Diagnostic de laboratoire des infections Flashcards
quels sont les 3 phases du cheminement diagnostique?
- phase pré analytique
- phase analytique
- phase post analytique
en quoi consiste la phase pré-analytique?
- Patient consulte avec des symptômes/signes d’une maladie
infectieuse - Diagnostic clinique tentatif
- Prescription de prélèvements de culture
- Prélèvements identifiés au nom du patient puis acheminés au
laboratoire avec la demande d’analyses - Réception des prélèvements au laboratoire
en quoi consiste la phase analytique?
- Examen direct sur le prélèvement
- Rapport partiel émis au médecin : interprétation
- Mise en culture du prélèvement
- Incubation des milieux ensemencés
- Lecture des milieux (le lendemain)
- Identification bactérienne
- Rapport partiel: interprétation
- Finalisation de l’identification
en quoi consiste la phase post analytique?
- Émission du rapport final
- Interprétation finale du méde
quelles sont les différentes raisons d’effectuer un examen direct?
- Quantifier les globules blancs présents dans le prélèvement: ceci nous
informe sur la réponse inflammatoire et la « purulence » de l’échantillon. - Dans certains cas, exprimer en valeur relative la quantité de polynucléaires
présents dans le prélèvement - Observation de micro-organismes (bactéries, m-o, levures, mycoses, parasites, etc)
- Évaluation de la qualité du prélèvement pour décider si le résultat final sera
fiable
quels examens directs sans coloration peut on faire?
- sérum physiologique
- Hydroxyde de potassium
- iode
- fond noir
quel est l’utilité du sérum physiologique?
- permet d’observer la mobilité de certains micro-organismes
- permet d’évaluer rapidement les micro-organismes avec des formes
particulières, ex.: levures
quel est l’utilité de l’hydroxyde de potassium?
- KOH 10 % digère la kératine
- utile pour diagnostiquer des éléments mycéliens (champignons) à
partir de prélèvement
d’ongles
peau
cheveux
quelle est l’utilité de l’iode?
- colore les noyaux et organelles cytoplasmiques
- utile pour colorer rapidement les selles d’un patient et diagnostiquer
la présence de protozoaires (ex.: amibes)
quelle est l’utilité du fond noir?
- utile pour mettre en évidence des micro-organismes mal visualisés
en microscopie optique standard et qui se colore difficilement
(ex. : spirochète)
quel est l egrand principe de la coloration de gram?
La teneur en lipide de la paroi cellulaire des bactéries est
variable.
Les parois pauvres en lipides retiennent plus le colorant cristal
violet (Gram positif).
Quand la paroi est riche en lipides, le cristal violet ne s’imprègne
pas de façon permanente. Le décolorant le déloge (Gram
négatif).
quel est l’utilité du test de gram?
- Permet de reconnaître rapidement le ou les bactéries
possiblement pathogènes présentes dans le prélèvement et
d’en informer rapidement le clinicien. - Permet d’évaluer la présence ou l’absence de flore normale
quand le prélèvement provient d’un site non stérile. - Permet d’évaluer la réponse inflammatoire car les globules
blancs sont colorés dans le processus. - Permet de quantifier de façon relative les polynucléaires
versus les cellules mononucléées. Ceci aide dans certains
cas à distinguer les infections bactériennes des infections
virales.
quel est le principe de la coloration de ziehl neelsen?
La paroi de certains micro-organismes est épaisse et cireuse et
ne se colore pas facilement. Une fois les parois colorées par
contre elles résistent à la décoloration par un solvant tel l’acidealcool.
Ces bactéries sont appelées par conséquent « bacilles
acido-alcoolo résistants » ou B.A.A.R.
comment interprète t on la coloration de ziehl neelsen?
rose: La paroi épaisse et cireuse a capté le premier colorant de la
coloration de Ziehl-Neelsen (« carbol fuchsin ») et a résisté au
décolorant. La contre-coloration au bleu de méthylène s’est
avérée inefficace. La couleur finale est rose. Il s’agit d’un bacille
acido-alcoolo résistant
bleue: La paroi plus mince de la bactérie, moins imperméable que dans
le cas précédent, a pris le « carbol fuchsin » (rose) mais n’a pas
résisté au décolorant. La contre-coloration avec le bleu de
méthylène a été possible. La couleur finale est bleue. Il ne s’agit
pas d’un bacille acido-alcoolo résistant.
quel est l’utilité de ziehl neelsen?
- Permet l’identification présomptive des mycobactéries sans
pouvoir les identifier à l’espèce. - D’autres germes sont des B.A.A.R., ex.: Nocardia
quels caractéristqiues macroscopqiues regarde t on en culture?
- forme de la colonie
- couleur de la colonie
- grosseur de la colonie
- présence ou non d’hémolyse autour de la colonie
un staphylocoque donne quel type de colonie?
grosse colonie convexe, jaune,
hémolyse Bêta (complète)
un streptocoque donne quel type de colonie?
petite colonie convexe,
translucide, hémolyse Bêta
large
un pneumocoque donne quel type de colonie?
colonie plate, ombiliquée,
translucide, hémolyse alpha
(incomplète - aspect verdâtre)
une entérobactérie donne quel type de colonie?
colonie surélevée, semiopaque,
grise
un pseudomonas donne quel type de colonie?
colonie plate, opaque, verdâtre,
odeur fruitée
quels sont les étapes de l’identification finale des bactéries?
- performance de tests biochimiques à partir des colonies
- rapport partiel
- identification finale de la bactérie
- performance de l’antibiogramme
- émission du rapport final
quel liquide biologqiue sont stérile?
Le sang et tous les liquides biologiques tels :
liquide céphalo-rachidien
liquide synovial
liquide pleural
quels sotn les pathogènes classiques de liquide céphalo-rachidien
liquide synovial
liquide pleural
liquide céphalo-rachidien: ménigiocoque
liquide synovial: staph aureus
liquide pleural: pneumocoque
que faut on faire pour bien interpréter les résultats de culture de sites non stériles?
- connaître la flore normale de ces sites
- porter attention seulement aux bactéries qui ne font pas partie de
cette flore ou qui sont reconnues pour causer des infections
quells sont les méthaodes de dx rapide?
- détection rapide d’antigène (protéine de surface)
- méthode moléculaire: amplifier le génome puis détacter la portion du génome amplifié pour confirmer la présence du pathogène
quelles sont les utilités des méthodes rapides?
Ces méthodes sont particulièrement utiles quand le germe à détecter se
cultive difficilement ou qui se trouve en faible quantité dans un prélèvement
donné, ce qui rend sa détection difficile.
quel est le principe de la sérologie?
Le principe de la sérologie est de mettre en évidence des preuves indirectes de la
présence d’un agent infectieux.
Au lieu de détecter le germe directement, il s’agit ici de détecter la présence
d’anticorps spécifiques produits par le patient colonisé ou infecté par un germe.
Ces anticorps produits par le système immunitaire sont présents dans le sérum
de la personne atteinte
quelle est l’utilité de la sérologie?
La recherche d’anticorps est particulièrement utile pour faire le diagnostic des
infections virales, les virus étant en général plus longs et difficiles à mettre en
évidence par culture.
quels sont les 2 types d’anticorps utiles en microbiologie dx?
- IgM: phase aigue, infection actuelle/récente
- IgG: phase de convalescence, immunité à long terme
comment appelle t on le passage de IgG négatif à positif?
séroconversion
