instuderingsfrågor kolhydratsmetabolism Flashcards

1
Q
  1. Var i cellen sker glykolys, omvandlingen av pyruvat till acetyl CoA, citronsyracykeln och elektrontransportkedjan?
A

Glykolys=Cytoplasman

Omvandlingen av pyruvat till acetyl CoA=Mitokondirens matrix

Citronsyracykeln= Mitokondirens matrix

Elektrontransportkedjan= Mitokondriens innermembran

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

2.Rita strukturformlerna för:

  • glukos
  • glukos-6-fosfat
  • fruktos-6-fosfat
  • fruktos-1,6-bisfosfat
  • dihydroxyacetonfosfat
  • glyceraldehyd-3-fosfat
  • pyruvat
A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q
  1. Vilken är totalreaktionen om en glukosmolekyl processas till glykolysens slutprodukt?
A

Glukos -> 2 pyruvat

2 NAD+ -> 2 NADH

2 ADP-> 2 ATP

Nettoreaktion:

Glukos + 2 Pi + 2 NAD+ + 2 ADP -> 2 pyruvat + 2 NADH + 2ATP + 2 H+ + 2 H2O

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

4.Hur många mol ATP, NADH och pyruvat erhålls (netto) om 1 mol glukos processas genom glykolysen?

A

Glukos -> 2 pyruvat

2 NAD+ -> 2 NADH

2 ADP-> 2 ATP

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

5.Hur många mol ATP, NADH och pyruvat erhålls (netto) om 1 mol glyceraldehyd-3-fosfat processas vidare genom glykolysen?

A

2 ATP, 1 NADH och 1 pyruvat.

“andra halvan” av glykolysen två gånger. Dihydroxyacetonfosfat går bara igenom en gång.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

6.Skissera en grov översikt över glykolysen och dess båda faser. Inkludera viktiga intermediärer och reaktionssteg. Vad sker i de två faserna?

A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q
  1. Den metabola regleringen av glykolysen är koncentrerad till tre reaktionssteg. Vilka är reaktionerna och vilka enzymer katalyserar reaktionerna?
A

Hexokinas (glukos -> glukos-6-fosfat)

Fosfofruktokinas (fruktos-6-fosfat -> fruktos-1,6-bisfosfat)

Pyruvatkinas (fosfofenolpyruvapyruvat -> pyruvat)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

8.Glykolysens tredje steg är en fosforylering.

  • Varifrån kommer fosfatgruppen?
  • Vad heter enzymet som katalyserar reaktionen
  • Varför är det logiskt att den huvudsakliga regleringen av glykolysen sker genom att modulera just detta enzyms aktivitet?
A

Enzymet: Fosfofruktokinas

Fosfatgruppen kommer ifrån: ATP-> ADP då 1 fosfat spjälkas av

Logiken: Fosfofruktokinas katalyserar en irreversibel reaktion så att detta ej sker och glykolysen fortgår eller ej då detta regleras av energi behovet.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

9.I glykolysen sker en nettosyntes av NADH. I vilken reaktion bildas NADH och vad kan denna molekyl användas till?

A

Glyceraldehyd-3-fosfat -> 1,3-bisfosfoglycerat då 2 NAD+ + 2Pi -> 2NADH + 2H+.

NADH kan transporteras till elektrontransportkedjan och för laktat bildning (anaerobt).

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q
  1. Hur kommer det sig att röda blodkroppar måste bilda laktat för att bilda det ATP cellerna behöver och hur sker denna bildning av laktat?
A

Röda blodkroppar saknar mitokondrier och bildar allt sitt ATP i glykolysen; NAD+ återskapas genom att omvandla pyruvat till laktat. Detta pga att efterföljande steg sker i mitokondrien.

Laktatbildningen gör att glykolysen kan fortgå under anaeroba förhållanden och i celler som saknar mitokondrier.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q
  1. Vad menas med allosterreglering?
A

Ett protein, ofta ett enzym, regleras genom inbindningen av en molekyl till proteinets allostera säte (ej att förväxla med proteinets aktiva säte).

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q
  1. Vilka allostera modulatorer hämmar glykolysen och vilka stimulerar den?

Vilket enzyms aktivitet regleras av respektive modulator?

A

Hexokinas

Inhiberas av: Glukos-6-fosfat (feedback inhibation)

Phosphofruktokinas

Aktiveras av: AMP och F-2,6-BP

Inhiberas av: ATP och Citrat

Pyruvatkinas

Aktiveras av: F-1,6-BP

Inhiberas av: ATP och Alanine

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

13.Vilket enzym aktiveras av fruktos 2,6-bisfosfat och vilken verkan har detta på glykolysens aktivitet?

