Micro 1: Bactérie et microbiote Flashcards
1
Q
Est-ce qu’une bactérie est un procaryote?
A
Oui
2
Q
Nomme les 7 parties toujours présentes d’une bactérie.
Nomme les 5 pas toujours présentes
A
- UN chromosome circulaire (juste ADN)
- nucleoide
- Membrane cellulaire
- Peptidoglycan
- Paroi cellulaire
- Cytoplame
- Ribosomes 70s
- Flagelle, plasmides, pili, capsule, biofilm pas toujours présents
3
Q
Nomme 5 eucaryotes.
A
- Algues
- Fungi
- Protozoaires
- Plantes
- Animaux
4
Q
De quoi sont constitués les chromosomes procaryotes?
A
ADN seulement
(1 chromosome circulaire supercoiled)
5
Q
Qu’est-ce qu’on ne trouve pas chez les procaryotes contrairement aux eucaryotes? (5)
A
- Noyau
- RE
- AG
- Mitochondries
- ARN
6
Q
Caractéristiques des ribosomes des procaryotes?
A
70S (50S + 30S)
7
Q
Est-ce que la membrane cellulaire des procaryotes contient des stérols?
A
Non, sauf pour les mycoplasmes
(contrairement aux micoses, ce qui modifie les meds à utiliser)
8
Q
Décrit la paroi cellulaire complexe des procaryotes.
A
- Protéines et peptidoglycanes
- Chez certaines seulement, acide téichoïque et/ou lipopolysaccharides
9
Q
Reproduction des procaryotes?
A
Reproduction asexuée (fission binaire)
10
Q
Comment les procaryotes font-ils de l’ATP?
A
Via la membrane cytoplasmique (pas des mitochondries!)
11
Q
Classification des bactéries
Nomme les 4 catégories de bactéries selon la forme.
A
- Cocci
- Bâtonnet
- Coccobacille
- Spiralée
12
Q
Classification des bactéries
Nomme les deux catégories de bactéries selon la coloration Gram.
A
- Gram + (bleu)
- Gram - (rouge)
13
Q
Sur quoi peut être fait le prélèvement des bactéries en vue d’une coloration Gram?
A
- Peut être faite sur certains échantillons (ex.: prélèvement de pus)
- Peut être faite sur une colonie bactérienne présente sur une gélose nutritive
- Ensuite on ensemence la culturette
14
Q
Procédures pour l’examen microscopique avec coloration de Gram?
A
- Prélèvement (nettoie, aiguille, sortir pus)
- Culturette + enveloppe de transport + requête
- Rouler tige lame microscopique
- Réactifs : violet cristal, lugol (adhésif), alcool-acétone (wash), safranine (Coloration de Gram)
15
Q
Dernière étape de la coloration de Gram pour Gram -?
Dernière étape de la coloration de Gram pour Gram +?
Pense au cheminement de la couleur que prendront les bactéries dépendamment si elle sont Gram - ou Gram +
A
Bactéries décolorées par l’alcool et recolorées rouge
Bactéries non décolorées
par l’alcool restent bleues (leur constitution favorise accrochage du violet)
16
Q
Pourquoi le violet de cristal reste accroché à la paroi cellulaire des bactéries Gram positif?
A
Car elle va s’attacher au peptidoglycane qui est épais dans les gram +, mais mince chez les gram -
17
Q
Décrit la paroi cellulaire d’un gram + qui diffère des gram -
A
- Peptidoglycane
- Acide téichoïque
- Acide lipotéichoïque
18
Q
Décrit la paroi cellulaire d’un gram - qui diffère des gram +
A
- Membrane externe
- Espace périplasmatique
- Mini couche de peptidoglycane
- (+ LPS- lipopolysaccharides et protéines)
19
Q
Quelle structure de la paroi des bactéries gram + et gram - est commune aux deux?
