Cours 11 : Régulation de l'expression génique part 2 Flashcards
Vrai ou faux : un même facteur peut agir sur plusieurs gènes
Vrai
Vrai ou faux : la majorité des gènes eucaryotes sont sous le contrôle de multiples éléments
Vrai
Qu’est ce que le contrôle combinatoire
Des groupes de gènes peuvent être sous le contrôle d’un même élément (F3) et avoir une régulation spécifique pour chacun d’entre eux (F1-2-4 pour gène #1 et F5-6 pour gène #2)
QU’est ce que l’intégration du signal (coordination)
Deux conditions (ou plus) sont nécessaires pour obtenir la pleine expression du gène
Ex : La présence de lumière (active F3) et l’absence de glucose (active F5 et F6)
Contrôle combinatoire des gènes de la globine :
1. Où sont regroupés les gènes
2. Quelle est la séquence régulatrice
3. Quelle est la conséquence de la liaison de protéines à la séquence régulatrice
- Dans un locus
- LCR (contient des activateurs et des inhibiteurs)
- Dérouler localement la chromatine pour accéder aux gènes
Mis à part la séquence LCR, qu’est ce qui permet de contrôler l’expression des différents gènes de la globine
Des éléments spécifiques de contrôle à chaque gènes qui sont situés à proximité de leur promoteur (détermine le taux de transcription)
Quand les activateurs de transcription agissent ensemble, quels sont les 4 types de coopération
- Coopérative (besoin des 2 facteurs pour lier l’ADN)
- Former un site de recrutement pour une autre protéine
- Recrutement de facteurs remodelant la chromatine (lie A, puis la modification de la chromatine permet de recruter B)
- Directement modifier la chromatine pour rendre le site B accessible
À quel moment le gène HO s’exprime chez la levure (S. cerevisiae)
Lorsque la levure bourgeonne et seulement chez la cellule mère
Le gène HO (levure) est sous le contrôle de quelles protéines (2)
SWI5 et SBF qui lient plusieurs sites sur la chromatine
Que se passe-t-il quand SWI5 se lie à des sites de liaison (gène HO chez la levure)
Recrutement du complexe de remodelage de la chromatine, ce qui révèle les sites de liaison pour SBF qui peut se lier et recruter le complexe médiateur
Avec quoi interagit le complexe médiateur (gène HO des levures)
Avec l’ARN pol pour débuter la transcription
À quel moment s’exprime le gène du B-interféron humain
Lors d’une infection virale
Quel est le résultat de la liaison de NFkB, IRF et Jun/ATF à l’ADN en amont du promoteur de B-interféron
Formation d’une structure : enhancéosome. Permet la liaison de HMG-I pour aider à l’activation de la transcription en repliant l’ADN (rapproche les éléments de l’enhancéosome)
Vrai ou faux : plusieurs voies de signalisation sont vouées presque exclusivement à la régulation de facteurs de transcription
Vrai, il faut les produire et les activer
Vrai ou faux : une cellule mammifère typique exprime des récepteurs pour plus d’une centaine de molécules dont la fonction première est de réguler l’activation des facteurs de transcription
Vrai
Quelles peuvent être les sources des molécules qui régule l’activité des facteurs de transcription
Neurones (neurotransmetteurs)
Glandes (hormones)
Nutriments (glucose)
Toxines…
Par quoi sont interceptés les signaux hydrophiles vs hydrophobes
Hydrophiles : des récepteurs membranaires
Hydrophobes : par des récepteurs nucléaires
Que contrôle TGF-bêta
La prolifération et la différenciation cellulaire
Vrai ou faux : l’activation des récepteurs TGF-b conduit à l’expression de plusieurs gènes sous le contrôle des séquences SBE
Vrai
Comment la liaison du TGF-b provoque l’agrégation de ses récepteurs (3 étapes)
- Ces derniers sont des kinases et se phosphorylent lors de l’activation
- Phosphorylation des protéines Smad3 et changement de conformation
- Smad3-P se lie avec Smad4 et révèle un signal d’exportation nucléaire (NLS)
L’agrégat de récepteur du TGF-b agit de quel façon une fois au noyau
Comme activateur de la transcription des gènes portant des éléments SBE
Vrai ou faux : les Smad3-4 interagissent également avec un autre activateur TFIIE
Faux, il interagit avec TFE3
Par quoi est activé le récepteur RTK
Par une hormone (EGF ou insuline)
Quel est le rôle de la protéine GRB2 dans la voie d’activation de Ras par EGF
C’est un pont qui possède 2 domaine : SH2 se lie au récepteur RTK activé et le SH3 se lie avec la protéine Sos
