Genetyka kliniczna Flashcards
Para, lat ok. 30, mają 2 zdrowych dzieci i teraz oczekiwali dziewczynki, lecz urodziła się martwa przez liczne wrodzone anomalie. Który temat będzie najmniej odpowiedni do rozmowy krótko po porodzie?
Zaproponowanie matce zrobienia niezwłocznie podwiązania jajowodów (zabieg sterylizacji) podczas tej hospitalizacji, by uniknąć pojawienia się podobnego problemu, zwłaszcza że już mają dwójkę zdrowych dzieci.
Przedsymptomatyczna diagnoza choroby Huntingtona wymaga analizy DNA przynajmniej jednego chorego krewnego.
FAŁSZ
Choroba Huntingtona (HD) jest spowodowana przez pojedynczą, znaną mutację, a test PCR może zapewnić bezpośrednią diagnozę bez konieczności sprawdzania innych członków rodziny. HD jest spowodowane ekspansją sekwencji CAG w kodującej części genu HD (huntingtyny). Normalnie CAG wynosi 10-36 powtórzeń, a w HD 36-121.
Konsultacja genetyczna obejmuje wszystkie poniższe oprócz:
Rekomendacja specyficznych opcji “rozmnażania”/reproduction options.
Choroba AR, z częstością 1/10000 w populacji (przyjmij 100 000 ludzi w Ann Arbor). Twój najlepszy przyjaciel przychodzi do ciebie bardzo smutny. Właśnie miał robiony test i wyszedł pozytywnie. Jest pewien, że jest nosicielem, choć nie ma przypadków choroby w historii jego rodziny. Mówi, że w klinice mu powiedziano, że test ma czułość 98%, a swoistość 90%. Jaka jest szansa, że nie jest nosicielem
83%
q2 = 1/10000 => q = 1/100 => 2pq = 1/50
2pq = 1/50 => w Ann Arbor jest ok. 2000 nosicieli i 98000 zdrowych
Czułość - powie nam jak często chorzy będą pozytywni, więc 2% chorych ma wynik ujemny.
A/2000 = 98% * 2000 = 1960
D/98000 = 90% * 98000 = 88200 => B = 9800
Szansa, że fałszywie pozytywny”
B/(B+A) = 9800/(9800+1960) = ok. 83%
26-letni M, student medycyny, bez problemów neurologicznych czy psychiatrycznych przechodzi przez genetyczny test sprawdzający, czy ma mutację w genie HD. Ma w swojej rodzinie (w tym jego matkę) przypadki HD.
HD allel 1 - 17 powtórzeń
HD allel 2 - 43 powtórzenia
Jest osobnikiem asymptomatycznym, który odziedziczył mutację genu HD i rozwiną się u niego objawy choroby, jeśli będzie żył wystarczająco długo.
Pacjent miał robiony test presymptomatyczny dla choroby AD. Test ten ma 100% predykcję.
Dziecko się rodzi z rozszczepem wargi i podniebienia. Wada urodzenia może być powiązana z
- Zaburzenia chromosomowe np. trisomia 13
- ” A healthy, otherwise completely normal, newborn infant”
- Defekt związany z pasmami owodniowymi.
Rozszczep wargi i podniebienia może być defekt izolowanym lub występuje jako część większego obrazu klinicznego.
Czułość testu
- sensitivity
- stosunek ilości chorych pozytywnych do wszystkich chorych => A/(A+C)
Swoistość testu
- specificity
- stosunek ilości zdrowych negatywnych do wszystkich zdrowych =? D/(D+B)
Czułość i swoistość vs reszta
Czułość i swoistość - niezależne od konkretnej populacji
Wartość predykcji pozytywnej i negatywnej oraz stosunek fałszywych ujemnie i stosunek fałszywych dodatnie są zależne od konkretnej populacji i do ich obliczenia potrzebujemy znać częstość choroby w populacji.
Co jest prawdziwe o badaniach przesiewowych noworodków na genetyczne choroby?
Noworodki najczęściej podlegają badaniu przesiewowemu:
na choroby, które są uleczalne/można uniknąć
By rozpocząć udany i opłacalny program badania przesiewowego na wykrywanie nosicieli choroby AR, wszystkie poniższe są ważne, oprócz:
Badanie przesiewowe musi mieć predykcyjność 100%
Genetic counseling is provided with the testing
The disease is severe enough to be clinically significant
Reproductive options are available
A high-risk population can be identified
