Diagnóstico molecular en COVID-19 I Flashcards
¿Cuales son los dos coronavirus patogenos conocidos antes del COVID19?
SARS-CoV
MERS-CoV
¿Que porcentaje de letalidad presenta el SARS y MERS?
SARS-CoV: 9,6&
MERS-CoV: 35%
¿Cual es la sigla para SARS-CoV-2?
Síndrome respiratorio agudo grave de tipo 2
Respecto a COVID19, nombre:
Familia
Genero
Subgenero
- Familia Coronaviridae
- Género Betacoronavirus
- Subgénero Sarbecovirus
Nombre algunas caracteristicas del SARS-CoV-2:
1) Corresponde a un retrovirus de cadena sencilla en sentido positivo, con polaridad positiva envuelto con una capa lipoproteica lo que lo hace mas sucetible al ambiente.
2) Posee efecto citopatico
3) Su genoma codifica proteinas estructurales (1/3) y no estructurales (2/3)
4) Posee mayor capacidad de transmision que SARS-CoV y MERS-CoV
5) El R0 del COVID-19 es de 2.5
6) Permanece en superficies inanimadas por días
Nombre las 5 proteinas estructurales y su funcion
- Proteína Spike o espícula (S): liga para la unión al epitelio respiratorio
- Proteína E: participa en el ensamblaje y liberación de la partícula viral
- Proteína M: ayuda a mantener la curvatura de la membrana y protegerlo
- Proteína N: forma parte de la nucleocápside, protege el material genético viral
- Proteína HE: Proteína accesoria, tiene actividad esterasa facilitando la entrada del virus a la célula huésped y ayuda en la propagación
Dentro de las proteinas no estructurales, menciona las proteinas mas relevantes
- ARN polimerasa ARN dependiente (RdRp), para la replicación viral
- 2 proteasas (3CLpro) y (PLpro) encargadas de cortar la poliproteína formada inicialmente
- 1 helicasa
¿De que parte de Wuhan provino el COVID?
Se estima que comenzó su propagación en los mercados humedos. Estos son mercados altamente riesgosos para el surgimientos de nuevos virus, ya que aquí se venden animales vivos, sacrificados en el momento, o animales congelados (hielo el cual se derrite durante el día lo que genera la propagación de contagio)
¿En que fecha es el primer caso reportado de (aun desconocido) COVID?
8 de Diciembre 2019
¿Cuando se anuncia Pandemia?
La OMS declara el COVID19 como pandemia el 11 de marzo del 2020
¿Qué porcentaje de identidad posee el COVID con el SARS-CoV y el MERS-CoV respectivamente?
79% de identidad con SARS-CoV y 50% de identidad con MERS-CoV
¿Que quiere decir que COVID posee un efecto citopatico?
Significa que genera lesiones y muerte celular producto de la replicación del virus en las células del huésped
¿Qué significa R0?
Es el número de personas infectadas por 1 sólo individuo. Existen dos posibilidades:
- R0 < 1: La infección desaparece después de un tiempo porque no tiene la capacidad de contagiar a una persona.
- R0 >1: La infección se propaga
La capacidad de propagacion del virus depende del ____________ y _______________
Material
Nivel de humedad
¿Cual es la media de edad de infección?
Alrededor de los 50 años
¿Cual es el mecanismo de transmision? y ¿A través de que se transmite?
El mecanismo de infección es por vía respiratoria principalmente. Se trasmite mediante gotitas, aerosoles y fómites
¿Que son las gotitas de flugge, aerosoles y fómites?
Gotitas de flugge: Son gotas de agua de mayor tamaño que descienden con mayor rapidez con una distancia de 1 metro aprox
Aerosoles: Son partículas de menor tamaño (< 5 micras) que quedan en suspensión en el aire
Fomites: Superficies u objetivos inanimados que permite la transmisión
Principalmente ¿en que celulas se replica el virus?
Principalmente en neumocitos tipo II del pulmón
Principalmente ¿en que celulas se replica el virus?
Principalmente en neumocitos tipo II del pulmón
¿Por cuales receptores el virus posee afinidad?
Receptor de la enzima convertidora de angiotensina 2 (ACE2)
En cuanto a la prevalencia, ¿En que genero se presenta con mayor frecuencia?
Hombres (2,8%)
¿Por qué no observamos una transmisión masiva a otros animales?
Porque los aniamles poseen diferencias en otras proteínas esenciales para la replicación impedirían la infección
Indique las caracteristicas de la Proteína S
Corresponde a una proteína transmembranal formada por 2 subunidades (dominios) en donde la S1 corresponde a la de unión al receptor (dominio de unión al receptor RBD). Mientras que la S2 permite la fusion con la celula huesped. Para que el virus complete la entrada, la proteína S debe ser clivada, proceso realizado gracias a una furina y una enzima proteasa (TMPRRS 2)
¿Como se produce el proceso de clivaje de la proteína S a la celula huesped?