Donne ses 3 composantes
A
Membrane plasmique:
* 2 Couches de phospholipides
* Protéines structurales
* Protéines enzymatiques
20
Q
Rôles (3) de la membrane cytoplasmique chez les bactéries?
A
- Produit l’ATP
- Permet l’entrée et la sortie de certains nutriments/substances
- Contient des protéines structurales qui contribuent à la forme de la bactérie
21
Q
Qui entoure qui?
Membrane plasmatique ou paroi cellulaire?
A
Paroi cellulaire entoure MP
22
Q
Paroi cellulaire des Gram +
À quoi sert le peptidoglycane chez les gram+? (3)
A
- Forme et structure
- Protection contre l’environnement: survivent bcp plus longtemps que les gram - sur le comptoir (face à produits ménagers)
- Tuer
23
Q
Paroi cellulaire des Gram +
À quoi sert l’acide teichoique chez les gram+? (2)
A
- Renforce la paroi cellulaire
- Séquestre le Ca
24
Q
Paroi cellulaire des Gram +
À quoi sert l’acide lipoteichoique chez les gram+ ?
A
Active le SI inné de l’hôte
25
**Paroi cellulaire des Gram -**
À quoi sert le peptidoglycane chez les gram-?
* Forme et stucture
26
**Paroi cellulaire des Gram -**
De quoi est fait la membrane extérieure des gram- ? (4)
* Phospholipides
* LPS (lipopolysaccharides)
* Protéines
* Enzymes
27
**Paroi cellulaire des Gram -**
À quoi sert la membrane externe des gram- ? (2)
* Structure
* Protection contre l'environnement de l'hôte
28
**Paroi cellulaire des Gram -**
Nomme deux protéines des gram-.
* Porines
* Secretory devices I-V
29
**Paroi cellulaire des Gram -**
Rôle des porines? (prot de la ME)
* Perméable aux petites molécules hydrophiles
* Protège de certains antibiotiques
* (entrée/sortie de produit)
30
**Paroi cellulaire des Gram -**
À quoi servent les secretory devices I-V? (prot de la ME)
Pénètre et livre des protéines dans la membrane, incluant les facteurs de virulence
31
**Paroi cellulaire des Gram -**
Nomme 3 LPS des gram- (de la ME)
* Lipid A
* Core polysaccaride
* O antigen
32
**Paroi cellulaire des Gram -**
**Fonctions (4) des LPS des gram- ?**
* Structure de la membrane externe
* Barrière de protection
* Activateur potentiel du SI inné de l'hôte
* **Joue un rôle dans la gravité de l'infection: risque accrue quand les Gram - passent au sang car contiennent LPS**
33
Différence entre la paroi cellulaire des gram - et des gram +?
* Couche de peptidoglycane est mince chez les gram-
* Paroi cellulaire est entourée d’un espace périplasmatique et d’une membrane externe
34
Nomme 5 structures des bactéries pas toujours présente et leur fct.
* Capsule: anti-phagocytose (armure)
* Biofilm: protection contre enviro, antimicrobiens ou réponse immunitaire (s'attache aux corps étrangers)
* Pili: Adhérence, entrée du plasmide ou reproduction
* Flagelle: mouvement ou chimiotaxie
* Plasmide: résistance (mat. génétique supplémentaire)
35
Fonctions (5) de la membrane cytoplasmique et de la paroi cellulaire?
* Squelette
* Manger et uriner
* Produire de l’énergie
* Bouger (si elle a un ou des flagelles)
* Échanger du matériel génétique (pili)
36
Les bactéries pathogènes peuvent... (5)
* Adhérer à certaines cellules
* Essayer d’échapper au système immunitaire (S.I.)
* Synthétiser des enzymes pour résister au S.I.
* Synthétiser des enzymes pour détruire les tissus
* Synthétiser des exotoxines: a) Répercussions locales ou b) à distances, systémiques
37
Comparaison Gram- vs Gram+:
Lipopolyaccharides?
