Génétique bactérienne et résistance aux antibiotiques Flashcards

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Q

Vrai ou faux: les maladies infectieuses peuvent toucher tout le monde

A

Vrai, personne est épargné

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Q

Quel est le nombre de décès associé aux infections et le pourcentage par rapport à toutes les autres causes de mortalités?

A

9 millions

16%

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Q

Qu’est-ce qui explique que la quantité de mort des maladies infectieuses à énormément diminuer en l’espace de 15 ans?

A

L’amélioration des conditions sanitaires

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Q

Vrai ou faux: les maladies infectieuses sont tellement meurtrières que même les compagnies veulent que la santé mondial y porte plus d’attention, par perte de main d’oeuvre

A

Vrai

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Q

Qu’est-ce qu’une bactérie panrésistante ?

A

Une bactérie résistante à tous les antibiotiques disponibles

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6
Q

Qu’est-ce qu’une entérobactérie ?

A

Une bactérie Gram -

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7
Q

Quel est le problème auquel fait face le monde aujourd’hui?

A

Il y a des souches de bactéries émergentes qui sont résistantes aux différents antibiotiques ce qui crée un enjeu majeur pour le système de santé et la santé publique

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8
Q

Vrai ou faux: depuis 2015 il y a une campagne pour s’attaquer à l’émergence des bactéries résistantes?

A

Vrai

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9
Q

En 2019, la mort de plus de 1,27 millions de personnes est … attribuable à la résistance aux anti microbiens

A

directement

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10
Q

Vrai ou faux: c’est plus de mort que le VIH/SIDA ou la malaria

A

Vrai

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11
Q

Quelles sont les étapes à partir de l’ADN pour obtenir une protéine?

A

1) Transcription de l’ARNm en codon par l’ARN polymerase

2) Traduction par des ribosomes

3) Protéines

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12
Q

Quelle est la protéine qui permet la réplication de l’ADN?

A

ADN polymerase

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13
Q

QSJ: principaux acteurs du vivant?

A

Protéines

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14
Q

Comment est-ce qu’une protéine peut accomplir ces fonctions?

A

À partir d’une conformation adéquate

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15
Q

Nommer des fonctions des protéines?

A
  • Adhésion
  • Catalyse
  • Communication
  • Défense
  • Entreposage
  • Moteurs moléculaires
  • Production d’énergie
  • Structure
  • Transport
  • Reconnaissance
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16
Q

Qu’est-ce qu’un médicament?

A

Un principe actif ayant une cible

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17
Q

Vrai ou faux: la plupart des médicaments ont besoin de rentrer dans la cellule pour atteindre la cible?

A

Vrai

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18
Q

Quelle est la première défense des bactéries contre un médicament?

A

Altération de la perméabilité/séquestration

ou

En pompant directement le médicament vers l’extérieur à l’aide d’une pompe à efflux

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19
Q

Quelle est le deuxième moyen de défense des bactérie contre un antibiotique?

A

Modification ou destruction de l’antibiotique à l’aide d’enzyme qui vont hydrolysés les molécules des médicaments (enlever ou ajouter un groupement chimique)

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20
Q

Quel est le troisième moyen de défense des bactéries contre les antibiotiques ?

A

Modification ou remplacement de la cible

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21
Q

Nommer les différentes cibles des antibiotiques? (11)

A
  • Membrane
  • Synthèse d’ATP
  • Biosynthèse de l’acide folique
  • Paroi
  • Synthèse des protéines (sous unité 50S du ribosome)
  • Synthèse des protéines (sous unité 30 S du ribosome)
  • Isoleucine aminoacyl ARNt synthétase
  • Synthèse des protéines (facteur d’élongation)
  • Polymérase à ARN
  • Fragmentation de l’ADN
  • Gyrases à ADN
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22
Q

Pourquoi est-ce que les ribosomes sont autant une cible des antibiotiques?

A

Étant donné qu’ils sont différents à ceux humains

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23
Q

Quel est le nom de la structure qui assure un empaquetage compact du matériel génétique?

A

Nucléoïde

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24
Q

Vrai ou faux: Les bactéries ont un noyau

A

Faux

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25
Q

Quel est le nombre de paire de base des différentes bactéries et le nombre de gène:

  • Eschrichia coli
  • Vibrio cholerae
  • Haemophilus influenza
  • Mycoplasma pneumoniae
A

1) 4639 kilo paire donc environ 4300 gènes

2) 2961 kilo paire environ 2700 gènes

3) 1830 kilo paires environ 1700 gènes

4) 816 kilo paires environ 700 gènes

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26
Q

Vrai ou faux: Escherichia coli est un parasite obligatoire, car il n’a pas assez de gènes pour survivre seul?

