Cours 2- microbiologie Flashcards
1
Q
Vrai ou faux: la notion de croissance microbienne se rapporte à la multiplication des cellules et à leur augmentation de taille?
A
Faux
2
Q
Qu’est-ce qu’une culture?
A
Le fait de croître les microbes in vitro dans des conditions physico-chimiques déterminés afin de faciliter leur identification, l’étude de leur métabolisme voire leur utilisation à des fins médicales ou industrielles
3
Q
Quelles sont les deux conditions nécessaire afin de pouvoir retrouver des microbes?
A
De l’eau sous forme liquide et du carbone. Partout où on retrouve ça on trouve des microbes
4
Q
Quelle est la source d’énergie des bactéries phototrophes et chimotrophe?
A
Phototrophe = lumières
Chimotrophe = composé chimiques
5
Q
Qu’est-ce que procure des nutriments aux microorganismes?
A
Source de carbone, d’électrons et de protons nécessaires aux fonctionnement métaboliques et physiologiques
6
Q
Quelle est la différence entre les bactéries autotrophes et hétérotrophes?
A
Autotrophes = seulement besoin du CO2 comme source de carbone
Hétérotrophe: besoin de composés organiques plus complexes (sucres)
7
Q
Quelles sont les deux types de sources d’électrons et le nom des bactéries selon la source?
A
Organique = sucres, bactéries organotrophes
Inorganique = NH3, H2S, bactéries lipothotrophe
8
Q
QSJ: préparation nutritive destinée à la croissance microbienne
A
Milieu de culture
9
Q
QSJ : milieux liquides qui favorisent la croissance rapide et abondante de microbes en suspension.
A
Bouillons de culture
10
Q
Vrai ou faux: les milieux de cultures sont les mêmes pour toutes les bactéries?
A
Faux, les milieux de cultures sont préparé de façon à ce que les éléments nutritifs soient optimaux selon la bactéries et les conditions de croissance également (humidité, température, etc.)
11
Q
QSJ: Milieu avec des compositions chimiques strictement connues et contrôlées dont le but est d’étudier les exigences nutritionnelles d’une bactéries.
A
Milieux synthétiques/définis)
12
Q
Vrai ou faux: on utilisent plus souvent des milieux complexes que synthétiques, car l’objectif est souvent de favoriser la croissance de tout microbe potentiellement présent dans un échantillon
A
Vrai
13
Q
Quel est le nom de l’agent gélifiant qu’on rajoute à un bouille de culture afin d’obtenir un milieu de culture appelé gélose?
A
L’agar
14
Q
Dans quoi sont coulées les milieux solides appelés géloses?
A
Des plaques circulaires nommées boîtes de Pétri
15
Q
À l’aide de quoi se fait le transfert d’une bactérie d’un milieu liquide à une plaque de pétri?
A
Au moyen d’un fil à boucle
16
Q
Quelle est la méthodes utilisées permettant de déposer des quantités décroissantes de cellules bactériennes sur les géloses?
A
La méthode des stries
17
Q
Qu’est-ce que forme la croissance sur géloses?
A
Des colonies bactériennes
18
Q
Qu’est-ce que l’expression “unité formant une colonie ou CFU en anglais?
A
En pratique, certaines bactéries sont parfois rattachées quelques-unes ensembles. On utilise donc ce terme pour désigner le nombre de bactéries dans un milieu de culture, car parfois une colonie ne provient pas d’une seule bactérie, mais plutôt de 2 collées.
19
Q
Vrai ou faux: si un échantillon contient un mélange de différentes bactéries, une culture mixte sera révélée en observant la morphologie des colonies
A
Vrai
20
Q
Qu’est-ce qu’une colonie pure?
A
Une colonie constituée d’une seule et même espèce microbienne
21
Q
Vrai ou faux: il est possible d’ajouter au milieux de bases des substances qui favorisent la sélection de microorganismes particuliers?
A
Vrai
22
Q
Quelle serait un exemples de substances qui favorisent la sélection de microorganismes particulier?
A
Sang, sang cuit qui libère de l’hémoglobine (appelé chocolat).
