Brainscape's Knowledge GenomeTM

Browse over 1 million classes created by top students, professors, publishers, and experts.


See full index

Genetik > Cellcykeln och kromosomer och DNA > Flashcards

Cellcykeln och kromosomer och DNA Flashcards

1
Q

Vad är en nukleosid?

A

Komponent i DNA-molekylen, sackarid (pentos) och kvävebas

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Vad är en nukleotid?

A

Komponent i DNA-molekylen, pentos, kvävebas och fosfatgrupp

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Vad är pyrimidin?

A

Samling kvävebaser
Cytosin, Uracil och Tymin
Enkel ring

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Vad är purin?

A

Samling kvävebaser
Adenin och Guanin
Dubbelring

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Vad är ribos?

A

Den sockergrupp som finns i RNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Vad är deoxyribos?

A

Den sockergrupp som finns i DNA (‘‘deoxy-‘’ syftar på ‘‘utan syre’’), dvs det som skiljer det åt från ribos är att 2’-kolet saknar en hydroxigrupp.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Vilka är de grundläggande krav för att en molekyl ska kunna bära på genetisk information?

A
  1. Den måste kunna replikeras
  2. Den måste kunna förvara information (vara stabil)
  3. Kunna uttrycka informationen (läsas av)
  4. Måste kunna ske nån slags förändring via mutation
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Vad är det genetiska materialet?

A

Den information som förvaras i specifika makromolekyler hos en individ och som uttrycker dess funktion och utseende.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Vad är molekylärbiologins centrala dogm?

A

Genetisk information överförs DNA–> RNA–> protein. Kan inte överföras från protein till makromolekyl eller till annat protein, kan ej återbildas till RNA eller DNA.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Hur sammanfogas nukleotider till längre oligonukleotider?

A

Genom polymeriseringsreaktion via fosfodiesterbindningar, en nukleotids fosfatgrupp (5’-kolet) binder till en annan nukleotids pentossackarid (3´-kolet).

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Hur packas DNA?

A

I nukleosomer, positivt laddade histoner (protein) binds till de negativt laddade fosfatgrupperna. DNA-helixen

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Hur packas prokaryot DNA?

A

Vanligast är att det prokaryota genomet är i form av RNA. Packningen är inte heller lika komplex som den av eukaryot DNA. Man har sett att det associeras med de DNA-bindande proteinerna HU och H-NS, som har positivt laddade aminosyror som binder till de negativt laddade fosfatgrupperna. De packas i s.k supercoils.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Hur skiljer sig mtDNA (mitokondrie-DNA) från en eukaryots ‘‘vanliga’’ DNA?

A

mtDNA är vanligen i form av en dubbelsträngad sluten cirkel istället för linjärt i en helix.
Saknar de kromosomala proteinerna
Hos de flesta saknas introner (regioner inom gener som inte kodar för proteiner)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Vad innebär 5’-3’ - polymerisering?

A

I replikationen av DNA syntasen av en ny sträng sker från mallen av en föräldrasträng binds nya nukleosid-trifosfater till den växande kedjan. Det är då fosfatgruppen som är bunden till 5’-kolet på nukleosiden som binder till hydroxigruppen på 3’-kolet på pentosen på den växande kedjan.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Vad är en primer?

A

Den växande, redan existerande kedjan vid replikation av DNA från vilken nya nukleotider fortsätter byggas på.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Vad är 3’-5’- exonnukleasaktivitet?

A

Att förlängningen av den växande kedjan sker i 5’-3’-riktningen där adderingen av nukleotider fortsätter utifrån 3’-kolet på pentosen. Alla tre polymeras DNA-polymeras I, II och III har 3’-5’-exonnukleasaktivitet, vilket innebär att de har förmågan att polymerisera i en riktning, pausa och även eliminera felaktiga nukleotider.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Hur skiljer sig den prokaryota DNA-replikationen från den eukaryota?

