Tbg-DNA tamir

Question 1

130 tane tamir geni varsa DNA tamirinde görevli kaç tane protein vardır?

Answer 1

130

Question 2

DNA hasarını oluşturan kimyasal reaksiyonun tersine çevrilmesi olayları

Answer 2

• fotoreaktivasyon
• O6-metilguanin onarımı
• tek zincir kırıklarının onarımı

Question 3

Primidin dimerleri nasıl oluşur

Answer 3

UV ışınları yüzünden

Question 4

Fotoreaktivasyonda kullanılan enzim?

Answer 4

PRE

Question 5

Fotoreaktivasyon hangi organizmalarda görülür?

Answer 5

Bakterilerde, mantarlarda, bitkilerde ve çoğu omurgalıda ama insanlarda görülmez

Question 6

Fotoreaktivasyonda gerekli enerji görünür ışığın hangi renginden sağlanır?

Answer 6

Mavi

Question 7

O6-metilguanin onarımında kullanılan enzim

Answer 7

O6-metilguanin metiltransferaz

Question 8

O6-metilguanin metiltransferaz enziminin çalışma prensibi?

Answer 8

Guaninde metili alarak kendi aktif merkezindeki sistin aminoaisidine transfer eder.

Question 9

Basit zincir kırıklarının onarımı nasıl olur?

Answer 9

DNA ligaz enzimiyle

Question 10

Tek zincir kırıklarında (fosfodiester bağının kırılmasıyla) oluşan bölgenin adı?

Answer 10

Nick

Question 11

Nükleotid kesip çıkarma tamirinde kullanılan enzim? (E.coli)

Answer 11

ABC eksonükleaz ve tek bir nükleotid çıkarılmaz genelde oligonükleotidler çıkarılır.

Question 12

ABC eksonğkleaz çalışma prensibi

Answer 12

3 alt ünitesi vardır uvrA, uvrB, uvrC
uvrA hasarlı bölgeyi tanır ve B ile C yi çağırır B helikaz özelliği gösterir C 3’ 5’ kesimlerini yapar uvrD ise lezyon bulunduran parçayı çıkarır sonra ligaz ve DNA polimeraz işlev görür

Question 13

Deaminasyon hangi molekül yüzünden gerçekleşir

Answer 13

Nitröz amin -amin grubunu uzaklaştırır

Question 14

Deaminasyonla guanin neye dönüşür?

Answer 14

Ksantin

Question 15

Deaminasyonla sitozin neye dönüşür?

Answer 15

Urasil

Question 16

Deaminasyonla adenin neye dönüşür?

Answer 16

Hipoksantin

Question 17

Baz kesip çıkarma tamirinde kullanılan enzimler

Answer 17

DNA glikozilaz, AP endonükleaz, deoksiribofosfodiesteraz, DNA polimeraz, DNA ligaz

Question 18

Baz kesip çıkarma tamirinde basamaklar?

Answer 18

DNA glikozilaz N-glikod bağını keser ve bazı uzaklaştırır, AP bölgesi oluşur. AP endonğkleaz gelir ve şeker fosfat omurgasını kırar, deoksiribofosfodiesteraz da bunu uzaklaştırır sonra DNA polimeraz ve ligaz

Question 19

Xeroderma pigmentosum hangi protein eksikliğinden doğar?

Answer 19

XP proteinleri

Question 20

Yanlış eşleşme tamir mekanizması?

Answer 20

Burda diğer kesip çıkarma mekanizmalarından farklı olarak DNA da olmaması gereken bazlar değil olması gereken ama yanlış yerleşmiş bazlarla ilgilenilir.

Question 21

Yanlış eşleşme mekanizması tamirinde rol alan elemanlar? e.coli

Answer 21

MutS, MutL, MutH

Question 22

DNA replike edildiğinde kalıp DNA nın metillenmesi hangi enzim tarafından?

Answer 22

Dam metilaz

Question 23

Yanlış eşleşme mekanizması tamiri?

Answer 23

MutL ve MutS proteini kompleks oluşturarak yanlış eşleşmiş baz çiftlerine bağlanır daha sonra Mut H proteinleri de bağlanır ve kırılma gerçekleştirilir

Question 24

DNA replike edildiğinde metillenen yer

Answer 24

GATC

Question 25

İnsanlarda yanlış eşleşme mekanizmalarında rol oynayan proteinlerde hasar sonucu ortaya çıkan hastalık?

Answer 25

Herediter nonpolipozis kolon kanseri

Question 26

DNA hasarının en tehlikeli formu

Answer 26

Çift zincir kırıkları

Question 27

Çift zincir kırıklarının homomog rekombinasyon ile tamiri?

Answer 27

Hasar görmemiş kromatitteki diziyi kullanarak gerçekleşir. Böylece DNA dizisi korunmuş olur

Question 28

Çift zincir kırıklarının homolog rekombinasyon ile tamirinde kilit rol oynayan proteinler?

Answer 28

RAD 51(tanınmayı sağlar) BRCA1 BRCA2

Question 29

Çift zincir kırıklarının temieinde homolog olmayan uç birleştirmesi?

Answer 29

Direkt olarak acik durumlarda kırık uçlar herhangi bir kalıba bakılmaksızın tamir edilir ama en çok hata oranının olabileceği tamir çeşididir.