Gram+: non
Gram-: oui
38
Comparaison Gram- vs Gram+:
Production d'endotoxin?
Gram+: non
Gram-: oui
39
Comparaison Gram- vs Gram+:
Production d'exotoxine?
Gram + et -: certaines souches
40
Comparaison Gram- vs Gram+:
Sporulation?
Gram+: des fois présent
Gram-: non
41
Comparaison Gram- vs Gram+:
Capsule?
Gram+: parfois
Gram-: parfois
42
Comparaison Gram- vs Gram+:
Lysozyme sensible ou résistant?
Gram+: sensible
Gram -: résistant
43
Comparaison Gram- vs Gram+:
**Réponse à la péniciline (antibactérienne)?**
Gram+: - résistant
Gram-: + résistante
44
Comparaison Gram- vs Gram+:
Susceptibilité à la sécheresse et à la disruption physique?
Gram+: moins
Gram-: plus
45
Nomme 3 cocci gram +.
* Staphylococcus
* Streptococcus
* Enterococcus
46
Nomme 2 cocci gram -.
* Neisseria
* Moraxella
* (souvent en paire)
47
Nomme 5 bâtonnets gram +.
* Bacillus
* Clostridium*
* Clostridioides*
* Listeria
* Corynebacterium
48
Nomme 10 bâtonnets gram -.
* Bacteroides*
* Yersinia
* Campylobacter
* Klebsiella
* Haemophilus
* Escherichia coli
* Salmonella
* Shigella
* Proteus
* Pseudomonas
49
Nomme le cocci gram + en amas.
Staphylococcus
50
Nomme le cocci gram + en paires/ courtes chaînes
Streptococcus pneumoniae
51
Nomme deux cocci gram + en chaines.
* Streptococcus (autres que pneumoniae)
* Enterococcus
52
Qu'est-ce qu'une bactérie sporulée?
Décrit la forme.
Décrit la transition en spore.
* Qui peut produire des spores (capacité de se mettre en boule lors de conditions que les conditions de survie sont dangereuses, quand elle souffre)
* Structure ronde, très résistante qui peut survivre sans nourriture
* Bactérie végétative - forme sporulée
* (Capable de retrouver sa forme)
53
Nomme les 3 bâtonnets **gram + sporulés**.
Et les 2 non-sporulées?
* Clostridium
* Clostridioïdes
* Bacillus
* N: Listeria
* N: Corynebacterium
* **Attention seulement (certains) bâtonnets Gram + peuvent sporuler**
54
Est-ce qu'on fait des colorations de Gram sur tous les échantillons reçus au lab?
Sinon, pas sur lesquelles? (4)
Absolument sur lesquelles? (5)
Non, pas là où flore normale: gorge, selle, vagin + Pas Urines (on a ++ de bactérie, ce qui aiderait pas le diagnostic)
Oui toujours: échantillons du bloc, normalement stériles (liquide articulaire, CR), pus, expectorations, bouteilles d'hémoculture.
55
Nomme les 3 principales géloses.
Décris l'incubateur dans lequel sont mises les géloses.
* Sang de mouton
* Chocolat (sang cuit = + nutritif)
* MacConkey (Gram - aérobies)
* Incubateur 37 degrés, examinées le lendemain
56
Atmosphère d'incubation des géloses pour satisfaire les exigences des bactéries (3)?
* Dans une étuve à l’air ambiant (21% d’O2)
* Dans une étuve à CO2 (5% d’O2)
* Dans une tente anaérobie (absence d’O2)
57
Nomme les bactéries anaérobie stricte + précise son type
* Clostridium: bâtonnet gram +
* Clostridioides: bâtonnet gram +
* Bacteroides: bâtonnet gram -
58
Nomme une bactérie aérobie stricte.
Forme et coloration?