A

Faux, mycoplasma pneumoniae

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27
Q

Quelle est la quantité de paire de base dans un noyau humain et la qualité de gène?

A

3 milliards de paires soient environ 20 000 gènes.

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28
Q

QSJ: élément extra chromosomique capables de se répliquer de façon indépendante par rapport au chromosome principal. Je ne suis pas présent dans toutes les bactéries

A

Plasmide

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29
Q

Quelle est la taille en nombre de paires de bases des plasmides?

A

Entre 1 et 1000 kilo

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30
Q

Vrai ou faux: les plasmides codent pour des fonctions essentielles à la cellule?

A

Faux, au contraire

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31
Q

Nommer des avantages uniques que peuvent apporter les plasmides bien qu’il ne soit pas essentiel dans une situation parfaite à la survie des bactéries ?

A
  • La résistance aux antibiotiques
  • Capacité métabolique supplémentaire
  • Facteur favorisant l’infection
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32
Q

Quel est le mode de division des bactéries et le temps de génération dans des conditions optimales?

A

Fission binaire (cellule mère donne deux cellule fille)

Environ 20 minutes

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33
Q

Quel est le mode d’action de la quinolone?

A

Il vise les enzymes qui sont responsables d’empaqueter et de dépaqueter les matériels génétiques. En les dépaquetant, cela joue avec l’intégrité de la cellule et peut vraiment lui nuire.

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34
Q

Vrai ou faux: les bactéries à gram + ou des bactéries anaérobies n’ont pas nécessairement les mêmes antibiotiques ?

A

Vrai

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35
Q

Vrai ou faux: la quantité de nouvelles molécules pouvant s’attaquer aux bactéries ne fait qu’augmenter

A

Faux, au contraire, nous somme dans une période “sombre” des découvertes. Les résistances des nouvelles souches compliquent énormément le développement de nouveaux médicaments

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36
Q

Pourquoi est-ce que Fleming a donné un avertissement sur l’usage de la pénicilline ?

A

Étant donné qu’un sur-usage des antibiotiques ne fera qu’augmenter la quantité de bactéries résistantes par sélection naturelle ce qui à mener à la pandémie silencieuse des nouvelles souches de bactérie.

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37
Q

Qu’est-ce qu’oblige un petit génome pour une bactérie?

A

De dépendre des facteurs de l’hôte pour sa reproduction (métabolite essentielles)

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38
Q

Quelles sont les 3 grandes catégories de gènes dans le chromosome ?

A
  • Essentiel
  • Virulence
  • Résistance
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39
Q

Quel est la forme des chromosomes dans une bactérie?

A

Forme circulaire

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40
Q

Vrai ou faux: la plupart des bactéries ont 3 chromosomes ?

A

Faux, 1

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41
Q

Vrai ou faux: il est possible d’avoir des bactéries avec 2 chromosomes, mais impossible d’avoir 2 plasmides différents?

A

Faux, les deux c’est possible

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42
Q

Quelles est la différence entre la souche K12 de l’escherichia coli et la souche Sakai de l’escherichia coli?

A

La souche Sakai a 5500 kilo paires de bases tandis que 4639 kilo paires pour la souche K12.

Ce plus gros génome confère plus d’information dont probablement des informations lui permettant d’infecter l’hôte et causer des maladies

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43
Q

Qu’est-ce qui explique que l’humanité à connu plusieurs pandémies de choléra?

A

C’est un génome sur 2 chromosomes ce qui lui confère des nouvelles résistances, car il est facilement capable de modifier des parties de ce dernier.

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44
Q

Vrai ou faux: la répartition des copies du chromosomes entre les cellules filles est pas totalement égale, mais toujours équitable pour le ou les plasmides?

A

Faux, répartition égale des chromosomes et des copies, mais pas toujours équitable pour le ou les plasmides

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45
Q

Qu’est-ce que fait la bactérie afin de minimiser ses dépenses énergétiques?

A

La bactérie n’active un système que si elle en a besoin

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46
Q

Les bactéries évitent de synthétiser les enzymes d’un sentier métabolique, mais elles sont toujours prêtes à …

A

produire ces enzymes si le substrat apparaît dans l’environnement.

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47
Q

Quelles sont les types de régulation? (décrire)

A

1) Changement dans la séquence d’ADN (amplification de gène, réarrangement de gène)

2) Changement dans le nombre de transcripts (activateurs/ répresseurs)

3) Changement dans la quantité de produit de gène actif (ajout de cofacteur ou groupe prostétique, clivage protéolytique, interactions avec d’autre macromolécules)

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48
Q

Qu’est-ce qu’un promoteur dans la régulation transcriptionnelle ?

