Cours 8 : Traduction des protéines Flashcards
Quelle réaction est catalysée par le ribosome
La formation d’un lien peptidique entre 2 a.a.
Que contient l’ARNm
L’information génétique sous forme des codons ordonnés selon un cadre de lecture précis
Quel est le rôle de l’ARNt dans la traduction
Faire l’intermédiaire entre le codon et l’a.a. via un anticodon correspondant
Est ce que le ribosome peut différencier un ARNt correctement chargé vs un ARNt avec le mauvais a.a.
NON
Comment l’AAS aide à l’association de l’a.a. sur l’ARNt
Chaque type d’AAS ne peut reconnaitre qu’un seul a.a. et le bon ARNt (séquences sur le bras accepteur et sur la boucle de l’anticodon)
Comment s’effectue la reconnaissance de la molécule d’ARNt par son AAS (3 éléments)
- Nucléotides de la tige acceptrice jouent un rôle majeure dans la reconnaissance de l’ARNt
- La plupart des AAS reconnaissent aussi l’anticodon de l’ARNt correspondant
- Les boucles variables peuvent aussi servir
Que se passe-t-il avec l’AAS une fois qu’il a chargé l’a.a. sur l’ARNt
Il est relâché dans le cytoplasme
Vrai ou faux : il existe un «pool» de a.a.-ARNt qui sont disponibles dans le cytoplasme pour la traduction
Vrai
Par qui est effectuée la sélection du bon a.a.-ARNt en fonction du codon lu sur l’ARNm
Le ribosome
Quel centre de la grande sous-unité du ribosome est responsable de la formation des liaisons peptidiques
Le centre peptidyl-transférase (PTC)
Quel centre de la petite sous-unité du ribosome est responsable du chargment des ARNt qui lisent les codons de l’ARNm
Le centre de décodage (DC)
Quel est le sens de décodage de l’ARNm par le ribosome
5’ —> 3’
Combien y a-t-il de cadres de lecture possibles (ARNm dans les ribosomes)
3 cadres, mais 1 seul est le bon
Par quel codon est presque toujours initié la traduction
AUG (met)
Quel est le premier a.a. de toutes les protéines (en partant de l’extrémité NH2)
MET
Quelle séquence conservée est présente en 5’ du codon AUG et qui détermine le cadre de lecture
RBS (RBS-AUG détermine le cadre)
Vrai ou faux : RBS est complémentaire à l’ARNr 16s
Vrai, leur appariement positionne l’AUG sur le ribosome pour accueillir le premier ARNt
Qu’est ce qu’un opéron
Plusieurs gènes sous le même promoteur (transcrit ensemble en 1 seul ARNm)
Que fait la petite sous-unité liée à un MET-ARNt
Elle avance sur l’ARNm (5’–>3’) jusqu’au premier AUG
Que se passe-t-il lorsque l’appariement codon-anticodon se produit (reconnaissance AUG)
La petite sous-unité s’arrête et la grande sous-unité vient la rejoindre
Que se passe-t-il si le premier AUG de l’ARNm s’éloigne trop de la séquence consensus RBS-AUG
Le premier AUG est ignoré et on passe au 2e ou au 3e
Quelle est la séquence optimale consensus pour la reconnaissance du codon initiateur
Séquence de Kozak : CRCCaugG (R=A ou G)
Vrai ou faux : les a.a.-ARNt arrivent tous en même temps dans le ribosome
Faux, ils arrivent 1 par 1, la chaîne peptidique en synthèse est attaché à l’ARNt du dernier a.a.
Quels sont les 4 sites du ribosomes
- Site de liaison à L’ARNm
- Site P : retient l’ARNt qui porte la chaine d’a.a. en élongation
- Site A : retient l’ARNt qui porte le prochain a.a.
- Site E : plus petit, pas de place pour un a.a. (seulement l’ARNt)
À quels niveaux se retrouvent les différences dans la traduction eucaryote vs procaryote
- Facteurs protéiques utilisés
- Séquences reconnues sur l’ARNm
Quelles sont les 3 grandes étapes de l’initiation de la traduction
- Trouver le cadre de lecture
- Liaison de l’ARNt-MET de départ
- Association des 2 sous-unités du ribosome
Quelles sont les 3 grandes étapes de l’élongation des protéines lors de la traduction
- Liaison des ARNt au site A
- Formation du lien peptidique
- Translocation du ribosome
À quel moment se termine la traduction
Lorsque le codon STOP est en position A
Pourquoi la traduction est co-transcriptionnelle chez les procaryotes
Parce que les ribosomes et l’ADN sont dans le même compartiment cellulaire
Vrai ou faux : Chez les procaryotes, dès que l’ARNm sort de la polymérase, celui-ci peut être traduit
Vrai (traduction co-transcriptionnelle)
Dans l’initiation de la traduction chez les procaryotes, quelles sont les 3 protéines qui reconnaissent les régions 5’ et 3’ de l’ARNm dans le cytoplasme
elF4E : reconnait la coiffe 5’
PABPl : reconnait la queue poly-A
elF4G : reconnait les 2 protéines liées à l’ARNm
**Formation d’une boucle
Qu’est ce qui est favorisé par la conformation en boucle de l’ARMm eucaryote par elF4E/G et PABPl
Le recrutement du complexe de pré-initiation de la traduction
La conformation circulaire de l’ARNm eucaryote accélère quel processus
La traduction en mettant à proximité les sites d’initiation et de terminaison = favorise la circulation des ribosomes
À quel état est relié la formation en boucle de l’ARNm chez les eucaryotes (découvert dernièrement)
États de stress cellulaire ou inhibition de la traduction
Dans les dernières années, quelles conformations des ARNm eucaryotes serait plus véridique (au lieu de la boucle)
Conformation plus ou moins linéaire
À quel moment est formé le complexe de préinitiation de la traduction (eucaryote)
Lorsque la petite sous-unité (40S) du ribosome se lie aux facteurs d’initiation et au complexe ternaire
Quelles sont les 3 similarités du complexe de préinitiation des eucaryotes et procaryotes
- ARNt initiateur dédié
- Facteurs d’initiation pour former un complexe de préinitiation
- Lie l’ARNm avant l’ajout de la grande sous-unité
Quel facteur d’initiation présent sur l’ARNm permet de défaire les structures secondaire et de scanner l’ARNm à la recher de AUG
elF4A avec son activité hélicase
Que se passe-t-il lorsque le complexe de préinitiation reconnait le codon initiateur
Le GTP associé à elF2 est hydrolysé en GDP ce qui immobilise le complexe au site d’initiation et la grande sous-unité (60S) associée au elF6 vient compléter le ribosome (hydrolyse d’un autre GTP avec elF5)
Vrai ou faux : l’arrivée de la grande sous-unité détache les elFs
Vrai