E. coli Flashcards
Nommez des caractéristiques de E. coli.
- Bacille Gram négatif
- Famille des Entérobactéries (réduisent les nitrates en nitrites, fermentent le glucose)
- Environnement (présent dans le sol et dans l’eau, plantes, flore digestives des humains et des animaux surtout intestin)
Qu’est ce que le E. coli peut causer?
- infections intestinales (pays en voie de développement)
- infections extra-intestinales (pays industrialisés)
Cas clinique: séjour à Cancun x 1 semaine, retour hier Raison de consultation: -Selles liquides depuis 4 jours -3-4 fois/jour -Crampes abdominales -Pas de nausées ni vomissements -Pas de sang dans les selles -Antécédents médicaux: s.p. -Revue des systèmes négative -Plusieurs compagnons malades -T° 37°C, pouls 80/min., TA 120/80 -Non déshydraté -Examen physique normal -Péristaltisme augmenté
Quel est le diagnostic?
diarrhée du voyageur
il faut faire culture de selles, diète, recommandations au départ
suivi: culture de selles: absence de pathogènes entériques, diarrhée disparue
Nommez des bactéries dans la famille enterobacteriaecae.
Escherichia coli, Klebsiella, Proteus, Enterobacter, Salmonella, Serratia, Citrobacter,
Morganella, Providencia, Yersinia, Hafnia, Shigella, Edwardsiella
Quelle est la morphologie de E. coli?
- Bacille à Gram négatif
- taille moyenne
- Bouts arrondis
- Mobile
- Non sporulé
Comment se fait la culture de E. coli?
- Facile 32°C à 40°C
- Milieux peu complexes
- Milieux sélectifs et différentiel: Gélose MacConkey (sels biliaires et le crystal violet inhibe les Gram positif, lactose)
- Aérobie, anaérobie facultatif
Comment est la paroi de E. coli?
- Structure rigide
- LPS (endotoxine) feuillet externe -Paroi de peptidoglycans
- Membrane cellulaire
Quelle est la structure du LPS?
- Lipide A
- Core
- Chaînes polysaccharidiques soit l’antigène”O”
Qu’est ce que le lipide A du LPS?
- Fraction riche en glucosamine
- Fraction toxique qui est responsable du choc endotoxinique
Qu’est ce que le core du LPS?
- Séquence répétée de polysaccharides
- A peu près semblable chez tous les Gram négatif
Qu’est ce que les chaines polysaccharidiques du LPS?
- Représentent les Ag O de surface
- Utilisées pour l’identification des souches
Quels sont les effets biologiques de l’endotoxine?
- Toxicité pour les mammifères
- Par action directe (ex: hémolysine)
- Par action indirecte: reconnu par le système immunitaire (faible quantité active la fièvre et large quantité cause hypotension et marginalisation des polymorphonucléaires et des plaquettes –> coagulation vasculaire disséminée)
Qu’est ce que la toxine entérotoxinogène?
- Diarrhée acquise sous les tropiques
- Contrôle plasmidique de la toxine
- Plasmide transférable
- Toxines St et LT: Heat-Labile toxin ( toxine sensible à la chaleur), Heat-Stable Toxin ( stable à la chaleur)
Qu’est ce que la toxine ST?
- Survit à 100°C – 30 minutes
- Exerce son action seulement sur les entérocytes
- Entraîne une sécrétion de liquide
- Activité anti-absorbante
Qu’est ce que la toxine LT?
- Détruite à 65°C ,30 minutes
- Semblable à la toxine du cholera (protection croisée avec le vaccin contre le choléra)
- Sécrétion active de Cl (eau et Na suivent passivement)
- Crée une perte importante de liquides et d’électrolytes
Qu’est ce que la vérotoxine (shiga-toxine)?
- Interfère avec la synthèse protéique
- lyse cellules endothéliales rénales et intestinales chez l’humain (principale cause d’IRA chez les jeunes enfants, cause ischémie par thrombose des petits vaisseaux)
- Réservoir (intestion des jeunes vaches et autres larges herbivores)
Quel est le nombre significatif de bactéries dans l’urine pour infection urinaire?
> 10^8 bactéries/L
par contre ce peut être asymptomatique
urine est normalement stérile
Quels sont les autres pathogènes de l’infection urinaire?
E. coli
K. pneumoniae
Proteus ou Entérococcus
Qu’est ce que la pathogenèse des infections urinaires?
voie ascendante ou rarement par voie hématogène
Quel est le traitement pour les infections urinaires?
- antibiotiques
- rarement prophylactiques
Comment est-ce qu’on peut arriver à une septicémie?
- Origines diverses: peau, système génito-urinaire, système respiratoire, système digestif ( voies biliaires, intestin et cie)
- Acquise dans la communauté
- Maladie nosocomiale (particulièrement des souches résistantes aux antibiotiques)
Quelle est la pathogenèse d’une septicémie?