A

La séquence d’ADN situé en amont d’un gène ou groupe de gène qui permet la transcription de ce gène en ARN.

L’ARN polymérase reconnait cette séquence et c’est cette séquence qui est requise pour amorcer la transcription du gène

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49
Q

Qu’est-ce qu’un opérateur dans la régulation transcriptionnelle ?

A

Séquence d’ADN adjacente à un gène ou groupe de gène.

Séquence reconnue par une protéine régulatrice qui agit comme répresseur ou activateur

Contrôle la transcription de ce gène ou groupe de gène

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50
Q

Quel est le type de régulation le plus utilisé par les mycètes?

A

Changement dans la séquence d’ADN

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51
Q

Quel est le type de régulation le plus utilisé par les bactéries?

A

Régulation transcriptionnelle

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52
Q

QSJ: Protéine inhibant la transcription d’un gène en se liant à une séquence spécifique de nucléotide de l’ADN (souvent l’…)

A

Répresseur

opérateur

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53
Q

QSJ: Protéine qui stimule la transcription d’un gène ou d’un ensemble de gènes. Ces protéines reconnaissent généralement une séquence spécifique sur l’ADN située à proximité d’un …

A

Activateur

promoteur

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54
Q

Le gène tetB qui permet aux bactéries de résister à la tétracycline est sous le contrôle du gène … tetR

A

répresseur

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55
Q

Le gène tetB est précédé d’un … et le gène TetR est situé sur l’autre brin d’ADN et qu’il est aussi précédé d’un …

A

promoteur

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56
Q

Qu’est-ce qui se passe en absence de trétracycline pour la protéine du répresseur TetR?

A

La protéine répresseur est produite et vient bloquer le promoteur de tetB, ainsi que son propre promoteur pour s’autoréguler.

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57
Q

Quel est donc l’effet de la protéine du répresseur tetR?

A

Empêcher la transcription des deux gènes et donc de diminuer la dépense énergétique

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58
Q

Qu’est-ce qui se passe en présence de tétracycline ?

A

L’antibiotique va se complexer avec la protéine du répresseur la rendant ainsi incapable de bloquer le promoteur de tetB, ce qui a pour effet de permettre la transcription du gène en ARNm et ultimement la traduction en la production de la protéine tetB qui est une pompe à efflux responsable de la résistance à la tétracycline.

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59
Q

Comment est appelé le phénomène ou le promoteur/opérateur est recouvert par un répresseur et ainsi pu accessible à la polymérase à ARN ce qui empêche la transcription des gènes?

A

La répression de la transcription

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60
Q

Vrai ou faux: lorsqu’il y a présence de la tétracycline, il y a production de la protéine répresseur tetR?

A

Vrai, cela permettra d’avoir une protéine répresseur qui sera disponible lorsque le complexe répresseur-tétracycline va avoir été sorti de la cellule

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61
Q

La régulation de l’expression des gènes est ordinairement un processus … qui exige que la cellule soit dans un état métabolique …

A

actif

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62
Q

Quand est-ce que la régulation est plus rapide?

A

Dans la phase de croissance exponentielle des bactéries

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63
Q

Quand est-ce qu’elle est moins rapide?

A

Durant les phases de latence, de plateau ou de décroissance.

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64
Q

La régulation est souvent un processus comprenant des … comme dans le cas de l’autorégulation

A

boucles de contrôle

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65
Q

Qu’est-ce que la régulation simple?

A

Une promoteur pour contrôler un gène

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66
Q

Qu’est-ce que la régulation dans un opéron?

A

Un seul promoteur pour contrôler plusieurs gènes adjacents

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67
Q

Qu’est-ce que la régulation par un régulon?

A

Une seule protéine régulatrice (répresseur/activateur) pour contrôler plusieurs gènes situés à différents endroits dans le génome

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68
Q

Qu’est-ce que la régulation par un stimulon?

A

Le contrôle de plusieurs gènes non contigus (pas à côté) par un même stimulus

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69
Q

Quelle est la définition d’une mutation?

A

Modification de la séquence des nucléotides de l’ADN

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70
Q

Vrai ou faux: une mutation est transmise à la cellule fille?

A

Vrai

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71
Q

Qu’est-ce qu’une mutation spontanée?

A

Mutation pouvant être causé par l’action des radiations naturelles ou encore être le résultat d’erreurs survenues lors de la réplication

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72
Q

Vrai ou faux: les erreurs de réplications sont relativement fréquentes au niveau des bactéries

A

Faux, 10^-7 à 10^-11 par paire de base durant une ronde de réplication bactérienne.

