Paramètre physico-chimique

Question 1

Quels sont les principaux facteurs expérimentaux qui affectent la vitesse des réactions enzymatiques?

Answer 1

• [S]
• [E]
• Stabilité enzymatique
• pH
• Température
• Viscosité
• Effet isotopique
  -> primaire
  -> secondaire
  -> Inventaire d’hydron

Question 2

Habituellement le pH optimal d’une enzyme reflète…

Answer 2

le pH de son environnement natif

Question 3

Poourquoi les enzyme ont un pH de fonctionnement optimal?

Answer 3

À cause de l’influence du pH sur :
-Vmax
-Km
-La stabilité de l’enzyme

Question 4

Comment le pH perturbe l’état d’ionisation de l’enzyme et/ou du substrat?

Answer 4

• État d’ionisation d’un résidu du site actif important pour la catalyse
• La structure et/ou l’environnement électronique du site actif ce qui modifie la cinétique de l’association entre l’enzyme et le substrat
• La structure de l’enzyme ou affecter l’association entre les sous-unité
• Le substrat et ainsi générer un état du substrat qui est incompatible au niveau électrostatique avec le site actif

Question 5

comment détermine-t-on le pH optimal?

Answer 5

La réaction enzymatique est mesurée à divers pH dans des tampons appropriés un graphique de Vo vs pH permet de déterminer le pH optimal ou la zone de pH optimal

Question 6

Comment détermine-t-on la zone de stabilité d’une enzyme?

Answer 6

l’enzyme est d’abord ajoutée à des tampons dedifférents pH. Après une certaine période d’incubation, le pH est ramené au pH optimal
(déterminé tel que décrit ci-haut). L’essai enzymatique est alors entrepris par l’ajout du substrat et du cofacteur si nécessaire. La mesure de 𝑣଴ permet alors de déterminer lazone de stabilité de l’enzyme, i.e. la gamme de pH à laquelle l’enzyme peut être exposée sans être dénaturée

Question 7

Comment la température peut affectée les enzymes?

Answer 7

1. Enzyme peuvent être dénaturée par l’élévation de température
2. Activité altérée par la température en modifiant :
   -> Localement la structure de l’enzyme
   -> La stabilité du complexe ES
   -> L’ionisation des groupements fonctionnels

Question 8

Quel information nous donne l’étude de l’effet de la viscosité?

Answer 8

Information à propos de l’étape limitante , qui peut impliquer la diffusion de molécule

Question 9

Qu’est-ce que la microviscosité?

Answer 9

Résistance au mouvement expérimenté par une molécule en solution

Question 10

Par quoi peut être modifier la microviscosité?

Answer 10

Par l’ajout d’agent viscogène monomérique

Question 11

Par quoi peut être modifier la macroviscosité?

Answer 11

Par l’ajout d’un agent viscogène monomérique ou polymérique

Question 12

Vrai ou faux
La macroviscosité modifier par un agent viscogène polymérique ne restrient pas la difusion de petites molécules en solution

Answer 12

Vrai

Question 13

Comment est étudiée la viscosité?

Answer 13

Étudier en faisant varier la microviscosité
Si une réaction enzymatique est limitée par la diffusion de molécules, le ratio Kcat/Km pour cette enzyme montrera une relation linéaire envers la viscosité

Question 14

Vrai ou faux
Les isotopes ne donnent pas beaucoup d’informations sur les mécanismes réactionnels et les voies métaboliques

Answer 14

Faux

Question 15

Les effets isotopiques sont à la bases de quelles études?

Answer 15

• La substitution isotopique : remplacement d’un atome par un isotope. Utile pour suivre/détecter une molécule particulière
• L’effet isotopique

Question 16

Quelles sont les différentes variétés de l’effet isotopique?

Answer 16

• primaire
  -secondaire
• Effet isotopique sur l’équilibre
• Effet isotopique du solvant

Question 17

De quoi dépend l’amplitude pour l’effet isotopique primaire?

Answer 17

de l’isotope utilisé

Question 18

L’effet isotopique découle de la différence d’énergie…

Answer 18

entre deux isotopes à l’état de base indiqué par ZPE sur un graphique de l’énergie en fonction du cheminement réactionnel

Question 19

À quelle étape d’une réaction enzymatique la différence des niveaux ZPE de deux isotopes peut être annulée?

Answer 19

À l’état de transition

Question 20

Vrai ou faux
Pour les enzymes, on assume que l’effet isotopique se fait sentir majoritairement pour la catalyse et non pas pour la liaison du substrat
Explique

Answer 20

Vrai

Parce que les atomes impliqués dans la liaison du substrat sont trop éloignés de l’atome impliqué dans le bris/création du lien à l’état de transition

Question 21

Quels sont les principes en jeu pour l’effet isotopique du solvant?

Answer 21

1. On assume que l’effet isotopique du solvant sur l’équilibre de la réaction est faible parce que l’effet isotopique global est essentiellement balancé des deux côtés de l’équilibre
2. On assume que l’effet des hydrons qui ne sont pas impliqués directement dans la réaction s’annule en grande partie à l’état de transition en comparaison de l’état de base

Question 22

Vrai ou faux
Il n’y a qu’une faible quantité d’hydrons qui sont affectés dans l’état de transition et qui contribuent majoritairement à l’effet isotopique du solvant

Answer 22

Vrai Ce sont ceux qui sont impliqués directement dans l’étape chimique de transformation de S en P

Question 23

Vrai ou faux
Il faut d’abord établir la gamme de pH ou l’enzyme est stable et ensuite établir le pH optimal

Answer 23

Faux
Contraire

Question 24

La réponse de Kcat, Km et Kcat/Km envers le pH permet de…

Answer 24

investiguer la nature des résidus impliqués dans les transitions en déterminant leur pKa

Question 25

La variation de tepérature permet de déterminer ___.

Answer 25

Ea

Question 26

l’effet de la viscosité peut être investiguer pour…

Answer 26

identifier les étapes d’un mécanisme réactionnel qui dépent de la vitesse de collision des molécules