A

Detta aktiverar fosfofruktoskinas, vilket gör att glykolysen fortgår.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q
  1. Insulin och glukagon reglerar aktiviteten av glykolysen. Hur sker detta och vilken blir respektive hormons effekt på glykolysens aktivitet?
A

Insulin = stimulerar

  • Stimulerar genom att öka den intracellulära koncentrationen av fruktos- 2,6-bisfosfat (F-2,6-BP) som aktiverar fosfofruktokinas.
  • Stimulerar genom att aktivera pyruvatkinas genom defosforylering

Glukagon = hämmar

  • Hämmar glykolysen genom att minska den intracellulära koncentrationen av F-2,6-BP
  • Hämmar glykolysen genom att inaktivera pyruvatkinas genom fosforylering
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q
  1. Varför kan omvandlingen av pyruvat till acetyl CoA och citronsyracykeln endast ske under aeroba förhållanden?
A

Begränsad totalmängd av FAD/FADH2 och NAD+/NADH i cellen.

  • Citronsyracykeln kan bara fortgå om FAD och NAD+ återbildas från FADH2 och NADH
  • Återbildningen sker i den O2-krävande elektrontransportkedjan

Under anaeroba förhållanden kan citronsyracykeln inte fortgå eftersom elektron- transportkedjan avstannar. Citronsyracykeln saknar nämligen alternativa sätt att återskapa FAD och NAD+ på egen väg.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

16.Hur tar sig det pyruvat som bildats i cytosolen in till mitokondriens matrix?

A

Mitokondriens inre membran är impermeabelt för det flesta polära molekyler och joner; speciella transportörproteiner krävs för dessa.

Pyruvat transporteras in i mitokondriens matrix med hjälp avtransportörproteinet ”mitochondrial pyruvate carrier” (MPC).

17
Q

17.Beskriv översiktligt den reaktion som katalyseras av pyruvatdehydrogenaskomplexet. Vilka är reaktanterna och produkterna?

A
18
Q

18.Vilka är de två så kallade elektronbärare som deltar i citronsyracykeln?

A
  • NADH
  • FADH2
19
Q

19.Beskriv översiktligt citronsyracykeln och dess ingående reaktioner. Vilken molekyl kan sägas utgöra bränslet som driver citronsyracykeln och vilka produkter avgår under ett varv i cykeln?

A

Bränslet: Acetyl CoA

Nettoreaktion:

Acetyl CoA + 3NAD+ + FAD + ADP + Pi + 2 H2O -> 2 CO2 + 3NADH + FADH2 + ATP + 2H+ + CoA

20
Q
  1. Så kallade dehydrogenaser en grupp enzymer som bland annat katalyserar flera av citronsyracykelns reaktioner.

Vilken typ av reaktioner katalyserar dessa enzymer?

A

Dehydrogenaser är enzymer som oxiderar ett substrat genom att överföra H till en acceptor, ex NAD+ eller FAD

Ex:

isocitrat -> alfa-ketoglutarat

Alfa-ketoglutarat-> succinyl CoA

21
Q

21.Omvandlingen av pyruvat till acetyl CoA utgör en viktig regleringspunkt i metabolismen.

Vad är det som primärt styr pyruvatdehydrogenaskomplexets aktivitet?

A

Aktiverar: ADP & pyruvat

Inhiberar: ATP, NADH, acetyl CoA

22
Q

22.Två av citronsyracykelns reaktioner utgör de viktigaste regleringspunkterna i cykeln och enzymerna som katalyserar reaktionerna påverkas av olika allostera modulatorer.

  • Vilka är enzymerna?
  • Vilka molekyler utgör de viktigaste allostera modulatorerna av dessa enzymers aktivitet
  • Vilken verkan har de allostera modulatorerna på enzymernas aktivitet och citronsyracykelns aktivitet i sin helhet?
  • Vad har de båda reaktionerna gemensamt med det reglerade reaktionssteget där pyruvat omvandlas till acetyl CoA?
A

Enzymerna: Isocitratdehydrogenas & alfa-ketoglutaratdehydrogenas

Allostera modullatorerna:

Isocitratdehyrogenas

Aktiveras: ADP

Inhiberas: ATP & NADH

Hur cykeln påverkas:

Alfra-ketoglutaratdehydrogenas

Inhiberas: ATP, Succinyl CoA, NADH

Hur cykeln påverkas:Det båda reaktionerna är irreverisbla så de kommer göra att cac ej fortgår.

Alfa-ketoglutaratet kan istället bli glutamat och oxaloacetatet aspartat

Gemensamt med pyruvatdehydrogenas: Alla inhiberas av ATP, NADH.

Isocitratdehydrogenas och pyruvtdehydrogenas aktiveras båda av ADP.