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73
Q

Nommer un exemple de polymérase pas très fidèle?

A

La polymérise du rétrovirus VIH avec une fréquence d’erreur de 10^-4 par paire de base.

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74
Q

Qu’est-ce qu’une mutation induite?

A

Une mutation causé par une variété d’agents physiques, chimiques et biologiques (agents mutagène)

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75
Q

Vrai ou faux: les mutations induites sont moins fréquentes que les mutations spontanées?

A

Faux, beaucoup plus fréquentes

76
Q

Quelles sont les deux grandes catégories d’altération de l’ADN?

A
  • Délétions ou insertions de nucléotides
  • Substition de nucléotides
77
Q

Quelles sont les différents types de substitutions de nucléotides?

A
  • Silencieuse (même acide aminé)
  • Non sens (codon stop)
  • Mauvais sens (protéine défectueuse)
78
Q

On parle de … pour décrire la séquence nucléotidique précise du génome. Les propriétés obserbables des mutants forment le …

A

génotype

phénotype

79
Q

Quel est l’impact sur la protéine d’une mutation silencieuse?

A

Aucun

80
Q

Quel est l’impact sur la protéine d’une mutation non sens?

A

La protéine est incomplète

81
Q

Quel est l’impact d’une mutation mauvais sens sur une protéine?

A

Défectueuse (par rapport à sa fonction de base)

82
Q

Qu’est-ce qui se passe si la mutation affecte l’expression de l’ARNm?

A

Elle n’est pas nécessairement transmise, mais elle affecte le fonctionnement optimal de la cellule mutée

83
Q

Qu’est-ce que veut dire un phénotype sélectionnant?

A

Un phénotype qui donne une propriété permettant aux mutants d’avoir un avantage sur les autres bactéries dans un environnement ayant des conditions dites sélectives.

84
Q

Nommer un exemple de phénotype sélectionnant?

A

Un phénotype de résistance aux antibiotiques

85
Q

Qu’est-ce qui se passe dans une population bactérienne exposée à une concentration d’antibiotiques telles qu’elle exerce une pression sélective?

A

Les mutants résistants pourront croître plus rapidement que les parents sensibles et bientôt les remplacer pour former la majorité de la population.

86
Q

Vrai ou faux: la pression sélective crée la mutation

A

Faux, la mutation est survenue au hasard et elle existait déjà avant que la pression sélective ne s’exerce

87
Q

Vrai ou faux: les mutations entraînent plus souvent des effets néfastes?

A

Vrai

88
Q

Comment est-ce que les dommages accidentels (mutation spontanée) peuvent être minimisés?

A

À l’aide de système de réparation efficaces

89
Q

Quelles sont les 5 systèmes réparation de l’ADN ?

A
  • La réparation directe de l’ADN
  • La réparation par excision
  • La réparation par recombinaison
  • La réponse SOS (peut stimuler le transfert de gène)
  • La réparation sujette à erreur (peut induire des mutations)
90
Q

Nommer des exemples de phénotypes qui peuvent changer à l’aide de mutation dans une colonies qui sont observables au microscope ou sur une culture?

A
  • Non-utilisation du lactose
  • Morphologie allongée des bactéries (moins actives si pathogène, car forme plus longue prend plus de temps à se reproduire)
  • Perte de capsule ce qui a un gros impact sur la virulence
91
Q

Qu’est-ce qui est possible d’observer lorsqu’on étale une suspension de cellules bactériennes sur une surface d’un milieu gelosé avec un disque de papier buvard imbibé de l’antibiotique qui diffuse sur la gélose en formant un gradient de concentration qui décroit en s’éloignant du disque?

A
  • Il est possible d’observer une croissance des bactéries qui forment un tapis d’apparence muqueuse qui s’arrête à une certaine distance du disque pour la majorité de la population bactérienne.

Cependant, certaines colonies plus près du disque sont des mutants plus résistant que la majorité de la population.

Ils ont donc reçu une mutation de résistance

92
Q

Vrai ou faux: la concentration des antibiotiques va affecter la croissance des bactéries susceptibles dans une population ainsi que celle des bactéries résistantes retrouvées dans cette population.

A

Vrai, Il y aura augmentation des résistantes et diminution des susceptibles selon la dose

93
Q

Dans quel moment est-ce que la sélection des mutants (mort des susceptible et survie des mutants) se fait?

A
  • Lorsque la concentration est en dessous de la concentration minimale inhibitrice des résistantes (celle qui tue toutes les bactéries, mais qui est ÉNORME comme dose)
  • Lorsque la concentration est au-dessus de la concentration minimale inhibitrice des susceptibles
94
Q

Une concentration … des antibiotiques durant le traitement peut sélectionner les mutants résistants

A

suboptimale (dangereuse)

95
Q

Vrai ou faux: l’action de certains antibiotiques peut activer les systèmes de réparation?

