2.2 Structures secondaire Flashcards
Définition de la structure secondaire
Repliement local de plusieurs aa pour former des motifs protéiques
Par quoi sont maintenues les motifs
Par des interactions non covalente entre acide aminés
Quels sont les deux principaux motifs étudiés en ndc
Hélice alpha
Feuillet plissé bêta
Quel type de liaison permet la formation de l’hélice
Liaisons H
Ou se trouve les liaisons H dans les hélices alpha
Entre le groupement amine de l’aa et le groupe carboxyle de l’aa en position n -4
Une hélice alpha de 36 aa fait combien de tour d’hélice
10 tours
Pourquoi les hélices alpha sont plus sur la forme right handed
Parce que la conformation left handed causent plus d’encombrement stérique
Quels sont les valeurs des angles dièdres dans les hélices alpha
Phi =-60
Psi = -50
Par quel technique l’hélice alpha a t elle été validée
Cristallographie
Quels sont les aa sont favorables à la formation d’hélice alpha
Ala
Glu
Leu
Met
Quels sont les aa sont défavorables à la formation d’hélice alpha
Pro
Gly
Pourquoi la proline est défavorable
Parce que après la formation du lien peptide, il n’y a pas de H disponible pour faire une liaison H
Les fortes contrainte de quel aa cause une distorsion de l’hélice
Proline
Ou est ce qu’on retrouve généralement la proline et la glycine
Aux extrémités de l’hélice
De quoi sont composé les feuillets bêta
Chaînes polypeptide de 5 a 8 aa dispose parallèlement ou anti-parallèlement