23
Q

23.Citronsyracykelns intermediärer utgör prekursorer för en rad viktiga biomolekyler. Vid syntes av dessa biomolekyler kommer citronsyracykelns intermediärer att konsumeras vilket kommer att leda till att citronsyracykelns kapacitet att processa acetyl CoA minskar. För att undvika detta måste citronsyracykeln fyllas på med nya intermediärer.

Nämn några viktiga molekyler som kan omvandlas till citronsyracykelintermediärer.

A

Om citronsyracykelintermediärer används som byggstenar för syntes av andra biomolekyler så måste cykeln fyllas på med nya intermediärer för att cykelns funktion skall upprätthållas!!

Omvandlingen av pyruvat och glukogena aminosyror till citronsyracykelintermediärer utgör viktiga påfyllnadsreaktioner (så kallade anaplerotiska reaktioner).

Glutamat -> alfa-ketoglutarat

Propionyl CoA -> Succinyl CoA (kan bli oxaloacetat & gå in i glukoneogenesen)

Pyruvat-> Acetyl CoA

Aspartat-> Fumarat/oxaloacetat

Fumarat från uracykeln kan bilda malat

24
Q

24.Var i cellen är elektrontransportkedjan förlagd?

A

Mitokondriens inner membran

25
Q

25.Vilka två elektronbärare lämnar av elektroner i elektrontransportkedjan?

A

NADH

FADH2

26
Q
  1. Beskriv översiktligt de ingående komponenterna som deltar i elektrontransportkedjan.
A
  • Elektronerna från NADH och FADH2lämnas i Komplex I respektive Komplex II
  • Via redoxreaktioner transporteras sedan elektronerna mellan ett antal olika elektronbärare för att slutligen reducera det syre vi andas till vatten i Komplex IV

Komplex I: tar emot elektroner från NADH och för över dem till koenzym Q; pumpar samtidigt in 4 st H+ till matrix

Komplex II: tar emot elektroner från FADH2 och för över dem till koenzym Q; citronsyracykelns succinatdehydrogenas är en del av komplexet

Komplex III: tar emot elektroner från reducerat koenzym Q och för över dem till cytokrom c; pumpar samtidigt in 2 st H+ till matrix

Komplex IV: tar emot elektroner från reducerat cytokrom c och reducerar molekylärt syre (H20 bildas); pumpar samtidigt in 4 st H+ till matrix

Lösliga elektronbärare

Koenzym Q (ubikinon): koenzym lösligt i membranet som för över elektroner från Komplex I och II till Komplex III

Cytokrom c: lösligt protein som för över elektroner från Komplex III till Komplex IV

27
Q

27.Elektrontransportkedjan utgörs av en serie redox-reaktioner där elektronersom lämnats av till kedjan slussas mellan ett antal proteinkomplex.

Vilken är den finalaacceptorn av elektronerna och var sker reduktionen av denna acceptor?

A

Den finala acceptorn: molekylärt syre (O2)

Reduktionen: Komplex 4

28
Q

28.På vilket sätt möjliggör elektrontransportkedjan syntes av ATP via oxidativ fosforylering?

A

Förlagd i mitokondriens inre membran.

Med hjälp av de elektroner som skördats som NADH och FADH2 genererar elektrontransportkedjan en protongradient över mitokondriens inre membran.

Protongradienten över mitokondriens inre membran används för att driva syntes av ATP när protonerna flödar tillbaka till mitokondriens matrix via proteinkomplexet ATP-syntas.

29
Q
  1. Vilket proteinkomplex utnyttjas för att slutligen bilda ATP och vad är det som driver denna syntes?
A

Under elektrontransporten genom komplex 1, 3 & 4 pumpas protoner från matrix till de intermembrana rummet vilket skapar en protongradient över mitokondriens inre membran.

Energin lagrad i protongradienten utnyttja för att driva syntesen av ATP när protonerna flödar tillbaka till matrix genom proteinkomplexet ATP-syntas

30
Q

30.Hur kommer det sig att FADH2 slutligen genererar mindre ATP än NADH, trots att båda dessa elektronbärare lämnar av två elektroner till elektrontransportkedjan?

A
  • NADH -> 2.5 ATP*
  • FADH2 -> 1.5 ATP.*

Skillnaden beror på att NADH lämnar av sina elektroner i Komplex I medan FADH2 gör det först i Komplex II; NADH bidrar således mer än FADH2 till protongradienten då dess elektroner gör att fler protoner pumpas in i matrix (NADH; 10 H+ pumpas in, FADH2; 6 H+ pumpas in).

10 H+ genererar 2.5 ATP när de strömmar tillbaka till matrix via ATP syntas; 6 H+genererar endast 1.5 ATP.

31
Q

31.Varför är elektrontransportkedjan en aerob process?

A

Den finala acceptorn av elektronerna är molekylärt syre (O2) vilket gör att elektrontransportkedjan är en aerob process som inte kan ske under anaeroba förhållanden.