- Colonisation et infection de corps étrangers (ex: sonde urinaire et infection urinaire)
- Bris de peau et des muqueuses
- Obstruction
- Abcès
Quels sont les signes et symptômes de la septicémie?
- Fièvre et frissons
- Hypothermie
- Hyperventilation
- Altération de l’état de conscience
Quel est le traitement pour la septicémie?
- Antibiotiques
- Enlever les corps étrangers
- Drainer les abcès et prise en charge des causes chirurgicales
- Traitement du choc ( maintenir la T.A.)
Qu’est ce que la méningite à E. coli?
- Méningite néonatale: 2e après le streptocoque du Groupe B ( S.agalactiae )
- Méningite lors de trauma crânien
- Méningite secondaire à septicémie
Qu’est ce que le E. coli entérohémorragique?
- Touche surtout les enfants et les vieillards
- Viande hachée insuffisamment cuite
- Lait crû
- Eau contaminée
Quelles sont les infections entériques causées par E. coli?
- ETEC (entérotoxinogène) = production de toxine non inflammatoire
- EPEC (entéropathogène)
- EIEC (entéroinvasive) = invasion et destruction de la muqueuse (shigella, salmonella typhi)
- EHEC (entérohémorragique)
- EAEC (entéroadhérent)
Comment est-ce que le E. coli peut causer la diarrhée du voyageur?
par ses 2 toxines: LT et ST
sécrétion d’eau dans la lumière du petit intestin
E. coli est responsable de > 50% des cas
Quel est le traitement du E. coli entérohémorragique?
- Réhydratation
- Des complications (rénales et cérébrales)
- Pas d’antibiotiques
Comment se fait le diagnostic de la diarrhée du voyageur?
- clinique
- pas de test de routine au labo
Quel est le traitement pour la diarrhée du voyageur?
- réhydratation orale
- lomotil - imodium
- subsalicylate de Bismuth
- pas d’antibiotiques
Qu’est ce que le E. coli entéroinvasif?
- E.coli utilisant les mêmes mécanismes et facteurs de virulence que la Shigelle
- Survient habituellement en épidémie
- Inoculum important (108 bactéries)
- Capacité d’envahir la muqueuse du gros intestin
Quels sont les signes et symptômes du E. coli entéroinvasif?
- Fièvre et crampes abdominales
- Ténesme
- Selles sanguignolentes
- Durée 5 à 7 jours
Comment se fait le diagnostic du E. coli entéroinvasif?
clinique
pas de tests de routine
sérogroupage
Quel est le traitement pour le E. coli entéroinvasif?
traitement
antibiotiques?
Comment est-ce quel le E. coli entérohémorragique est dangereux?
Toxine qui inhibe la synthèse protéique: portée par un bactériophage, production de toxines augmentée lors de stress ( ABX) et induit la lyse de la cellule d’E.coli (libération de toxine augmentée)
-Mort des cellules de la muqueuses et des cellules endothéliales: SHU (syndrome hémolytique urémique) qui est la cause la plus fréquente d’insuffisance rénale en pédiatrie, PTT (purpura thrombocytopénique thrombotique) qui cause ischémie par thrombose des petits vaisseaux
Quelles sont les couches de la paroi cellulaire?
couche externe: mannanes et protéines pariétales
couche intermédiaire: glucane
couche interne: chitine
présence de mélanine chez certains champignons filamenteux (aspergillus, alternaria)
Qu’est ce que la chitine?
2% et 6% de la masse de la paroi des levures et champignons filamenteux, microfibres insolubles du poly beta (1 –> 4)N- acetylglucosamine polymère associés aux glucanes
Qu’est ce que les glucanes?
58-60% de la masse de la paroi
beta (1 –> 3)D- Glucane et beta (1 –> 6) D-Glucane
Qu’est ce que les mannanes?
hémi-cellulose
composants majeurs des protéines pariétales (38-40% de la masse de la paroi)
antigène majeur de C. albicans
Qu’est ce que les protéines pariétales?
protéines GPI (glycosyl-phosphatidylinositol-protéine) associées à la chitine et au beta (1 –> 6) glucan
fonctions: adhésines (attachement à l’hôte), biogen;se de la paroi
Quelles sont les mycoses les plus importantes?