Hémoglobine sert de facteur de croissance
23
Q
Quelles sont les différents types de milieux de cultures complexes ?
A
- Milieux enrichis
- Milieux sélectifs
- Milieux différentiels
24
Q
Quel est le but des milieux sélectifs?
A
Inhiber la croissance de bactéries indésirables et stimuler celle des microbes recherchés.
25
Nommer un exemple de situation de milieu sélectifs?
- Recherche de bactéries dans les selles contenant une flore microbienne abondante et variée
- Gélose au mannitol et au sel permettant d'isoler le Staphylocoque qui peut croître à 7,5% de NaCL contrairement aux autres bactéries qui meurt dans de telles concentrations salines.
26
Qu'est-ce que le mannitol?
Un alcool hypertonique au pouvoir sucrant. C'est une substance différentielle, car seulement certaines bactéries l'utilisent comme substrats.
27
QSJ: Milieu où on a ajouté des produits qui favorisent les microbes qui croissent lentement et dont la culture est fastidieuse
Milieux enrichis
28
Quel est le but des milieux différentiels?
Distinguer entre colonies qui croissent sur la même boîtes de Pétri
29
Donner un exemple de produit utilisé pour un milieu différentiel?
Addition de sang permet de distinguer entre les souches de streptocoques qui sécrètent ou pas de l'hémosyline en observant l'apparition de zones d'inhibition plus ou moins claires autour des colonies.
Addition de divers sucres ainsi qu'un indicateur de pH pour connaître les souches en fonction de leurs capacités fermentaire et de produire des acides ou gaz
30
Qu'est-ce que le concept de combinaison de propriété?
Un milieu qui possède une combinaison de propriété, soit enrichie et/ou sélectif et/ou différentiel.
31
Nommer un exemple de gélose qui est sélective et différentielle?
Gélose de Chapman qui est sélective grâce au sel, mais aussi différentielle car elle permet de vérifier la fermentation du mannitol en produit acides.
32
Quel est le but du milieu de transport?
Un milieu suffisant pauvre pour limiter la croissance, mais capable de préserver les microorganisme contre la dessiccation, les modifications de pH ou la présence d'oxygène.
33
Dans quelle situation on utilise un milieu de transport?
Si le specimen ne peut être ensemencé immédiatement
34
L'agar est un extrait d'algue gélifiant solide jusqu'à combien de degrés?
45°C
35
Après combien de temps d'incubation à 35°C, la plupart des espèces peuvent produire des colonies visibles?
18 à 24 heures
36
Quelles sont les espèces bactériennes qui requiert le plus de temps allant de 2 à 6 semaines?
Les mycobactéries
37
Qu'est-ce que la gélose MacConkey?
Gélose qui inhibe les gram + par addition de sels biliaires et de Crystal violet, mais différencie les formes de Gram - selon leur capacité à fermenter le lactose. (gélose différentielle et sélective)
38
Qu'est-ce que la gélose de Chapman?
Gélose sélective, car salé et différentielle, car peut vérifier la capacité de fermentation du mannitol en produit acides (indicateur de pH intégré)
39
Qu'est-ce que la méthode d'épuisement (strie)
Méthode d'étalement qui permet d'isoler les colonies de façon à être certains qu'une colonie provient d'une bactérie à la base (ou de deux qui étaient collé au départ)
40
Qu'est-ce que permet d'observer une gélose de sang?
Le type d'hémolyse en observant comment les bactéries attaquent l'hémoglobine.
41
QSJ: bactéries qui peuvent vivrent à des température qui varient entre - 10 et et 25°C avec une température optimale de croissance de 15°C
Psychrophiles
42
Où est-ce qu'on retrouve les phychrophiles?
Dans certaines régions polaires et les grands fonds marins
43
Vrai ou faux: on ne côtoie jamais ou presque les psychrophiles?
Faux, ils sont la cause de la détérioration des aliments gardés au réfrigérateur à 4°C
44
Quelles sont les bactéries qui sont pathogènes chez l'humain et pourquoi?
