Autres catalyseurs biologiques Flashcards
Que sont les ribozymes?
Des ARN catalytiques
Quelle est la structure d’un anticorps?
Deux chaines légères et deux chaines lourdes réunies par des ponts disulfures
Par quelle portion de l’anticoprs se fait la reconnaissance de l’antigène?
Portion variable
Que sont les anticorps catalytiques?
immunoglobines qui possèdent une activité enzymatique
Comment les anticorps peuvent agir comme des enzymes?
Parce qu’ils sont complémentaires au niveau structural à l’état de transition formé au cours d’une réaction enzymatique, ils se lieraient fortement à l’état de transition d’un composé chimique et accélèreraient la vitesse d’une réaction, comme une enzyme le ferait, en réduisant l’entropie rotationnelle et imposant des contraintes structurales
Vrai ou faux
Certains anticorps naturels ont une activité catalytique
Vrai
Comment sont obtenus les anticorps catalytiques?
- immunisant un animal et en sélectionnant des anticorps qui lient fortement une molécule dont la structure est analogue à celle de l’état de transition d’une réaction
- par voie biologique
Décrire l’approche chimique pour obtenir un anticorps catalytique
- molécule qui est un analogue de l’état de transition d’une réaction est attachée à une molécule de plus grande taille (haptène, sert immunisation des animaux)
-Le but de coupler la petite molécule analogue de l’état de transition à une molécule de plus grande taille, par exemple l’albumine sérique de bœuf, est d’obtenir une réponse immunitaire suffisante lorsque l’haptène est injecté chez un animal (Étape B). - Les cellules sécrétrices d’anticorps sont ensuite isolées (Étape C)
- immortalisées par fusion avec une lignée cellulaire cancéreuse (Étape D).
Les cellules immortalisées sont ensuite diluées et cultivées (Étape E).
Elles seront ensuite testées pour une détecter une activité enzymatique donnée, souvent par un test colorimétrique ou fluorimétrique (Étape F).
Les cellules sécrétant les anticorps catalytiques les plus actifs sont sélectionnées, les anticorps monoclonaux sont purifiés et ils peuvent être analysés pour tester leur propriétés enzymatiques
décrire l’approche biologique pour obtenir des anticorps catalytiques
- utiliser une enzyme ou un inhibiteur de nature protéique comme matériel de départ
- Lorsqu’une enzyme est utilisée, le principe en jeu est l’obtention d’une empreinte qui représente une structure inversée de celle du site actif d’une enzyme. Cette empreinte est obtenue par un anticorps qui reconnait le site actif. Une deuxième immunisation avec cette fois l’anticorps qui porte cette empreinte, permet alors d’obtenir des anticorps dont une région est similaire en terme structural au site actif de l’enzyme de départ.
- L’autre option est de démarrer le processus avec une protéine qui est un inhibiteur compétitif d’une enzyme. Puisqu’elle reconnait le site actif, cette protéine inhibitrice, si elle est utilisée comme antigène, permettra d’obtenir des anticorps qui s’y lient, et donc, qui imitent la structure du site actif.
Quelles sont les réactions catalysées par les anticorps catalytiques?
- addition et élimination électrophile
- Racémisation
- Isomérisation
- Hydrolyse
- Formation et coupure de lien C-C
Quelles sont les applications des anticorps catalytiques?
- Synthèse de molécules organique simple (peu efficace)
- Traitement des cancers
- Traitement des allergies et maladies autoimmunes
- traitement des infections virales et bactériennes
- biotechnologie
- Détection d’états pathologiques
Pourquoi les protéines dominent maintenant comme catalyseurs?
-Lient plus facilement les molécules hydrophobes
- Lient plus facilement les molécules flexibles
- Diversité de stratégies de catalyse accrue par les 20 acides aminés en comparaison des bases de l’ADN et l’ARN
Quelles sont les réactions catalysées par les ARNs naturels?
- Hydrolyse d’autres ARN
- Polymérisation de nouveaux ARNs
- Phosphorylation de l’ADN et de l’ARN
- Épissage
- Réaction peptide transférase
- Maturation des ARNt
Quelles sont les réactions catalysées par les ARNs artificiels?
- L’auto-ligature
- L’auto-coupure
-L’auto-réplication
Quelles sont les applications des ADNs catalytiques?
- biosenseurs
- Agents thérapeutiques
