Cinétique enzymatique Flashcards
Pour quoi utilise-t-on une approche de mesure des cinétiques des réactions enzymatiques?
- Obtenir de l’information sur la vitesse et l’affinité des enzymes pour leurs substrats et leurs produits
-Comparer des enzymes provenant de différentes sources
-Comparer des enzymes modifiées
-Établir le mécanisme d’action des enzymes
Déterminer si et comment l’activité des enzymes est régulée et de quantifier leur effet sur leur vitesse
-Déterminer le mode d’action des inhibiteurs et quantifier leur impact sur la vitesse
Que faut-il générer pour déterminer la vitesse des réactions enzymatiques?
Une courbe de prgression
Quelle sera la forme générale de la courbe de progression pour la conversion d’un substrat en produit?
cinétique de premier ordre
À quoi est dû la diminution de la vitesse avec le temps lors d’une réaction chimique?
Lors d’une réaction enzymatique?
Chimique :
- À la baisse [S]
Enzymatique :
- Enzyme devient instable et s’inactive
- Réactions inverse prend de l’importance en raison de la [P]
- Le ou les produits de la réaction inhibe l’enzyme
- Une combinaison de ces facteurs
Quelle méthode est utilisée en cinétique enzymatique pour mesurer la vitesse sans complication?
quels sont les avantages?
On mesure la vitesse de réaction initiale
Quantité de substrat converti en produit est faible -> estime que la fraction du substrat complexé à l’enzyme par rapport à la totalité du substrat est négligeable
[P] faible donc réaction inverse et inhibition par le produit négligeable
Enzyme peut être considéré comme étant stable
Vrai ou faux
La vitesse de réaction enzymatique initiale varie linéairement en fonction du substrat
Faux
Quelles sont les trois régions du graphique de la vitesse initiale d’une réaction enzymatique?
- Faible [S] -> variation est linéaire envers la [S] et similaire à une réaction de premier ordre
- [S] élevé ou la vitesse de la réaction devient indépendante de la [S] donc ordre zéro -> vitesse de réaction est saturbale
- [S] de substrat intermédiaire avec un tracé curviligne
Explique l’hypothèse enzyme-substrat
La réaction comporte deux étapes élémentaires :
- La formation d’une complexe entre le substrat et l’enzyme (ES)
- Décomposition du complexe ES pour donner le produit et l’enzyme libre
Qu’est ce que l’hypothèse de l’équilibre?
De quoi tient-elle compte contrairement à l’hypothèse enzyme-substrat?
Équilibre entre E et S menant au complexe ES et équilibre entre E et P pour la formation du complexe EP
Tient compte de l’inhibition par le produit à mesure que celui-ci s’accumule en cours de réaction
Qu’est ce que le modèle de l’état stationnaire ne requiert pas comparativement au modèle de michaelis mentens?
ne requiert pas K2«K-1
À quoi réfère l’état stationnaire?
À la période de temps pendant laquelle la concentration du complexe ES ne change pas
Que faut-il pour que la phase de l’état stationnaire soit atteinte pendant une réaction enzymatique?
La [S] doit être en grand excès par rapport à la [Ef]
Quelles sont les hyptohèses associées au modèle de l’état stationnaire?
- [S] est en grand excès par rapport à [E] de sorte que la formation de ES ne diminue pas significativement la [] de substrat libre et l’approximation [Sf] = [S]
- Durant la phase initiale de la réaction il n’y a formation d’aucun intermédiaire autre que ES
- À l’état stationnaire, la [ES] ne change pas
- Durant la phase initiale de la réaction, il y a très peu de produit formé par rapport à [S]
Comment est définie Km?
la concentration de substrat à laquelle la vélocité de la réaction atteint la moitié de la vélocité maximale mesurée en condition saturante de substrat
Vrai ou faux Km peut être considérée comme une constante thermodynamique comme la Ks
Faux, constante/paramètre cinétique