HOOFDSTUK 10

Question 1

uit hoeveel nucleotiden bestaat 1 codon?

Answer 1

= 3 nucleotiden

Question 2

wat is het startcodon?

Answer 2

AUG (Met)

Question 3

wat zijn de stopcodons?

Answer 3

UAA
UAG
UGA

Question 4

wat is een codon

Answer 4

= triplet van nucleotiden die coderen voor een aminozuur

Question 5

wat is het + wat is het doel van ontaarding?

Answer 5

= meerdere codons encoderen voor hetzelfde AZ
= zorgt voor resistentie voor mutaties

Question 6

wat is een open-leesraam

Answer 6

een leesraam begint met een startcodon en een aanzienlijk # codons bevat voordat een stopcodon wordt gelezen = open leesraam

Question 7

tRNA’s bevatten veel ongebruikelijke basen…?

Answer 7

= 7 - 15 basen per molecuul

Question 8

inosine?

Answer 8

= belangrijk derivaat van nucleotiden (A, G, C en U)

Question 9

aminozuurarm

Answer 9

= acceptorstam
= bevat geconserveerde CCA-3’-sequentie waaraan een specifiek AZ covalent gekoppeld is

Question 10

TuC-arm

Answer 10

= gebied mer ribothymidine, pseudouracil en cytosine

Question 11

D-arm

Answer 11

= bevat dihydrouracil

Question 12

anticodon-arm

Answer 12

= bevat het anticodon

Question 13

Wobble hypothese?

Answer 13

=de herkenning van meerdere codons door 1 tRNA-molecuul is mogelijk omdat sommige tRNA’s wiebelig zijn => kunnen atypische baseparen vormen op een specifieke positie op hun anticodon

Question 14

wat zijn aminoacyl-tRNA synthetasen

Answer 14

aminozuren worden op de juiste tRNA-moleculen geladen door speciale enzymen

Question 15

hoeveel aminoacyl-tRNA-synthetasen zijn er?

Answer 15

20
elk AZ heeft zijn eige aminoacyl-tRNA-synthetase

Question 16

aminoacyl-tRNA-synthetase katalyseert welke reactie?

Answer 16

AZ + ATP <=> aminoacyl-AMP + PPi

aminoacyl-AMP + tRNA <=> aminoacyl-tRNA + AMP

AZ + ATP + tRNA <=> aminoacyl-tRNA + AMP + PPi

Question 17

reactiemechanisme stap 1 (hetzelfde voor beide klasse)

Answer 17

• carboxylgroep van AZ voert nucleofiele aanval uit op fosfoanhydride P-atoom en PPi is de leaving groep
• aminoacyl-AMP intermediair wordt gevormd

Question 18

reactiemechanisme stap 2; klasse I

Answer 18

2 opeenvolgende nucleofiele substituties door 3’-positie adenosine van tRNA

2-OH van terminale adenosine = nucleofiele aanval op esterkoolstofatoom en AMP is leaving groep

3-OH van terminale adenosine = nucleofiele aanval op esterkoolstofatoom en 2-OH is leaving groep

Question 19

reactiemechanisme stap 2; klasse II

Answer 19

3-OH van terminale adenosine voert een nucleofiele aanval uit op esterkoolstofatoom en AMP is de leaving groep

Question 20

klasse I enzymen?

Answer 20

monomeren

Question 21

klasse II enzymen

Answer 21

dimeren

Question 22

aminoacyl-tRNA synthetasenheeft een proofreading activiteit

Answer 22

• een eerste filter wordt opgelegd door de vorm van de actieve plaats van het enzym
• na het opladen van tRNA wordt geactiveerde verplaatst naar een bewerkingsplaats op hetzelfde enzyme (grootte)

Question 23

de proofreading activiteit van aminoacyl-synthetasen is zeer effectief want..

Answer 23

aminoacyl-tRNA kan worden gegenereerd en bewerkt op hetzelfde enzym zonder dissociatie

effect van dwingen van het systeem door 2 opeenvolgende filters is vermenigvuldigend

Question 24

ribosomen functie

Answer 24

= translatie en eiwitsynthese uitvoeren

Question 25

ribosomen bestaan uit

Answer 25

rRNA en zijn versierd met eiwitten

Question 26

A-site

Answer 26

aminoacyl site
= geladen aminoacyl-tRNA

Question 27

P-site

Answer 27

peptidyl site
= peptide wordt gevormd

Question 28

E-site

Answer 28

exit site
= ongeladen tRNA gaat weg

Question 29

wat zijn de 2 initiatiefactoren van het 30S-subunit

Answer 29

= IF1 en IF3

Question 30

IF1

Answer 30

= voorkomt de vroegtijdige binding van tRNA aan de ribosomale A-site

Question 31

IF3

Answer 31

= voorkomt de vroegtijdige associatie van 50S-subunit en verbeterd de specificiteit van de P-site voor fMet-tRNA^fmet

Question 32

Shine-Dalgarno sequentie?

Answer 32

= 5’-AGGAGGU-3’
= bacteriële mRNA-molculen bevatten een geconserveerde ribosoombindingssite

Question 33

wat is het initiatie complex?

Answer 33

= functioneel 70 S-subunit
- associatie van fMet-tRNA^fmet aan 30S
- 50S wordt gerekruteerd
- GTP wordt gehydrolyseerd door IF2
= 70S

Question 34

elongatiefactor Ef-Tu

Answer 34

= de eerste stap van de elongatiecyclus bestaat uit het binden van het inkomende aminoacyl-tRNA dus nood aan elongatiefactor

Question 35

translocatie

Answer 35

de laatste stap van de elongatie omvat de beweging van het ribosoom door 1 codon richting het 3’-einde van mRNA

Question 36

de translocase is hier?

Answer 36

de derde elongatiefactor = Ef-G

Question 37

polysoom

Answer 37

= een enkel mRNA-transcript kan gebonden zijn aan meerdere ribosomen voor eiwitsynthese

Question 38

kozak consensus sequentie

Answer 38

= de ribosoombindingssite dat het startcodon voorgaat

Question 39

vastgelopen ribosomen kunnen gered worden?

Answer 39

• vertaling van beschadigd mRNA leidt tot ribosoom stalling = vorming non-stop-complex
• ribosomale A-site is leeg = geen mRNA-codon dat kan interageren
• speciaal transfer-boodschapper-RNA (tmRNA) bindt aan lege A-site

= resulterende eiwit is defect en wordt gemarkeerd voor afbraak door cellulaire proteasen

Question 40

NLS?

Answer 40

= nucleaire lokalisatiesignalen
= signalen die eiwitten naar de kern leiden

Question 41

waar vinden post-translationele modificaties van de meeste eukaryotische eiwitten plaats?

Answer 41

= endoplasmatisch reticulum