Mésophiles, car vivent à des températures entre 20° et 50°
45
Quelles est le nom des bactéries qui peuvent se développer de façon optimale à des température entre 50 et 80°C
Thermophiles
46
Vrai ou faux: il existe des hyperthermophiles capable de vivre dans des conditions avoisinant les 300°C
Faux, 100°C
47
Quelles sont les températures auxquels les bactéries doivent survivre pour pouvoir être pathogène chez l'homme?
Entre 30 et 40 °C
48
Quelles sont les deux principaux gaz affectant la croissance bactérienne?
Oxygène et CO2
49
Quelles sont les 3 mécanismes utilisés par la bactéries pour se procurer de l'énergie?
- Aérobique
- Anaérobiques
- Fermentaire
50
Quelles sont les deux enzymes qui permettent d'éliminer la formation de radicaux oxygénés toxiques suite au métabolisme en présence d'oxygène?
- Superoxyde dismutase
- Catalase
51
Quelles sont les différents types de bactéries selon leurs façons de se procurer de l'énergie?
- Aérobies stricts
- Anaéorobies facultatifs
- Anaérobies stricts
- Aérotolérants
- Microaérophiles
52
QSJ: microorganismes qui ont obligatoirement besoin d'oxygène pour vivre
Aérobies stricts
53
QSJ: microbes qui peuvent croître en présence ou absence d'oxygène.
anaérobies facultatifs
54
Vrai ou faux: Les microbes qui sont anéarobies facultatifs croîent plus rapidement en absence d'oxygène?
Faux, plus rapidement en présence d'oxygène
55
Quel est le métabolisme utilisé par les anaérobies stricts?
Métabolisme fermentaire
56
Pourquoi est-ce que l'oxygène est fatale pour les bactéries anaérobique strict?
Car elles ne possèdent pas d'enzymes pouvant éliminé les radicaux oxygénés toxiques produit en mode respiratoire
57
Pourquoi est-ce que l'oxygène est fatale pour les bactéries anaérobiques stricts?
Car elles ne possèdent pas d'enzymes pouvant éliminé les radicaux oxygénés toxiques produit en mode respiratoire
58
Où est-ce qu'on retrouve les anaérobiques stricts?
Dans les sol et dans l'intestin
59
QSJ: Groupe de bactérie dont la croissance se fait en anaérobie seulement, mais qui n'est pas inhibé par la présence d'oxygène, car possède des enzymes de détoxification des radiaux oxygénés.
Aérotolérants
60
QSJ: Besoin essentiel d'oxygène et sont donc de croissance aérobie seulement, mais à faibles concentrations donc développe juste dans milieux à faible concentration.
Microaérophiles
61
Dans les tubes contenant un bouillon de culture, les aérobies stricts croîtront en (1) seulement, les anaérobies stricts croîtront au (2) seulement, les facultatifs se (3) dans le tube, les microaérophiles se tiendront (4) la surface et les aérotolérants (5)
1) Surface
2) Fond
3) Répartissent un peu plus au niveau de la surface, mais un peu partout quand même
4) Légèrement sous
5) De façon uniforme partout
62
Vrai ou faux: la majorité des bactéries ont une croissance optimale dans un intervalle de pH étroit et voisin de la neutralité entre 6 et 7
Faux, 6,5 et 7,5
63
Pourquoi est-ce que certains aliments se conservent bien?
Car certains comme les cornichons et les fromages sont très acides et c'est rare que les bactéries se développent dans un milieu avec un pH inférieur à 4
64
Les ... se développe dans un pH inférieur à 5,5
acidophiles
65
Les ... se développe dans un pH entre 5 à 8
neutrophiles
66
Les ... se développe dans un pH entre 8,5
alcalophiles
67
Qu'est-ce qu'un métabolite essentiel?
Petites molécules organiques (a.a., base nucléiques, vitamine, ions, etc.) indispensable au métabolisme d'un organisme qu'il doit s'approprier d'une source externe.
