Cours Synchrone 1: Structure des acides aminés Flashcards
Les acides aminés sont les unités de base formant les ______
Protéine
Quels sont les fonctions de base présente sur un aa
Fonction acide (COO-) et une fonction amine (NH3+)
A quoi le carbone chiral d’un acide aminé est il lié
Fonction amine, fonction acide, la chaîne latéral R, un hydrogene
Les aa ne sont pas amphoterique
V ou F
Faux, il le sont. Ils ont des propriétés d’acide et de base
Dans les protéines, on retrouve seulement les acides aminés de la forme ______
L
Par quoi les propriétés des aa sont elles déterminée
La chaîne latéral
Les acides aminés ont une chaîne latérale unique
V ou F
V
Cette chaîne latéral peut faire varier : ______
taille forme charge hydrophobicité réactivité
Quels sont les 4 grande famille de aa
Chaîne latéral hydrophobe (non-polaire)
Chaîne latérale non chargé polaire
Chaîne latérale polaire basique (chargé +)
Chaîne latérale polaire acide (chargé -)
Quels sont les caractéristiques des aa hydrophobe
Non-polaires;
Interaction faible ou nulle avec l’eau;
Dans les protéines, les acides aminés hydrophobes sont fréquemment retrouvés à l’intérieur de la molécule;
Ne participent pas directement aux réactions chimiques.
Quelles sont les caractéristiques des aa polaire non charge
Polaires;
Interaction des groupements fonctionnels avec l’eau;
Dans les protéines, les acides aminés polaires forment des contacts avec le solvant;
Peuvent également se retrouver à l’intérieur, si pont H possible.
Quel est la particularité de l’histidine
C’est un aa polaire non chargé où son groupement imidazole peut gagner ou perdre un proton en fonction du pH.
pH 5.8 —-> N lié avec proton
pH 7.8 —-> N non lié avec proton
Qu’est ce que l’histidine permet a la protéine.
Elle lui permet de moduler son activité en fonction du pH
Quel est la particularité de la glycine
Seul aa avec carbone non chiral
Quels sont les caractéristiques des aa polaire chargé
Chaîne latérale chargée à pH physiologique;
Polaire;
Dans les protéines, les acides aminés polaires forment des contacts avec le solvant;
Peuvent également se retrouver à l’intérieur, si pont H possible.
A quoi correspond le pKa sur la courbe de titrage
Point d’inflexion et point de Demi-titration
Le pH d’une solution d’aa est en fonction _____
Il suit quelle équation mathématique.
de la proportion de la forme acide et de la forme basique.
L’équation de Henderson-Hasselbalch
Qu’est ce que le point isoélectrique
pH où l’acide aminé est électriquement neutre (autant de charges positives que négatives)
Comment appelle t on la forme de l’acide aminé au point isoélectrique
Le zwiterrion
Quel est la particularité au point isoélectrique
Toutes les molécules sont sous la forme zwiterrion
La glycine est un aa hydrophobe
V ou F
Faux , non-hydrophobe et non-chargé. C’est pourquoi on le classe parfois comme un aa polaire
Quelle est la formule du point isoélectrique si 2 fonctions ionisable
pI = (pKa1 +pKa2)/2
Si 2 fonctions ionisable
Quelle est la formule du point isoélectrique si c’est dibasique
pI = (pKa2 + pKa3)/2 (si dibasique)
Les chaîne latérales ne peuvent pas perdre de protons
V ou F
Faux, certaine peuvent
Voir ndc diapo 16-17
Ndc
Comment on appelle une condensation de 2 aa
Dipeptide
Comment appelle t on la liaison entre 2 aa
Liaison peptidique
Ou est ce que ce situe le lien peptide
Le lien peptidique est situé entre le C=O et le N-H
Comment s’appelle les extrémités d’une chaîne peptidique
extrémité N-terminale (NH3+) et C-terminale (COO-)
Qu’est-ce qu’un polypeptide
courte chaîne d’acides aminés (<50)
Qu’est ce qu’une protéine
polypeptides longs ayant une structure tridimensionnelle définie
Comment nomme t on un polypeptide (nomenclature)
En commençant par l’extrémité N terminal jusqu’à l’extrémité C-terminale
Quel est le nombre de possibilités de tetrapeptide possible
20^4
Qu’est ce que la structure primaire
arrangement linéaire des A.A
Qu’est que la structure secondaire
formations locales de structures tridimensionnelles à plusieurs A.A
Qu’est ce que la structure tertiaire
assemblage de structures secondaires en motifs protéiques formant la configuration native de la protéine
Qu’est ce que la structure quaternaire
assemblage de plusieurs polypeptides entre eux pour former une protéine fonctionnelle (sous-unités) (pas toutes les proteine)
