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SF3 (exam 2) > Microbio - Diagnostic de laboratoire des infections > Flashcards

Microbio - Diagnostic de laboratoire des infections Flashcards

1
Q

Quelles sont les phases du cheminement diagnostique en microbiologie infectiologie?

A

Phase pré-analytique
Phase analytique
Phase post-analytique

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Q

Que ce passe-t-il lors de la phase pré-analytique?

A
  1. Pt consulte avec symptômes/signes cliniques = hypothèses diagnostiques
  2. Prescription de prélèvements
  3. Réception des prélèvements au laboratoire
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3
Q

Quels sont les types d’examens faits sur des prélèvements possibles?

A

Examens direct
Cultures
Détections antigéniques/PCR
Sérologie

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4
Q

Qu’est-ce qui est requis d’un prélèvement pour être acheminé au laboratoire?

A

Requête du prescripteur
Identification double du spécimen

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5
Q

Pour les cultures, il est nécessaire de connaître les germes recherchés ______ et ceux nécessitant une ____.

A

De routine
Demande spéciale

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6
Q

Donne un exemple de germes qui requièrent une demande spéciale pour une culture.

A

Mycobactériologie/mycologie

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7
Q

Qu’est-ce qui est indispensable pour un résultat diagnostique de qualité?

A

Qualité du prélèvement

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8
Q

Quelle est la première étape faite lors de la phase analytique?

A

Examen direct sur le prélèvement

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9
Q

Quelles sont les étapes d’une culture bactérienne?

A

Ensemencement/incubation
Isolement/épuration
Lecture périodique

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10
Q

Vrai ou faux: l’ensemencement/incubation dure 48h à 72h.

A

Vrai ET faux: pour certains pathogènes 48-72h suffit, mais pour d’autres il faut plus longtemps (ex: tuberculose prend 6 semaines)

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11
Q

Quel est l’objectif de l’ensemencement/incubation?

A

Culture pure

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12
Q

Pour les pathogènes usuels, il y a une lecture périodique à chaque ____h.

A

24h

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13
Q

Qu’est-ce qui est observé/effectué pour l’identification des pathogènes?

A

Aspect des colonies
Hémolyse sur gélose sang
Test biochimiques rapides
Aspect au Gram

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14
Q

Beta veut dire une hémolyse _____ alors qu’alpha veut dire une hémolyse _____.

A

Complète
Partielle

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15
Q

Quel est l’aspect au Gram des colonies…
a) Staphylocoques
b) Streptocoques
c) Entérobactéries

A

a) cocci gram + en amas
b) cocci gram + en chaînettes
c) bâtonnets gram -

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16
Q

Quels autres tests peuvent être faits si nécessaire pour l’identification d’un pathogène?

A

Analyse biochimique de l’isolat
Malditof
Antibiogramme

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17
Q

Qu’est-ce qu’un résultat critique?

A

Un résultat qui nécessite un rapport sans délai au prescripteur

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18
Q

Après les étapes analytiques, un ________ est fait.

A

Rapport préliminaire

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19
Q

Que se passe-t-il lors de la phase post-analytique?

A

Émission du rapport final validé par un microbiologiste infectiologue
Interprétation finale du médecin prescripteur

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20
Q

Quelles sont les deux notions d’importance pour le processus analytique microbiologique?

A

Validité du résultat
Délai de réalisation analytique

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21
Q

Vrai ou faux: quand un prélèvement a été fait à un site stérile, tous les germes identifiés doivent faire l’object d’une lecture attentive.

A

Vrai (car normalement il n’y a aucun germe)

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22
Q

Vrai ou faux: quand un prélèvement a été fait à un site non-stérile, tous les germes identifiés doivent faire l’object d’une lecture attentive.

A

Faux: il faut connaître les germes qui font partie de la flore normale et porter attention au germe qui n’y font pas partie ou qui sont reconnus pathogènes

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23
Q

Dans le vagin, la flore normale est composée de _____. La présence de ______ pourrait indiquer une ____.

A

Lactobacillus
Levures en grande quantité
Vaginite à Candida

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24
Q

Dans un prélèvement de selles, la flore normale est composée d’______. La présence de _____ pourrait indiquer une ______.

A

Entérobactéries
Campylobacter
Gastro-entérite

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25
Q

Qui a inventé la coloration de Gram? Quand?

A

Hans Christian Joachim Gram
1884

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26
Q

Vrai ou faux: la coloration de Gram est la coloration la plus utilisée pour l’examen microscopique des bactéries.

A

Vrai

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27
Q

Décris les 5 étapes de la coloration de Gram.