A

På grund av att eukaroyta celler har ett mycket större genom går replikationen mycket långsammare, vilket har lösts med multipla initieringsregioner (istället för en). Många fler DNA-polymeras är involverade.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Hur skiljer sig den prokaryota DNA-replikationen från den eukaryota?

A

På grund av att eukaroyta celler har ett mycket större genom går replikationen mycket långsammare, vilket har lösts med multipla initieringsregioner (istället för en).

Många fler DNA-polymeras är involverade, på grund av de multipla initieringsregionerna.

Eukaryot DNA har nukleosomalt kromatin, då även faktorer som löser upp och monterar ihop det under replikationan (CAFs)

Då de eukaryota DNA-strängarna är linjära har de fria och är sårbara för nukleaser - telomerer skyddar (repetitiva ändesekvenser med 3’-överhäng)

Då eukaryoters genom är packat i kromatin krävs avancerat samspel mellan histonerna

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Hur skiljer sig den prokaryota DNA-replikationen från den eukaryota?

A

På grund av att eukaroyta celler har ett mycket större genom går replikationen mycket långsammare, vilket har lösts med multipla initieringsregioner (istället för en).

Många fler DNA-polymeras är involverade, på grund av de multipla initieringsregionerna.

Eukaryot DNA har nukleosomalt kromatin, då även faktorer som löser upp och monterar ihop det under replikationan (CAFs)

Telomerer

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

Vad är ett holoenzym?

A

Den aktiva formen av det huvudsakliga syntetiserande polymeraset DNA Pol III (prokaryot replikation)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Vad lindar upp helixen och hur?

A

DnaA och helikas, binder till strängen destabiliserar helixen och den öppnas upp och exponerar ssDNA.

SSBPs binder till ssDNA med vätebindningar och ser till så att strängarna inte binds ihop igen (energimässigt instabilt att vara öppet).

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

Vad är OriC och vad utgörs det av?

A

OriC är den region i den prokaryota replikationen där replikation initieras.

  • 245 baspar
  • 5 upprepande sekvenser av 9 baspar =9mers
  • 3 upprepande sekvenser av 13 baspar = 13mers
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

Vad är supercoiling och DNA-gyras?

A

Supercoiling är den spänning som uppstår framför replikationsgaffeln vid prokaryot replikation, DNA-gyras är ett enzym som förhindrar denna spänning

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

Vad är primas?

A

RNA-polymeras som bildar primrar från vilka replikationen initieras

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Q

Vad initierar replikationen?

A

RNA-polymeraset Primas syntetiserar en kort sträcka av RNA

26
Q

I vilken ordning sker replikationen? (alla steg)

A
  1. Upplindning av dubbelhelixen med proteinet DnaA (bryter upp vätebindningar och denaturerar helixen)
  2. Motverkan av supercoiling med DNA-gyras
  3. Priming med Primas
  4. Polymerisering med DNA Pol III i 5’-3’-riktning
27
Q

Vad är syftet med PCR?

A

Att amplifiera en DNA-sekvens (öka mängden), bl.a inom kloning då många kopior av en gen behövs för uttryck

28
Q

Vilka är de undantag som finns utifrån Wobble-principen i translationen?

A

I den 3:e positionen (sett utifrån mRNA-kedjan 5’-3’) på kodonet kan samma kvävebas baspara till fler än en annan bas.

I tRNA-Ala återfinns Inosin, som kan bespara till U, A och C på mRNA-kedjan.

I tRNA-Ser kan G (utöver C) även paras till U. Dock är detta suboptimalt, fungerar endast om det tolereras för just den aminosyran.

29
Q

Vilken är det initierande tRNAt i den prokaryota translationen, vars antikodon binder till AUG i mRNA? (vilken aminosyra)

A

tRNA -formylMetiodin

30
Q

Vilken är det initierande tRNAt i den eukaryot translationen, vars antikodon binder till AUG i mRNA? (vilken aminosyra)

A

tRNA-Metiodin

31
Q

Hur går det till när ett tRNA ‘‘laddas’’ med en aminosyra?

