MoG del 2: Mutationer och DNA-reparation Flashcards
Från föreläsning 1
Vad innebär en recessiv loss-of-function-mutation och vad betyder det för genprodukten?
Mutationen innebär att funktionen hos en genprodukt reduceras eller går förlorad. Denna är recessiv eftersom vildtyp-allelen fortfarande kodar för en funktionell genprodukt.
Vad innebär en dominant loss-of-function-mutation och vad betyder det för genprodukten?
Mutationen innebär att den skadade genprodukten interagerar med den normala och slår ut dess funktion totalt. Därför krävs två stycken ‘‘friska’’ alleler för att mutationen inte ska uttryckas hos individen.
Vad innebär en gain-of-function-mutation?
Innebär en förbättrad eller helt ny funktion av en genprodukt. Ofta är den enhancern som påverkas.
Ge ett exempel på en sjukdom som orsakas av replikations-slippage. Vilka typer av DNA-sekvenser uppstår replikations-slippage ofta i?
Huntingtons sjukdom, orsakas av repetitiva tripletter (CAG). Om sjukdomen bryter ut avgörs av antalet upprepade tripletter. Replikations-slippage kan uppstå när en ‘‘loop’’ bildas i strängen vid replikationen, som DNA Pol hoppar över. Detta kan leda till deletion eller insertion av nya nukleotider. Händer oftast i tandem-repetitiva sekvenser.
Vilken är den allra viktigaste mekanismen för DNA-reparation?
Proofreading, utförs under själva replikationen. DNA Pol har 3’-5’-exonnukleasaktivitet.
Vad är mismatch repair?
En reparationsmekanism för muterade DNA-sekvenser som proofreading inte lyckats åtgärda. Reparationsenzymer detekterar mismatches på icke-metylerade DNA-strängar (Adelinmetylas har bundit metylgrupper till båda strängarna, men är långsammare än DNA Pol).
Vad är deaminering?
En spontan eller inducerad mutation där en aminogrupp konverteras till en ketogrupp. Detta innebär förändringar för nukleotider och vilka de basparar med. T.ex cytosin konverteras till uracil som basparar med adenin.
Vid replikationen kommer den ena strängen ge upphov till ett förändrat kodon.
Vad är depurinering?
Mutation som innebär förlust av en kvävebas inom en intakt DNA-molekyl. Oftast en adenin eller guanin (purin)
UV-ljus kan vara en källa till inducerade mutationer. Hur fungerar det ?
UV-ljus når till skillnad från joniserande strålning inte så långt in i vävnader, men det kan orsaka bildning av pyrimidin-dimerer då två pyrimidiner sitter bredvid varandra i en DNA-sträng. Detta leder till förändrad DNA-struktur och inhiberad normal replikation.
Ge exempel på en typ av mutagen som kan orsaka inducerade mutationer.
Alkylerande ämnen är ämnen som kan donera en alkylgrupp till en keto-eller aminogrupp i nukleotider. Detta leder till att nukleotidernas uppbyggnad förändras och orsakar nukleotidsubstitution.
Ge exempel på en typ av mutagen som kan orsaka inducerade mutationer.
Interkalerande ämnen är ämnen som tränger in i DNA-sekvenser mellan puriner och pyrimidiner, vilket orsakar förvridning av strängen och även frameshift-mutationer.
Hur sker replikations-slippage? Hur uppkommer det?
Det uppkommer genom att det bildas en loop på DNA-strängen som DNA-polymeras hoppar över vid replikation. Oftast leder det till insertion av nukleotider, men även deletioner. Huntingtons sjukdom orsakas av replikations-slippage i Huntingtongenen
Hur fungerar mis-match-repair?
Om 3’-5’-exonnukleasaktiviteten inte reparerar punktmutationer kan detta detekteras av mis-match-repair. Reparationsenzym känner igen den felaktigt insatta nukleotiden, varpå endonukleas klyver mutationen. Exonukleas plockar bort den från strängen. DNA Pol sätter in den korrekta nt, varpå DNA-ligas legerar ihop stränge.
Hur fungerar post-replication repair?
Reparationsmekanism som verkar på skadat DNA som inte kunnat replikeras. T.ex kan DNA-pol ha hoppat över en TT-dimer som orsakats av UV-strålning. Proteinet RecA genomför rekombination där de komplementära nukleotiderna på den undre strängen fyller hålet som DNA-Pol hoppade över. RecA-proteinet rekombinerar och DNA-ligas legerar ihop hålet.
