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Biologie Moléculaire > Cours 8 : ARNm (part 2) > Flashcards

Cours 8 : ARNm (part 2) Flashcards

1
Q

Vrai ou faux : les ARNm matures doivent être exportés vers le cytoplasme pour participer à la traduction

A

Vrai

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Q

Le transport hors du noyau des ARNm matures est contrôlé via quoi

A

Facteurs d’export
Récepteurs de signaux d’exports

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3
Q

Quel est le rôle des karyophérines

A

Protéines importatrice (importines) et exportatrices (exportines) qui gère le trafic bidirectionnel des ARN et des protéines entre le noyau et le cytoplasme

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4
Q

Que reconnaissent les Karyophérines sur les ARN/protéines

A

Une séquence d’a.a. spécifique
ARN : a.a. des protéines exportatrices
Protéines : a.a. de la protéines

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5
Q

Qu’est ce qu’un ribonucléoprotéine messager (RNPm)

A

ARNm + complément de protéines qui s’associent à l’ARNm durant la transcription et maturation

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6
Q

Les protéines des RNPm reconnaissent quoi sur l’ARNm + à quoi s’associent-elles sur l’ARNm

A

les exons
S’associe à la coiffe en 5’ et la queue poly A

**Permet la reconnaissance d’ARN pour la transcription

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7
Q

Vrai ou faux : quand l’ARNm parvient au cytoplasme, d’autres protéines s’associent à l’ARNm pour assurer la traduction

A

Vrai

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8
Q

Qu’est ce que les Tap

A

Protéines hétérodimériques qui sont des récepteurs du transport nucléaire des ARNm qui peuvent associer à l’ARN

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9
Q

Qu’est ce que le complexe TREX

A

Pour la transcription exportation : permet de cibler les ARNm spécifiquement

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10
Q

Quel est le rôle de TREX

A

Amener Tap jusqu’à l’ARNm (coiffe/queue poly-A), puis se détache

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11
Q

Vrai ou faux : Tap permet le passage à travers le CPN de la même façon que les karyophérines

A

Vrai, il interagit avec les nucléoporines du centre du pore

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12
Q

Qu’arrive-t-il à Tap après le passage de l’ARNm à travers le CPN

A

Tap est retenu par les protéines associées au CPN, ce qui force leur détachement de RNPm

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13
Q

Combien d’ARN polymérase pour les procaryotes vs eucaryotes

A

P : une seule
E : 3

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14
Q

Vrai ou faux : les principes généraux de l’initiation de la transcription par l’ARN pol II s’appliquent aussi aux ARN pol I et III

A

Vrai

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15
Q

Vrai ou faux : Les 3 ARN polymérases dépendent des mêmes facteurs de transcription

A

Faux, ce sont des facteurs de transcription différents

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16
Q

L’initiation de la transcription par ARN pol I (ARNr) et pol III (ARNt et ARNr 5S) est relié à quel état cellulaire

A

La prolifération et la croissance cellulaire

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17
Q

Combien de sous-unité contient le ribosome eucaryote

A

2 sous-unités

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18
Q

Combien de gène pour le précurseur des ARNr + par qui est-il transcrit

A

1 seul gène (18S, 5.8S et 28S), transcrit par ARN pol I

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19
Q

Que contient le promoteur du gène précurseur des ARNr

A
  1. Élément central (core) essentiel à l’initiation avec TBP
  2. Séquence UCE qui active la transcription x10
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20
Q

À quelle séquence se lie les facteurs de transcription spécifiques à ARN pol I lors de la transcription du gène précurseur des ARNr

A

UCE, puis à l’élément central (qui contient TBP)

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21
Q

Quelles sont les proportions (%) des ARNs dans une cellule en croissance

A

80% : ARNr
15% : ARNt
5% : ARNm

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22
Q

Vrai ou faux : les ARNr matures quittent le noyau dès qu’ils sont transcrits

A

Faux, ils quittent seulement lorsqu’ils sont incorporés dans les sous-unités ribosomales

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23
Q

Les ARNr chez E. Coli sont codés par combien d’opérons + résultat de leur transcription

A

7 opérons (rrnA…rrnG) qui est transcrit en un long précurseur 30S

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24
Q

Par qui se fait le clivage de 30S (ARNr procaryotes) + quels 3 ARNr matures sont produits