Il est donc nécessaire d'ajouter des bouillons nutritifs à certains milieux de culture pour favoriser la croissance bactérienne
68
Quel est la méthode la plus courante de quantification d'une population bactérienne?
Le dénombrement sur gélose
69
Qu'est-ce que suppose cette méthode?
Que chaque bactérie donne naissance à une colonie
70
Pourquoi est-ce qu'on décompte en terme de CFU et non de bactéries ?
Étant donné que certaines bactéries se tiennent en chaînettes ou en grappes.
71
Comment faire pour pouvoir compter le nombre de CFU sachant que le nombre de bactéries initiale dans l'échantillon donné est souvent énorme?
On procède à une dilution en série de tube avant de les déposer sur Pétri.
On obtient environ 50 colonies par pétri.
Un calcul simple permettra d'exprimer le compte en CFU/mL d'échantillon initial ou estimer le nombre de microbes par gramme de tissu dans une biopsie
Voir image diapo 29
72
Quelles sont les différents phases de la courbe de croissance d'un bouillon de culture?
1) Latence (essentielle)
2) Accélération
3) Exponentielle (essentielle)
4) Ralentissement
5) Stationnaire (essentielle)
6) Décroissance (essentielle)
73
Qu'est-ce que la phase de latence?
Période comprise entre l'ensemencement du bouillon et le moment où les bactéries commencent à se multiplier.
74
La phase de latence correspond à quoi?
Au délais nécessaire pour la synthèse d'enzymes qui doivent être élaborées avant que les bactéries puissent métaboliser les nutriments contenus dans le milieu de culture
75
Qu'est-ce que la phase exponentielle?
Période pendant laquelle la population bactérienne croît à une vitesse optimale.
Production d'énergie, de protéines ou de produits de fermentation est maximale alors que le temps de division cellulaire est minimale
76
Quelle est la phase où les bactéries pathogènes sécrètent des déchets métaboliques toxiques pour les humains appelés exotoxines?
Phase exponentielle
77
Vrai ou faux: la phase exponentielle est de longue durée?
Faux, courte
78
Pourquoi est-ce qu'il y a une phase de ralentissement?
Étant donné que les éléments nutritifs commencent à manquer et la production de déchets dans le milieu commence à affecter les microbes eux-mêmes.
79
Quand est-ce qu'on atteint la phase stationnaire ?
Lorsque la densité maximale de la culture est atteinte. Il y a équilibre entre le nombre de bactéries formées et le nombre de bactéries qui meurent.
80
Est-ce que le milieu est toxique en phase stationnaire?
Il devient de plus en plus toxique c'est ce qui explique que les bactéries qui peuvent sporuler le font.
81
Qu'est-ce qui est présent en phase de décroissance ?
Des endotoxines constitutives des parois cellules des bactéries à Gram négatifs sont libérés lorsque celles-ci se brisent. Cela mène à la mort cellulaire de la culture
82
Qu'est-ce que le métabolisme?
L'ensemble des transformations des composés biochimiques de la cellule
83
Qu'est-ce que le catabolisme?
L'ensemble des réactions de dégradation qui assurent la production d'énergie et rendent accessible les matériaux de base, à partir desquels la cellule élabore ses propres composés structuraux et fonctionnels.
84
Quel est le nom de la biosynthèse à partir de matériaux de base qui requiert de l'énergie?
L'anabolisme
On catabolise pour ensuite anaboliser
85
Vrai ou faux, les réactions métaboliques fondamentales sont assez similaires entre procaryotes et eucaryotes, mais plus diversifiées chez les eucaryotes en ce qui a trait aux substrats utilisables ?
Faux, chez les procaryote
86
Vrai ou faux: les bactéries font leurs mécanismes respiratoires dans les mitochondries comme les eucaryotes?
Faux, le long des membranes cytoplasmiques, car ils n'ont pas de mitochondries
87
REVOIR diapo 36 - 40 pour révision du processus de respiration cellulaire (Connaître le nom des différentes protéines qui sont des transporteurs)
LACHE PAS
88
Quelles sont les 3 classes de transporteurs moléculaires dont font appels les chaînes de transports des électrons?