A

Vrai, ce qui peut causer des mutations et par le fait même tuer la bactérie

96
Q

Vrai ou faux: les bactéries peuvent faire de la reproduction sexuée?

A

Faux, asexuée

97
Q

Vrai ou faux: étant donné que les bactéries ne peuvent pas faire de reproduction sexuée, elle ne peuvent pas faire d’échange d’information entre les cellules?

A

Faux, elles peuvent le faire (transfert horizontal)

98
Q

Quelles sont les trois mécanismes distincts de transfert d’information génétique ?

A
  • La transformation
  • La conjugaison
  • La transduction
99
Q

Quand est-ce que les cellules bactériennes se divisent par fission binaire (cellule mère se divise en deux ?

A

Lorsqu’elles atteignent une certaine taille

100
Q

On parle de quel type de transmission lorsqu’on parle de fission binaire?

A

Transmission verticale

101
Q

Qu’est-ce que la transmission horizontale?

A

Un échange de gènes qui permet aux bactéries d’acquérir de l’information génétique d’une autre bactérie

102
Q

Vrai ou faux: l’échange horizontale se fait uniquement entre bactéries d’espèces apparentées

A

Faux, il peut se faire avec des espèces très distantes d’un point de vue évolutif.

103
Q

Où est-ce que sont incorporés les gènes acquis de manière horizontale?

A

Au bagage génétique et pourront donc être transmis de manière verticale à la descendance ou encore être transférés de nouveau à d’autres groupes de bactéries

104
Q

Qu’est-ce que la transformation (mécanisme horizontale)

A

Lorsque des résidus d’ADN de bactéries mortes peuvent entrer à l’intérieur d’une bactérie vivante et permettre ainsi à cette dernière de bénéficier d’informations utiles qui auraient été possédées par les défuntes.

105
Q

Qu’est-ce que la conjugaison?

A

Lorsqu’il y a rapprochement physique entre deux cellules bactériennes où une cellule donatrice peut transférer activement une partie de son bagage génétique à une bactérie réceptrice.

106
Q

Qu’est-ce que la transduction?

A

Lorsque des bactériophages peuvent empaqueter accidentellement du matériel génétique appartenant à la cellule hôte et ainsi transférer certains gènes bactériens de manière horizontale.

107
Q

Qu’est-ce qu’une bactériophage?

A

Virus qui infecte juste les bactéries

108
Q

Quel est le mécanisme prédominant ?

A

La conjugaison

109
Q

Quelle structure utilise la bactérie lors de la conjugaison?

A

Des pilis conjugatifs

110
Q

Comment est-ce que le phénomène de transformation a été découvert en 1926?

A

Lorsqu’on a mélangé une culture de bactérie A, qui tuent des souris, mortes avec une culture de bactérie B qui ne tuent pas les souris.

Bien que les bactéries A étaient mortes, les souris mourraient lorsqu’exposé à ce mélange. On a déduis que le matériel génétique pouvait se transmettre.

111
Q

Quel est le nom de la capacité qu’ont certaines cellules d’être transformées par de l’ADN externe?

A

Compétence

112
Q

Vrai ou faux: cette compétence peut être acquise uniquement par l’exposition d’agents chimiques ?

A

Faux, agents physiques également ou chez certaines espèces (elle est naturelle).

113
Q

Quand est-ce que la transformation est la plus efficace ?

A

Lors de transformation entre bactéries d’une même espèces.

114
Q

La transformation est responsable entre autre, de la résistance de la bactérie … aux antibiotiques de la classes bêta-lactamines (pénicillines, etc.)

A

streptococcus pneumonia

115
Q

Comment est-ce que la streptococcie pneumonia (pneumocoque) peut augmenter sa résistance ?

A

Grâce à l’incorporation par transformation de petits fragments d’ADN issus d’espèces de streptocoques non pathogènes qui habitent la cavité buccale.

116
Q

Nommer les espèces chez lesquelles la compétence est naturelle?

A
  • Bacillus sp.
  • Haemophilus influenza
  • Neisseria sp.
  • Streptococcus pneumonia
117
Q

Qu’est-ce qui permet à une bactérie d’être compétente?

A

Une machinerie protéique qui lui permet de faire entrer l’ADN externe dans sa cellule et de l’intégrer dans son génome par recombinaison homologue.

118
Q

Comment est-ce que les antibiotiques peuvent favoriser la transformation?

