Introducción a las ciencias Ómicas y su relevancia en el diagnóstico clínico I Flashcards
¿Cuáles son las aplicaciones que tiene el diagnostico molecular en el campo clínico?
Tiene aplicaciones en la medicina de precisión (estudio del genoma de cada individuo), industrias farmacéuticas, nanotecnologías
¿En que se utiliza la biologia molecular en la medicina de precisión?
Estudio del genoma para determinar tratamientos especificos para la persona. Medicina personalizada
¿Que estudia la genomica?
Material genetico en si, estudia el DNA de organismos
¿Cuáles son los beneficios de las ciencias omicas ?
Personalización de la medicina para cada individuo
Conocimiento ampliado sobre nuevos mecanismos de accion en los sistemas biológicos
Transversalidad ya que se pueden usar en varios ámbitos
Desarrollo de la industria farmaceutica
¿Que estudia la transcriptomica?
Estudia RNA mensajeros, ya sea de celulas, tejido u organo
¿Que estudia la proteomica?
Proteinas de una celula
¿Que estudia la metabolomica?
Estudia metabolitos (compuestos intermedios de bajo peso molecular)en una celula, tejido u organo
A que esta relacionada las ciencias genomicas
o Relacionada con la genética de la población. o Riesgo genético en enfermedades o Variación somática o Aplicación y nuevas tecnologías o Secuencia clínica
¿Por qué la genomica está relacionada con la genetica de poblaciones?
Por que permite determinar las variaciones y la homogeneidad en el DNA de determinadas poblaciones. Asocia factores de riesgo con el fenotipo
Cual es la base metodológica de la técnica de extracción PCR
Corresponde a un método enzimático de amplificación de secuencias especificas del ADN
¿Por qué la genomica está relacionada con las variaciones somaticas?
Porque las variaciones somaticas permiten ver los procesos no codificados en la secuencia de DNA, como la metilacion, acetilacion, alquilacion, etc
Cuales son las aplicaciones que tiene la técnica PCR
Amplificación de genes, genotipificación, detección de mutaciones
¿De qué depende la extracción de DNA?
Tipo de muestra
Tipo celular
Del objetivo
Cuales son las ventajas y desventaja de la técnica PCR
Ventajas: Limite de detección muy alto
Desventajas: Requieren de material genético bicatenario
¿Por qué el tipo de muestra influye en la extraccion de DNA?
Porque varia la matriz de donde deriva el DNA se encuentra, de esto tambien depende la tecnica a utilizar para la extracción
¿Por qué el tipo de celula influye en la extraccion de DNA?
Porque en una muestra pueden estar incluidos celulas de origen viral/bacteriano incluyendo DNA de estos
¿Qué es importante considerar en la extracción de acidos nucleicos?
Cantidad
Calidad
Pureza
¿Cuales son los pasos fundamentales de la extracción?
Pre-tratamiento
Lisis celular
Purificacion de DNA
¿Qué puede mencionar del pre-tratamiento de la muestra en la extraccion?
Depende de la matriz de la muestra, ya que algunas veces requieren procedimientos distintos
Puede realizarse por: Neutralizacion o tratamiento con solventes orgánicos
¿Mediante qué se realizar la lisis celular en la extraccion de DNA?
Mediante disrupción mecánica o agentes químicos
¿Como se purifica el DNA?
A través de precipitación o matrices (asociado a kit comerciales)
¿Qué se debe considerar para la preparación de muestra de ácidos nucleicos?
- Liberar acidos nucleicos
- Protección y estabilización de los ácidos nucleicos frente a la degradación
- Eliminación de inhibidores de la amplificación
- Concentración del producto de extracción
- Almacenar el producto de extracción en un medio acuoso compatible con el método de amplificación
¿Qué quiere decir cuando dice que se debe considerar la liberación de acidos nucleicos?
La liberacion de acidos nucleicos puede variar segun el MO del que se extrae, algunas membranas pueden tener mayor complejidad que otras.
¿Qué quiere decir cuando dice que se debe considerar la protección y estabilizacion de acidos nucleicos frente a la degradación?
El RNA tiende a ser mas inestable que el DNA, por lo que es mas facil que se desintegre. Para evitar esto la extracción debe ser mas sensible para evitar moleculas en el medio que generen la desestibilización de la molecula
¿Qué quiere decir cuando dice que se debe considerar la eliminación de inhibidores especificos de la amplificación?
Se debe considerar las caracteristicas del origen de la muestra y la matriz de esta
¿Qué quiere decir cuando dice que se debe considerar la concentración del producto de extracción?
Algunas muestras poseen menos concentracion de MO, y por ende, menor cantidad de DNA.
¿Qué quiere decir cuando dice que se debe considerar el almacenamiento del DNA en medio acuoso?
Debe estar en medio acuoso compatible con el metodo de amplificación, por ende, los ácidos nucleicos deben estar en matrices donde estén estables y que sean compatibles con el siguiente paso a utilizar para su análisis.