A

Clivage par RNase III
16S (petite sous-unité)
5S + 23S (grosse sous-unités)

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25
Q

Vrai ou faux : les ARNr eucaryotes 18S, 5.8S et 28S sont tous inclus dans un même pré-ARNr

A

Vrai (45S)

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26
Q

Dans quelle région du nucléole sont produits les ARNr (transcription + maturation)

A

Dans les centres fibrillaires du nucléole

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27
Q

Dans quelle région du nucléole sont assemblés les sous-unités ribosomales

A

En périphérie du nucléole (zone granuleuse)

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28
Q

Comment sont organisés les gènes codant 45S (eucaryotes)

A

En tendem, séparés par 2 à 30 kb non transcrit (qui seront éliminés)
5’ —18S—5.8S—28S—3’

29
Q

Qu’est ce que les ARNsno

A

Ce sont des guides pour les modifications chimiques et le clivage des précurseurs des ARNr

30
Q

Vrai ou faux : la majorité des ARNsno fait partie de ribonucléoprotéines

A

Vrai, ils se placent à une séquence spécifique sur le 45S par appariement de leur séquence avec celle de l’ARNr

31
Q

La liaison des ARNsno avec le 45S permet le recrutement de quoi

A

D’enzymes de maturation

32
Q

Vrai ou faux : plusieurs ARNsno sont des introns excisés des autres gènes

A

Vrai, surtout des gènes codant les protéines ribosomales

33
Q

La transcription par l’ARN pol III des ARNt et de l’ARNr 5S est régie par quelles séquences

A

Des séquences à l’intérieur de la région codante (promoteur interne)

34
Q

La transcription des ARNr 5S est régie par quelle région

A

La boîte C

35
Q

Quel est le rôle des boîtes A et B

A

Ils contrôlent la transcription des ARNt. Elles sont reconnues par TFIIIC (recrutement de TFIIIB)

36
Q

Vrai ou faux : TFIIIC et TFIIIB sont requis pour la transcription des ARNt et de l’ARNr 5S

A

Vrai, ils contiennent TBP pour diriger l’ARN pol III

37
Q

Vrai ou faux : TFIIIA participe seulement à la transcription des ARNr 5S

A

Vrai, c’est un adaptateur pour TFIIIC

38
Q

Combien de nucléotides pour les ARNt matures

A

75-95 nucléotides

39
Q

Puisque les ARNt sont synthétisés sous forme de long s précurseurs, quels sont les 2 mécanismes de maturation

A
  1. Clivage en 5’ par RNase P et modification de plusieurs bases
  2. Possibilité d’épissage
40
Q

Quelles sont les 3 types de modifications possibles des ARNt

A
  1. Les U en 3’ sont remplacés par CCA
  2. Méthylation sur 2’ des riboses
  3. Conversion de U spécifiques
41
Q

À quel moment les ARNt peuvent-ils quitter le noyau

A

Lorsqu’ils sont matures

42
Q

Forme secondaire vs tertiaire des ARNt

A

2 : En trèfle
3 : En L

43
Q

Quelle molécule reconnait le bras accepteur de l’ARNt et est responsable de charger l’a.a.

A

Aminoacyl-ARNt-synthétase (AAS)

44
Q

Quelles sont les 4 étapes du chargement d’un a.a. sur l’ARNt

A
  1. Le site actif de AAS se lie à un a.a. et à un ATP
  2. ATP est couper pour lui enlever 2P = AMP est collé sur l’a.a.
  3. ARNt approprié déplace l’AMP du site actif tout en se liant à l’a.a. toujours en place
  4. AAS libère l’aminoacyl-ARNt (complexe formé d’un a.a. et d’un ARNt)
45
Q

Qu’est ce que la règle du WOBBLE (3 éléments)

A
  1. L’appariement des bases 1 et 2 du codon avec les bases 3 et 2 de l’anticodon suit les règles de l’appariement A-U et C-G
  2. Le numéro de chaque base est de 5’ -> 3’
  3. La 3e position du codon peut former des appariement inhabituel = flexibilité à cette position
46
Q

Quels sont les avantages de la base fluctuante (flexible; ARNt)

A
  1. Moins d’ARNt nécessaire
  2. Facilite la dissociation de l’ARNt pendant la synthèse protéique
  3. Les mutations en position 3 du codon sont (souvent) sans conséquence
47
Q

Vrai ou faux : la base 5’ du codon est moins confiné dans l’espace (ARNt-a.a.)

