Liaison à l'équilibre Flashcards
La fonction de nombreuses protéeines, dont les enzymes dépend de…
La liaison réversible avec d’autres molécules (ligands)
Comment est app. la protéine qui li le ligand?
Récepteur
Qu’est ce que le ligand?
généralement une molécules plus petite, prots, ARN, ADN
Le _______ des interactions entre le récepteur et le ligand est fondamental pour la survie des organismes
caractère réversible
À quoi correspond la valeur de Kd?
À la concentration de ligand nécessaire pour lier, à l’équilibre, la moitié des récepteur présent en solution
Plus l’affinité du ligand est grande…
Plus la valeur de Kd est faible
Sur quoi les études quantitatives nous renseignent?
elles nous permettent de comprendre quoi?
- Quantité de certains composés
- La vitesse des réactions
- l’affinité avec laquelle des molécules interagissent entre elles
- Les mécanismes de réactions enzymatiques
-les voies de signalisation
-les voies de régulation
Qu’est ce qui nous permet de déterminer si une expérience doit être qualitative ou quantitative?
Contexte et but rechercher
Que représente Ki?
Ks?
Ki: constante de dissociation à l’équilibre pour un inhibiteur
Ks: constante de dissociation pour un substrat
Par quoi est dictée la position à l’équilibre entre les constituants libres R et L et le complexe RL?
Par la vitesse avec laquelle le complexe est formé et la vitesse à laquelle il se dissocie pour donner R et L
Quelles sont les deux approches pour mesurer la Kd?
- titration à l’équilibre
- Mesure des constantes cinétiques
Explique brièvement la titration à l’équilibre
mélanger le récepteur avec des concentrations croissante et en excès de ligand. La [L] ou 50% du récepteur est en complexe [RL] est ensuite déterminée à l’aide d’équations
Quelle des deux approches pour mesurer la Kd est plus exigeante?
Les études cinétiques, pcq besoin d’instrumentation particulière
Vrai ou faux
Plus la valeur de Kd est élevée, plus la réaction est favorable (dG a une valeur neg)
Faux,
Plus la valeur de la Kd est faible, plus la réactoin est favorable
Que décrit l’équation de langmuir?
l’absorption de molécules gazeuses sur une surface solide en fonction de la pression à température normale
La liaison d’un ligand à son récepteur en fonction de la concentration de ligand
de quelle forme est la courbe décrivant l’équation de langmuir?
hyperbole rectangulaire
Quels sont les trois postulats de l’équation de langmuir?
- le récepteur n’a qu’un seul site de liaison du ligand
- Chaque molécule de ligand ne peut exister que sous deux formes : la forme libre ou en complexe avec le récepteur
- Chaque molécule de récepteur ne peut aussi exister que sous deux forme, forme libre et en complexe avec le ligand
L’équation de langmuir est valable pour…
une réaction simple de liaison réversible
Les données de la titration modélisées à l’aide de l’quation de langmuir donnent quelles informations?
Kd et concentration du complexe RL à saturation
Qu’est ce que la liaison coopérative?
Lorsque la liaison d’un ligand à un site modifie l’affinité de d’autres sites sur la même molécule
Vrai ou faux
Pour utiliser l’équation de langmuir, la liaison de L à R doit être spécifique
vraia
Vrai ou faux
Pour utiliser l’équation de langmuir, la liaison de L à R doit être spécifique
vrai
Quelles sont les trois méthodes qui permettent de linéariser les données de liaison des ligands?
- Le graphique de la double réciproque de l’équation 4.24 (voir notes)
- Le graphique de Scatchard
- Le graphique de Hanes-Wolff
Quelle est la méthode à privilégier pour la représentation de données obtenues avec langmuir?
représentation semi-log
Dans quel cas l’équation de langmuir n’est pas valide?
[R] se rapproche de la Kd pcq la [L] ne sera pas vraiment en excès par rapport à celle du récepteur
Vrai ou faux
Les complexes RL sont importants en science biologique
Vrai
Explique la différence entre étude qualitative et quantitative
Études qualitatives permettent d’interpréter les phénomènes biologiques, mais pas les études quantitative
Les études quantitative permettent d’interpréter les phénomènes biologiques et les études qualitative
La mesure de Kd permet de…
quantifier la force des interactions entre les molécules
Vrai ou faux
La Kd est l’inverse de la Ka
Vrai
Vrai ou faux
Il faut parfois tenir compte des liaisons non-spécifique pour corriger des données
Vrai
