Genetyka populacji i dziedziczenie wieloczynnikowe

Question 1

Zesztywniające zapalenie stawów kręgosłupa jest przewlekłym zapaleniem stawów zajmującym kręgosłup i stawy krzyżowo-biodorowe. 95% jest pacjentów pozytywnych dla HLA-B27 haplotypu, podczas gdy 7% ludzi jest pozytywnych. Jest to dowód na:

Answer 1

ASOCJACJA

• kiedy genotyp w danej populacji współistnieje z cechą fenotypu częściej niż byłoby przewidywane przez przypadkowe zdarzenie
• For ankylosing spondylitis to be linked to the HLA-B locus, a gene causing the disease would have to be located close enough to the HLA-B locus to have recombination events occur between the two loci less often than by chance (50%). ????

Question 2

Młoda kobieta z północnej Europy jest samotną matką dziecka z AR mukowiscydozą (CF). Wychodzi za niespokrewnionego mężczyznę z północnej Europy i chcą mieć więcej dzieci. Jakie jest ryzyko, że jest on nosicielem CF. Przyjmij, że częstość CF w tej populacji wynosi 1/2500

Answer 2

1/25

Bo:
q^2 = 1/2500 => q = 1/50 => p = 1-1/50 => p = 49/50
2pq = 2* 49/50 * 1/50 = ok. 1/25

Question 3

Wymień 5 “predykcji” wieloczynnikowego “dziedziczenia” ???

There are five predictions of multifactorial treshold model:

Answer 3

1. Ryzyko rekurencji reprezentuje średnie ryzyko i będzie różniło się między różnymi rodzinami.
2. Ryzyko wzrasta z liczbą chorych krewnych.
3. Ryzyko wzrasta wraz z ciężkością wady rozwojowej / choroby.
4. The differential risk to relatives of an affected proband increases as the frequency of the disease or malformation in the general population decreases.
5. Gdy sex ratio chorych probandów odbiega znacząco od równości, potomstwo chorego probanda płci rzadziej chorującej ma większe ryzyko choroby.

Question 4

For a given autosomal recessive disease, q = 0.01 (where q is the allele frequency of the mutant allele). Approximately what percentage of the population has two copies of the normal allele?
Dla danej choroby AR q = 0,01 (częstość allelu zmutowanego). Jakie jest średnie występowanie w populacji 2 kopii normalnego allelu

Answer 4

98%

q = 0,01 => p = 0,99 
p^2 = 0,98 => 98%

Question 5

If 1 out of every 250,000 people have Disease X, a nonlethal autosomal recessive disorder, what is the approximate carrier frequency of this disease? (Assume Hardy-Weinberg equilibrium.)
Jeśli 1 z 250,000 ludzi ma chorobę X (nieśmiertelna AR choroba), jaka jest średnia częstość nosicieli tej choroby?

Answer 5

1/250

q^2 = 1/250000
q = 1/500
p = 499/500
2pq = 2/500 = 1/250

Question 6

Które z podanych jest najsilniejszym dowodem na ważną genetyczną komponentę w cukrzycy typu 1?

Answer 6

• “Concordance rate” u monozygotycznych bliźniaków jest 5 razy wyższy niż u dizygotycznych

Question 7

Częstość nosiciela (heterozygoty) choroby XR o częstości choroby 1/10,000 jest większa od częstości nosiciela choroby AR o częstości choroby 1/1,000,000
Prawda czy Fałsz?

Answer 7

FAŁSZ

1 choroba:

• tylko kobiety mogą być heterozygotami
• mężczyźni mający zmutowany q są chorzy
• ilość chorych kobiet jest raczej nieistotna bo wynosiłaby 1/100,000,000
• chorzy mężczyźni stanowią więc 1/10,000

nosicielki (2pq) = 29999/100001/10000 = 2/10000 = 1/5000 => nosicieli w społeczeństwie (M i K) jest 1/10000

2 choroba:
q2 = 1/1000000 => q = 1/1000 => 2pq = 1/500

Question 8

Przyjmując równanie Hardy-Weinberga dla alleli CFTR (w mukowiscydozie) i wiedząc, że q = 1/50, jaka jest frakcja nosicieli w społeczeństwie?

Answer 8

1/25 = 2/50

q = 1/50 => p = 49/50 => 2pq = 1/25