A
  • En imposant une pression sélective aux bactéries transformées par des gènes de résistance
  • En agissant comme stimulus externe induisant ou augmentant la compétence
  • En favorisant la lyse de cellules, libérant ainsi l’ADN servant à la transformation
119
Q

Vrai ou faux: la transformation peut même être induite par des médicaments qui ne sont pas des antibiotiques ?

A

Vrai (étude en cours)

120
Q

Qu’est-ce que requiert la conjugaison?

A

Des contacts cellule-cellule

121
Q

Vrai ou faux: l’échange de matériel génétique est toujours bidirectionnel ?

A

Faux, unidirectionnel

122
Q

Les gènes nécessaires à cet échange sont codés par des

A

plasmides conjugatifs (gros plasmides)

123
Q

Qu’est-ce qu’un plasmide conjugatif de type R?

A

Plasmide conjugatif qui donne une résistance aux antibiotiques

124
Q

Comment se fait la conjugaison chez les Gram + vs Gram -

A

Gram - = pili conjugatif

Gram + = Un mécanisme distinct du pili conjugatif

125
Q

Qu’est-ce que le mécanisme de mobilisation?

A

Lorsque des plasmides non-conjugatif sont transférés en même temps que des conjugatifs.

126
Q

Vrai ou faux: la conjugaison peu transmettre plus d’un gène de résistance en même temps?

A

Vrai, ce qui peu créer des bactéries multirésistantes ou même pan résistantes (plusieurs classes de rx )

127
Q

Vrai ou faux: il est possible d’avoir une conjugaison à 3 en même temps?

A

Vrai

128
Q

Les bactériophages utilisent les bactéries pour…?

A
  • Reproduire leur enveloppe protéique (capside)
  • Reproduire leur matériel génétique (ADN ou ARN)
129
Q

Qu’est-ce qu’entraîne un cycle de vie lytique des bactériophages?

A

La mort des cellules bactériennes.

130
Q

Comment est appelé un phage uniquement capable de cycle lytique?

A

Phage virulent ou strictement lytique

131
Q

Qu’est-ce que la lysogénie? (Cycle lysogénique)

A

Capacité de certains phages à rentrer dans une cellule sans la détruire et intégrer leur matériel génétique dans le génome bactérien où il sera répliqué comme une partie intégrante du chromosome.

132
Q

Comment sont appelés les phages lysogènes?

A

Phages tempérés

133
Q

Qu’est-ce qu’un phage chronique?

A

Un phage qui infectent une bactérie de manière chronique, mais qui peuvent se reproduire et sortir de la cellule sans la tuer

134
Q

Quelles sont les deux types d’erreur d’empaquetage et laquelle des deux permet de transférer le matériel génétique d’une bactérie à l’autre à partir d’un phage?

A

Spécialisée : Un génome hybride phage-bactérie est créé quand le génome du phage est improprement excisé du génome de l’hôte. Le phage peut infecter une autre bactérie et ainsi donner son matériel génétique hybride contenant celui d’une autre bactérie.

Générale: Seulement de l’ADN de la bactérie ce qui empêche le virus d’aller infecter d’autres bactéries et par le fait même transmettre son ADN.

135
Q

Vrai ou faux: la transduction spécialisée est un phénomène fréquent?

A

Faux, rare

136
Q

Vrai ou faux: ces bactériophages hybrides peuvent se propager?

A

Vrai

137
Q

Qu’est-ce que la transduction généralisé?

A

Le résultat de l’empaquetage accidentel de fragment de l’ADN de l’hôte dans le capside (enveloppe protéique qui renferme leur matériel génétique) du phage.

138
Q

Vrai ou faux: les phages qui font de la transduction généralisée ne peuvent pas se propager suite à l’infection initiale?

A

Vrai

139
Q

Pourquoi les phages qui font de la transduction généralisée ne peuvent pas se propager suite à l’infection initiale?

A

Car l’information pour synthétiser les nouvelles capsides est absente.

140
Q

Qu’est-ce que contient la capside lors d’une transduction spécialisée vs généralisée?

A

Spécialisée: Matériel génétique du virus et de la bactérie (peut se propager)

Généralisée : Matériel générique uniquement de l’hôte (ne peut se propager)

141
Q

Nommer des gènes transférés par transduction?

A
  • Toxine de Corynebacterium
  • Entérotoxine de certaines souches de E. coli
  • Toxine du streptocoque responsable de la scarlatine
  • Toxine de Clostridium botulinum
  • Certains gènes de résistances aux bêta-lactamines (PNC) chez les Pseudomonas
142
Q

Quel est l’effet général de la transmission horizontale entre les bactéries appartenant à des lignées distinctes?