- Les flavines
- Les cythochromes
- Les ubiquinones (Coenzyme Q)
89
On définit l'oxydation et la réduction comme des ... d'électrons
échanges
90
Quelles sont les donneurs d'électrons les plus importants ?
Atomes d'hydrogènes des composés organiques
91
Comment appelle-on la réaction où il y a un transfert d'un proton en même temps qu'un électron?
Une déshydrogénation.
C'est souvent ce qu'il se passe
92
Quel est l'accepteur final d'électrons en mode de respiration aérobie?
L'oxygène
93
Quel type de molécules est l'accepteur final d'électron dans une respiration anaérobie?
Certains microbes utilisent des composés inorganiques simples comme accepteur finaux de H+ et d'électrons.
94
Les bactéries qui font de la respiration anaérobies ont un rôle essentiel pour?
le cycle de l'azote et du souffre qui se déroulent dans la nature
95
Vrai ou faux: une partie du cycle de Krebs fonctionne en anaérobiose?
Vrai, c'est ce qui explique que l'ATP n'y est jamais aussi élevée qu'au cours de la respiration aérobie.
96
Lesquelles entre les anaérobies et les aérobies croissent le plus vite et pourquoi
Aérobie, car ils produisent plus d'ATP
97
Vrai ou faux: certains microbes utilisent un mode respiratoire ou un mode fermentaire, tandis que d'autres ne font que de la fermentation ?
Vrai
98
Vrai ou faux, le pyruvate en mode fermentaire se termine en CO2
Faux, le catabolisme du pyruvate s'arrête précocement.
99
Qu'est-ce qui se passe avec le pyruvate en mode fermentation?
Il est dérivé en produits intermédiaires excrétés, appelés produits de fermentation.
100
Quel est l'accepteur final de l'électron dans la fermentation?
Une molécule organique synthétisé dans la cellule. Ça peut être le pyruvate
101
Vrai ou faux: on peut trouver différents produits finaux de fermentation dependemmant de la nature du microorganisme, du substrat et des enzymes dont il dispose et de leur activité
Vrai
102
Vrai ou faux: le produit final peut être mise à profit afin de faire des tests d'identification sur les spécimens cliniques?
Vrai
103
Pourquoi est-ce qu'il faut mettre beaucoup de sucre initial afin de produire une certaine quantité d'alcool par fermentation?
Étant donné que la production d'ATP est faible
104
Quelles sont les deux premiers produits de fermentations qui ont étés utilisés au niveau industriel?
Acide lactique (à partir de produit laitier)
Éthanol (à partir de brassage)
105
Qu'est-ce que la biotechnologie?
Des méthodes de fabrications d'organismes modifiés à l'aide de la technologie de l'ADN recombinant, ainsi que les produits obtenus par ces méthodes
106
Vrai ou faux: La fermentation peut être utile pour faire la formation d'insuline ou d'hormone de croissance, en ayant recours à des microorganismes génétiquement modifiés ou même des anticorps monoclonaux?
Vrai
107
QSJ: fermentation dont le produit terminal du catabolisme du pyruvate est l'alcool éthylique.
Fermentation alcoolique
108
À partir de quoi est fait l'alcool?
Levures équivalentes à la levure de boulanger
109
QSJ: Le pyruvate est oxydé en acide lactique. Formation de yaourt et de fromage
Fermentation homolactique
110
QSJ: Formation de produits parallèles à l'acide lactique. Formation de kéfir, mais aussi utile à l'altérations du vin, de la bière et des jus de fruits.
Fermentation hétérolactique
111
QSJ: Produit terminal est l'acide propionique. À la base de certains fromages à pâte cuites.
Fermentation propionique
112
QSJ: Fermentation réalisée par des entérobactéries qui conduit à de multiples acides (lactique, éthanol, acétique, etc.)
Fermentation acides mixtes
113
QSJ: Fermentation qui produit de l'acétone et du butanol
Fermentation acétonobutylique
114
QSJ: Fermentation qui produit de l'acide butyrique. Fermentation type des boîtes de conserves
Fermentation butyrique
115
Qu'est-ce qu'on appelle bioréacteur?