Pseudomonas (on ne la verra jamais en condition anaérobie stricte)
Bâtonnet gram -
59
Nomme les 3 bactéries qui ne peuvent pas être classifiées par la coloration de Gram.
* Mycobactéries
* Mycoplasma
* Chlamydia
60
**3 bactéries pas classées par Gram**
Décrit les mycobactéries.
Paroi riche en acide mycolique (waxy outer shell) qui interfère avec la coloration de Gram.
61
**3 bactéries pas classées par Gram**
Décrit les mycoplasma.
Absence de peptidoglycane dans la paroi cellulaire
62
**3 bactéries pas classées par Gram**
Décrit les chlamydia.
* Très petites bactéries, non cultivables sur des géloses
* Se multiplient uniquement dans des cellules grâce à des structures appelées «corps élémentaires» et «corps réticulés»
63
**Le fétus vit dans un milieu __________.**
**Que se passe-t-il à la naissance avec les bactéries? (au niveau des bactéries)**
* stérile
* Bébé entre en contact avec la flore normale de sa mère : début colonisation de sa peau/ système digestif par une «flore normale»
* Après naissance, enfant en contact avec autres personnes/ environnement (tout dans bouche!)
64
Qu'est-ce que le microbiote?
Ensemble des micro-organismes qui résident sur un site donné : la peau, les narines, le tractus génito-urinaire, le tractus digestif, etc.
65
Qu'est-ce que le microbiome?
Le microbiome est l’ensemble des micro-organismes **et de leurs gènes** qui résident sur un site donné
66
**Décrit les 3 différences entre microbiome central et secondaire**
* Espèces bactériennes présentes chez > 95% des personnes humaines à un site donné VS. Espèces bactériennes qui diffèrent d’un individu à l’autre
* Représente la majorité des bactéries présentes à un site donné VS. Chaque espèce est en plus petite quantité
* Moins varié que le microbiome secondaire VS Grande variété d'espèces
67
**Nomme 3 bactéries du microbiome central de la peau. (Flore bactérienne normale)**
Staphylococcus epidermidis
Corynebacterium
Propionibacterium
68
**Nomme 3 bactéries du microbiome central de la bouche. (Flore bactérienne normale)**
Streptococcus viridans (C+)
Neisseria (C-)
Corynebacterium (B+)
69
**Nomme 5 bactéries du microbiome central du côlon. (Flore bactérienne normale)**
Escherichia coli (B-)
Klebsiella (B-)
Proteus (B-)
Enterococcus (C+)
Bacteroides (intestin) (B-)
70
**Nomme 1 bactéries du microbiome central du vagin. (Flore bactérienne normale)**
Lactobacillus
71
Quel est le risque avec les antibiotiques?
Vont partout dans le corps et détruisent le microbiote
72
**Par quoi est influencé le microbiote de la peau?**
* Site
* Présence ou non de glandes sébacés
* Présence ou non d'humidité
* Sexe
73
Quantité de microorganisme dans la salive?
Quantité de microorganisme dans l'estomac?
Quantité de microorganisme dans l'intestin grêle?
**Quantité de microorganisme dans le côlon?**
10^9 microorganimes/mL
10^3 organismes/mL
10^4 organisme/g
10^11 organismes/g
74
Quantité de microorganisme sur la peau (aisselles/aines)?
Peau (autre)
Sécrétions nasales
Sécrétions vaginales
10^6 microorganimes/mL
10^3 organismes/mL
10^6 organisme/g
10^9 microorganimes/mL
75
Selon quoi varie la diversité et la quantité de bactérie du tractus digestif?
Selon le segment
76
Décrit les bactéries du côlon.
- cb?
- lesquelles sont + nombreuses?
- nb espèces?
- cultivables?
- identifiées comment?