A

Det är en ATP-krävande reaktion.

aa-tRNA-syntetaser binder till korrekt aminosyra med hjälp av ATP, ett energirikt intermediat har bildats

Intermediatet känner igen rätt tRNA-struktur med rätt antikodon

Aminosyran binds till tRNA och energi frigörs

32
Q

Vilka typer av genreglering finns det?

A 
Transkriptionell genreglering
Genreglering med RNA- sekundärstruktur, har två submekanismer:
- Riboswitches
- Attenuering (dämpning)
Genreglering med antisens-RNA
33
Q

Vad är negativ kontroll (genreglering)?

A

Typ av genreglering där en gen alltid uttrycks, om den inte stängs av

34
Q

Vad är positiv kontroll (genreglering)?

A

Typ av genreglering där gen endast uttrycks om den induceras till det

35
Q

Vad är en strukturell gen?

A

Gener som kodar för den primära strukturen hos ett enzym

36
Q

Vad är en repressor-gen?

A

En gen som ligger uppströms till operonet och de strukturella generna, kan producera repressor-protein som binder till operonet och förhindrar transkription av genen.

37
Q

Varför är det bara prokaryoter som ha genreglering via transkriptionsattenuering?

A

Eftersom att det kräver att transkription kan ske samtidigt som translationen

38
Q

Förklara transkriptionell genreglering med hjälp av ett exempel.

A

Reglering av Lac-operonet och produktionen av beta-galaktosidas hos E. coli:

Hos E. coli finns ett operon som inkluderar tre strukturella gener: lacA, lacY och lacZ, dessa kodar för strukturen hos enzymet beta-galaktosidas som spjälkar laktos till glukos och galaktos. Uppströms dessa (fortfarande i operonet) finns en promotor och en operator som i sin tur reglerar de strukturella generna. Uppströms dessa finns en repressor-gen som producerar ett repressor-protein. Hela systemet styrs av negativ kontroll. När det inte finns laktos i omgivningen som måste spjälkas är det onödigt för bakterien att använda energi till att transkribera mRNA som translateras till nedbrytande enzymer. Därför, när inget laktos binder till repressor-proteinet, kan proteinet binda till operator-genen vilket förhindrar RNA-polymeras att börja transkription av Lac-generna.

Däremot, när laktos är närvarande, binder molekylen till repressor-proteinet och ändrar formen på dess bindnings-site. Detta gör att den inte kan binda till operatorn, därav kan RNA-polymeras påbörja transkription av Lac-generna. Detta är negativ kontroll eftersom att transkription endast sker när repressor-proteinet misslyckas med att binda till operatorn.

39
Q

Vilka är några mutationer av Lac-operonet och hur påverkar det hur genen uttrycks?

A

I- Mutation= gör att repressorproteinets bindningssite är förändrat och ej kan binda till operatorn –> transkription sker oavsett

Oc - mutation = gör att nukleotidsekvensen hos operatorgenen är förändrat –> ingen bindning av repressorn och transkription sker oavsett

Is - mutation = gör att laktosbindande region är förändrad och inte kan binda till laktos som förhindrar att det binder till operatorgenen –> transkriptionen är alltid blockad

40
Q

Hela den transkriberade mRNA-sekvensen translateras inte. Vad heter de delar som translateras (kodar för ett protein), och de som inte translateras?

A

De som kodar för ett protein och translateras: ‘‘Open Reading Frame’’ ORF

De som inte translateras = ‘‘Untranslated Region’’ UTR

41
Q

Hur skiljer sig den eukaryota transkriptionen från den prokaryota?

A

Generellt sett

42
Q

Hur skiljer sig den eukaryota transkriptionen från den prokaryota?

