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Biologie Moléculaire > Cours 1 : Structure de l'ADN > Flashcards

Cours 1 : Structure de l'ADN Flashcards

1
Q

Qu’est ce qu’un atome

A

La plus petite unité possédant les propriétés d’un élément

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Q

Quelles sont les 3 principales particules élémentaires qui constituent les atomes

A
  1. Neutron
  2. Protons
  3. Électrons
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Q

Où se retrouvent les neutrons et les protons dans l’atome

A

Dans le noyau

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4
Q

Où se retrouvent les électrons dans l’atome

A

Ils gravitent autour de l’atome à la vitesse de la lumière

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Q

Qu’indiquent les rangées dans le tableau périodique des éléments

A

Le nombre de couches d’électrons pour chaque atome

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6
Q

Qu’est ce que la couche de valence

A

C’est la dernière couche d’électrons

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7
Q

Que permet la couche de valence

A

Les interactions entre les atomes

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8
Q

Qu’est ce que la règle de l’octet

A

Pour être stable, un atome cherche à compléter sa dernière couche électronique avec 8 électrons en faisant des liaisons chimiques avec d’autres atomes

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9
Q

Quels atomes font exception à la règle de l’octet

A

H et He (2 électron sur leur couche de valence)

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10
Q

Qu’est ce que l’état électriquement neutre

A

Le nombre de protons est égal au nombre d’électrons

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11
Q

Pourquoi la formation d’une liaison chimique entre 2 atomes dégage-t-elle de l’énergie

A

Parce que les atomes deviennent stable et bougent moins

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12
Q

Que faut-il apporter pour briser une liaison chimique

A

De l’énergie pour permettre aux atomes de retrouver leur mouvement initial

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13
Q

Classer les types de liaisons chimiques de la plus énergétique à la moins énergétique

A
  1. Covalentes (polaires et non-polaires)
  2. Ioniques
  3. Hydrogènes
  4. Interactions hydrophobes
  5. Van Der Waals
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14
Q

Par quel type de liaison s’effectue la formation de chaînes carbonnées

A

Liaison covalente

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15
Q

3 types de liaisons que peuvent faire les carbones entre eux
3 types de squelettes carbonnés

A

Simple, double ou triple
Longue rectiligne, ramifiée ou cyclique

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16
Q

Est ce que les chaînes carbonées peuvent faire des liaisons avec d’autres molécules

A

Oui, pour construire des tissus et des organes

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17
Q

De quoi dépendent les propriétés d’une molécule organique

A
  1. Disposition des carbones
  2. Molécules se liant au squelette carboné
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18
Q

Qu’est ce qu’un groupement fonctionnel

A

Groupement d’atomes qui participent aux réactions chimiques des molécules organiques

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19
Q

Quel est l’avantage de posséder des liaisons covalentes polaires par rapport aux liaisons covalentes non-polaires

A

Favorise l’équilibre et l’efficacité énergétique

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20
Q

Quel type de liaison contiennent les groupements fonctionnels

A

Covalentes polaires (parfois ionisés)

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21
Q

Par quoi est déterminé la forme d’une macromolécule

A

Par la séquence

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22
Q

Par quel type de liaison les monomères sont-ils liés les uns aux autres

A

Par des liaisons covalentes

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23
Q

Par quels types de liaisons la structure 3D des macromolécules sont-elles stabilisées

A

Liaisons covalentes et non-covalentes

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24
Q

Vrai ou faux : Plus 2 molécules s’assemblent bien, plus elles forment de lien covalents entre elles

A

Faux, plus elles forme de liens NON-COVALENTS

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25
Q

Pourquoi les interactions de faible énergie sont elles efficaces pour stabiliser les molécules

A

Parce qu’elles sont très nombreuses

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26
Q

Dogme central de la biologie

A

Réplication
Transcription
Traduction

27
Q

Qu’est ce qu’un nucléotide

A

Sucre + base azotée + groupement phosphate

28
Q

Qu’est ce qu’un nucléoside

A

Sucre + baze azotée

29
Q

Différence entre ribose et désoxyribose

A

OH sur le C2 du sucre (ribose)
H sur le C2 du sucre (désoxyribose)

30
Q

Quelles sont les 2 purines

A

Adénine
Guanine

31
Q

Quelles sont les 2 pyrimidines

A

Cytosine
Thymine (Uracile)

31
Q

Qu’est ce que le lien phosphodiester

A

Lien entre le C5 du sucre et le groupement phosphate

32
Q

Qu’est ce que le lien glycosidique

A

Lien entre le C1 du sucre et la base azotée

33
Q

Lors de la formation des liaisons phosphodiester et glycosidique, quelle molécule est relâchée

A

H2O (réaction de condensation)