* 100,000,000,000 bactéries (10^11 microorganimes/mL)
* Bactéries anaérobies strictes plus nombreuses que les bactéries aérobies
* > 200 espèces
* Dont la majorité sont non cultivables
* Identifiées principalement par séquençage moléculaire
77
**En fonction de quoi le microbiote humain sain varie-t-il?**
* D’une personne à l’autre
* D’une région géographique à l’autre
* En fonction de l’âge
* Alimentation (+ elle est diversifiée, + le microbiote l'est = bénéfique!)
78
Vrai ou faux? L’analyse du microbiote permet de prédire le développement éventuel d’une maladie.
FAUX
79
**Microbiote d'un nouveau-né dépend de quoi?
Explique.**
Dépend du mode d'accouchement
- Vaginal: microbiote de la mère (vaginal/selles) colonise
- Césarienne: * Plus de risque de contamination par certains pathogènes
* Plus de risques de maladies atopique (asthme, ecczéma)
80
**Microbiote de l'enfance?**
* Nouvelles souches vont être en plus grand nombre que les anciennes
* Dév. +++ de la diversité
* Instabilité ++
* Varie selon diète et maladies
81
**Microbiote de l'adulte?**
* Très différencié
* Peut continuer de changer, mais plus lentement
82
**Microbiote d'une personne âgée?**
Très différent de celle des adultes (du à alimentation)
83
**Nomme les 4 rôles du microbiote intestinal.**
1. Fonctions métaboliques
1.1 Métabolise certains nutriments plus facilement = les rend + disponibles pour les cellules de l'hôte
2. Stimule l’immunité innée
3. Prévient la colonisation par des bactéries pathogènes
4. Protège contre des infections entériques
84
**Fonction métabolique**
Quels nutriments sont mieux métabolisé par le microbiote intestinal?
Quelle en est la conséquence sur les bactéries indésirables?
* Grosses molécules d’hydrates de carbone (ex.: cellulose) sont transformées en petites molécules (acétate, propionate et butyrate) **facilement absorbées par les cellules hôtes.**
* Les acides comme l’acétate, le propionate et le butyrate limitent la croissance de certaines bactéries indésirables.
85
Comment le microbiote intestinal nous protège-t-il des infections entériques? (3) (du plus superficiel au plus profond)
* En tapissant la muqueuse (sert de rempart) et en consommant les nutriments (affame les pathogènes)
* En stimulant la production de mucine (empêche d'accéder aux couches profondes), d’immunoglobuline IgA (soldats protection muqueuse - lait paternel) et des peptides antimicrobiens (AMPs)
* En stimulant la production d’IL-22 (↑ résistance cell épithéliales) et d’IL-1β (↑ recrutement de cellules inflammatoires - interleukines).
86
**Nomme 4 facteurs externes qui influencent le microbiote.**
* Hygiène personnelle (savon, déodorant, rince-bouche, douche vaginale)
* Diète (riche en fibre, en graisse, en sucre) + diversifiée ou non
* Eau (avec chlore vs eau de puits)
* Prise d’antibiotique
87
**Définis dysbiose**
Altération de la flore normale
88
**Nomme 5 dysbiose.**
1. Diarrhée à Clostridioides difficile (DACD)
2. Colite ulcéreuse
3. Maladie céliaque (entéropathie au gluten)
4. Vaginite à Candida
5. Obésité
89
**Dysbiose**
Décrit les cdts pour avoir une diarrhée à Clostridioides difficile.
Comment cause diarrhées?
* Prise d’antibiotique qui altère la flore normale du côlon (1)
* (Consommer la bactérie)
* Prolifération du C. difficile (perte de la compétition alimentaire)
* C. difficile qui produit des toxines responsables de la diarrhée
90
Décrit la colite ulcéreuse.
* Prolifération de la bactérie **Akkermansia muciniphila** qui produit une sulfatase qui dégrade la couche de mucine.
* Augmentation de **Prevotellaceae** qui produit des chemokines inductrices d’inflammation.