A

Eukaryota är mer komplex, har fler delsteg.

  • Hos eukaryoter baseras transkriptionen på cis-agerande element och trans-agerande faktorer
  • Hos prokaryoter binds RNA-polymeraset till promotorn m.h.a sigmafaktorn (subenhet på polymeras), medan hos eukaryoter måste trans-agerande faktorer som TFIID binda till promotorn och rekrytera polymeraset
  • Endast 1 RNA-polymeras hos prokaryoter, totalt 3 hos eukaryoter
  • Pga större och mer komplext genom hos eukaryoter genomgår de post-transkriptionell RNA-processing, förberedelse inför translationen
  • ## Generellt striktare reglering av transkriptionen, pga fler element inblandade
43
Q

Hur går RNA-processningen till?

A

Efter transkriptionen är det nybildade mRNAt känsligt för nedbrytning av nukleaser samt utgörs till stor del av introner (sekvenser som inte kodar för protein).

  • Capping
    En 7-metylguanosin binds till 5’-änden på pre-mRNA, vilket både skyddar mot nedbrytning av nukleaser och fungerar som signal för fortsatt processning
  • Splicing
  • Polyadenylering
44
Q

Hur många aminosyror kodar ett kodon för?

A

Endast en

45
Q

Hur många kodon kan en och samma aminosyra specificeras av?

A

Mer än en

46
Q

Hur ser tRNA-molekylen ut? Hur basparar den till tripletten (kodonet) på mRNA?

A

Se teckning i blocket. tRNA har ett antikodon som basparar komplementärt till mRNA, varje tRNA-molekyl är laddad med en specifik aminosyra.

47
Q

Hos vilken tRNA-molekyl finns Inosin? (3:e positionen) Vilka andra kvävebaser kan denna baspara med?

A

Hos tRNA-Ala, Inosin basparar med U, C, eller A.

48
Q

Vilka är de två tRNA-molekylerna vars 3:e position skiljer sig i vilka kvävebaser de kan baspara till? Vilka baser är det?

A

Hos tRNA-Ala finns Inosin i 3:e positionen, kan baspara till A, U och .

Hos tRNA-Ser finns G i 3:e positionen, parar mest optimalt med C (som vanligt), men kan även baspara till U.

49
Q

Varför är wobble-konceptet viktigt i translationen?

A

Det är ett kostnadseffektivt användande av tRNA-molekyler då flera kodon som kodar för en viss aminosyra kan läsas av samma tRNA.

50
Q

Vilka är de två huvudsakliga kompositionerna av histoner?

A

H2A - huvudkompositionen

H2A.Z - mindre positivt laddat och binder därför sämre till DNA-strängarna - ger mer uppluckring i kromatinet

51
Q

Vad är negativ kontroll (genreglering)?

A

Syftar på att genen alltid uttrycks såvida den inte i närvaro av ett specifikt kemiskt substrat hindras från att uttryckas.

52
Q

Vad är positiv kontroll (genreglering)?

A

Syftar på att genen endast uttrycks och producerar en genprodukt när ett specifikt kemiskt substrat är närvarande.

53
Q

Hur ser Shine-Dalgarno-sekvensen ut?

A

AGGAGG

54
Q

Hur ser startkodonet ut?

A

AUG

55
Q

Hur ser de tre stoppkodonen ut?

A

UAA, UAG, UGA

56
Q

Vad heter Adenin som nukleosid?

A

Adenosin

57
Q

Vad heter cytosin som nukleosid?

A

Cytidin

58
Q

Vad heter Guanin som nukleosid?

A

Guanosin

59
Q

Vad heter Uracil som nukleosid?

A

Uridin

60
Q

Vad heter Tymin som nukleosid?

A

Tymidin

Genetik (13 decks)

Brainscape helps you reach your goals faster, through stronger study habits.
© 2024 Bold Learning Solutions. Terms and Conditions