dans la niche
- des peptides qui sont normalement peu représentés à la surface deviennent plus prédominants en présence de DO
- allèle HLA-DOB quand normal : ne confère ni résistance ni sensibilité, quand gain de fonction : peut rendre l’individu plus susceptible à des infections, quand nulle ou perte de fonction : résistance accrue contre certains virus grâce à une meilleure réponse immunitaire (augmentation Ac)
21
Q
Génération des épitoges T CD4
A
- tout se passe dans l’endosome
- les lysosomes contiennent des enzymes hydrolytiques qui dégradent les protéines et d’autres substances
- les lysosomes ont un pH acide grâce aux pompes à proton
- les enzymes lysosomales fonctionnent de façon optimale à pH acide
- les hydrobases incluent les cathepsines (cystéine protées), quelques aspartate protases et une métalloprotéase (zinc)
- les endosomes précoces fusionnent avec les endosomes tardifs à et forme des lysosomes (pH baisse au fur et à mesure des étapes)
- il y a des changements dans les enzymes présents
- devient plus acide donc plus actif
- contient beaucoup de HLA DM
22
Q
Comment les antigènes sont-ils apportés aux compartiments vacuolaires?
A
- phagocytose (ingère molécules), macropinocytose (ex : protéines), endocytose (ex : récepteurs)
- toutes les voies evoient les Ag dans la voie endocytaire
23
Q
Récepteurs de surface
A
- sélectif
- concentrer les Ags
- ex: BCR augmente l’efficacité de présentation
- ex: récepteurs des protéines du choc thermique (heat-shock)
- diriger vers compartiments fonctionnels
- ex: « Mannose receptor » augmente l’efficacité de présentation croisée de OVA
- signalisation intracellulaire
- ex: la signalisation par la C-type lectine DNGR-1 augmente la présentation et la présentation croisée d’antigènes de cellules nécrotiques
24
Q
Macropinocytose
A
- non sélective
- permet la capture de grandes quantités de matériel extracellulaire
- ex: protéines, bactéries, virus
- très efficace chez les macrophages et DCs immatures
25
Q
Différence CMH I et II structure
A
- CMH I : petits peptides, niche fermée
- CMH II : niche ouverte, pas d’interaction au bout, lie de spetides plus gros, pas de limite de la taille de peptides
26
Q
Comment les épitopes servant à stimuler
les cellules T sont-ils captés par le CMH II ?
A
- capture tardive du CMH II : Ag sont dégradés en épitopes et se lient aux molécules du CMH de classe II après le clivage de la chain invariante et les complexe sont transportés à la surface de la cellule pour être présentés
- capture précoce du CMH II : Ag sont capturés à un stade précoce dans des compartiments intracellulaires, molécules du CMH de classe II interagissent avec la chaine invariante qui est ensuite clivée pour permettre le chargement des épitopes
27
Q
Voie exogène
A
- chaîne invariante (Ii; CD74) : Chaperon transmembranaire de type II
- bloque la niche peptidique
- stabilise les classe II
- encode les signaux de type « LL » pour le ciblage aux endosomes
- cathepsines: Cystéine exo- et endoprotéases. CatS induite par IFN-. CatL chez la souris dans les cellules épithéliales
- GILT: g-IFN-induced lysosomal thiol oxydoreductase; réduit les ponts disulfures
- HLA-DM: Lysosomal (motif YxxL), Classe II non-classique, Non polymorphique, Ne lie pas de peptides
- retire le CLIP
- edite les peptides pour favoriser ceux de haute affinité
- HLA-DO: CMHII non-classique, non polymorphique, Retenu dans le ER en absence de DM, ne lie pas de peptides
- inhibe DM dans les endosomes précoces seulement ;favorise la présentation des antigènes spécifiques internalisés par le BCR
- exprimé dans les lymphocytes B matures naifs et régulé à la baisse suite à l’activation
- surexpression dans les souris NOD réduit le diabète de type I