A

Vrai, les liaisons H sont possibles à condition d’avoir la même distance que les appariement standards de nucléotides

48
Q

Quelle est la terminaison de la l’ARN pol I (ARNr)

A

Dépend d’un facteur de terminaison spécifique : une protéine STOP se lie à une séquence d’ADN en aval du gène transcrit et arrête la Pol I

** Orientation de la séquence doit être respectée

49
Q

Quelle est la terminaison de la l’ARN pol III (ARNt)

A

Après que l’enzyme eut incorporé une série de U à la molécule d’ARN (hybride A-U ADN-ARN est très instable = détachement)

50
Q

Le petit d’ADN circulaire de la mitochondrie code pour combien de protéines

A

13 protéines essentielles + ARNr et ARNt

51
Q

Comment sont transcrits les ARN des mitochondries

A

Par une polymérase simple, apparentée aux polymérases procaryotes (codée par l’ADN nucléaire, puis transportée aux mitochondries)

52
Q

Vrai ou faux : les chloroplastes contiennent une molécule d’ADN

A

Vrai

53
Q

Qu’est ce qui se retrouve dans le génome des chloroplaste (homologue à ceux de E. Coli)

A

Des protomères alpha, bêta et bêta’ qui codent pour une ARN polymérase

54
Q

Vrai ou faux : le transport au cytoplasme des ARNm matures est contrôlé via des facteurs d’export et des récepteurs de signaux d’export

A

Vrai

55
Q

À quel endroit les ARNr sont-ils incorporés en sous-unités ribosomales

A

Dans le noyau au niveau du nucléole

56
Q

Via quelle structure s’effectue le transport des ARN du noyau vers le cytoplasme (et des protéines nucléaires du cytoplasme vers le noyau)

A

Par le complexe du pore nucléaire (CPN)

57
Q

Quels sont les principaux composants du complexe du pore nucléaire

A

Les nucléoporines (Nups)

58
Q

Vrai ou faux : les molécules diffusent librement à travers le complexe du pore nucléaire

A

Faux, les petites molécules peuvent diffuser, mais le transport des grandes molécules est contrôlé par des récepteurs

59
Q

De quoi est composé le TREX

A

THO et UAP56

60
Q

Quel est le rôle de Dbp5-Gle1 lors de l’exportation des ARNm (exemple du metazoa)

A

Retenir les TAP pour forcer leur détachement de l’ARNm

61
Q

Quelles sont les 2 modifications chimiques de l’ARNr 45S

A
  1. Méthylation en 2’-OH des sucres de nucléotides
  2. isomérisation des uridines en pseudouridines (position précise dépendant de la séquence)
62
Q

Que permet l’isomérisation des uridines en pseudouridines dans l’ARNr 45S

A

Rigidifier la structure secondaire et tertiaire des ARN

63
Q

Quelle structure de l’ARNt permet les actions suivantes :
1. Fixation du ribosome
2. Fixation de l’aminoacyl synthétase
3. Appariement avec l’ARNm

A
  1. Boucle T-pseudouridine-C
  2. Boucle D
  3. Boucle anticodon
64
Q

Sur quoi se basent les AAS pour différencier les ARNt

A

Sur l’Anticodon, le bras 3’ (séquences) et la boucle variable (forme)

65
Q

Vrai ou faux : un ARNt peut s’apparier avec 2 codons qui diffèrent par la 3e base

A

Vrai, mais ces codons doivent coder le même a.a.

66
Q

Vrai ou faux : il est possible d’apparier une guanine avec un uracile lors de l’appariement codon-anticodon (ARNt)

A

Vrai (si elle est à la première position de l’anticodon)

67
Q

Quelle est le 5e base possible, comment est-elle obtenue et à quelle base peut-elle s’apparier

A

Inosine
Modification d’une adénine durant la maturation de l’ARNt
U, C ou A (lorsqu’elle est en première position de l’anticodon)

68
Q

Quel est l’énergie gradient pour le trafic bidirectionnel des ARN et des protéines entre le noyau et le cytoplasme

A

Ran-GTP

69
Q

Quels sont les signaux de localisation nucléaire vs d’export nucléaire reconnus par les importines et exportines

A

NLS (importine)
NES (exportine)

Biologie Moléculaire (12 decks)

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