Les cuves utilisées pour la fermentation industrielle
116
Quelles sont les facteurs dont on tient compte dans la conception de ces cuves?
- L'aération
- Le pH
- La régulation de la température
117
Qu'est-ce que la production par lots?
Lorsqu'on recueille le produit après la fermentation
118
Qu'est-ce que la production à écoulement continus?
Enzymes immobilisés ou les cellules en croissance dans un milieu perpétuellement alimenté en substrat et on retire en continu le milieu épuisé de même que le produit recherché
119
Nommer un exemple de métabolite primaire et de métabolite secondaire
- Éthanol
- Pénicilline
120
Quelle est la différence entre un métabolite primaire et secondaire
Primaire : se forme au moment où les cellules se divisent (phase exponentielle)
Secondaire: Se forme durant la phase stationnaire
121
Quand est-ce qu'on a fait croître pour la première fois en culture pure les microbes pour la production alimentaire?
19ème siècle
122
La fabrication des vins se fait à partir de quoi?
De raisins contenant des glucides que les levures sont capables de fermenter directement en alcool
123
La fabrication de bière est fait à partir de quoi?
À partir de la fermentation d'amidon de grains céréaliers par des levures. Il faut cependant transformer l'amidon en maltose et glucose pour pouvoir faire la fermentation
124
Comment est formé le vinaigre?
Lorsque certaines types de bactéries convertissent l'éthanol en acide acétique produisant du vin aigre.
125
Vrai ou faux: plus la durée d'incubation est longue pour des bactéries lactiques dans un fromage plus le fromage est acide et piquant?
Vrai
126
Le beurre doit sa saveur à la présence de ... qui résultent de la combinaison de deux molécules d'acide acétiques (le produit final de l'acide lactique)
diacétyles
127
Comment est formé le yogourt?
À partir de lait à basse teneur en matière grasse dont le quart de l'eau est éliminée par évaporation. Le lait épaissis est ensuite ensemencée avec une culture mixte de bactéries
128
Pourquoi est-ce qu'on pétrit la pâte à pain à plusieurs reprises?
En jouant avec la pâte, on favorisent la production de ce gaz produit en condition aérobie ce qui rajoute des bulles dans la pâte levée
129
Vrai ou faux: les acides aminés constituent un important produit industriel issu de microorganisme?
Vrai
130
L'acide citrique est un constituant des ...
agrumes
131
Vrai ou faux: l'acide citrique est retrouvé uniquement dans les agrumes, car ce n'est pas le produit d'aucun microorganisme après la fermentation
Faux, on fabrique aujourd'hui beaucoup d'acide citrique à partir du métabolisme de moisissures.
132
Les amylases sont des enzymes qui sont utilisés au niveau industriel dans quels contextes?
- Fabrication de sirops à partir d'amidon de maïs
- Collage du papier et à la production de glucose à partir d'amidon
133
Quelle enzymes est utilisé pour transformer le glucose en fructose?
La glucose isomérases (utile pour faire des édulcorants)
134
Quel est le but d'ajouter des protéases à la pâte de pain?
Réguler la quantité de gluten(protéine) dans le blé ce qui rend le pain plus moelleux
135
Quelle substance produit le xanthomonas à partir du glucose?
le xanthane puis des amas gommeux
136
Dans quelle circonstances ont utilises le xanthane?
Produits laitiers, vinaigrettes, crème pour la peau et shampoings
137
Vrai ou faux: Rares étaient les antibiotiques fait à base de produits du métabolisme microbien
Faux, à l'époque tous les antibiotiques l'étaient (dont pénicilline)
138
Quelles sont les 3 produits pharmaceutiques fait par la microbiologie industrielle?
- Antibiotique
- Vaccin:
- Hormones : stéroïdes synthétisés à partir de stérols par microorganisme
139
Qu'est-ce que la gélose de Chapman?
Gélose sélective, car salé et différentielle, car peut vérifier la capacité de fermentation du mannitol en produit acides (indicateur de pH intégré)