A
  1. 1er colorant: Crystal violet (15 sec)
  2. Lavage à l’eau puis iode (Lugol) comme mordant (15 sec)
  3. Acétone / alcool comme décolorant (15 sec)
  4. Lavage à l’eau
  5. Safranine comme contre-colorant (15 sec)
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28
Q

Quelles sont les limites de la coloration de Gram pour la sensibilité?

A

Densité bactérienne du prélèvement (il y a un densité bactérienne minimale)
Résolution optique (certaines bactéries ne sont pas visibles)
Type de paroi bactérienne (les mycobactéries ne sont pas visibles)

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29
Q

Quels sont les trois éléments qui expliquent le phénomène des Gram “variables”?

A

Conditions de cultures peuvent affecter bactéries
Exposition préalable au antibiotiques
Propriété des bactéries à se décolorer

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30
Q

Quelles sont les cinq utilités de la coloration de Gram?

A
  • Reconnaître rapidement les bactéries pouvant être pathogènes dans le prélèvement et en informer le clinicien
  • Évaluer la présence/l’absence de flore normale quand le prélèvement provient d’un site non stérile
  • Évaluer la réponse inflammatoire car les globules blancs sont colorés dans le processus
  • Quantifier de façon relative les polynucléaires vs les cellules mononucléées
  • Aider à distinguer l’infection bactérienne et l’infection virale
31
Q

Donne un exemple de coloration de Gram effectuée…
a) de routine, en urgence.
b) de routine, non urgente.
c) sur demande spéciale

A

a) liquide céphalo-rachidien
b) expectorations
c) prélèvement urinaire

32
Q

Vrai ou faux: pour tous les prélèvements, une coloration de Gram est effectuée immédiatement après l’arrivée du spécimen au laboratoire.

A

Faux: pour les hémocultures, il faut incuber les bouteilles avant, car la densité bactérienne serait trop faible

33
Q

Vrai ou faux: après l’incubation, une coloration de Gram est effectuée sur toutes les bouteilles d’hémocultures.

A

Faux: seulement celles qui sont ciblées positives par l’appareil (90% sont positives après 48h)

34
Q

Vrai ou faux: un résultat positif à la coloration de Gram sur une hémoculture est un résultat critique et le médecin prescripteur doit être appelé.

A

Vrai

35
Q

À quel type de bactéries s’adressent les colorations d’acido-alcoolo-résistance?

A

Bactéries dont la paroi est riche en acides mycoliques et qui sont difficile à colorer (notamment au Gram)

36
Q

Les colorations d’acido-alcoolo-résistances sont des colorations où les bactéries résistent à une décoloration par ________ (_____ /____ dans le cas du Ziehl ou Kinyoun)

A

alcool acidifié
Éthanol / HCl

37
Q

Quelles sont les bactéries soumises à des colorations d’acido-alcool-résistance?

A

Bacilles acido-alcoolo-résistants (BAAR)
Mycobactéries tuberculeuses et non tuberculeuses

38
Q

Décris les trois étapes des colorations d’acido-alcool-résistance et le résultat.

A
  1. Lame colorée avec Carbol Fuchsine
  2. Décoloration avec alcool acidifié
  3. Contre-coloration au bleu de méthylène
    Résultat: bactéries rouge sur fond bleuté
39
Q

La coloration de Ziehl-Neelson est une coloration à ____ alors que la coloration de Kinyoun est une coloration à _____ .

A

Chaud
Froid

40
Q

Les colorations de Ziehl-Neelson et de Kinyoun s’adressent à la recherche de quels microbes?

A

Mycobactéries

41
Q

La coloration de Kinyoun modifiée s’adresse à la recherche de quels microbes?

A

Certaines espèces partiellement acido-alcoolo-résistantes (Nocardia notamment)

42
Q

Quelle est la différence entre la coloration de Kinyoun et la coloration de Kinyoun modifiée?

A

La modifiée utilise un décolorant plus doux

43
Q

En quoi consiste la coloration à l’auramine (rhodamine)?

A

Fluorochromes non spécifiques qui se lient au acides mycoloiques et résistent à la décoloration par de l’alcool acidifié

44
Q

À quoi ressemble un résultat positif à l’auramine?

A

Bactéries (bâtonnets) fluorescentes jaunâtres sur fond noirâtre

45
Q

Compare la valeur diagnostique et le temps de lecture de la coloration à l’auramine à celle de Ziehl-Neelson.

A

Auramine a une valeur diagnostique équivalente mais une lecture plus rapide pour le technicien

46
Q

Nomme les colorations acido-alcoolo-résistantes.

