Microbio - Microbiote Flashcards
Ratio bactéries : cellules humaines
10:1
Origine de la flore bactérienne normale
Naissance avec bactérie vagin femme
Colonisation de la peau et du système digestif
Définition microbiote
Ensemble des micro-organismes qui réside sur un site donné
Définition microbiome
Ensemble des micro-organismes et leurs gènes qui résident sur un site donné
Division du microbiome
Microbiome central vs secondaire
Qu’est-ce que le microbiome central
Espèces bactériennes présentes chez plus de 95% des humains à un site donné (majorité des bactéries de ce site)
Quelle division du microbiome est le plus varié
Microbiome secondaire
Qu’est-ce que le microbiome secondaire
Espèces bactériennes qui diffèrent d’un individu à l’autre
Quelle division du microbiome a les espèces bactériennes en plus grandes quantité
Microbiome central
Bactéries du microbiome centrale de la peau
Staphylococcus epidermidis
Corynebacterium
Propionibacterium
Bactérie du microbiome centrale de la bouche
Streptococcus viridans
Neisseria
Corynebacterium
Bactéries du microbiome centrale du côlon
Escherichia coli
Klebsiella
Proteus
Enterococcus
Bacteroides
Bactérie du microbiome centrale du vagin
Lactobacillus
Facteurs de variation du microbiote (qté, variabilité, type) sur une même personne
Site
Glandes sébacées et humidité
Sexe
Qté de microorganisme salivaire
10^9 /mL
Qté de microorganisme gastrique
10^3 / mL
Qté de microorganismes intestin grêle
10^4 /g
Qté de microorganisme côlon
10^11 / g
V ou F, même bactérie au long du tube digestif
F! diversité et qté varient selon le segment (tube digestif = de la bouche à l’anus)
Particularité du microbiote du colon
Bactéries anaérobiques strictes plus qu’aérobies
Plus de 200 espèces dont la majorité sont non cultivables
Cause de la mauvaise odeur des selles
Bactéries anaérobies strictes
Comment identifie-t-on les bactéries du côlon
Séquençage moléculaire
Impossible par coloration Gram à cause de la qté de bactéries présentes
Facteurs de variation du microbiote à grande échelle
D’une personne à l’autre
Région géographique
Âge
Rôle de l’alimentation dans le microbiote
Alimentation diversifié permet un microbiote diversifié = Bon pour la santé
Lien entre l’analyse du microbiote et le développement éventuel d’une maladie
AUCUN! L’analyse ne permet pas la prédiction de maladie
Groupe d’âge à haut risque de maladie atopic (eczéma)
Nouveau né
Groupe d’âge avec importance de ne pas trop donner d’antibiotiques
Jeune enfance, risque de débalancement du microbiote
Rôles du microbiote intestinal
Fonction métabolique
Stimulation de l’immunité inné
Prévention de la colonisation de bactéries pathogènes
Exemple de métabolisation par bactéries intestinales
Transforme grosse molécule comme hydrate de carbone en petite molécule (acétate, propionate et butyrate), facilite absorption par les cellules hôtes
Exemple de limitation de croissance de bactéries indésirables par microbiote intestinal
Métabolisation d’acides comme acétate, propionate et butyrate
Façon pour le microbiote intestinal de protéger contre infections entériques
- Tapisse de mucus et consomme les nutriments disponibles (bloc et affame)
- Production de mucine, immunoglobuline IgA et peptides antimicrobiens (AMPs)
- Production IL-22 et IL-1b (béta)
Rôle IL-22
augmentation de la résistance des cellules épithéliales
Rôle IL-1b (béta)
Augmentation recrutement de cellules inflammatoires
Facteurs externes qui influence le microbiote
Hygiène personnelle
Diète (quoi on mange + diversifié)
H2O (présence de chlore vs eau de puits)
Prise antibiotiques
Qu’est-ce que la dysbiose
Altération de la flore bactérienne normale
Exemples de dysbiose
Diarrhée à clostridioides difficile
Colite ulcéreuse
Maladie céliaque
Vaginite à Candida
Obésité
Qu’est-ce que la diarrhée à clostridioides difficile (DACD)
Altération de la flore du côlon par antibiotiques
Perte de la compétition alimentaire = prolifération de C. Diff
Production de toxine de la diarrhée
Qu’est-ce que la colite ulcéreuse
Prolif. de la bactérie Akkermansia muciniphila qui produit sulfatase qui dégrade la couche de mucine
Augmentation de Provotellaceae = production chemokines inductrices d’inflammation
Lien entre l’obésité et une dysbiose
Bactéries intestinales plus efficaces à transformer des gros hydrates de carbone en petites molécules plus facilement absorbables
Qu’est-ce que les probiotiques
Mélanges de bactéries/levures pour coloniser, même temporairement, l’intestin
Bactéries principales des probiotiques
Gram + comme bifidobacterium et lactobacillus
Levure comme saccharomyces
Facteurs d’efficacité des probiotiques
Microorganismes choisis
Dose
Survies des microorganismes apres l’estomac (acidité)
Désavantages des probiotiques vs médicaments
Moins bon contrôle sur la composition exacte et sur la concentration résiduelle du microorganisme post estomac
Exemple de cas où des probiotiques précis ont prouvés leur efficacité
Pouchite (inflammation de l’anse iléale efférente après colectomie totale)
Entérocolite nécrosante
Qu’est-ce que l’entérocolite nécrosante
Maladie inflammation de l’intestin chez le nouveau né prématuré de moins de 37 semaines
Recommandation de l’institut national en excellence de la santé et des services sociaux vis-à-vis les probiotiques pour la DACD
AUCUNE RECOMMANDATION pour la prévention ou traitement
Contre-indicaiton des probiotiques
Immunosupprimés
Approuvé = éprouvé cliniquement ?
NON, approuvé c’est good, éprouvé veut juste dire qu’une étude à dit que ça marche, par nécessairement accepté