Quel est le rôle de Sos dans la voie d’activation de Ras par EGF
C’est une GEF pour Ras : elle catalyse l’échange de GDP pour le GTP = activation de Ras
Quelle est la cascade produite lorsque MAPK est activé (4 étapes)
- Phosphoryle et active p90
- MAPK et p90 pénètrent dans le noyau
- P90 phosphoryle et active SRF alors que MAPK phosphoryle et active TCF
- 2 SRF et un TCF forment un complexe trimère qui reconnait et active la transcription de gènes portant un élément SRE
Que contrôle les gènes portant des éléments SRE
Contrôle la prolifération cellulaire
Quelles sont les structures communes des récepteurs des hormones de stéroïdiennes
- Domaine variable
- Domaine de liaison à l’ADN (doigt de zinc)
- Domaine de liaison à l’hormone = domaine activateur de transcription
Vrai ou faux : le domaine de liaison à l’hormone peut agir comme un répresseur
Vrai, en absence de l’hormone
Quelle caractéristique des hormones stéroïdiennes leur permettent d’influencer directement l’activité d’une famille de facteur de transcription
Ils sont liposolubles (peuvent passer à travers la membrane lipidique)
À quel endroit sont localisés les récepteurs nucléaires hétérodimériques (récepteurs hormones stéroïdiennes)
Exclusivement dans le noyau
Que se passe-t-il avec les récepteurs nucléaires hétérodimaériques quand :
1. Absence de leur hormone
2. Présence de leur hormone dans le noyau
- Se lient à l’ADN et agissent comme répresseurs
- Modification du domaine activateur et activation de la transcription
À quel endroit sont localisés les récepteurs nucléaires homodimériques en absence de leur hormone (récepteurs hormones stéroïdiennes)
Dans le cytoplasme
Que se passe-t-il avec les récepteurs nucléaires homodimériques lorsque leur hormone spécifique est présente dans la cellule
- Liaison de l’hormone induit la translocation du complexe à l’intérieur du noyau
- Le récepteur peut se lier à l’ADN et induire la transcription de gènes spécifiques
Comment se produit la transcription et la maturation des miARN (4 étapes)
- Transcrit à partir des gènes par l’ADN pol2
- Au début, maturation similaire à ARNm
- Retrait des modifications aux extrémités = repliement pour faire une structure double brin
- Maturation continue dans le cytoplasme avec le complexe Dicer et RISC
Quel est le rôle des miARNs
Réprimer les ARNm qui présentent des séquences complémentaires aux miARNs
Quels sont les 2 moyens par lesquels il est possible de faire la répression de la traduction
- Inhibant la traduction de l’ARNm
- Dirigeant la destruction de l’ARNm
Comment est l’expression des miARN dans les cancers
Diminution générale des taux de nombreux miARN
Quelle est l’utilité des miARNs pour les thérapies géniques
L’ajout de miARN pour réguler l’expression de gènes surexprimés
Les siARN sont produits à partir d’ARN double brin provenant d’où (2)
- De la cellule (ARNm appariées, transposons)
- De l’extérieur (virus)
Quelles sont les 2 façons d’inhiber les gènes avec les siARN
- Enzyme Dicer (RNase) reconnait et digère les ARN double brin en fragments de 20 nucléotides
- siARN sont pris en charge par le complexe protéique RISC qui dénature l’ARN pour produire des séquences sp
La dénaturation du siARN a quel effet sur RISC
Activation et RISC se dirige vers les séquences sur l’ARNm complémentaire à siARN
Vrai ou faux : RISC activé peut bloquer la traduction des ARNm ou l’amplifier
Vrai
Quel est le rôle de RISC lorsqu’il se retrouve dans le noyau
Remodeler la chromatine
Grossomodo, qu’est ce que la voie Ras/MAPK
Activation de Ras induit l’activation de la voie MAPK : série de phosphorylations successives -> passage d’une MAPK au noyau et activation de facteurs de transcription
Est ce que tous les récepteurs tyrosine kinase déclenchent une cascade MAPK
Non
Dans quoi les récepteurs tyrosine-kinase (RTK) sont-ils impliqués (rôles)
Régulation de la croissance
Différenciation
Survie des cellules
Quelles molécules se lient aux RTK
Facteurs de croissances
Petites protéines libérées localement (faible concentration)
Étapes de la voie d’activation de Ras/MAPK via les RTK (4 étapes)
- RTK inactifs sont monomériques
- Liaison à leur molécule = dimérisation
- activation de leurs domaines kinases (phosphorylation d’une tyrosine)
- Cross-phosphorylation de tyrosines supplémentaires = reconnaissance des RTK activés par des protéines intracellulaires