A

Ziehl-Neelson
Kinyoun
Kinyoun modifiée
Auramine

47
Q

Quelles sont les limites des colorations acido-alcoolo-résistantes?

A

Recherche de tuberculose: moins sensible dans les prélèvements extra-pulmonaires (10 à 30%) que dans les prélèvements respiratoires (50-60%)

48
Q

Vrai ou faux: un prélèvement contenant des mycobactéries sera + Ziehl et Kinyoun modifié, mais un prélèvement contenant du Nocardia sera - Ziehl et + Kinyoun modifié.

A

Vrai

49
Q

En quoi constiste l’immunofluorescence?

A

Anticorps combinés à un marqueur fluorescent qui se lient à un antigène spécifique
Observés au microscope à fluorescence

50
Q

Donne un exemple de microbe observé à l’immunofluorescence.

A

Légionella

51
Q

À quoi ressemble un résultat positif à l’immunofluorescence?

A

Bactéries vert pomme granulaire sur fond noirâtre

52
Q

Vrai ou faux: l’immunofluorescence est de plus en plus utilisée.

A

Faux: de plus en plus remplacée par d’autres méthodes immunologiques et les PCR

53
Q

À quoi sert le KOH?

A

Digérer la kératine des spécimens cliniques (ongles, peau, cheveux) et rendre les éléments fongiques mycéliens plus visibles

54
Q

En quoi consiste le fond noir?

A

Utilisation de la diffraction de la lumière pour mettre en évidence les tréponèmes (syphilis et spirochètes)
Examen direct au microscope avec un condenseur dédié pour des prélèvements obtenus d’ulcères

55
Q

À quoi ressemble un positif au fond noir?

A

Bactéries brillantes sur fond noir

56
Q

Vrai ou faux: le fond noir tombe en désuétude.

A

Vrai

57
Q

Qu’est-ce que le calcofluor?

A

Azurant optique qui se lie à la cellulose et à la chitine, fluorescent à une longueur d’onde dédiée aux UV

58
Q

Le calcofluor est utilisé dans la détection de quoi?

A

Champignons
Amibes pathogènes

59
Q

Le calcofluor est parfois utilisé concomitamment avec le ____.

A

KOH

60
Q

À quoi ressemble un résultat positif au calcofluor?

A

Éléments fongiques blanc bleutés à verdâtre fluorescent sur fond noirâtre

61
Q

Vrai ou faux: le calcofluor est une coloration spécifique et ainsi très fiable.

A

Faux: non spécifique alors il y a un risque de faux positifs avec des éléments tissulaires (collagène) ou de l’environnement (fibres de coton)

62
Q

Quel est l’avantage des tests de détection rapide d’antigènes?

A

La rapidité du résultat

63
Q

En quoi consiste les test biomoléculaires (PCR)?

A

Utilisation d’amorces et amplification d’une partie du génome de l’agent microbien à identifier = détection de la portion du génome

64
Q

Quels sont les avantages du PCR?

A

Sensibilité et spécificité usuellement élevées
Rapidité / automatisation
Monoplex / multiplex

65
Q

Quelles sont les limitations du PCR?

A

Coûts
Accessibilité des appareils

66
Q

En quoi consiste la sérologie?

A

Détection d’anticorps spécifiques contre un agent infectieux, normalement dans le sérum

67
Q

L’utilité la plus fréquente de la sérologie est dans les infections _____ et ______ , ainsi que dans le _____ .

A

Virales
Parasitaires
Dépistage d’immunité

68
Q

Lors de la sérologie, un dosage est effectué pour quels anticorps?

A

IgM et IgG

69
Q

Pourquoi est-ce que les IgM sont utiles en sérologie?

A

Permet le dx de l’infection aiguë si la technique est performante pour le germe recherché
Nécessite un seul sérum

70
Q

Pourquoi est-ce que les IgG sont utiles en sérologie?

A

Peuvent signifier une immunité à long terme ou une exposition sans immunité
Spécificité élevée
Notion de séroconversion

71
Q

Vrai ou faux: le dosage d’IgG nécessite deux sérums.

A

Vrai

72
Q

Qu’est-ce que la notion de séroconversion?

A

Passage d’un test - au test + entre deux sérums analysés à 2 ou 3 semaines d’intervalles
OU
Le titre augmente significativement de 4 dilutions ou plus

73
Q

Quelle est la différence entre un IgG neutralisant ou non?

A

Neutralisant: signe une immunité à long terme
Non neutralisant: signe une exposition sans immunité

SF3 (exam 2) (12 decks)

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