A

Accélérer les capacités d’adaptation évolutives des bactéries

143
Q

Quel est le risque par rapport à la sur-utilisation d’antibiotique?

A

Que les bactéries résistantes dominent les populations.

Des bactéries résistantes même non-pathogènes relèvent un problème, car une augmentation de ces dernières vont également influencer les gènes résistants pour les bactéries pathogènes.

144
Q

Qu’est-ce que la transposition?

A

Le mouvement de segment d’ADN à l’intérieur d’une même cellule

145
Q

Qu’est-ce que requière la transposition?

A

Une proximité physique entre les endroits où le transfert a lieu

146
Q

Vrai ou faux: les mouvements de transposition peuvent s’opérer entre différents éléments génétique susceptible d’être présents simultanément dans une même cellule

A

Vrai

147
Q

Quelles sont les 3 classes de transposons?

A
  • Les séquences d’insertion
  • Les transposons complexes (composites avec IS + autres gènes)
  • Les phages transposables
148
Q

Pourquoi est-ce que les transposons complexes ont une importance médicale considérable ?

A

Car ils peuvent encoder à l’intérieur de leur région centrale, des gènes de toxines ou de résistance aux antibiotiques

149
Q

Vrai ou faux: les bactéries disposent de systèmes qui facilitent la récolte et l’expression de nouveaux gènes potentiellement utiles?

A

Vrai

150
Q

Qu’est-ce que sont les intégrons?

A

Des éléments génétiques qui recrutent des gènes de résistances et les intègrent les uns à la suite des autres devant des promoteurs forts assurant l’expression de multiples gènes simultanément.

Ce système peut permettre à une bactérie de survivre si les gènes activés sont des gènes de résistances ou bien mener à la mort de la bactérie car cela demande une énorme demande énergétique

151
Q

Où est-ce qu’on retrouve les intégrons?

A
  • À l’intérieur de transposons complexes
  • Sur des plasmides
152
Q

Quel est le nom de l’enzyme qui déplace l’ADN d’un endroit à l’autre?

A

La transposase

153
Q

Vrai ou faux: il y a 100 fois plus de cellules bactériennes que de cellules nucléés dans le corps humain?

A

Faux, 10

154
Q

Qu’est-ce qu’engendre les antibiotiques sur la flore microbienne?

A

Une perturbation pouvant entraîner des désordres passagers et même parfois des pathologies très importantes.

NB: même des non-antibiotiques peuvent causer cela

155
Q

Vrai ou faux: les microbes de notre flore peuvent parfois augmenter stimuler l’action d’un médicament ou interférer avec cette dernière

A

Vrai

156
Q

Vrai ou faux: l’administration répétée d’antibiotiques favorisent la sélection des bactéries résistantes qu’à l’intérieur du patient?

A

Faux, dans son environnement aussi.

Les antibiotiques sont des facteurs non négligeables influençant la nature de l’écosystème microbien

157
Q

Quelles sont les conséquences possibles associés à des perturbations répétées du microbiote par des antibiotiques chez l’enfant?

A

Plusieurs conséquences cliniques (diabètes, obésité, asthme, sclérose, etc.)

Plusieurs conséquences immunologiques

158
Q

Vrai ou faux: les infections à S. aureus résistant à la méthyciline ont augmenté de 60%

A

Vrai

159
Q

Vrai ou faux: Plus de 20% de toutes les infections de gonorrhées sont résistantes à au moins un antibiotique?

A

Faux, 50%

160
Q

Vrai ou faux: les infections à la C. difficile demeurent stables depuis 2015?

A

Vrai

161
Q

Une augmentation de … fois chez les personnes porteuses de bactéries résistantes aux carbapénèmes, l’un des antibiotiques les plus puissants

A

5

162
Q

Vrai ou faux: les spécialistes sont ceux qui prescrivent le plus d’antibiotiques ?

A

Faux, généralistes

163
Q

Quelles sont les infections responsables de la plupart des ordonnance d’antibiotique?

A
  • Infections respiratoires
  • Infections urinaires
  • Infections de l’oreille
164
Q

Vrai ou faux: la résistances aux antimicrobiens peut se répandre par de multiples voies directes et indirectes c’est ce qui explique l’aussi grand impact des antibiotiques?

A

Vrai

165
Q

Vrai ou faux: la majorité des antibiotiques utilisés dans le monde sont utilisés pour les animaux pour l’industrie alimentaire

A

Vrai

166
Q

Vrai ou faux: la sélection des bactéries se fait uniquement pendant la thérapie?

