Cinétique enzymatique Flashcards

1
Q

Pour quoi utilise-t-on une approche de mesure des cinétiques des réactions enzymatiques?

A
  • Obtenir de l’information sur la vitesse et l’affinité des enzymes pour leurs substrats et leurs produits
    -Comparer des enzymes provenant de différentes sources
    -Comparer des enzymes modifiées
    -Établir le mécanisme d’action des enzymes
    Déterminer si et comment l’activité des enzymes est régulée et de quantifier leur effet sur leur vitesse
    -Déterminer le mode d’action des inhibiteurs et quantifier leur impact sur la vitesse
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Que faut-il générer pour déterminer la vitesse des réactions enzymatiques?

A

Une courbe de prgression

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Quelle sera la forme générale de la courbe de progression pour la conversion d’un substrat en produit?

A

cinétique de premier ordre

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

À quoi est dû la diminution de la vitesse avec le temps lors d’une réaction chimique?
Lors d’une réaction enzymatique?

A

Chimique :
- À la baisse [S]
Enzymatique :
- Enzyme devient instable et s’inactive
- Réactions inverse prend de l’importance en raison de la [P]
- Le ou les produits de la réaction inhibe l’enzyme
- Une combinaison de ces facteurs

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Quelle méthode est utilisée en cinétique enzymatique pour mesurer la vitesse sans complication?
quels sont les avantages?

A

On mesure la vitesse de réaction initiale

Quantité de substrat converti en produit est faible -> estime que la fraction du substrat complexé à l’enzyme par rapport à la totalité du substrat est négligeable
[P] faible donc réaction inverse et inhibition par le produit négligeable
Enzyme peut être considéré comme étant stable

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Vrai ou faux
La vitesse de réaction enzymatique initiale varie linéairement en fonction du substrat

A

Faux

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Quelles sont les trois régions du graphique de la vitesse initiale d’une réaction enzymatique?

A
  • Faible [S] -> variation est linéaire envers la [S] et similaire à une réaction de premier ordre
  • [S] élevé ou la vitesse de la réaction devient indépendante de la [S] donc ordre zéro -> vitesse de réaction est saturbale
  • [S] de substrat intermédiaire avec un tracé curviligne
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Explique l’hypothèse enzyme-substrat

A

La réaction comporte deux étapes élémentaires :
- La formation d’une complexe entre le substrat et l’enzyme (ES)
- Décomposition du complexe ES pour donner le produit et l’enzyme libre

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Qu’est ce que l’hypothèse de l’équilibre?
De quoi tient-elle compte contrairement à l’hypothèse enzyme-substrat?

A

Équilibre entre E et S menant au complexe ES et équilibre entre E et P pour la formation du complexe EP

Tient compte de l’inhibition par le produit à mesure que celui-ci s’accumule en cours de réaction

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Qu’est ce que le modèle de l’état stationnaire ne requiert pas comparativement au modèle de michaelis mentens?

A

ne requiert pas K2«K-1

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

À quoi réfère l’état stationnaire?

A

À la période de temps pendant laquelle la concentration du complexe ES ne change pas

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Que faut-il pour que la phase de l’état stationnaire soit atteinte pendant une réaction enzymatique?

A

La [S] doit être en grand excès par rapport à la [Ef]

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Quelles sont les hyptohèses associées au modèle de l’état stationnaire?

A
  • [S] est en grand excès par rapport à [E] de sorte que la formation de ES ne diminue pas significativement la [] de substrat libre et l’approximation [Sf] = [S]
  • Durant la phase initiale de la réaction il n’y a formation d’aucun intermédiaire autre que ES
  • À l’état stationnaire, la [ES] ne change pas
  • Durant la phase initiale de la réaction, il y a très peu de produit formé par rapport à [S]
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Comment est définie Km?

A

la concentration de substrat à laquelle la vélocité de la réaction atteint la moitié de la vélocité maximale mesurée en condition saturante de substrat

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Vrai ou faux Km peut être considérée comme une constante thermodynamique comme la Ks

A

Faux, constante/paramètre cinétique

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Sur quoi nous renseigne la Km?

A

-Sur l’efficacité avec laquelle une enzyme sélectionne son substrat et le convertit en produit
- Concentration à laquelle la moitié des sites actifs présents sont saturés en substrat à l’état stationnaire
- Plus la Km est petite, plus elle est efficace à de faibles [S]

17
Q

De quoi dépend la valeur de la Km?

A

Nature de l’enzyme
Substrat
pH
Température
etc

18
Q

Vrai ou faux
Dans certaines conditions la Km est une mesure de l’affinité de l’enzyme pour son substrat
Quelles conditions?

A

Seulement si la Kcat est beaucoup plus petite que K-1
Une enzyme qui peut utiliser 2 substrat montre la même Kcat mais des Km différentes

19
Q

À quoi correspond Kcat?

A

Au nombre de cycles catalytiques par unité de temps et par molécule d’enzyme

20
Q

Vrai ou faux
Les valeurs de Kcat peuvent varier jusqu’a 8 ordres de grandeur dépendamment de l’enzyme ou des substrats

A

Vrai

21
Q

Que reflètent des changements dans la valeur de Kcat?

A

Des perturbations dans les étapes qui suivent la formation de ES

22
Q

Vrai ou faux
Kcat fournit des informations détaillée sur la vitesse des différentes étapes qui suivent la formation de ES

A

Faux, sauf si une seule étape est nécessaire pour transformer ES en produit

23
Q

La Kcat représente une limite inférieur pour…

A

la vitesse correspondant à l’étape la plus lente du chemin réactionnel

24
Q

Kcat/Km est une mesure de?

A

La spécificité du substrat

25
Q

Dans quelle condition la vitesse de réaction varie linéairement en fonction de la concentration du substrat?
À quoi est égale la pente dans ces conditions?

A

Lorsque [S]«Km
Kcat/Km

26
Q

Vrai ou faux
Kcat sur Km est une constante de premier ordre

A

Faux 2ieme

27
Q

Kcat/Km reflète les impact d’un substrat sur…. et fournit…

A

l’une ou l’autre des deux constantes cinétiques
une limite inférieure pour la constante de vitesse de deuxième ordre de la liaison du substrat

28
Q

Quelle mesure représente la meilleure mesure de la spécificité du substrat:
Kcat
Km
Kcat/Km

A

Kcat/Km

29
Q

Vrai ou faux
La Kcat/Km peut être utilisée pour comparer l’efficacité de deux enzymes

A

Faux

30
Q

Quelle hypothèse peut expliquer que la plupart des enzymes ne sont pas très efficace et spécifique?

A

La pression évolutive pour optimiser les enzymes n’est pas si grande à partir du moment ou une enzyme catalyse une réaction avec suffisamment d’efficacité