per jamth enzymer ✓ Flashcards

1
Q

Vad är ett enzym och hur fungerar det?

A

Ett protein som katalyserar en kemisk reaktion.

Den sänker aktiveringseneregin (som alla katalysatorer)

Ingen av de enskilda reaktionerna i en cell vid metabolismen t.ex kan ske utan hjälp av ett specifikt enzym.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Förklara detta

E + S ES –> E + P

A

Enzym som binder substrat ger oss ett enzymsubstratkomplex och sen får man en produkt

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Vad är Kofaktorer?

ge exempel på två kofaktorer

A

En kemisk förening eller metall som inte är ett protein och som är viktig för den biologiska funktionen.

Metalljoner
CoA
NAD
FAD

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

vad är ett coenzym?

A

en kofaktor som är en organisk förening, kan innehålla metalljoner.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

förklara vad Kosubstrat är?

stärk med exempel

A

ett svagt bundet coenzym, ett coenzym som byts ut i varje katalytisk cykel.

Koenzym som inte är hårt bundet till ett enzym kallas kosubstrat.

t.ex CoA som kan ta upp en acylgrupp som acetat och blir då acyl-CoA. Acyl -CoA används av många olika enzymer i metabolismen, till exempel citratsyntas i citronsyracykeln.

NAD är också ett exempel på kosubstrat.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Vad är en Prostetisk grupp?

Ge exempel

A

ett coenzym som sitter kvar , coenzym som sitter starkt bundet till ett enzym.

Till exempel FAD och FMN. FAD kan ta upp två väteatomer och blir då FADH2.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Apo enzym

A

enzym utan sin cofaktor

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Holo enzym

A

enzym med cofaktor

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

mätning av enzymaktiviteter

A

E + S ES –> E + P
u = hastigheten = delta [P]/delta t

man vill mäta snabbt och effektivt –>
modellsubstrat används ofta där delta [P]/delta t är lätt att mäta.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

absorbans

A

hur mycket ljus ett visst ämne absorberar. Hur mycket ljus försvinner när ljuset går genom kuvetten

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

absorbans

A

hur mycket ljus ett visst ämne absorberar. Hur mycket ljus försvinner när ljuset går genom kyvetten

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Lambart beers lag

samt vad formelns tecken står för

A
A = E l c
A = absorbans
E = Extinction coefficient. Vaje ämne har en viss E vid en viss våglängd. 

l = våglängd på kyvetten

c = koncentrationen

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Alkaliskt fosfatas

A

Fosfatas - detta enzym hydrolyserar bort fosfatgrupper

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

mätning av enzymaktiviteter

A

E + S ES –> E + P
v = hastigheten = delta [P]/delta t

man vill mäta snabbt och effektivt –>
modellsubstrat används ofta där delta [P]/delta t är lätt att mäta.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

C = absorbansen genom E gånger l

C= A/E l

A

Lutningen i början är linjär och från den beräknas hastigheten i början (emission rate) = Vo

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

mät Vo vid olika substratkoncentrationer och plotta Vo som en funktion av [S]

A

Vo som funktion av [S] kallas mättnadskurva

Vo = V noll

17
Q

K kat är?

A

antal katalytiska cykler per sekund under normala betingelser

18
Q

K kat är?

A

antal katalytiska cykler per sekund under normala betingelser.

Det säger hur många katalytiska cykler ett enzym kan göra när det är mättad med substrat

Hu många cyklar en enzymmolekyl kan utföra när substrattillgång inte är begränsade.

19
Q

K cat är?

A

antal katalytiska cykler per sekund under normala betingelser.

Det säger hur många katalytiska cykler ett enzym kan göra när det är mättad med substrat

Hu många cyklar en enzymmolekyl kan utföra när substrattillgång inte är begränsade.

20
Q

vad är Km?

A

Den substratkoncentration där enzymet arbetar på halva sin macimala kapacitet.

den substratkoncentration som ger halvmättnad dvs. när Vo = Vmax/2
enhet: M
Varje enzym har ett visst Kcat och ett visst Km-värde under givna betingelser.

21
Q

Hur fungerar ett enzym?

A

ett enzym minskar aktiveringsenergin och höjer därigenom reaktionshastigheten. Detta sker genom att ett substrat binder till enzymet på ett visst ställe (ofta aktiva ytan). Där finns det aminosyrarester som sitter på ett sätt som gör att det blir katalys.

Ett enzym underlättar en reaktion genom att bindningsytan passar till en övergångsform (transition state) - inte till den normala formen av substratet. Enzymer har en viss substratspecificitet.

kolla slide 4…

22
Q

Enzymer har en viss substratspecificitet, förklara vad som menas med detta?

A

T.ex så klyver proteaser som pepsin och trypsin peptidbindningar i proteiner. Sidokedjorna runt klyvningsstället bestämmer om ett visst proteas klyver bra eller dåligt.

ex. 2.) Oxidoreduktaser katalyserar oxidationer och reduktioner i kroppen med hjälp av kosubstraten NADH eller NADPH. Alkoholdehydrogenas föredrar NADH medan glutathionreduktas föredrar NADPH (med en extra fosfatgrupp)

För många enzymer fungerar bara ett substrat, medan andra enzymer är mer promiskuösa

23
Q

Ändrar enzymer jämnviktskonstanten?

Vad bestämmer ΔG?

A

Nej, Enzymer ändrar inte jämviktskonstanten; ΔG bestämmer om reaktionen sker och åt vilket håll den går

24
Q

Vad finns på den aktiva ytan hos ett enzym? och vad har det för funktion?

A

Den aktiva ytan på enzymet har aminosyrarester som är organiserade för katalys av en viss reaktion

25
Q

Hur är det med enzymernas substratspecificitet?

A

Enzymer kan katalysera samma reaktion (t ex hydrolys av peptidbindning) men ha olika substratspecificitet (t ex olika proteaser).

26
Q

Vad är ett enzym?

A

Katalytisk aktiva proteiner

27
Q

Ge exempel på en funktion i en reaktion hos en kofaktor

A

Exempel: Karboxypeptidas A (ett pankreatiskt exoproteas) har en zinkjon i sin aktiva yta. Zinkjonen drar till sig elektroner så att kolet i peptidbindningen blir partiellt positiv (elektrofil) och kan reagerar med syret i vatten (nukleofil): hydrolys.

28
Q

Ge exempel på koenzym som verkar som bärare av olika grupper

A

CoA överför acyl grupper

FAD överför H+ atomer

NAD överför hydrid (H^-) joner

29
Q

Ge exempel på prostetisk grupp och vad det gör

A

Till exempel Hemgrupper i cytokromer. Här kan en järnjon i en hemgrupp ta upp eller avge en elektron.
Fe3+ + e- Fe2+

Ex. cytokrom c och cytokrom c oxidas i elektrontransportkedjan.

30
Q

Vad är betydelsen av [S]? (substratkoncentrationen)

A

När [S]= Km, arbetar enzymet på halva sin maximala hastighet, alltså, v0= 1/2 Vmax.

När [S] är&raquo_space; Km, så har nästan alla enzymmolekyler en substratmolekyl bunden till sig (enzymet är mättat) och v0 ≈ Vmax.