gastcc microscopie

Question 1

wat doen light-sheet microscopen?

Answer 1

laten toe om in 3d naar weefsels te kijken

Question 2

waarom is light-sheet microscopie een interdisciplinair veld?

Answer 2

biologie
chemie
optica
computerwetenschappen

Question 3

waarom is biologie belangrijk?

Answer 3

in vivo experiments
CRISPR/Cas9 : laat gericht DNA-manipulatie toe
ziektemodellering

Question 4

waarom is chemie belangrijk?

Answer 4

om weefsels te bekijken door een microscoop, moeten deze optisch transparant gemaakt worden voor goede beelden. (immunostaining, tissue clearing)

Question 5

waarom is optica belangrijk?

Answer 5

light-sheet microscopie, mesoSPIM: algemene kennis van optische elementen nodig.

Question 6

waarom zijn computerwetenschappen belangrijk?

Answer 6

informatie die uit de microscoop gehaald wordt = 100den GB data (afbeelding -> data, image processing en AI)

Question 7

wat is het principe van light-sheet microscopie?

Answer 7

• Staal wordt optisch transparant gemaakt (zie verder)
• Bekeken via microscoop
• Met de computer worden specifieke 3D beelden gemaakt: elk punt is een neuron, slechts 0,5% vd neurons zijn gelabeld

Question 8

hoe is de microscoop opgebouwd?

Answer 8

optisch element -> light sheet
light sheet -> lichtblad
lichtblad is niet cst: middenin is het het dunste

Question 9

wat is een light sheet?

Answer 9

laser die via een spiegel heel snel op een neer beweegt

Question 10

wat was het probleem bij oudere light-sheet microscopen?

Answer 10

goede resolutie in het midden (dunste deel lichtblad), slechtere naar buiten toe (dikkere delen: licht van verschillende kanten)

dit kwam omdat er een globale shutter werd gebruikt: het beeld werd in 1 keer gevormd

Question 11

wat was de oplossing vh probleem van oudere light-sheet microscopen?

Answer 11

rolling shutter gebruiken : lens beweegt in sync met het dunste deel vh lichtblad.

Question 12

wat is tissueclearing?

Answer 12

weefsel is ingebakend in de cuvet in een clearingmedium

noodzakelijk: biologisch weefsel laat licht reflecteren: zonder clearing zie je enkel de oppervlakte

Question 13

hoe clear je een weefsel?

Answer 13

je steekt het in een clearingmedium met dezelfde refractieve index
- geen breking meer
- maakt het weefsel transparant: geen weerkaatsing vh licht meer.

Question 14

wat is schmidt microscopie?

Answer 14

= toestellen die toelaten om in nog veel groter optisch detail biologische weefsels weer te geven

Question 15

hoe zien jakobsschelpen?

Answer 15

• Ogen: inkomend licht gaat voorbij de retina, en wordt weerkaatst door hun biologische spiegel achterin de ogen.
• Na de weerkaatsing komt het licht wel correct in de retina te recht.

Question 16

wat was het probleem van de grote refractor telescoop in Potsdam?

Answer 16

kwaliteit: er was geen concreet brandpunt: de stralen vielen niet mooi in 1 punt samen: sferische aberraties.

oplossing: een specifiek gescherpte correctieplaat invoegen om een mooi brandpunt te creëren (Schmidt)

Question 17

principe schmidt microscopen

Answer 17

• Licht komt binnen
• Gecorrigeerd door correctieplaat
• Valt op spiegel
• Reflecteert op staal

Question 18

hoe kan het verantwoordelijke gen voor een aangeboren afwijking bepaald worden?

Answer 18

door modellering via kikkers
- embryonale ontwikkeling extern bekijken
- snel
- als je een 2 cel embryo hebt en je injecteert 1 helft met een gen -> afwijking blijft aan die kant

Question 19

waarom is AI nuttig in dit onderzoek?

Answer 19

Bij zeer grote beelden is het voordelig om AI te gebruiken om de beelden te analyseren om de problemen te vinden