91
**Dysbiose**
Décrit l'obésité
Personnes qui ont des bactéries intestinales plus efficaces à transformer des gros hydrates de carbone en petites molécules facilement absorbables (donc microbiote a une influence sur l'obésité)
(Souris mince nourrit avec un microbiote provenant d'une sourie obèse)
92
Est-ce qu'il est possible de manipuler le microbiote humain à des fins thérapeutiques?
Comment et pour qui?
Oui
Possibilité de transplantation de selles (efficacité 40-96%) pour traiter C.dif pour P avec diarrhées réfractaires
93
**Que sont les probiotiques?**
Que contiennent la majorité des probiotique?
* Considérées comme des produits de santé naturels
* Mélanges de **bactéries et/ou de levures** ingérées dans le but de coloniser temporairement, l’intestin (pour apporter potentiellement bénéfice à l'hôte)
* Bactéries **Gram positif** (Bifidobacterium et les Lactobacillus) et des levures (Saccharomyces).
94
**De quoi dépend l'efficacité des probiotiques?**
* Microorganismes choisis
* Dose
* Survie des microorganismes après le passage dans l’estomac (acidité).
95
Problématique avec les probiotiques?
Contrairement aux médicaments, moins bon contrôle sur la composition exacte et la [ ] résiduelle de microorganismes après le passage dans l’estomac.
96
Qu'est-ce que la pouchite?
Inflammation du réservoir (pour garder selles plus longtemps car perte du colon qui réabsorbe liquide) dans le cas d'une colectomie totale avec anastomose iléo-rectale
Peut être guérir par tx avec probiotiques
97
Qu’est-ce que l’entérocolite nécrosante?
- touche quoi?
- qui?
- symptômes?
- causes (3)?
* Maladie qui touche l’intestin
* Enfant né prématurément (< 37 semaines de grossesse)
* Se manifeste par un gonflement de l’abdomen, du sang dans les selles et de l’air dans la paroi de l’intestin.
* Prédisposition génétique + intestin immunoréactif + réponse inflammatoire immature
* Dysbiose du tractus digestif?
* Mortalité : 20 -30%
* Probiotics!!
98
Contres-indications des probiotiques? (3)
1. Chez les patients traités par chimio pour un cancer (risque d'abîmer les muqueuses déjà présent)
2. PAS pour la prévention/tx de DACD (INESSS)
3. Considérer le volet fiancier
99
Que faire avant de donner ou de prendre un antiobiotique en vente libre?
Demander au pharmacien lequel est le plus adapté selon nos besoins (car contenu varie ++)
100
Est-ce que les probiotiques en vente libre varient ++ des yogourts?
NON
* Lactobacillus acidophilus CL1285 (idem)
* Lactobacillus casei LBC80R (idem)
* Lactobacillus rhamnosus CLR2
101
Qu'est-ce qu'une transplantation fécale?
Transfert de microorganismes de la flore fécale d’un donneur sain à une personne malade. Quatre méthodes possibles : colonoscopie, tube naso-gastrique, lavement intestinal ou ingestion de capsules (non commercialisées jusqu’à maintenant)
102
**Qu'est-ce qu'un prébiotique?**
Produits alimentaires administrés pour favoriser la croissance de microorganismes endogènes désirables
DIFFÉRENT de probiotique
103
Est-ce que la forme spore est pathogène?
Non
104
Indications probiotiques (4)
* Prévenir/ Tx rechute de pouchite
* Prévenir entérocolite nécrosante chez le bébé prématuré
* Réduire le risque de décès d'un prématuré qui fais un sepsis
* Réduire risque dermite atopique chez enfant à risque (ex.: exzéma familial) - probiotique pdt grossesse, allaitement et sevrage allaitement
105
Probiotiques peuvent être considérés dans les 4 indications suivantes...
* Prévenir diarrhée due aux antiobios
* Traiter coliques infantiles
* Améliorer la tolérance au tx de l'infection gastrique causée par Helicobacter pylori
* Améliorer les symptômes du côlon irritable
