2.2 Structures secondaire Flashcards
Définition de la structure secondaire
Repliement local de plusieurs aa pour former des motifs protéiques
Par quoi sont maintenues les motifs
Par des interactions non covalente entre acide aminés
Quels sont les deux principaux motifs étudiés en ndc
Hélice alpha
Feuillet plissé bêta
Quel type de liaison permet la formation de l’hélice
Liaisons H
Ou se trouve les liaisons H dans les hélices alpha
Entre le groupement amine de l’aa et le groupe carboxyle de l’aa en position n -4
Une hélice alpha de 36 aa fait combien de tour d’hélice
10 tours
Pourquoi les hélices alpha sont plus sur la forme right handed
Parce que la conformation left handed causent plus d’encombrement stérique
Quels sont les valeurs des angles dièdres dans les hélices alpha
Phi =-60
Psi = -50
Par quel technique l’hélice alpha a t elle été validée
Cristallographie
Quels sont les aa sont favorables à la formation d’hélice alpha
Ala
Glu
Leu
Met
Quels sont les aa sont défavorables à la formation d’hélice alpha
Pro
Gly
Pourquoi la proline est défavorable
Parce que après la formation du lien peptide, il n’y a pas de H disponible pour faire une liaison H
Les fortes contrainte de quel aa cause une distorsion de l’hélice
Proline
Ou est ce qu’on retrouve généralement la proline et la glycine
Aux extrémités de l’hélice
De quoi sont composé les feuillets bêta
Chaînes polypeptide de 5 a 8 aa dispose parallèlement ou anti-parallèlement
A quoi est lié le groupement NH d’un acide aminé d’une chaîne polypeptide d’un feuillet bêta
Au groupement COO- de l’autre chaîne parallèle
Comment sont projeter les chaîne d’un feuillet bêta
Alternativement en haut et en bas du plan d’un feuillet
Quel type de feuillet plissé bêta est le plus stable
Les feuillets dispose anti-parallele
En général, les feuillets bêta sont forme de combien de segments polypeptide
2 a 15 segment polypeptidique d’en moyenne 6 AA
De quel type de structures secondaire sont composé les fibrine de soie
Feuillet plissé bêta empackter un sur l’autre
Les structures secondaire régulières correspondent à quel pourcentage d’une protéine globulaire
50%
Les autres segments ont quel conformation
Solénoïde ou en boucle
Les boucles qui relient les structures secondaires sont de longueur et de forme fixe
Faux, forme variable
Par quoi sont prédéterminés les structure des boucles et dès solénoïde
Par la séquence primaire