Se produce en 2 puntos de forma secuencial
1) Corta entre la región S1/S2 realizada por Furina (proteasa)
2) Corta en la región S2` (segunda región de S2) realizada por TMPRRS2 (proteasa)
3) Una vez clivada se libera el dominio RBD de S1 y se fusiona con la membrana celular
4) Entrada del virus por endocitosis
¿En que momento la carga viral es mayor?
desde los 2 dias a los 5 dias aprox del inicio de sintomas
¿De cuanto es el periodo de incubacion?
1-14 dias aprox. 5 dias en promedio
¿Cuando inician los sintomas?
Desde el quinto dia de infeccion aproximadament
¿Cual es el cuadro clinico mas critico del virus?
Sindrome de distres respiratorio agudo
En un orden de menos letal a mas letal, ¿cuales son los cuadros clinicos que mas destacan?
Infeccion asintomatica - Enfermedad leve - Neumonia - Neumonia severa - Sindrome de distres respiratorio agudo
¿Que pacientes poseen mayor riesgo de desarrollar cuadros graves?
Mayores de 60 años, pacientes con comorbilidades (HTA, DM, Obesidad, Neumopatias, etc)
¿En que consiste la respuesta imune del huesped?
1) Llegada de linfocitos T al lugar de la infección
2) Destrucción de células infectadas
3) Tormenta de citoquinas
4) Destrucción de células infectadas y no infectadas
¿Que citocina aumenta considerablemente con la infeccion de COVID?
IL-6
¿Por qué ocurre una tormenta de citocinas?
Porque el sistema inmunologico comienza a reaccionar descontroladamente, citoquinas proinflamatorias aumentan en mayor cantidad perdiendo el balance normal
¿Cual es la principal causa del síndrome de distrés respiratorio agudo?
Tormenta de citoquinas
El Uso de tratamientos en caso de un Síndrome de distrés respiratorio agudo van dirigidos al sistema inmune, ¿este consiste en?
Bloqueo de IL-6 principalmente con Tocilizumab o uso de corticoide (puede volver susceptible al paciente a tener otras infecciones debido a la supresión del sistema inmune)
¿Por que podría verse que el COVID es menos grave en niños?
No se conoce la causa del todo pero se postula:
• Respuesta inmune cualitativamente distinta a la de los adulto
• Competencia e interacción directa con otros virus presentes en vía aérea que limitarían la infección por SARS-CoV-2
• Limitada (menor) expresión y funcionalidad de ACE-2
¿Qué clase de mutaciones pueden generar variantes de virus?
- Sustituciones
- Inserciones
- Deleciones
¿Qué clase de mutaciones pueden generar variantes de virus?
- Sustituciones
- Inserciones
- Deleciones
SARS-CoV-2 presentaría en promedio ______mutación cada 2 ____________
una
semanas
Variante de interes:
Variantes de preocupación:
Variante de interes: Que pueden llegar a tener ciertos cambios pero no significativos
Variantes de preocupación: Se relacionan con cambios clínicamente significativos
Las mutaciones pueden originar linajes víricos distintos afectando en:
Transmisibilidad
Diagnóstico de Laboratorio
Tratamiento
¿Por que Las mutaciones pueden originar linajes víricos distintos afectando en la tranmisibilidad?
Porque pueden generar cambios en la facilidad de propagación, o patogenicidad, asociadas principalmente a la proteína S o al aumento de la gravedad, signos y síntomas atípicos, respectivamente
¿Por que Las mutaciones pueden originar linajes víricos distintos afectando en tratamiento?
Porque generan una alteración en la eficacia de las vacunas y cambios en susceptibilidad a los tratamientos
¿Cómo se hace la vigilancia de mutaciones?
Mediante la Secuenciación genómica del virus, y vigilancia de variantes
¿Que son las Variantes de interés (VOI)?
Presentan cambios en el genoma que Afectan a características del virus como su transmisibilidad, la gravedad de la enfermedad que causa y su capacidad para escapar a la acción del sistema inmunitario, tambien su capacidad de ser detectado por medios diagnósticos o ser atacado por medicamentos.
Que son las Variante VOC?
Variantes que en un grado resulta significativo para la salud pública ya sea por:
• Aumento de la transmisibilidad o cambio perjudicial en la epidemiología
• Aumento de la virulencia o cambio en la presentación clínica de la enfermedad
• Disminución de la eficacia de las medidas sociales y de salud pública o de los métodos de diagnóstico, las vacunas y los tratamientos disponibles.
¿Cuales son las variantes de preocupacion actualmente?
Delta
Omicron
¿Quien es la persona que mas te ama?
tu polola