-candidiasis
-multiples mycoses
-zygomycosis
-aspergillosis
-cryptococcosis
-histoplasmosis
-blastomycosis
-coccidioidomycosis
etc
Qu’est ce que cause aspergillus sp?
aspergillomes pulmonaires et cérébrale
aspergilloses pulmonaires chroniques
infections superficielles: sinus, otomycose (oreille), onychomycosis (ongles)
allergies
Qu’est ce que cause le cryptococcus?
lésions cérébrales et pulmonaires, et méningites
sujets seins et immunosuprimés
Qu’est ce cause les blastomyces?
infection fatale
infection pulmonaires, lésions dermiques et ostéomyélite
Qu’est ce que cause les paracoccidioides sp?
infections pulmonaires
enflement des ganglions lymphatiques
Qu’est ce que la candidose?
infection fongiques causée par candida albicans
- 4eme maladie nosocomiale la plus commune
- cause fréquente de morbidité et de mortalité chez les patients immunosuprimés
- hospitalisation couteuse
À quoi est associée la virulence de c. albicans?
associée à son dimorphisme:
- hyphes dédiés à l’invasion et la colonisation des organes
- levures associées à la dissémination de C. albicans
Qu’est ce que la candidose?
infection fongiques causée par candida albicans
- 4eme maladie nosocomiale la plus commune
- cause fréquente de morbidité et de mortalité chez les patients immunosuprimés
- hospitalisation couteuse
Quelles sont les techniques de diagnostic des mycoses?
- caractéristiques morphologiques: apparence en milieu de culture
- examen microscopique: patho-histologie
- diagnostic moléculaire: ADN, PCR, séquençage
- diagnostic sérologique: anticorps
Quels sont les types de thérapies antifongiques?
- Chimique : Trois grandes classes de molécules sont utilisées incluant les azoles,
les échinochandines et les polyènes. - Immuno-modulation: Vaccination (essais cliniques en cours pour un vaccin contre les
vaginoses fongiques causées par Candida albicans et C. glabrata. - Immunothérapie: stimulation des défenses immunitaires contre les pathogènes fongiques
Qu’est ce que les azoles?
- Les antifongiques les plus utilisés.
- Fongistatiques
- Utilisés contres des infections systémiques et superficielles
- Différentes sous-classes:
- 1,2,3-Triazoles (Fluconazoles, itraconazole)
- Imidazole (ketoconazole, Clotrimazole)
Quel est la cible cellulaire des azoles?
-Cible cellulaire: membrane plasmique
- Cible moléculaire: Les azoles inhibent la
biosynthèse de l’Ergosterol.
Quel est la cible cellulaire des azoles?
- Cible cellulaire: membrane plasmique
- Cible moléculaire: Les azoles inhibent la biosynthèse de l’Ergosterol.
Qu’est ce que les échinocandines?
- Antifongiques administrés par intraveineuse.
- Fongicides.
- Utilisés contres des infections systémiques graves.
- Différent molécules:
- Caspofungin (Cancidas-Merck): Contre C. albicans, Aspergillus
- Micafungin (Mycamine, Astellas Pharma): Contre C. albicans
- Anidulafungin (Eraxis, Pfizer): Contre C. albicans
Quelle est la cible cellulaire des échinocandines?
-Cible cellulaire: Paroi cellulaire
-Cible moléculaire: Inhibent la biosynthèse des
glucanes.
Qu’est ce que les polyènes (amphotéricine B)?
- Antifongiques administrés par intraveineuse ou par voie orale.
- Fongistatiques/Fongicides (concentration-dépendante)
- Toxiques, mais la formulation sous forme de liposome (AmBisome) réduit sa toxicité.
- Spectre antifongique large:
- Aspergillus fumigatus
- Candida albicsans, C. glabrata, C. krusei, C. lusitaniae
- Cryptococcus neoformans
- Fusarium oxysporum
Quelle est la cible cellulaire des polyènes?
-Cible cellulaire: membrane plasmique
- Cible moléculaire: Les polyènes inhibent la biosynthèse
de l’Ergosterol et forment des pores qui fragilisent la membrane
Quelles sont les limites des thérapies antifongiques?
-Toxicité pour toutes les molécules connues
- Pourquoi? Ressemblance des cibles thérapeutiques due à la nature eucaryotique
des cellules humaines et fongiques
- Les échinochandines sont insolubles.
- Nature fongistatique de certaines molécules (azoles): Problème de récurrence et résistance.
- Perte d’efficacité dans certaines niches acides (vagin et abcès)
- RESISTANCE
Quelle est la résistance naturelle aux antifongiques?
- Certains champignons ne sont pas sensibles aux antifongiques.
- Exemples: Candida krusei et C. auris (à tout), C. glabrata (azoles)
- Biofilm
Mode de vie sessile (attaché) liée à la contamination des dispositifs médicaux (Cathéters, Prothèses, Pacemakers)
Levures, hyphes et pseudohyphes emballés dans une matrice polysaccharidique qui donne au biofilm une structure en 3D.
Résistance à toutes les molécules : ~ 1000x comparée aux cellules planktoniques
Qu’est ce que la résistance clinique?
-Altération de la cible (Modifications génétiques)
-Altération de transport: Hyper-activation des transporteurs d’efflux ABC- et MFS ABC (ATP Binding Cassette) exigent de l’ATP pour l’efflux de drogues.
MFS (Major Facilitator Superfamily) efflux passive de drogues.
Aneuploïdies: Trisomie de certains chromosomes.
Duplication de fragments intra-chromosomiques contenant des transporteurs d’efflux de drogues (Cas de C. albicans)
