2.1 Structure primaire des protéines Flashcards
Qu’est ce que la structure primaire
Arrangement linéaire des acides s aminés
Comment se forme un lien dipeptide
Par condensation de 2 aa
Ou est situe le lien peptide
Entre le C=O d’un premier aa et le N-H d’un second aa
Les chaîne latérale ne sont (habituellement) pas impliqués dans le lien peptidique
V ou F
Vrai
Comment se nomme la molécule (ex des ndc) ou la chaîne latérale fait le lien peptide
Glutathion
Quels aa du glutathion forme ce lien peptidique atypique et pourquoi est il atypique
Acide glutamique et cysteine
C’est le carboxyle de la chaîne latérale de l’acide glutamique qui fait le lien peptidique avec le groupement amine de la cysteine
Pourquoi les électrons autour du lien peptidique veulent se déplacer
Pour se partager uniformément entre les atomes
Le lien peptidique a un caractère partiel de quel type de liaison
Liaison double
Quel type d’isomérie le lien peptidique peut il adopter
Cis ou trans
Le lien peptide est tridimensionnel
V ou F
Faux, il est planaire
Qu’est ce que la configuration trans dans un lien peptidique
Cα des résidus peptidiques occupent les coins opposés au groupe peptidique
Qu’est ce que la configuration cis dans un lien peptidique
Cα des résidus peptidiques sur le même côté du groupe peptidique, donc plus proches
Quel est la forme favorise (cis ou trans) et la plus abondante dans la protéine
Trans
Pourquoi est ce que la forme trans est favorise
Parce qu’il y a moins d’encombrement stérique
Quel est l’exception ou la forme cis et trans ont la même énergie
Proline
Ou est ce que se situe l’angle phi
Entre le carbone alpha et l’atome d’azote
Ou est ce l’angle psi se situe
Entre le carbone alpha et le C (C=O)
De quoi dépendent les angles dièdre
Il dépende de l’encombrement stérique entre les oxygène du carbonyle du lien peptidique et les atomes de la chaîne latérale
Quand il s’agit de la proline, les angles dièdre ne varient pas
Vrai
Pourquoi sont ils fixe
A cause du cycle de la chaîne latérale
Qu’est ce que le graphique de Ramachadran indique
Indique les paire d’angle dièdre qui ne causent pas d’encombrement stérique et qui sont donc permis pour les aa d’une protéine donne
Les angles psi et phi sont spécifique à diverses plusieurs structures secondaire
Vrai
