2.1 Structure primaire des protéines Flashcards

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1
Q

Qu’est ce que la structure primaire

A

Arrangement linéaire des acides s aminés

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Q

Comment se forme un lien dipeptide

A

Par condensation de 2 aa

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Q

Ou est situe le lien peptide

A

Entre le C=O d’un premier aa et le N-H d’un second aa

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4
Q

Les chaîne latérale ne sont (habituellement) pas impliqués dans le lien peptidique

V ou F

A

Vrai

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Q

Comment se nomme la molécule (ex des ndc) ou la chaîne latérale fait le lien peptide

A

Glutathion

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6
Q

Quels aa du glutathion forme ce lien peptidique atypique et pourquoi est il atypique

A

Acide glutamique et cysteine

C’est le carboxyle de la chaîne latérale de l’acide glutamique qui fait le lien peptidique avec le groupement amine de la cysteine

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7
Q

Pourquoi les électrons autour du lien peptidique veulent se déplacer

A

Pour se partager uniformément entre les atomes

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8
Q

Le lien peptidique a un caractère partiel de quel type de liaison

A

Liaison double

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9
Q

Quel type d’isomérie le lien peptidique peut il adopter

A

Cis ou trans

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10
Q

Le lien peptide est tridimensionnel

V ou F

A

Faux, il est planaire

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11
Q

Qu’est ce que la configuration trans dans un lien peptidique

A

Cα des résidus peptidiques occupent les coins opposés au groupe peptidique

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12
Q

Qu’est ce que la configuration cis dans un lien peptidique

A

Cα des résidus peptidiques sur le même côté du groupe peptidique, donc plus proches

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13
Q

Quel est la forme favorise (cis ou trans) et la plus abondante dans la protéine

A

Trans

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14
Q

Pourquoi est ce que la forme trans est favorise

A

Parce qu’il y a moins d’encombrement stérique

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15
Q

Quel est l’exception ou la forme cis et trans ont la même énergie

A

Proline

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Perfectly
16
Q

Ou est ce que se situe l’angle phi

A

Entre le carbone alpha et l’atome d’azote

17
Q

Ou est ce l’angle psi se situe

A

Entre le carbone alpha et le C (C=O)

18
Q

De quoi dépendent les angles dièdre

A

Il dépende de l’encombrement stérique entre les oxygène du carbonyle du lien peptidique et les atomes de la chaîne latérale

19
Q

Quand il s’agit de la proline, les angles dièdre ne varient pas

A

Vrai

20
Q

Pourquoi sont ils fixe

A

A cause du cycle de la chaîne latérale

21
Q

Qu’est ce que le graphique de Ramachadran indique

A

Indique les paire d’angle dièdre qui ne causent pas d’encombrement stérique et qui sont donc permis pour les aa d’une protéine donne

22
Q

Les angles psi et phi sont spécifique à diverses plusieurs structures secondaire

A

Vrai