kurul 1- Biyokimya proteinlerin 3 boyutlu yapısı Flashcards

1
Q

peptit bağı nasıl bir bağdır?

A

kovalent

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

amin grubun olduğu uca verilen ad

A

N-terminal

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

karboksil grubunun olduğu uca verilen ad

A

C-terminal

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

polipeptit zinciri hangi taraftan hangi tarafa doğru okunur

A

N-terminalden C-termanile doğru okunur

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

bilgi shot

A

proteinin üç boyutlu yapısı eşsizdir (özgündür)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

C-N bağı kısmi çift bağ özelliğindedir. Bu nedenle peptit bağı hangi fizyolojik durumda kabul edilir

A

katı

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

peptid bağının kısmi çift bağ özelliği göstermesi nedeniyle bağ farklı elementlerle farklı koşullarda çift bağ kurma özelliğine sahiptir bu birbirinin izomeri olan bileşenlere verilen ad

A

rezonans melezleri

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

peptit zincirinde hangi bağlar arasında serbest dönüş görülür

A

Calfa N arasında ve Calfa ve C arasında

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Yan zincirlerin boşlukta istenmeyen etkileşimlerden uzak olduğu için hangi izomeri daha stabildir

A

trans

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

trans şeklinin görülmediği aa

A

prolin

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

sekonder yapılar

A
  • alfa-heliks
  • beta-kırmalı
  • gelişigüzel kıvrılma
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

polipeptit zincirinin helezon şeklinde kıvrılmasıyla oluşur.

A

B-kırmalı

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

sekonder yapının en düşük enerjili olduğu (çünkü her peptit bağı H bağına katılır) yapı?

A

alfa-heliks

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

proteinlerde alfa-heliks ne tarafa dönüşlü olarak bulunur

A

sağa

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

alfa heliks yapısına uygun olmayan aa

A

-yapısındaki imino gruptan dolayı prolin
küçük R grubu nedeniyle glisin
-yüklü aa ler
-triptofan, valin ve izolösin gibi dallı yan zincirli aminoasitler

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

alfa heliks yapısı hangi yapıların içinde bulunur

A
  • keratin
  • kollajen
  • kas proteinleri (miyozin,tropomiyozin)
  • fibrinde süperheliks yapısı görülür
17
Q

2-5 polipeptit zincirinin birbirine H bağıyla bağlanmasıyla oluşan sekonder protein yapısı

A

B kırmalı

18
Q

bilgi shot

A

B kırmalı tabakada zinci içi H bağı bulunmaz yapı zizaglar oluşturur ve karşılıklı olan kırmalı yapılar arasında H bağı görülür

19
Q

bilgi shot

A

beta kırmalı tabaka paralel ve antiparalel olarak karşılıklı dağılım gösterebilir

20
Q

ipek bluzun çekmesinin nedeni normalde ipek gelişigüzel kıvrımlarda stabilleştirici H bağı bulunur mu ve hangi yapılarda bulunur

A

bulunmaz ve Cibril’ler proteinler gayet düzgün sıralanmışken, bu yapı globüler proteinlerde gözlemlenir.

21
Q

2 tane alfa heliks yapısının üst üste sarmallaşmasıyla oluşan yapının adı

A

süperheliks

22
Q

sekonder yapıyı oluşturan bölgelerin daha sıkı globüler yapılar oluşturmak üzere katlanmasıyla oluşan yapının adı

A

tersiyer yapı

23
Q

tersiyer yapıya H bağından faklı olarak başka hangi bağ katılır

A

disülfit bağı

24
Q

tersiyer yapının stabilizasyonuna katılan bağlar

A
  • disülfit bağı
  • hidrojen bağı
  • iyonik bağ
25
tek bir polipeptit zincirinden meydana gelen proteinlere verilen ad
monomerik proteinler
26
birçok polipeptit zincirinden meydana gelen proteinlere verilen ad
kuarterner yapıda olan multimerik proteinler
27
globüler yapıdaki proteinlerde düzgün yapı sergileyen yani belirli bir sekonder yapıya sahip olan bölümler birbirinden düz segmentler halinde ayrılmış ve her bir ayrı bölüm ayrı bir görev üstleniyorsa bu bölümlere verilen ad?
domen
28
Cibril'ler proteinlerde birden fazla polipeptit zinciri kümeleşir ve lif oluştururlar bunlar arasındaki stabilizasyon hangi bağlarla sağlanır
kovalent ve nonkovalent bağlarla
29
tuz köprülerini kırarak denatürasyona neden olan?
ağır metaller
30
disğlfit gruplarını indirgeyerek sülfit gruplarına dönüştüren?
indirgeyici ajanlar, onlar gittikten sonra S-S bağları tekrardan oluşur
31
proteinlerin katlanmasına yardım eden eleman
şaperonlar
32
kısmen katlanmış proteinlerin tamamen katlanmasını sağlayan eleman?
rotamazlar
33
sekonder yapının bozulmasıyla oluşan hastalıklar
- amiloidoz - alzheimer - deli dana hastalığı
34
alfa heliks yapısı yanlış kesimden ötürü beta kırmalı tabakaya dönüşüp plak oluşturan şey
amiloid, hastalığın adı amiloidoz
35
virüs gibi davranarak girdiği hücreyi enfekte eden ve nükleik asidi olmayan yapı
prion, enfeksiyonu oluşturan bir glikoproteindir
36
prion proteinini kodlayan gende oluşan bir mutasyon sonucu oluşan hastalık
ailesel prion hastalığı, Creutzfeltd-Jacob hastalığı, otozomal dominantla geçer