Brainscape's Knowledge GenomeTM

Browse over 1 million classes created by top students, professors, publishers, and experts.


See full index

Biochemie 2 > HOOFDSTUK 7 > Flashcards

HOOFDSTUK 7 Flashcards

organisatie en architectuur van DNA in de cel

1
Q

genetisch materiaal in prokaryoot?

A
  • nucleaire zone
  • nucleoïd
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

eukaryoten de nucleus?

A

nucleus
nucleair membraan
nucleaire poriën
chromatine

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

heterochromatine

A

= nucleaire periferie
= transcriptief inactief

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

euchromatine

A

= midden van de nucleus
= transcriptief actief

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

de nucleolus

A

= suborganel binnenin de nucleus waar ribosomen geassembleerd worden

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

topologie

A

= de studie van de geometrische eigenschappen van een object dat niet verandert onder continue vervormingen

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

topoisomeren

A

= dezelfde DNA-molecule kan in verschillende vormen voorkomen

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

continue vervormingen

A

= conformatieveranderingen door thermische beweging of door interactie met eiwitten of andere moleculen

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

discontinue vervormingen

A

= conformationele veranderingen waarbij DNA-strengen breken

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

supercoiling

A

= de topologische toestand van covalent gesloten cirkelvormige dubbel schroefvormig DNA waarin de dubbele helix om zichzelf heen gedraaid is

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

gerelaxt DNA

A

= elk DNA dat bestaat in zijn meest stabiele, onbelaste structuur, meestal de B-vorm onder de meeste cellulaire omstandigheden

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

linking number Lk

A

het aantal keren dat een gesloten cirkelvormige DNA-streng om een andere wordt gewikkeld wanneer de as van de dubbele DNA-helix in een vlak ligt

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

twist Tw

A

het aantal volledige omwentelingen dat één streng van een covalent gesloten cirkelvormig dubbel DNA maakt rond de as van de duplex

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Writhe Wr

A

het aantal omwentelingen dat de duplex-as van een covalent gesloten cirkelvormig dubbel schroefvormig DNA maakt rond de superhelix-as

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

superhelische densiteit

A

= een maat voor het aantal draaiingen verwijderd relatief aan het aantal draaiingen aanwezig in de gerelaxte (B-vorm) vorm van DNA => beschrijft het percentage aan helicale draaiingen die verwijderd zijn van DNA in zijn B-vorm

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

plectonemische supercoiling

A

een type negatieve supercoiling dat kan worden aangenomen door sterk onderwikkeld DNA en bestaat uit uitgebreide rechtshandige spoelen die op een eenvoudige en regelmatige manier om elkaar heen gedraaid zijn

17
Q

solenoidale supercoiling

A

een soort negatieve supercoiling die kan worden toegepast door sterk onderwikkeld DNA en bestaat uit nauwe linkshandige draaiingen

18
Q

wat doet/is een topoisomerase?

A

= een enzyme dat de DNA-supercoiling verandert door de breuken te katalyseren in 1 of 2 strengen. DNA passeert doorheen de breuk en hersluit de breuk.

19
Q

type 1 topoisomerase

A

= er breekt 1 streng van de DNA-duplex, Lk verandert in sprongen van 1, vereist geen ATP

20
Q

type 2 topoisomerase

A

= er breken 2 strengen van de DNA-duplex, Lk verandert in sprongen van 2, vereist wel ATP

21
Q

mechanisme van type 1 topoisomerase?

A
  1. Tyrosine valt aan op de fosfodiestergroep in 1 DNA-streng
    = breken => nucleofiele substitutie
  2. Enzyme verandert in een open formatie
  3. De andere streng wordt door het gat in de 1e streng getrokken
  4. Enzyme in gesloten conformatie 3’OH valt aan op 5’fosfohydrotyrosyleiwit = herverbinden van de strengen
22
Q

waarom vereist type 1 topoisomerase geen ATP?

A

Supercoiled DNA = gestressed op vlak van torsie => hogere Gibbs vrije energie => door de supercoils te verwijderen = spontaan
=> thermodynamisch gunstig = geen ATP

23
Q

mechanisme van topoisomerase type 2

A
  1. Enzym bindt zich aan G-segment
  2. T-segment van dezelfde DNA-molecule is gebonden aan de N-poort
  3. T- segment zit vast. G-segment wordt gekliefd in beide strengen, tvv 2 ‘5-fosfotyrosylbindingen aan het enzyme
  4. T-segment wordt door de breuk gehaald
  5. Het gebroken DNA wordt herplakt en het T-segment wordt vrijgelaten door de C-poort
24
Q

wat zijn histonen?

A

= eiwitten waarrond DNA zich wikkelt ter vorming van het fundamentele legoblokje voor verdere verdichting

25
Q

wat zijn nucleosomen

A

= het complex van een histonoctameer en ongeveer 150 baseparen van DNA die een structurele eenheid vormen voor het verpakken van chromatine

26
Q

nucleosoom?

A

= equivalent van een linkshandige solenoïde

27
Q

DNA -> mitotisch chromosoom
(orden alle tussenstappen van groot naar klein)

A
  • DNA
  • nucleosoom
  • 30-nm-filament
  • extended vorm van chromosoom
  • condensed deel van chromosoom
  • mitotisch chromosoom
28
Q

introductie van negatieve supercoils?

A

= Gibbs vrije energie opslaan
= nood aan input van energie

=> supercoiled DNA kan niet relaxen zonder strengen te breken, Gibbs vrije energie zit gevangen binnenin de gesupercoilede molecule

Biochemie 2 (11 decks)

Brainscape helps you reach your goals faster, through stronger study habits.
© 2024 Bold Learning Solutions. Terms and Conditions