Denaturazione Flashcards
Cos’è la denaturazione?
PERDITA DELLA STRUTTURA TRIDIMENSIONALE della proteina
Cause di denaturazione
Le proteine possono essere denaturate da:
CALORE: Tm (temperatura di melting) alla quale il 50% della proteina è denaturata
VARIAZIONI DI pH: cambiamenti nello stato di ionizzazione delle catene laterali alterano la stabilità di struttura terziaria e quaternaria
DETERGENTI: interferiscono con le interazioni idrofobiche tra i residui non polari
AGENTI CAOTROPICI: a [ ] di 5-10M aumentano la solubilità di sostanze apolari in acqua rompendo i legami H e le interazioni idrofobiche
AGENTI RIDUCENTI: rompono ponti disolfuro
Folding proteico
RIPIEGAMENTO SPONTANEO delle proteine DOPO essere state DENATURATE nella conformazione nativa (rinaturazione) dopo aver RIMOSSO l’AGENTE DENATURANTE
Esperimento di Anfinsen
In condizioni fisiologiche le proteine si ripiegano nella conformazione nativa termodinamicamente più stabile
Due modelli di ripiegamento
ANDAMENTO GERARCHICO: si formano prima STRUTTURE SECONDARIE (legami H), poi STRUTTURE TERZIARIE (legami ionici e interazioni elettrostatiche) infine strutture secondarie si raggruppano in DOMINI PROTEICI
COLLASSO IDROFOBICO: RESIDUI APOLARI si raggruppano all’interno formando un CORE IDROFOBICO che esclude l’acqua (interazioni idrofobiche).
Scelta del meccanismo dipende dal tipo di struttura secondaria dominante o dal contesto strutturale
Errato ripiegamento
Può provocare patologie se le proteine ripiegate in modo scorretto non vengono degradate
Es. amiloidosi: accumulo proteina αβ amiloide (Alzheimer)
malattie prioniche: α elica sostituita da β foglietto (encefalopatie spongiformi trasmissibili)