A

Faux, car il y a dispersion des bactéries résistante et des antibiotiques dans l’environnement donc elle continue après

167
Q

Vrai ou faux: dans l’humain il y a plus de barrières à l’échange des gènes que dans le sol?

A

Faux, au contraire, il y a plus de mobilité dans l’humain donc plus de sélection que dans le sol

168
Q

Quel est le système le mieux connu qui protège les bactéries contre l’invasion d’ADNs étranger?

A

Le système de restriction-modification de classe 2

169
Q

Quelle est la première composante de ce système (restriction-modification)?

A

Méthylase qui modifie l’ADN de l’hôte à certaines séquences spécifiques pour le protéger d’une digestion éventuelle par la seconde composante du système.

170
Q

Quelle est la deuxième composante de ce système (restriction-modification)?

A

La nucléases de restriction qui détruit l’ADN étranger non méthylé ce qui restreint ainsi l’entrée de matériel génétique à nouveau

171
Q

Quelle est le second système de restriction des échanges qui est encore plus spécifique que celui de restriction modification?

A

CRISPR/Cas

172
Q

Qu’est-ce qu’incorpore le système CRISPR lorsqu’un nouveau phage infecte une bactérie?

A

Une courte séquence dérivée du génome du phage, conservant ainsi une mémoire spécifique des infections passées.

173
Q

Quel est le but d’avoir une séquence dérivée du génome du phage?

A

Des séquences CRISPR sont transcrites et traitées pour générer de courtes molécules d’ARN CRISPR qui patrouillent l’intérieur de la bactérie à la recherche de séquence de phages qui pourraient infecter la bactérie.

174
Q

Qu’est-ce qui se passe lorsqu’une molécule d’ARN CRISPR rencontrent une séquence d’envahisseur?

A

Il guide la protéine Cas qui sert à couper l’ADN étranger, prévenant ainsi l’infection de la bactérie par le phage

175
Q

Vrai ou faux: on utilise des produits synthétisés par les bactéries et d’autres types de cellule dans l’industrie pharmaceutique ?

A

Vrai.

Insuline

Vaccin

Anicorps monoclonaux humanisés

Etc.

176
Q

Quel est la base de la méthode diagnostic par PCR?

A

La polymerase à ADN qui recopie un brin complémentaire en effectuant une réaction d’extension d’amorce.

177
Q

Comment sont choisis les séquences nucléotidiques des amorces des tests diagnostic par PCR? ?

A

Elles sont choisis pour reconnaitre spécifiquement certains gènes comme des gènes permettant de reconnaitre et distinguer les différents microbes, leurs gènes de résistances et/ou facteur de virulence.

178
Q

Qu’est-ce que permet le cycle thermique?

A

De répéter la réaction d’extension d’amorce.

À chaque cycle, l’ADN polymérase reconfirme la reconnaissance spécifique des régions ciblées par les amorces, contribuant ainsi à la spécificité de la réaction PCR.

179
Q

Qu’est-ce qui se passe après 30 à 40 cycles thermiques?

A

La matériel génétique est amplifié pour atteindre des milliards de copies qui deviennent alors facilement détectables à l’aide de sondes fluorescentes

180
Q

Qu’est-ce que permet ce haut niveau d’amplification spécifique des acides nucléiques ciblés?

A

Que la PCR ne requièrent pas de devoir multiplier par culture le nombre de microbes avant de pouvoir les détecter et les identifier (en gros permet de gagner du temps)

181
Q

Quelles sont les étapes d’un cycle thermique?

A

1) 95 °C : Dénaturation (séparation des deux brins)

2) 55 °C: Appariement des amorces

3) 72 °C: Élongation

4) Fin du premier cycle avec deux copies

182
Q

Ce sont les …, et non les êtres humains ou les animaux, qui deviennent résistantes.

A

bactéries

183
Q

Vrai ou faux: les bactéries résistantes causent des infections plus difficiles à traiter que celles non résistantes ?

A

Vrai

184
Q

Est-ce que la solution à la résistance est de développer de nouveaux antibiotiques?

A

Non, car la résistances va continuer par pression sélective. Il faut plutôt modifier nos comportements afin d’avoir une solution à long terme.

185
Q

Quelles sont les actions que peuvent faire les professionnels de la santé pour prévenir et combattre la propagation de la résistance aux antibiotiques?

A
  • Faire de la prévention en veillant à la propreté des mains, instruments et environnement
  • Prescrire et délivrer des antibiotiques que si ils sont nécessaires
  • Signaler les infections résistantes aux antibiotiques aux équipes de surveillance
  • Parler à leurs patients de la prise correcte des antibiotiques, des résistances et des dangers d’un usage abusif
  • Parler à leurs patients de la prévention des infections