Module 9 Flashcards
Qu’est-ce que le PDH?
C’est le complexe de la pyruvate déshydrogénase : plusieurs copies de 3 enzymes
Ou est situé le PDH
Eucaryotes = mitochondrie
Procaryotes = cytosol
Quelles réactions sont catalysées par les trois enzymes du PDH?
E1 = (étape 1) décarboxylation du pyruvate (pyruvate à l’hydroxyéthyl-TPP (HETPP) Production CO2
E2 = (étape 2) oxydation du groupement hydroxyéthyl en groupement acétyl. L’acétyl est transféré à la lipoamide
E2 = (étape 3) transfert groupement acétyl à COA
E3 = (étape 4 ) Régénération du lien disulfure de la lipoamide par Oxydoréduction
E3: (étape 5)Régénération du FAD et formation NADH par Oxydoréduction
Quelles sont les cinq coenzymes nécessaire au PDH ? leurs localisation et leurs fonctions?
- thiamine pyrophosphate (TPP) : Facilite la décarboxylation du pyruvate (E1)
-FAD : Agent oxydant permettant de regénérer la lipoamide (E3)
-NAD+ : Agent oxydant permettant de regénérer la FAD (E3)
-lipoamide : Bras oscillant permettant le transfert d’un groupement acétyle (E2)
-coenzyme A (CoA) : Accepteur final du groupement acétyle (E2)
Qu’est-ce que le cycle de krebs?
Dans la mitochondrie des eucaryotes, l’acéty-CoA, des lipides et des acides aminées sont oxydés en CO2 pour faire de l’énergie
Les 8 réactions du cycles de krebs?
- Condensation (formation d’un lien C-C)
- Isomérisation
- Décarboxylation oxydative d’un acide béta-cétonique
- Décarboxylation oxydative d’un acide alpha-cétonique
- Phosphorylation au niveau du substrat
- Oxydation (production d’un FADH+)
- Hydratation
- Oxydation
Quelles réactions produiront de l’énergie, du NADH et du FADH2 et de l’ATP
ATP : #5
NADH : #3, #4, #8
FADH2 : #6
Les réactions libérant du CO2 dans le cycle de Krebs
l’étape 3 catalysée par l’isocitrate déshydrogénase.
l’étape 4 catalysée par l’α-cétoglutarate déshydrogénase.
Les enzymes catalysant les réactions irréversibles
- la citrate synthase (étape 1)
- l’isocitrate déshydrogénase (étape 3)
- l’α-cétoglutarate déshydrogénase (étape 4)
La logique chimique derrière le cycle de krebs
c’est biochimiquement impossible de convertir directement l’acéty-CoA en énergie, il faut passer par le groupement méthylène (—CH2—) .
Donc étape 1 = on ajoute un méthyle à acétyl-CoA (on le nomme maintenant Méthylène)
étape 2 = la citrate est réarrangé pour former l’isocitrate (son isomérase) Le OH doit être déplacer pour qu’on puisse l’oxyder à l’étape 3
étape 3 = conversion de l’isocitrate (6 carbones) en
α-cétoglutarate (5 carbones) = libération d’énergie
étape 4 = conversion de lA-cétoglutarate en succinyl-CoA
étape 5 = rupture du lien thioester du succinyl-CoA
étape 6 à 8 = retour à l’oxalocétate pour un autre tour de cycle
Le bilan énergétique d’une molécule de glucose jusqu’à la fin du cycle de krebs
Glycolyse : 2 ATP et 2 NADH
PDH : 2 NADH
Krebs: 2 GTP + 6 NADH + 2 FADH2
* Total : 32 ATP par molécule de glucose oxydée en CO2
Qu’est-ce que le caractère amphibolique du cycle de krebs?
catabolisme et anabolisme à la fois. En effet, en plus de produire des molécules énergétiques (catabolisme), les intermédiaires du cycle de Krebs servent de précurseurs lors de la biosynthèse de diverses molécules (anabolisme).
La régulation du PDH
L’activité de la PDH est contrôlée allostériquement à trois niveaux :
1- Par le rapport ATP/ADP.
2- Par le rapport NADH/NAD+.
3- Par le rapport acétyl-CoA/CoASH
++ de ATP ,NADH et acétyl-Coa= diminution du PDH
La régulation du cycle de krebs
Le cycle de Krebs est régulé au niveau de trois enzymes :
* la citrate synthase,
* l’isocitrate déshydrogénase,
* l’α-cétoglutarate déshydrogénase
Le flux du cycle de krebs est également régulé par La concentration en ATP et NADH
Placez dans l’ordre les substrats du cycle de Krebs
- Acétyl-CoA et oxaloacétate
2.Citrate
3.Isocitrate - α-cétoglutarate
5.Succinyl-CoA
6.Succinate
7.Fumarate
8.Malate
9.Oxaloacétate