34
Q

Est ce qu’il est possible de polymériser l’ADN avec des nucléotides monophosphates

A

Non, la polymérisation de l’ADN requiert des nucléotides triphosphates

35
Q

3 fonctions des nucléotides

A
  1. Source d’énergie chimique (liaison entre les gr. phosphate)
  2. Coenzyme (association avec différents gr. chimiques)
  3. Molécules de signalisation
36
Q

Combien d’énergie donne l’hydrolyse de l’ATP à pH7

A

7.3 kcal/mol

37
Q

Par quel lien se fait la polymérisation de l’ADN

A

Par le lien phosphodiester

38
Q

2 éléments requis pour la polymérisation de l’ADN

A
  1. Polymérase (enzyme)
  2. apport en nucléotide triphosphate
39
Q

Dans quel sens se fait la polymérisation et quelle molécule est libérée

A

Du 5’ au 3’
On libère une molécule de pyrophosphate

40
Q

Quelle est la charge globale de l’ADN

A

négative

41
Q

Quel groupe se retrouve à l’extrémité 3’ et à l’extrémité 5’ des chaines de nucléotides

A

5’ : groupe phosphate
3’ : groupe hydroxyle libre

42
Q

Comment est identifier une séquence de chaîne de nucléotides

A

Avec les bases azotées (du 5’ vers 3’)

43
Q

Quelles liaisons assurent la formation de la structure bicaténaire de l’ADN

A

Les liaisons hydrogènes (faibles, mais nombreuses)

44
Q

Quelles sont les règles de Chargaff

A
  1. Peu importe la source, %A=%T et %C=%G
  2. Le rapport des purines sur pyrimidines est toujours de 1
  3. % de (G+C)/(G+C+A+T) d’un génome dépend de l’espèce (mais est toujours le même pour une espèce donnée)
45
Q

Quels nucléotides se lient ensembles avec combien de liens H

A

A se lie avec T (2 liens H)
G se lie avec C (3 liens H)

46
Q

Que veut dire orientation antiparallèle

A

Les liens H ne se forment entre les couples compatibles que si le 5’ est face au 3’

47
Q

Les bases sont-elles situées vers l’intérieur ou l’extérieur de l’ADN

A

Vers l’intérieur

48
Q

Qu’est ce qui constitue l’information génétique

A

Le nombre et l’ordre précis des bases

49
Q

Les protéines peuvent-elles toujours lire les séquences de bases

A

Non, il faut avoir accès aux bases

50
Q

Vrai ou faux : certaines protéines peuvent reconnaitre des séquences à travers les sillons de l’ADN

A

Vrai

51
Q

Peut ont répliquer l’ADN sans ouvrir la double hélice d’ADN

A

Non, il faut briser les liens H entre les bases pour ouvrir l’ADN

52
Q

pourquoi y a-t-il un sillon mineur et un sillon majeur dans l’ADN

A

À cause de l’angle entre 2 liens glycosidiques d’un couple de nucléotides (2 angles différents)

53
Q

Quels sont les angles des sillons mineurs et majeurs

A

Mineur : 120
Majeur : 240

54
Q

Quels sont les groupes chimiques exposés dans chaque sillon

A

Mineur : AHA et ADA
Majeur : ADAM, MADA, HDAA et AADH

55
Q

Une protéine peut lire plus d’information dans le sillon mineur ou majeur

A

Majeur, elle a aussi plus de place pour approcher le sillon majeur

56
Q

Qu’est ce que la dénaturation

A

Perte de la structure quaternaire, tertiaire ou secondaire présente dans la forme native de la molécule

57
Q

Qu’arrive-t-il si on chauffe l’ADN à 95 degrés

A

On brise les liens H entre les bases azotées et on obtient 2 chaines d’ADN à un seul brin

58
Q

Est ce que la dénaturation est réversible

A

Oui, lorsque la température redescend, les brins se réassocient selon leur compatibilité

59
Q

Comment peut-on détecter une séquence spécifique d’ADN dans un échantillon

A

En hybridant l’ADN avec un brin ajouté qui correspond à la séquence complémentaire de la séquence recherchée (voir diapo 32-33)

60
Q

Qu’est ce que la spécificité

A

Le degré de complémentarité entre 2 molécules (dépend de la complémentarité de forme et du nombre de liens chimiques formés)

61
Q

Vrai ou faux : plus la température d’hybridation est élevée, plus l’hybride est spécifique

A

Vrai

62
Q

Qu’est ce que la technique d’hybridation in situ

A

Permet de voir une séquence cible grâce à l’hybridation de l’ADN avec sonde marquée fluorescente (voir diapo 35-36)

63
Q

Technique d’hybridation sur membrane

A

Voir diapo 38-41

Biologie Moléculaire (6 decks)

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